Matky proti dekapentaplegickému homologu 2 - Mothers against decapentaplegic homolog 2

SMAD2
Protein SMAD2 PDB 1dev.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySMAD2, JV18, JV18-1, MADH2, MADR2, hMAD-2, hSMAD člen rodiny 2
Externí IDOMIM: 601366 MGI: 108051 HomoloGene: 21197 Genové karty: SMAD2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 18 (lidský)
Chr.Chromozom 18 (lidský)[1]
Chromozom 18 (lidský)
Genomické umístění pro SMAD2
Genomické umístění pro SMAD2
Kapela18q21.1Start47,808,957 bp[1]
Konec47,931,146 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE SMAD2 203075 na fs.png

PBB GE SMAD2 203076 s na fs.png

PBB GE SMAD2 203077 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

4087

17126

Ensembl

ENSG00000175387

ENSMUSG00000024563

UniProt

Q15796

Q62432

RefSeq (mRNA)

NM_001003652
NM_001135937
NM_005901

NM_001252481
NM_010754
NM_001311070

RefSeq (protein)

NP_001003652
NP_001129409
NP_005892

NP_001239410
NP_001297999
NP_034884

Místo (UCSC)Chr 18: 47,81 - 47,93 MbChr 18: 76,24 - 76,31 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Matky proti dekapentaplegickému homologu 2 také známý jako Člen rodiny SMAD 2 nebo SMAD2 je protein že u lidí je kódován SMAD2 gen.[5][6] MAD homolog 2 patří do SMAD, rodina proteinů podobná genovým produktům Drosophila gen „matky proti dekapentaplegikům“ (Mad) a C. elegans gen Sma. SMAD proteiny jsou převodníky signálu a transkripční modulátory které zprostředkovávají více signálních drah.

Funkce

SMAD2 zprostředkovává signál transformující růstový faktor (TGF)-beta, a tak reguluje více buněčných procesů, jako je buňka proliferace, apoptóza, a diferenciace. Tento protein je získáván na receptory TGF-beta prostřednictvím své interakce s proteinem kotvy SMAD pro aktivaci receptoru (SARA). V reakci na signál TGF-beta je tento protein fosforylovaný receptory TGF-beta. Fosforylace indukuje disociaci tohoto proteinu se SARA a asociaci s členem rodiny SMAD4. Spojení s SMAD4 je důležité pro translokaci tohoto proteinu do buněčné jádro, kde se váže na cíl promotéři a tvoří transkripci represor komplex s dalšími kofaktory. Tento protein lze také fosforylovat kináza receptoru aktivinu typu 1 a zprostředkovává signál z aktivinu. Alternativně byly pozorovány sestřižené varianty transkriptu kódující stejný protein.[7]

Stejně jako ostatní Smady hraje Smad2 roli při přenosu extracelulárních signálů z ligandů Nadrodina růstových faktorů transformujícího růstového faktoru beta (TGFβ) do buněčného jádra. Vazba podskupiny ligandů superrodiny TGFp na extracelulární receptory spouští fosforylaci Smad2 na motivu serin-serin-methionin-serin (SSMS) na jeho extrémním C-konci. Fosforylovaný Smad2 je poté schopen tvořit komplex s Smad4. Tyto komplexy se hromadí v buněčném jádru, kde se přímo účastní regulace genová exprese.

Nomenklatura

Proteiny SMAD jsou homology obou proteinů drosophila, matek proti dekapentaplegikům (MAD) a C. elegans protein SMA. Název je kombinací obou. V průběhu Drosophila výzkumu bylo zjištěno, že mutace v genu ŠÍLENÝ v matce potlačil gen decapentaplegic v embryu. Byla přidána fráze „Matky proti“, protože matky často vytvářejí organizace, které se staví proti různým problémům, např. Matky proti řízení pod vlivem alkoholu nebo (MADD). Názvosloví tohoto proteinu je založeno na tradici tak neobvyklého pojmenování v komunitě pro výzkum genů.[8]

Interakce

Ukázalo se, že matky proti dekapentaplegickému homologu 2 komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175387 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024563 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Eppert K, Scherer SW, Ozcelik H, Pirone R, Hoodless P, Kim H, Tsui LC, Bapat B, Gallinger S, Andrulis IL, Thomsen GH, Wrana JL, Attisano L (srpen 1996). „MADR2 se mapuje na 18q21 a kóduje TGFbeta regulovaný protein související s MAD, který je funkčně mutován v kolorektálním karcinomu“. Buňka. 86 (4): 543–52. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80128-2. PMID  8752209. S2CID  531842.
  6. ^ Riggins GJ, Thiagalingam S, Rozenblum E, Weinstein CL, Kern SE, Hamilton SR, Willson JK, Markowitz SD, Kinzler KW, Vogelstein B (červenec 1996). "Šíleně související geny u člověka". Nat. Genet. 13 (3): 347–9. doi:10.1038 / ng0796-347. PMID  8673135. S2CID  10124489.
  7. ^ „Entrez Gene: SMAD2 SMAD family member 2“.
  8. ^ „Ježek Sonic, DICER a problém pojmenování genů“, 26. září 2014, Michael White. psmag.com
  9. ^ Nourry C, Maksumova L, Pang M, Liu X, Wang T (květen 2004). „Přímá interakce mezi Smad3, APC10, CDH1 a HEF1 při proteazomální degradaci HEF1“. BMC Cell Biol. 5: 20. doi:10.1186/1471-2121-5-20. PMC  420458. PMID  15144564.
  10. ^ Hocevar BA, Smine A, Xu XX, Howe PH (červen 2001). „Adaptérová molekula Disabled-2 spojuje receptory transformujícího růstového faktoru β s cestou Smad“. EMBO J.. 20 (11): 2789–801. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2789. ISSN  0261-4189. PMC  125498. PMID  11387212.
  11. ^ A b C d Wotton D, Lo RS, Lee S, Massagué J (duben 1999). "Transkripční corepresor Smad". Buňka. 97 (1): 29–39. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80712-6. ISSN  0092-8674. PMID  10199400. S2CID  6907878.
  12. ^ A b Pessah M, Prunier C, Marais J, Ferrand N, Mazars A, Lallemand F, Gauthier JM, Atfi A (květen 2001). „c-Jun interaguje s faktorem interagujícím s TGIF (corepressor), aby potlačil transkripční aktivitu Smad2“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98 (11): 6198–203. Bibcode:2001PNAS ... 98.6198P. doi:10.1073 / pnas.101579798. ISSN  0027-8424. PMC  33445. PMID  11371641.
  13. ^ Liu B, Dou CL, Prabhu L, Lai E (leden 1999). „FAST-2 je savčí protein s křídlovými helixy, který zprostředkovává signály β transformujícího růstového faktoru“. Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 424–30. doi:10.1128 / MCB.19.1.424. ISSN  0270-7306. PMC  83900. PMID  9858566.
  14. ^ Liu F, Pouponnot C, Massagué J (prosinec 1997). „Dvojí role nádorového supresoru Smad4 / DPC4 v transkripčních komplexech indukovatelných TGFβ“. Genes Dev. 11 (23): 3157–67. doi:10.1101 / gad.11.23.3157. ISSN  0890-9369. PMC  316747. PMID  9389648.
  15. ^ Dou C, Lee J, Liu B, Liu F, Massague J, Xuan S, Lai E (září 2000). „BF-1 interferuje s transformací signálu růstového faktoru β spojením s partnery Smad“. Mol. Buňka. Biol. 20 (17): 6201–11. doi:10.1128 / MCB.20.17.6201-6211.2000. ISSN  0270-7306. PMC  86095. PMID  10938097.
  16. ^ Chen X, Weisberg E, Fridmacher V, Watanabe M, Naco G, Whitman M (září 1997). „Smad4 a FAST-1 při sestavování faktoru reagujícího na aktivin“. Příroda. 389 (6646): 85–9. Bibcode:1997 Natur.389 ... 85C. doi:10.1038/38008. ISSN  0028-0836. PMID  9288972. S2CID  11927346.
  17. ^ O'Neill TJ, Zhu Y, Gustafson TA (duben 1997). "Interakce MAD2 s karboxylovým koncem inzulínového receptoru, ale ne s IGFIR. Důkazy o uvolnění z inzulínového receptoru po aktivaci". J. Biol. Chem. 272 (15): 10035–40. doi:10.1074 / jbc.272.15.10035. ISSN  0021-9258. PMID  9092546.
  18. ^ Labbé E, Letamendia A, Attisano L (červenec 2000). „Sdružení Smadů s vazebným faktorem pro zesílení lymfoidů 1 / T-buněčný specifický faktor zprostředkovává kooperativní signalizaci prostřednictvím drah transformujícího růstového faktoru β a Wnt“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97 (15): 8358–63. Bibcode:2000PNAS ... 97,8358L. doi:10.1073 / pnas.150152697. ISSN  0027-8424. PMC  26952. PMID  10890911.
  19. ^ Feng XH, Liang YY, Liang M, Zhai W, Lin X (leden 2002). „Přímá interakce c-Myc se Smad2 a Smad3 k inhibici indukce CDG inhibitoru p15 (Ink4B) zprostředkovanou TGF-beta.“. Mol. Buňka. 9 (1): 133–43. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00430-0. ISSN  1097-2765. PMID  11804592.
  20. ^ Quinn ZA, Yang CC, Wrana JL, McDermott JC (únor 2001). „Smad proteiny fungují jako komodulátory transkripčních regulačních proteinů MEF2“. Nucleic Acids Res. 29 (3): 732–42. doi:10.1093 / nar / 29.3.732. PMC  30396. PMID  11160896.
  21. ^ Long J, Wang G, Matsuura I, He D, Liu F (leden 2004). "Aktivace transkripční aktivity Smad proteinovým inhibitorem aktivovaného STAT3 (PIAS3)". Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101 (1): 99–104. Bibcode:2004PNAS..101 ... 99L. doi:10.1073 / pnas.0307598100. ISSN  0027-8424. PMC  314145. PMID  14691252.
  22. ^ A b Nakano A, Koinuma D, Miyazawa K, Uchida T, Saitoh M, Kawabata M, Hanai J, Akiyama H, Abe M, Miyazono K, Matsumoto T, Imamura T (březen 2009). „Pin1 down-reguluje signalizaci transformačního růstového faktoru beta (TGF-beta) indukcí degradace proteinů Smad“. J. Biol. Chem. 284 (10): 6109–15. doi:10,1074 / jbc.M804659200. ISSN  0021-9258. PMID  19122240.
  23. ^ Harada J, Kokura K, Kanei-Ishii C, Nomura T, Khan MM, Kim Y, Ishii S (říjen 2003). „Požadavek interrepresorové homeodomény interagující proteinové kinázy 2 pro lyžařsky zprostředkovanou inhibici transkripční aktivace kostního morfogenetického proteinu. J. Biol. Chem. 278 (40): 38998–9005. doi:10,1074 / jbc.M307112200. ISSN  0021-9258. PMID  12874272.
  24. ^ Luo K, Stroschein SL, Wang W, Chen D, Martens E, Zhou S, Zhou Q (září 1999). „Lyžařský onkoprotein interaguje s proteiny Smad a potlačuje signalizaci TGFβ“. Genes Dev. 13 (17): 2196–206. doi:10.1101 / gad.13.17.2196. ISSN  0890-9369. PMC  316985. PMID  10485843.
  25. ^ Stroschein SL, Bonni S, Wrana JL, Luo K (listopad 2001). „Smad3 rekrutuje komplex podporující anafázu pro ubikvitinaci a degradaci SnoN“. Genes Dev. 15 (21): 2822–36. doi:10,1101 / gad. 912901 (neaktivní 2020-10-04). ISSN  0890-9369. PMC  312804. PMID  11691834.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
  26. ^ Stroschein SL, Wang W, Zhou S, Zhou Q, Luo K (říjen 1999). „Negativní zpětnovazební regulace signalizace TGF-beta pomocí onkoproteinu SnoN“. Věda. 286 (5440): 771–4. doi:10.1126 / science.286.5440.771. ISSN  0036-8075. PMID  10531062.
  27. ^ Nakao A, Imamura T, Souchelnytskyi S, Kawabata M, Ishisaki A, Oeda E, Tamaki K, Hanai J, Heldin CH, Miyazono K, ten Dijke P (září 1997). „Signalizace zprostředkovaná TGF-beta receptorem prostřednictvím Smad2, Smad3 a Smad4“. EMBO J.. 16 (17): 5353–62. doi:10.1093 / emboj / 16.17.5353. ISSN  0261-4189. PMC  1170167. PMID  9311995.
  28. ^ Lebrun JJ, Takabe K, Chen Y, Vale W (leden 1999). "Role dráhy specifické a inhibiční Smads v signalizaci receptoru aktivinu". Mol. Endokrinol. 13 (1): 15–23. doi:10.1210 / opravit. 13.1.0218. ISSN  0888-8809. PMID  9892009.
  29. ^ Lin X, Liang M, Feng XH (listopad 2000). „Smurf2 je ubikvitinová E3 ligáza zprostředkující proteazom-závislou degradaci Smad2 v transformaci signalizace růstového faktoru-beta“. J. Biol. Chem. 275 (47): 36818–22. doi:10,1074 / jbc.C000580200. ISSN  0021-9258. PMID  11016919.
  30. ^ Bonni S, Wang HR, Causing CG, Kavsak P, Stroschein SL, Luo K, Wrana JL (červen 2001). „TGF-beta indukuje sestavení komplexu ubikvitin ligázy Smad2-Smurf2, který je zaměřen na degradaci SnoN“. Nat. Cell Biol. 3 (6): 587–95. doi:10.1038/35078562. ISSN  1465-7392. PMID  11389444. S2CID  23270947.
  31. ^ Leong GM, Subramaniam N, Figueroa J, Flanagan JL, Hayman MJ, Eisman JA, Kouzmenko AP (květen 2001). „Protein interagující s lyžemi interaguje s proteiny Smad a zvyšuje transkripci závislou na transformačním růstovém faktoru beta“. J. Biol. Chem. 276 (21): 18243–8. doi:10,1074 / jbc.M010815200. ISSN  0021-9258. PMID  11278756.
  32. ^ Datta PK, Moses HL (květen 2000). „STRAP a Smad7 Synergizují při inhibici transformace růstového faktoru β. Mol. Buňka. Biol. 20 (9): 3157–67. doi:10.1128 / MCB.20.9.3157-3167.2000. ISSN  0270-7306. PMC  85610. PMID  10757800.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.