NFATC2 - NFATC2

NFATC2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1A02, 1OWR, 1P7H, 1PZU, 2AS5, 2O93, 3QRF
Identifikátory
Aliasy	NFATC2, NFAT1, NFATP, jaderný faktor aktivovaných T-buněk 2, jaderný faktor aktivovaných T buněk 2
Externí ID	OMIM: 600490 MGI: 102463 HomoloGene: 7861 Genové karty: NFATC2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	51,562,831 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	168,601,657 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru; • vazba chromatinu; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • transkripce regulační oblasti sekvenčně specifické vazby DNA; • vazba fosfatázy; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • nukleární chromatin; • cytosol; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• Signální dráha receptoru B buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • produkce cytokinů; • kalcineurin-NFAT signalizační kaskáda; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • vývoj buněk myotube; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • pozitivní regulace fúze myoblastů; • pozitivní regulace genové exprese; • pozitivní regulace proliferace B buněk; • migrace buněk; • reakce na drogu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace regulační diferenciace T buněk; • negativní regulace diferenciace buněk hladkého svalstva cév;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4773
	18019
	ENSG00000101096
	ENSMUSG00000027544
	Q13469
	Q60591
NM_001136021; NM_001258292; NM_001258294; NM_001258295; NM_001258296;
	NM_001258297; NM_012340; NM_173091
NM_001037177; NM_001037178; NM_001136073; NM_001291168; NM_001291169;
	NM_001291170; NM_001291171; NM_001291172; NM_001291173; NM_001291174; NM_001291175; NM_001291176; NM_001291177; NM_001291178; NM_001291179; NM_010899
NP_001129493; NP_001245221; NP_001245223; NP_001245224; NP_001245225;
	NP_001245226; NP_036472; NP_775114
NP_001032254; NP_001032255; NP_001129545; NP_001278097; NP_001278098;
	NP_001278099; NP_001278100; NP_001278101; NP_001278102; NP_001278103; NP_001278104; NP_001278105; NP_001278106; NP_001278107; NP_001278108; NP_035029
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Jaderný faktor aktivovaných T-buněk, cytoplazmatický 2 je protein že u lidí je kódován NFATC2 gen.^[5]

Funkce

Tento gen je členem jaderného faktoru aktivovaných T buněk (NFAT ) rodina. Produktem tohoto genu je a Protein vázající DNA s regionem REL-homologie (RHR) a regionem NFAT-homologie (NHR). Tento protein je přítomen v cytosol a translokuje se pouze do jádra po stimulaci receptoru T buněk (TCR), kde se stává členem nukleárních faktorů aktivovaného transkripčního komplexu T buněk. Tento komplex hraje ústřední roli při indukci transkripce genů během imunitní odpovědi. Byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty kódující různé izoformy.^[6]

Klinický význam

Translokace tvořící produkt fúze v rámci mezi Gen EWSR1 a gen NFATc2 byl popsán v kostním tumoru s klinickým vzhledem podobným Ewingovu sarkomu. Bod zlomu translokace vedl ke ztrátě řídících prvků proteinu NFATc2 a fúze N terminální oblasti genu EWSR1 poskytla konstantní aktivaci proteinu.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že NFATC2 komunikovat s MEF2D,^[8] EP300,^[9] IRF4^[10] a Protein kináza Mζ.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101096 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027544 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Northrop JP, Ho SN, Chen L, Thomas DJ, Timmerman LA, Nolan GP, Admon A, Crabtree GR (červen 1994). "NF-AT komponenty definují rodinu transkripčních faktorů cílených na aktivaci T-buněk". Příroda. 369 (6480): 497–502. Bibcode:1994Natur.369..497N. doi:10.1038 / 369497a0. PMID 8202141. S2CID 9920546.
^ "Entrez Gene: NFATC2 jaderný faktor aktivovaných T-buněk, cytoplazmatický, na kalcineurinu závislý 2".
^ Szuhai K, Ijszenga M, de Jong D, Karseladze A, Tanke HJ, Hogendoorn PC (duben 2009). „Gen NFATc2 se podílí na nové klonované translokaci ve variantě Ewingova sarkomu, která spojuje jeho funkci v imunologii s onkologií.“. Klinický výzkum rakoviny. 15 (7): 2259–68. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-08-2184. PMID 19318479.
^ Youn HD, Chatila TA, Liu JO (srpen 2000). „Integrace signálů kalcineurinu a MEF2 koaktivátorem p300 během apoptózy T-buněk“. Časopis EMBO. 19 (16): 4323–31. doi:10.1093 / emboj / 19.16.4323. PMC 302027. PMID 10944115.
^ García-Rodríguez C, Rao A (červen 1998). "Nukleární faktor aktivovaných T buněk (NFAT) - závislá transaktivace regulovaná koaktivátory p300 / CREB-vazebný protein (CBP)". The Journal of Experimental Medicine. 187 (12): 2031–6. doi:10.1084 / jem.187.12.2031. PMC 2212364. PMID 9625762.
^ Rengarajan J, Mowen KA, McBride KD, Smith ED, Singh H, Glimcher LH (duben 2002). „Interferonový regulační faktor 4 (IRF4) interaguje s NFATc2 za účelem modulace genové exprese interleukinu 4“. The Journal of Experimental Medicine. 195 (8): 1003–12. doi:10.1084 / jem.20011128. PMC 2193700. PMID 11956291.
^ San-Antonio B, Iñiguez MA, Fresno M (červenec 2002). "Protein kináza Czeta fosforyluje jaderný faktor aktivovaných T buněk a reguluje jeho transaktivační aktivitu". The Journal of Biological Chemistry. 277 (30): 27073–80. doi:10,1074 / jbc.M106983200. PMID 12021260.

Další čtení

Rao A, Luo C, Hogan PG (1997). "Transkripční faktory rodiny NFAT: regulace a funkce". Výroční přehled imunologie. 15: 707–747. doi:10.1146 / annurev.immunol.15.1.707. PMID 9143705.
Crabtree GR (březen 1999). "Obecné signály a specifické výsledky: signalizace přes Ca2 +, kalcineurin a NF-AT". Buňka. 96 (5): 611–614. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80571-1. PMID 10089876. S2CID 8817053.
Horsley V, Pavlath GK (březen 2002). „NFAT: všudypřítomný regulátor buněčné diferenciace a adaptace“. The Journal of Cell Biology. 156 (5): 771–774. doi:10.1083 / jcb.200111073. PMC 2173310. PMID 11877454.
Aramburu J, Azzoni L, Rao A, Perussia B (září 1995). „Aktivace a exprese jaderných faktorů aktivovaných T buněk, NFATp a NFATc, v lidských přirozených zabíječských buňkách: regulace po navázání ligandu CD16“. The Journal of Experimental Medicine. 182 (3): 801–810. doi:10.1084 / jem.182.3.801. PMC 2192167. PMID 7650486.
Auffray C, Behar G, Bois F, Bouchier C, Da Silva C, Devignes MD, Duprat S, Houlgatte R, Jumeau MN, Lamy B (únor 1995). "[OBRÁZEK: molekulární integrace analýzy lidského genomu a jeho exprese]". Comptes Rendus de l'Académie des Sciences, Série III. 318 (2): 263–72. PMID 7757816.
Li X, Ho SN, Luna J, Giacalone J, Thomas DJ, Timmerman LA, Crabtree GR, Francke U (1995). "Klonování a chromozomální lokalizace lidských a myších genů pro transkripční faktory T-buněk NFATc a NFATp". Cytogenetika a buněčná genetika. 68 (3–4): 185–191. doi:10.1159/000133910. PMID 7842733.
Ho S, Timmerman L, Northrop J, Crabtree GR (1995). „Klonování a charakterizace NF-ATc a NF-ATp: cytoplazmatické složky NF-AT“. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 365: 167–73. doi:10.1007/978-1-4899-0987-9_17. ISBN 978-1-4899-0989-3. PMID 7887301.
Jabado N, Le Deist F, Fisher A, Hivroz C (listopad 1994). „Interakce HIV gp120 a anti-CD4 protilátek s molekulou CD4 na lidských CD4 + T buňkách inhibuje vazebnou aktivitu NF-AT, NF-kappa B a AP-1, tří jaderných faktorů regulujících aktivitu zesilovače genu interleukinu-2“. European Journal of Immunology. 24 (11): 2646–2652. doi:10.1002 / eji.1830241112. PMID 7957556.
Vacca A, Farina M, Maroder M, Alesse E, Screpanti I, Frati L, Gulino A (listopad 1994). „Virus lidské imunodeficience typu 1 zvyšuje aktivitu promotoru interleukinu-2 prostřednictvím synergismu s forbolesterem a vápníkem zprostředkovanou aktivací NF-AT cis-regulačního motivu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 205 (1): 467–474. doi:10.1006 / bbrc.1994.2689. PMID 7999066.
Jain J, McCaffrey PG, Miner Z, Kerppola TK, Lambert JN, Verdine GL, Curran T, Rao A (září 1993). „Transkripční faktor T-buněk NFATp je substrátem pro kalcineurin a interaguje s Fos a Jun“. Příroda. 365 (6444): 352–355. Bibcode:1993 Natur.365..352J. doi:10.1038 / 365352a0. PMID 8397339. S2CID 4283223.
Luo C, Burgeon E, Carew JA, McCaffrey PG, Badalian TM, Lane WS, Hogan PG, Rao A (červenec 1996). „Rekombinantní NFAT1 (NFATp) je regulován kalcineurinem v T buňkách a zprostředkovává transkripci několika cytokinových genů“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (7): 3955–66. doi:10,1128 / mcb.16.7.3955. PMC 231392. PMID 8668213.
Di Somma MM, Majolini MB, Burastero SE, Telford JL, Baldari CT (září 1996). „Cyklosporin Citlivost dlouhého terminálního opakování HIV-1 identifikuje odlišné dráhy závislé na p56lck aktivované spouštěním CD4“. European Journal of Immunology. 26 (9): 2181–2188. doi:10.1002 / eji.1830260933. PMID 8814265.
Copeland KF, McKay PJ, Rosenthal KL (leden 1996). „Potlačení dlouhého terminálního opakování viru lidské imunodeficience CD8 + T buňkami závisí na prvku NFAT-1.“ Výzkum AIDS a lidské retroviry. 12 (2): 143–148. doi:10.1089 / podpora.1996.12.143. PMID 8834464.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Hodge MR, Chun HJ, Rengarajan J, Alt A, Lieberson R, Glimcher LH (prosinec 1996). „NF-AT-řízená transkripce interleukinu-4 potencovaná NIP45“. Věda. 274 (5294): 1903–1905. Bibcode:1996Sci ... 274.1903H. doi:10.1126 / science.274.5294.1903. PMID 8943202. S2CID 29436825.
Lyakh L, Ghosh P, Rice NR (květen 1997). "Exprese proteinů rodiny NFAT v normálních lidských T buňkách". Molekulární a buněčná biologie. 17 (5): 2475–84. doi:10,1128 / mcb.17.5.2475. PMC 232096. PMID 9111316.
Amasaki Y, Masuda ES, Imamura R, Arai K, Arai N (březen 1998). „Odlišné proteiny rodiny NFAT jsou zapojeny do jaderných komplexů vázajících NFAT-DNA z podskupin lidských thymocytů“. Journal of Immunology. 160 (5): 2324–33. PMID 9498773.
Chen L, Glover JN, Hogan PG, Rao A, Harrison SC (březen 1998). "Struktura domén vázajících DNA z NFAT, Fos a Jun se specificky váže na DNA". Příroda. 392 (6671): 42–48. Bibcode:1998 Natur.392 ... 42C. doi:10.1038/32100. PMID 9510247. S2CID 4305535.