MAFF (gen) - MAFF (gene)

MAFF
Identifikátory
AliasyMAFF, U-MAF, hMafF, MAF bZIP transkripční faktor F
Externí IDOMIM: 604877 MGI: 96910 HomoloGene: 7825 Genové karty: MAFF
Umístění genu (člověk)
Chromozom 22 (lidský)
Chr.Chromozom 22 (lidský)[1]
Chromozom 22 (lidský)
Genomické umístění pro MAFF
Genomické umístění pro MAFF
Kapela22q13.1Start38,200,767 bp[1]
Konec38,216,507 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE MAFF 36711 na fs.png

PBB GE MAFF 205193 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

23764

17133

Ensembl

ENSG00000185022

ENSMUSG00000042622

UniProt

Q9ULX9

O54791

RefSeq (mRNA)

NM_152878
NM_001161572
NM_001161573
NM_001161574
NM_012323

NM_010755
NM_001304830
NM_001304831
NM_001304832

RefSeq (protein)

NP_001155044
NP_001155045
NP_001155046
NP_036455

NP_001291759
NP_001291760
NP_001291761
NP_034885

Místo (UCSC)Chr 22: 38,2 - 38,22 MbChr 15: 79,35 - 79,36 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš
Struktury proteinů rodiny Maf.

Transkripční faktor MafF je bZip Maf transkripční faktor protein že u lidí je kódován MAFF gen.[5][6]

MafF je jedním z malý maf proteiny, které jsou základní oblastí a leucinový zip Transkripční faktory typu (bZIP). Genový název schválený Výborem pro genovou nomenklaturu HUGO MAFF je „v-maf ptačí muskuloaponeurotický fibrosarkom onkogenní homolog F“.

Objev

MafF byl poprvé klonován a identifikován u kuřat v roce 1993 jako člen malých genů Maf (sMaf).[5] MAFF byl identifikován u mnoha obratlovců, včetně lidí.[6] U obratlovců existují tři funkčně redundantní proteiny sMaf, MafF, MafG, a MafK.

Struktura

MafF má strukturu bZIP, která se skládá ze základní oblasti pro vazbu DNA a struktury leucinového zipu pro tvorbu dimeru.[5] Podobně jako u jiných sMafs, MafF postrádá jakékoli kanonické transkripční aktivační domény.[5]

Výraz

MAFF je široce, ale rozdílně exprimován v různých tkáních. MAFF exprese byla detekována ve všech 16 tkáních vyšetřovaných lidským BodyMap Project, ale relativně hojná v tkáních tukového, tlustého, plicního, prostatického a kosterního svalstva.[7] Člověk MAFF Gen je indukován prozánětlivými cytokiny, interleukinem 1 beta a faktorem nekrózy nádoru v myometriálních buňkách.[8]

Funkce

Z důvodu podobnosti sekvencí nebyly pozorovány žádné funkční rozdíly mezi sMafs, pokud jde o jejich bZIP struktury. sMaf tvoří samy homodimery a heterodimery s dalšími specifickými transkripčními faktory bZIP, jako jsou proteiny CNC (cap 'n' límec) [p45 NF-E2 (NFE2 ), Nrf1 (NFE2L1 ), Nrf2 (NFE2L2 ) a Nrf3 (NFE2L3 )][9][10][11][12] a Bachovy proteiny (BACH1 a BACH2 ).[13]

Cílové geny

sMaf regulují různé cílové geny v závislosti na svých partnerech. Například heterodimer p45-NF-E2-sMaf reguluje geny odpovědné za produkci krevních destiček.[9][14][15] Heterodimer Nrf2-sMaf reguluje řadu cytoprotektivních genů, jako jsou geny pro antioxidační / xenobiotické metabolizující enzymy.[11][16] Heterodimer Bach1-sMaf reguluje gen heme oxygenázy-1.[13] Zejména bylo hlášeno, že MafF reguluje gen receptoru pro oxytocin.[17] Příspěvek jednotlivých sMaf k transkripční regulaci jejich cílových genů nebyl dosud dobře prozkoumán.

Vazba nemoci

Ztráta sMafs má za následek fenotypy podobné chorobám, jak je shrnuto v tabulce níže. Myši bez MafF jsou v laboratorních podmínkách zdánlivě zdravé.[18] Myši bez MafG však vykazují mírný neuronální fenotyp a mírnou trombocytopenii,[19] chybí myši Mafg a jedna alela Mafk (Mafg−/−:: Mafk+/−) vykazují progresivní neuronální degeneraci, trombocytopenii a kataraktu,[20][21] a myši postrádající MafG a MafK (Mafg−/−:: Mafk−/−) vykazují závažnější neuronální degeneraci a umírají v perinatálním stadiu.[22] Myši postrádající MafF, MafG a MafK jsou embryonální letální, což ukazuje, že MafF je pro embryonální vývoj nepostradatelný.[23] Embryonální fibroblasty, z nichž jsou odvozeny Maff−/−:: Mafg-/−:: Mafk−/− myši v reakci na stres neaktivují cytoprotektivní geny závislé na Nrf2.[16]

GenotypMyší fenotyp
MaffMafgMafk
−/−Žádný zjevný fenotyp za laboratorních podmínek [18]
−/−Mírná motorická ataxie, mírná trombocytopenie [19]
−/−+/−Těžká motorická ataxie, progresivní neuronální degenerace, těžká trombocytopenie a katarakta [20][21]
−/−−/−Závažnější neuronální fenotypy a perinatální smrtelné [22]
−/−+/−−/−Žádná závažná abnormalita [23] (Úrodná)
−/−−/−−/−Zpomalení růstu, hypoplázie jater plodu a smrtící kolem embryonálního dne, 13.5 [23]
+/− (heterozygot ), −/− (homozygot ), prázdné (divoký typ)

Hromadění důkazů navíc naznačuje, že jako partneři proteinů CNC a Bach se sMaf podílejí na vzniku a progresi různých lidských onemocnění, včetně neurodegenerace, arteriosklerózy a rakoviny.

Viz také

Poznámky

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185022 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042622 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C d Fujiwara KT, Kataoka K, Nishizawa M (září 1993). „Dva noví členové rodiny onkogenů maf, mafK a mafF, kódují jaderné proteiny b-Zip bez domnělé domény trans-aktivátoru“. Onkogen. 8 (9): 2371–80. PMID  8361754.
  6. ^ A b „Entrez Gene: MAFF v-maf muskuloaponeurotický fibrosarkom onkogenní homolog F (ptačí)“.
  7. ^ Petryszak R, Burdett T, Fiorelli B, Fonseca NA, Gonzalez-Porta M, Hastings E, Huber W, Jupp S, Keays M, Kryvych N, McMurry J, Marioni JC, Malone J, Megy K, Rustici G, Tang AY, Taubert J, Williams E, Mannion O, Parkinson HE, Brazma A (leden 2014). „Aktualizace Expression Atlas - databáze genové a transkripční exprese z experimentů funkční genomiky založených na čipech a sekvencích“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (Problém s databází): D926-32. doi:10.1093 / nar / gkt1270. PMC  3964963. PMID  24304889.
  8. ^ Massrieh W, Derjuga A, Doualla-Bell F, Ku CY, Sanborn BM, Blank V (duben 2006). „Regulace transkripčního faktoru MAFF prozánětlivými cytokiny v myometriálních buňkách“. Biologie reprodukce. 74 (4): 699–705. doi:10.1095 / biolreprod.105.045450. PMID  16371591. S2CID  11823930.
  9. ^ A b Igarashi K, Kataoka K, Itoh K, Hayashi N, Nishizawa M, Yamamoto M (únor 1994). „Regulace transkripce dimerizací erytroidního faktoru NF-E2 p45 s malými proteiny Maf“. Příroda. 367 (6463): 568–72. Bibcode:1994Natur.367..568I. doi:10.1038 / 367568a0. PMID  8107826. S2CID  4339431.
  10. ^ Johnsen O, Murphy P, Prydz H, Kolsto AB (leden 1998). „Interakce faktoru CNC-bZIP TCF11 / LCR-F1 / Nrf1 s MafG: výběr vazebného místa a regulace transkripce“. Výzkum nukleových kyselin. 26 (2): 512–20. doi:10.1093 / nar / 26.2.512. PMC  147270. PMID  9421508.
  11. ^ A b Itoh K, Chiba T, Takahashi S, Ishii T, Igarashi K, Katoh Y, Oyake T, Hayashi N, Satoh K, Hatayama I, Yamamoto M, Nabeshima Y (červenec 1997). „Nrf2 / malý Maf heterodimer zprostředkovává indukci genů detoxikačního enzymu fáze II prostřednictvím prvků antioxidační odpovědi“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 236 (2): 313–22. doi:10.1006 / bbrc.1997.6943. PMID  9240432.
  12. ^ Kobayashi A, Ito E, Toki T, Kogame K, Takahashi S, Igarashi K, Hayashi N, Yamamoto M (březen 1999). „Molekulární klonování a funkční charakterizace nového transkripčního faktoru rodiny Cap'n 'límců Nrf3“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (10): 6443–52. doi:10.1074 / jbc.274.10.6443. PMID  10037736.
  13. ^ A b Oyake T, Itoh K, Motohashi H, Hayashi N, Hoshino H, Nishizawa M, Yamamoto M, Igarashi K (listopad 1996). „Bachovy proteiny patří do nové rodiny transkripčních faktorů BTB-základního leucinového zipu, které interagují s MafK a regulují transkripci přes NF-E2 místo“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (11): 6083–95. doi:10.1128 / mcb.16.11.6083. PMC  231611. PMID  8887638.
  14. ^ Shavit JA, Motohashi H, Onodera K, Akasaka J, Yamamoto M, Engel JD (červenec 1998). „Zhoršená megakaryopoéza a poruchy chování u mutovaných myší s nulovou hodnotou mafG“. Geny a vývoj. 12 (14): 2164–74. doi:10.1101 / gad.12.14.2164. PMC  317009. PMID  9679061.
  15. ^ Shivdasani RA, Rosenblatt MF, Zucker-Franklin D, Jackson CW, Hunt P, Saris CJ, Orkin SH (červen 1995). „Transkripční faktor NF-E2 je vyžadován pro tvorbu krevních destiček nezávisle na působení trombopoetinu / MGDF při vývoji megakaryocytů.“ Buňka. 81 (5): 695–704. doi:10.1016/0092-8674(95)90531-6. PMID  7774011. S2CID  14195541.
  16. ^ A b Katsuoka F, Motohashi H, Ishii T, Aburatani H, Engel JD, Yamamoto M (září 2005). „Genetický důkaz, že malé proteiny maf jsou nezbytné pro aktivaci genů závislých na antioxidační odezvě na prvku“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (18): 8044–51. doi:10.1128 / MCB.25.18.8044-8051.2005. PMC  1234339. PMID  16135796.
  17. ^ Kimura T, Ivell R, Rust W, Mizumoto Y, Ogita K, Kusui C, Matsumura Y, Azuma C, Murata Y (říjen 1999). „Molekulární klonování lidského homologu MafF, který se specificky váže na gen pro oxytocinový receptor v termínu myometrium“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 264 (1): 86–92. doi:10.1006 / bbrc.1999.1487. PMID  10527846.
  18. ^ A b Onodera K, Shavit JA, Motohashi H, Katsuoka F, Akasaka JE, Engel JD, Yamamoto M (červenec 1999). "Charakterizace myšího genu mafF". The Journal of Biological Chemistry. 274 (30): 21162–9. doi:10.1074 / jbc.274.30.21162. PMID  10409670.
  19. ^ A b Shavit JA, Motohashi H, Onodera K, Akasaka J, Yamamoto M, Engel JD (červenec 1998). „Zhoršená megakaryopoéza a poruchy chování u mutovaných myší s nulovou hodnotou mafG“. Geny a vývoj. 12 (14): 2164–74. doi:10.1101 / gad.12.14.2164. PMC  317009. PMID  9679061.
  20. ^ A b Katsuoka F, Motohashi H, Tamagawa Y, Kure S, Igarashi K, Engel JD, Yamamoto M (únor 2003). „Malé mutanty sloučeniny Maf vykazují degeneraci neuronů centrálního nervového systému, aberantní transkripci a nesprávnou lokalizaci Bachova proteinu shodnou s myoklonem a abnormální vyděšenou odpovědí“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (4): 1163–74. doi:10.1128 / mcb.23.4.1163-1174.2003. PMC  141134. PMID  12556477.
  21. ^ A b Agrawal SA, Anand D, Siddam AD, Kakrana A, Dash S, Scheiblin DA, Dang CA, Terrell AM, Waters SM, Singh A, Motohashi H, Yamamoto M, Lachke SA (červenec 2015). „Složené myší mutanty transkripčních faktorů bZIP Mafg a Mafk odhalují regulační síť nekrystalických genů spojených se šedým zákalem“. Genetika člověka. 134 (7): 717–35. doi:10.1007 / s00439-015-1554-5. PMC  4486474. PMID  25896808.
  22. ^ A b Onodera K, Shavit JA, Motohashi H, Yamamoto M, Engel JD (březen 2000). „Perinatální syntetická letalita a hematopoetické defekty u sloučenin mafG :: mafK mutovaných myší“. Časopis EMBO. 19 (6): 1335–45. doi:10.1093 / emboj / 19.6.1335. PMC  305674. PMID  10716933.
  23. ^ A b C Yamazaki H, Katsuoka F, Motohashi H, Engel JD, Yamamoto M (únor 2012). „Embryonální letalita a apoptóza jater plodu u myší bez všech tří malých proteinů Maf“. Molekulární a buněčná biologie. 32 (4): 808–16. doi:10.1128 / MCB.06543-11. PMC  3272985. PMID  22158967.

Další čtení

externí odkazy