HOXA5 - HOXA5

HOXA5
Protein HOXA5 PDB 1hom.png
Identifikátory
AliasyHOXA5, HOX1, HOX1.3, HOX1C, homeobox A5
Externí IDOMIM: 142952 MGI: 96177 HomoloGene: 40726 Genové karty: HOXA5
Umístění genu (člověk)
Chromozom 7 (lidský)
Chr.Chromozom 7 (lidský)[1]
Chromozom 7 (lidský)
Genomické umístění pro HOXA5
Genomické umístění pro HOXA5
Kapela7p15.2Start27,141,052 bp[1]
Konec27,143,681 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE HOXA5 213844 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

3202

15402

Ensembl

ENSG00000106004

ENSMUSG00000038253

UniProt

P20719

P09021

RefSeq (mRNA)

NM_019102

NM_010453

RefSeq (protein)

NP_061975

NP_034583

Místo (UCSC)Chr 7: 27,14 - 27,14 MbChr 6: 52,2 - 52,2 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-A5 je protein že u lidí je kódován HOXA5 gen.[5][6][7]

Funkce

U obratlovců geny kódující třídu transkripční faktory volala homeobox geny se nacházejí ve shlucích A, B, C a D na čtyřech samostatných chromozomech. Exprese těchto proteinů je během embryonálního vývoje regulována prostorově a časově. Tento gen je součástí klastru A na chromozomu 7 a kóduje transkripční faktor vázající DNA, který může regulovat genovou expresi, morfogeneze a diferenciace. Methylace tohoto genu může mít za následek ztrátu jeho exprese a protože kódovaný protein upreguluje tumor supresor p53, tento protein může hrát důležitou roli v tumorigeneze.[7]

HoxA5 je ovládán, alespoň částečně, pomocí Methylace DNA.[8] Bylo prokázáno, že HoxA5 upreguluje tumor supresor p53 a AKT1 downregulací PTEN.[9] Ukázalo se, že potlačení HoxA5 tlumí hemangiom růst.[10] HoxA5 má dalekosáhlé účinky na genovou expresi a způsobuje indukci ~ 300 genů po indukci v buněčných liniích rakoviny prsu.[11] Nadměrná exprese domény proteinu HoxA5 zabraňuje zánětu projevenému inhibicí TNFa -indukovatelný monocyt vázající se na HUVEC.[12][13]

Srovnání HoxA5 promotér methylační profil napříč buněčnými typy od nejméně diferencovaných (lidské embryonální kmenové buňky) po nejvíce endoteliální (lidské endoteliální buňky z pupečníkové žíly nebo HUVEC) ukazuje, že promotor HoxA5 je normálně silně methylován v nediferencovaných buňkách a stává se demetylovaným jako buňky rozlišit endoteliální linie.[14] HoxA5 obsahuje a C-Amp Response Elements (CRE) ve svém promotoru.[8] POL2 a CTCF vazby jsou obohaceny na CpG - hustý HoxA5 promotor v HUVEC, prokazující transkripční aktivitu.[14]

Klinický význam

HoxA5 je potlačen v Akutní myeloidní leukémie (AML) a DNMT inhibitor decitabin (5Aza) se používá k léčbě tohoto onemocnění. I když je známo, že HoxA5 je hypermethylován v AML, dosud nebylo prokázáno, zda je decitabin přímo zaměřen na tyto geny pro demethylaci.[15][16]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106004 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038253 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ McAlpine PJ, Ukazuje TB (červenec 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID  1973146.
  6. ^ Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID  1358459. S2CID  13370372.
  7. ^ A b „Entrez Gene: HOXA5 homeobox A5“.
  8. ^ A b Dunn J, Thabet S, Jo H (červenec 2015). „Methylace epigenetické DNA závislá na průtoku při expresi endoteliálních genů a ateroskleróze“. Arterioskleróza, trombóza a vaskulární biologie. 35 (7): 1562–9. doi:10.1161 / ATVBAHA.115.305042. PMC  4754957. PMID  25953647.
  9. ^ Arderiu G, Cuevas I, Chen A, Carrio M, East L, Boudreau NJ (2007). „HoxA5 stabilizuje adherenční křižovatky zvýšením Akt1“. Buněčná adheze a migrace. 1 (4): 185–95. doi:10,4161 / vačka. 1.4.5448. PMC  2634105. PMID  19262140.
  10. ^ Zhu Y, Cuevas IC, Gabriel RA, Su H, Nishimura S, Gao P, Fields A, Hao Q, Young WL, Yang GY, Boudreau NJ (červen 2009). „Obnova transkripčního faktoru HoxA5 exprese inhibuje růst experimentálních hemangiomů v mozku“. Journal of Neuropathology and Experimental Neurology. 68 (6): 626–32. doi:10.1097 / NEN.0b013e3181a491ce. PMC  2728585. PMID  19458547.
  11. ^ Chen H, Rubin E, Zhang H, Chung S, Jie CC, Garrett E, Biswal S, Sukumar S (květen 2005). „Identifikace transkripčních cílů HOXA5“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (19): 19373–80. doi:10,1074 / jbc.M413528200. PMID  15757903.
  12. ^ Lee JY, Park KS, Cho EJ, Joo HK, Lee SK, Lee SD, Park JB, Chang SJ, Jeon BH (červenec 2011). „Lidská homeodoména HOXA5 zvyšuje transdukci bílkovin a její aplikaci na vaskulární zánět.“ Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 410 (2): 312–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2011.05.139. PMID  21664342.
  13. ^ Chen Y, Gorski DH (únor 2008). „Regulace angiogeneze prostřednictvím mikroRNA (miR-130a), která down-reguluje antiangiogenní homeoboxové geny GAX a HOXA5“. Krev. 111 (3): 1217–26. doi:10.1182 / krev-2007-07-104133. PMC  2214763. PMID  17957028.
  14. ^ A b Dunn J, Simmons R, Thabet S, Jo H (říjen 2015). „Role epigenetiky ve smykové stresové reakci endoteliálních buněk a ateroskleróze“. International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 67: 167–76. doi:10.1016 / j.biocel.2015.05.001. PMC  4592147. PMID  25979369.
  15. ^ Strathdee G, Sim A, Soutar R, Holyoake TL, Brown R (únor 2007). „HOXA5 je zaměřen na metylaci ostrovního CpG ostrovního typu v normálních buňkách a během vývoje akutní myeloidní leukémie“. Karcinogeneze. 28 (2): 299–309. doi:10.1093 / carcin / bgl133. PMID  16861263.
  16. ^ Kim SY, Hwang SH, Song EJ, Shin HJ, Jung JS, Lee EY (říjen 2010). „Úroveň hypermethylace HOXA5 u akutní myeloidní leukémie je spojena s krátkodobým výsledkem“. Korejský žurnál laboratorní medicíny. 30 (5): 469–73. doi:10,3343 / kjlm.2010.30.5.469. PMID  20890077.

externí odkazy

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.