NFYC - NFYC

NFYC
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1N1J, 4AWL, 4CSR
Identifikátory
Aliasy	NFYC, CBF-C, CBFC, H1TF2A, HAP5, HSM, NF-YC, nukleární transkripční faktor Y podjednotka gama
Externí ID	OMIM: 605344 MGI: 107901 HomoloGene: 7440 Genové karty: NFYC
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	40,771,603 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	120,831,572 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru; • sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• Komplex vazebných faktorů CCAAT; • komplex protein-DNA; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • skládání bílkovin; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace procesu biosyntézy cholesterolu; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4802
	18046
	ENSG00000066136
	ENSMUSG00000032897
	Q13952
	P70353
NM_001142587; NM_001142588; NM_001142589; NM_001142590; NM_001308114;
	NM_001308115; NM_014223
NM_001048168; NM_001277095; NM_008692; NM_001357192; NM_001357193;
	NM_001357194
NP_001136059; NP_001136060; NP_001136061; NP_001136062; NP_001295043;
	NP_001295044; NP_055038
NP_001041633; NP_001264024; NP_032718; NP_001344121; NP_001344122;
	NP_001344123
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Jaderná transkripční faktor Y podjednotka gama je protein že u lidí je kódován NFYC gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je jednou podjednotkou trimerního komplexu, který tvoří vysoce konzervovaný transkripční faktor který se váže s vysokou specificitou na CCAAT motivy v promotér regiony v různých genech. Tento genový produkt, podjednotka C, tvoří těsný dimer s podjednotkou B (NFYB ), předpoklad pro podjednotku A (NFYA ) sdružení. Výsledný trimer se váže na DNA s vysokou specificitou a afinitou. Každá podjednotka B a C obsahuje a histon -jako motiv. Pozorování histonové povahy těchto podjednotek je podporováno dvěma typy důkazů; srovnání proteinových sekvencí a experimenty s mutanty. Dodatečnou regulaci, předběžně podporovanou databází EST, lze v této podjednotce představovat alternativním sestřihem.^[7]

Dva mikroRNA; miR-30c a miR-30e jsou umístěny uvnitř introny z nfyc gen. Tyto mikroRNA se aktivně transkribují při produkci lidského inzulínu beta buňky v pankreatické ostrůvky které také vykazují vysokou expresi nfyc a CDH1 geny. Exprese těchto intronových mikroRNA je nezbytná pro udržení diferencovaného fenotypu lidských ostrůvkových beta buněk. Inhibice mikroRNA rodiny miR-30 indukuje epiteliálně-mezenchymální přechod lidských buněk ostrůvků pankreatu.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že NFYC komunikovat s Moje C.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000066136 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032897 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sinha S, Maity SN, Seldin MF, de Crombrugghe B (únor 1997). "Chromozomální přiřazení a tkáňová exprese CBF-C / NFY-C, třetí podjednotky savčího faktoru vázajícího CCAAT". Genomika. 37 (2): 260–3. doi:10.1006 / geno.1996.0555. PMID 8921405.
^ Bellorini M, Zemzoumi K, Farina A, Berthelsen J, Piaggio G, Mantovani R (srpen 1997). "Klonování a exprese lidského NF-YC". Gen. 193 (1): 119–25. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00109-1. PMID 9249075.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NFYC nukleární transkripční faktor Y, gama“.
^ Joglekar MV, Patil D, Joglekar VM, Rao GV, Reddy DN, Mitnala S, Shouche Y, Hardikar AA (září – říjen 2009). „MikroRNA rodiny miR-30 propůjčují lidským buňkám pankreatu epiteliální fenotyp“. Ostrůvky. 1 (2): 137–147. doi:10,4161 / isl.1.2.9578. PMID 21099261.
^ Taira T, Sawai M, Ikeda M, Tamai K, Iguchi-Ariga SM, Ariga H (srpen 1999). „Přepínání up-and-down regulace lidské exprese genu hsp70 v závislosti na buněčném cyklu interakcí mezi c-Myc a CBF / NF-Y“. J. Biol. Chem. 274 (34): 24270–9. doi:10.1074 / jbc.274.34.24270. PMID 10446203.

Další čtení

Mantovani R (1999). "Molekulární biologie CCAAT-vazebného faktoru NF-Y". Gen. 239 (1): 15–27. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00368-6. PMID 10571030.
Martinelli R, Heintz N (1994). „H1TF2A, velká podjednotka heterodimerního transkripčního faktoru vázajícího CCAAT bohatého na glutamin podílejícího se na regulaci buněčného cyklu histonu H1“. Mol. Buňka. Biol. 14 (12): 8322–32. doi:10,1128 / mcb.14.12.8322. PMC 359371. PMID 7969168.
Nakshatri H, Bhat-Nakshatri P, Currie RA (1997). „Asociace podjednotek a DNA vazebná aktivita heterotrimerního transkripčního faktoru NF-Y je regulována buněčným redoxem“. J. Biol. Chem. 271 (46): 28784–91. doi:10.1074 / jbc.271.46.28784. PMID 8910521.
Dmitrenko V, Garifulin O, Kavsan V (1997). "Izolace a sekvenční analýza cDNA kódující podjednotku C lidského transkripčního faktoru vázajícího CCAAT". Gen. 197 (1–2): 161–3. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00255-2. PMID 9332362.
Currie RA (1998). „Funkční interakce mezi trimerizační doménou podjednotky vázající DNA NF-Y a proteinem skupiny s vysokou mobilitou HMG-I (Y)“. J. Biol. Chem. 272 (49): 30880–8. doi:10.1074 / jbc.272.49.30880. PMID 9388234.
Taira T, Sawai M, Ikeda M, Tamai K, Iguchi-Ariga SM, Ariga H (1999). „Přepínání up-and-down regulace lidské exprese genu hsp70 v závislosti na buněčném cyklu interakcí mezi c-Myc a CBF / NF-Y“. J. Biol. Chem. 274 (34): 24270–9. doi:10.1074 / jbc.274.34.24270. PMID 10446203.
Yoshida H, Okada T, Haze K, Yanagi H, Yura T, Negishi M, Mori K (2001). „Tvorba komplexu transkripčních faktorů ERSF vyvolaná stresem vyvolaným endoplazmatickým retikulem, včetně NF-Y (CBF) a aktivujících transkripčních faktorů 6alfa a 6beta, které aktivují savčí rozvinutou proteinovou odpověď“. Mol. Buňka. Biol. 21 (4): 1239–48. doi:10.1128 / MCB.21.4.1239-1248.2001. PMC 99577. PMID 11158310.
Izumi H, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (2001). "Mechanismus transkripční represe pomocí c-Myc na PDGF beta-receptoru". J. Cell Sci. 114 (Pt 8): 1533–44. PMID 11282029.
Chen F, Ogawa K, Liu X, Stringfield TM, Chen Y (2002). "Represe transaktivační aktivity Smad2 a Smad3 spojením s novou sestřihovou variantou podjednotky C-vazebného faktoru C". Biochem. J. 364 (Pt 2): 571–7. doi:10.1042 / BJ20011703. PMC 1222603. PMID 12023901.
Romier C, Cocchiarella F, Mantovani R, Moras D (2003). „Struktura NF-YB / NF-YC poskytuje pohled na vazbu DNA a regulaci transkripce faktorem CCAAT NF-Y“. J. Biol. Chem. 278 (2): 1336–45. doi:10,1074 / jbc.M209635200. PMID 12401788.
Salsi V, Caretti G, Wasner M, Reinhard W, Haugwitz U, Engeland K, Mantovani R (2003). "Interakce mezi p300 a více trimery NF-Y určují funkci promotoru cyklinu B2". J. Biol. Chem. 278 (9): 6642–50. doi:10,1074 / jbc.M210065200. PMID 12482752.
Hirose T, Sowa Y, Takahashi S, Saito S, Yasuda C, Shindo N, Furuichi K, Sakai T (2003). „Indikace Gadd45 nezávislá na p53 inhibitorem histon-deacetylázy: regulace koordinace transkripčními faktory Oct-1 a NF-Y“. Onkogen. 22 (49): 7762–73. doi:10.1038 / sj.onc.1207091. PMID 14586402.
Chattopadhyay C, Hawke D, Kobayashi R, Maity SN (2004). „Lidský p32 interaguje s B podjednotkou CCAAT-vazebného faktoru, CBF / NF-Y a inhibuje aktivaci transkripce zprostředkovanou CBF in vitro“. Nucleic Acids Res. 32 (12): 3632–41. doi:10.1093 / nar / gkh692. PMC 484179. PMID 15243141.
Wang B, Gao C, Ponder KP (2005). „C / EBPbeta přispívá k replikaci hepatocytů hlodavců vyvolané růstovým faktorem hepatocytů“. J. Hepatol. 43 (2): 294–302. doi:10.1016 / j.jhep.2005.02.029. PMID 15922473.

externí odkazy

NFYC + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000066136 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032897 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8921405-5] Sinha S, Maity SN, Seldin MF, de Crombrugghe B (únor 1997). "Chromozomální přiřazení a tkáňová exprese CBF-C / NFY-C, třetí podjednotky savčího faktoru vázajícího CCAAT". Genomika. 37 (2): 260–3. doi:10.1006 / geno.1996.0555. PMID 8921405.

[pmid9249075-6] Bellorini M, Zemzoumi K, Farina A, Berthelsen J, Piaggio G, Mantovani R (srpen 1997). "Klonování a exprese lidského NF-YC". Gen. 193 (1): 119–25. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00109-1. PMID 9249075.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: NFYC nukleární transkripční faktor Y, gama“.

[Joglekar_2009-8] Joglekar MV, Patil D, Joglekar VM, Rao GV, Reddy DN, Mitnala S, Shouche Y, Hardikar AA (září – říjen 2009). „MikroRNA rodiny miR-30 propůjčují lidským buňkám pankreatu epiteliální fenotyp“. Ostrůvky. 1 (2): 137–147. doi:10,4161 / isl.1.2.9578. PMID 21099261.

[pmid10446203-9] Taira T, Sawai M, Ikeda M, Tamai K, Iguchi-Ariga SM, Ariga H (srpen 1999). „Přepínání up-and-down regulace lidské exprese genu hsp70 v závislosti na buněčném cyklu interakcí mezi c-Myc a CBF / NF-Y“. J. Biol. Chem. 274 (34): 24270–9. doi:10.1074 / jbc.274.34.24270. PMID 10446203.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]