TBPL1 - TBPL1

TBPL1
Identifikátory
Aliasy	TBPL1, MGC: 8389, MGC: 9620, STUD, TLF, TLP, TRF2, TATA-box binding protein like 1
Externí ID	OMIM: 605521 MGI: 1339946 HomoloGene: 3577 Genové karty: TBPL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	133,990,432 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	22,731,938 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba DNA specifické pro sekvenci jádra promotoru RNA polymerázy II; • Vazba regulační oblasti RNA polymerázy III na DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • transkripční faktor vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • transkripční faktor TFIIA komplex; • buněčné jádro; • komplex transkripčního faktoru TFIIIB; • komplex regulátoru transkripce; • transkripční faktor TFIID komplex;
Biologický proces	• diferenciace spermatidových jader; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • sestava akrozomu; • dTTP biosyntetický proces; • transkripce, chráněná DNA; • spermatogeneze; • Transkripce s templátem DNA, iniciace; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Sestava transkripčního preiniciačního komplexu RNA polymeráza III;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9519
	237336
	ENSG00000028839
	ENSMUSG00000071359
	P62380; Q7Z6T9
	P62340
	NM_004865; NM_001253676
	NM_011603
	NP_001240605; NP_004856
	NP_035733
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

TATA box-binding protein-like protein 1 je protein že u lidí je kódován TBPL1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Zahájení transkripce RNA polymerázou II vyžaduje aktivity více než 70 polypeptidů. Protein, který koordinuje tyto aktivity, je transkripční faktor IID (TFIID), který se váže na promotor jádra, aby správně umístil polymerázu, slouží jako kostra pro sestavení zbytku transkripčního komplexu a působí jako kanál pro regulační signály. TFIID se skládá z proteinu vázajícího TATA (TBP) a skupiny evolučně konzervovaných proteinů známých jako faktory spojené s TBP nebo TAF. TAF se mohou účastnit bazální transkripce, sloužit jako koaktivátory, fungovat při rozpoznávání promotoru nebo modifikovat obecné transkripční faktory (GTF), aby se usnadnilo složité sestavení a zahájení transkripce. Tento gen kóduje protein, který má stejnou funkci jako TBP a nahrazuje TBP u některých promotorů, které TFIID nerozpoznává. Je nezbytný pro spermiogenezi a považuje se za důležitý při expresi vývojově regulovaných genů.^[8]

Interakce

TBPL1 bylo prokázáno komunikovat s GTF2A1.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000028839 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000071359 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ohbayashi T, Kishimoto T, Makino Y, Shimada M, Nakadai T, Aoki T, Kawata T, Niwa S, Tamura T (únor 1999). "Izolace cDNA, mapování chromozomů a exprese lidského proteinu podobného TBP". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 255 (1): 137–42. doi:10.1006 / bbrc.1999.0159. PMID 10082669.
^ Rabenstein MD, Zhou S, Lis JT, Tjian R (duben 1999). „TATA box-binding protein (TBP) související s faktorem 2 (TRF2), třetí člen rodiny TBP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (9): 4791–6. Bibcode:1999PNAS ... 96.4791R. doi:10.1073 / pnas.96.9.4791. PMC 21770. PMID 10220372.
^ Chong JA, Moran MM, Teichmann M, Kaczmarek JS, Roeder R, Clapham DE (duben 2005). „Faktor podobný TATA-vázajícímu proteinu (TBP) (TLF) je funkční regulátor transkripce: reciproční regulace genů neurofibromatózy typu 1 a c-fos pomocí TLF / TRF2 a TBP“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (7): 2632–43. doi:10.1128 / MCB.25.7.2632-2643.2005. PMC 1061635. PMID 15767669.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TBPL1 TBP-like 1“.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Teichmann M, Wang Z, Martinez E, Tjernberg A, Zhang D, Vollmer F, Chait BT, Roeder RG (listopad 1999). „Lidský TATA-vázající protein-příbuzný faktor-2 (hTRF2) se stabilně asociuje s hTFIIA v HeLa buňkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (24): 13720–5. Bibcode:1999PNAS ... 9613720T. doi:10.1073 / pnas.96.24.13720. PMC 24131. PMID 10570139.

Další čtení

Ohbayashi T, Makino Y, Tamura TA (únor 1999). „Identifikace myšího proteinu podobného TBP (TLP) vzdáleně souvisejícího s faktorem souvisejícím s TBP drosophila“. Výzkum nukleových kyselin. 27 (3): 750–5. doi:10.1093 / nar / 27.3.750. PMC 148243. PMID 9889269.
Teichmann M, Wang Z, Martinez E, Tjernberg A, Zhang D, Vollmer F, Chait BT, Roeder RG (listopad 1999). „Lidský TATA-vázající protein-příbuzný faktor-2 (hTRF2) se stabilně asociuje s hTFIIA v HeLa buňkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (24): 13720–5. Bibcode:1999PNAS ... 9613720T. doi:10.1073 / pnas.96.24.13720. PMC 24131. PMID 10570139.
Martianov I, Brancorsini S, Gansmuller A, Parvinen M, Davidson I, Sassone-Corsi P (únor 2002). „Výrazné funkce TBP a TLF / TRF2 během spermatogeneze: požadavek TLF na tvorbu heterochromatického chromocentra v haploidních kulatých spermatidech“. Rozvoj. 129 (4): 945–55. PMID 11861477.
Kieffer-Kwon P, Martianov I, Davidson I (říjen 2004). „Buněčně specifická nukleolární lokalizace faktoru 2 souvisejícího s TBP“. Molekulární biologie buňky. 15 (10): 4356–68. doi:10,1091 / mbc.E04-02-0138. PMC 519132. PMID 15269281.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

externí odkazy

TBPL1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000028839 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000071359 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10082669-5] Ohbayashi T, Kishimoto T, Makino Y, Shimada M, Nakadai T, Aoki T, Kawata T, Niwa S, Tamura T (únor 1999). "Izolace cDNA, mapování chromozomů a exprese lidského proteinu podobného TBP". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 255 (1): 137–42. doi:10.1006 / bbrc.1999.0159. PMID 10082669.

[pmid10220372-6] Rabenstein MD, Zhou S, Lis JT, Tjian R (duben 1999). „TATA box-binding protein (TBP) související s faktorem 2 (TRF2), třetí člen rodiny TBP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (9): 4791–6. Bibcode:1999PNAS ... 96.4791R. doi:10.1073 / pnas.96.9.4791. PMC 21770. PMID 10220372.

[pmid15767669-7] Chong JA, Moran MM, Teichmann M, Kaczmarek JS, Roeder R, Clapham DE (duben 2005). „Faktor podobný TATA-vázajícímu proteinu (TBP) (TLF) je funkční regulátor transkripce: reciproční regulace genů neurofibromatózy typu 1 a c-fos pomocí TLF / TRF2 a TBP“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (7): 2632–43. doi:10.1128 / MCB.25.7.2632-2643.2005. PMC 1061635. PMID 15767669.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: TBPL1 TBP-like 1“.

[pmid17353931-9] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid10570139-10] Teichmann M, Wang Z, Martinez E, Tjernberg A, Zhang D, Vollmer F, Chait BT, Roeder RG (listopad 1999). „Lidský TATA-vázající protein-příbuzný faktor-2 (hTRF2) se stabilně asociuje s hTFIIA v HeLa buňkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (24): 13720–5. Bibcode:1999PNAS ... 9613720T. doi:10.1073 / pnas.96.24.13720. PMC 24131. PMID 10570139.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]