Transkripční faktor II E - Transcription factor II E - Wikipedia
Transkripční faktor II E (TFII E ) je jedním z několika obecné transkripční faktory které tvoří RNA polymeráza II preiniciační komplex .[1] Jedná se o tetramer dvou alfa a dvou beta řetězců a interaguje s proteiny IE63 viru TAF6 / TAFII80, ATF7IP a varicella-zoster.[2]
TFIIE rekrutuje TFIIH do iniciačního komplexu a stimuluje aktivity kinázy C-koncové domény RNA polymerázy II a aktivity TFIIH závislé na ATPáze DNA. Jak TFIIH, tak TFIIE jsou vyžadovány pro clearance promotoru RNA polymerázou.[2] Transkripční faktor II E je kódován GTF2E1 a GTF2E2 geny.[3] [4] [5] [6] TFIIE je považována za účastníka Tání DNA na promotér : obsahuje motiv zinkové pásky, který může vázat jednovláknovou DNA.[7]
Viz také Reference ^ Lewin, Benjamin (2004). Geny VIII . Upper Saddle River, NJ: Pearson Prentice Hall. str.636 –637. ISBN 0-13-144946-X . ^ A b „UniProtKB - P29083 (T2EA_HUMAN)“ . UniProt . Citováno 2016-10-19 .^ Ohkuma Y, Hashimoto S, Roeder RG, Horikoshi M (1992). "Identifikace dvou velkých subdomén v TFIIE-alfa na základě homologie mezi Xenopus a lidskými sekvencemi" . Nucleic Acids Res . 20 (21): 5838. doi :10.1093 / nar / 20.21.5838 . PMC 334425 . PMID 1454543 . ^ Heng HH, Xiao H, Shi XM, Greenblatt J, Tsui LC (1994). „Geny kódující obecné iniciační faktory pro transkripci RNA polymerázy II jsou rozptýleny v lidském genomu“. Hučení. Mol. Genet . 3 (1): 61–4. doi :10,1093 / hmg / 3,1,61 . PMID 8162052 . ^ Sumimoto H, Ohkuma Y, Sinn E, Kato H, Shimasaki S, Horikoshi M, Roeder RG (1991). "Zachované sekvenční motivy v malé podjednotce lidského obecného transkripčního faktoru TFIIE". Příroda . 354 (6352): 401–4. Bibcode :1991 Natur.354..401S . doi :10.1038 / 354401a0 . PMID 1956404 . S2CID 4288495 . ^ Ohkuma Y, Sumimoto H, Hoffmann A, Shimasaki S, Horikoshi M, Roeder RG (prosinec 1991). "Strukturální motivy a potenciální homologie sigma ve velké podjednotce lidského obecného transkripčního faktoru TFIIE". Příroda . 354 (6352): 398–401. doi :10.1038 / 354398a0 . PMID 1956403 . S2CID 4325438 . ^ Lee TI, Young RA (2000). "Transkripce genů kódujících eukaryotický protein". Annu. Genet . 34 : 77–137. doi :10.1146 / annurev.genet.34.1.77 . PMID 11092823 . externí odkazy Signalizační cesty Agenti
Podle vzdálenosti Další pojmy
(1) Základní domény
(1.1) Základní leucinový zip (bZIP )(1.2) Základní šroubovice-smyčka-šroubovice (bHLH )
Skupina A Skupina B Skupina C bHLH-PAS Skupina D Skupina E Skupina F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
(2) Zinkový prst Domény vázající DNA
(2.1) Jaderný receptor (Cys4 )
podčeleď 1 podčeleď 2 podčeleď 3 podčeleď 4 podčeleď 5 podčeleď 6 podčeleď 0
(2.2) Ostatní Cys4 (2.3) Cys2 Jeho2 (2.4) Cys6 (2.5) Střídavé složení (2.6) NEBEZPEČNÉ
(4) Faktory β-lešení s malými kontakty drážky
(0) Další transkripční faktory
viz také nedostatky transkripčního faktoru / koregulátoru