HOXC10 - HOXC10

HOXC10
Identifikátory
Aliasy	HOXC10, HOX3I, homeobox C10
Externí ID	OMIM: 605560 MGI: 96192 HomoloGene: 9680 Genové karty: HOXC10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	53,990,279 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	102,971,893 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• komplex cyklin-dependentní protein kinázy aktivující kinázový holoenzym; • buněčné jádro; • jaderné těleso; • nukleoplazma;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj kosterního systému; • tvorba proximálního / distálního vzoru; • neuromuskulární proces; • regulace transkripce, DNA-šablony; • embryonální morfogeneze končetin; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • specifikace předního / zadního vzoru; • specifikace osudu buněk motorických neuronů míchy; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace termogeneze vyvolané chladem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3226
	209448
	ENSG00000180818
	ENSMUSG00000022484
	Q9NYD6
	P31257
	NM_017409
	NM_010462
	NP_059105
	NP_034592
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-C10 je protein že u lidí je kódován HOXC10 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen patří do homeobox rodina genů. Geny homeoboxu kódují vysoce konzervovanou rodinu transkripční faktory které hrají důležitou roli v morfogenezi ve všech mnohobuněčných organismech. Savci mají čtyři podobné klastry homeoboxových genů, HOXA, HOXB, HOXC a HOXD, které jsou umístěny na různých chromozomech a skládají se z 9 až 11 genů uspořádaných do tandemu. Tento gen je jedním z několika homeoboxových HOXC genů umístěných v klastru na chromozomu 12. Hladina proteinu je kontrolována během buněčné diferenciace a proliferace, což může naznačovat, že tento protein hraje roli při aktivaci původu.^[6]

Patologie

HOXC10 je nadměrně vyjádřený v rakovina prsu a transkripčně regulováno estrogen prostřednictvím zapojení histon methylázy MLL3 a MLL4.^[7]
Methylace estrogenem potlačovaného genu HOXC10 u rakoviny prsu určuje rezistenci inhibitory aromatázy. Tento epigenetické přeprogramování HOXC10 je pozorováno v endokrinně rezistentní rakovina prsu.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000180818 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022484 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HOXC10 homeobox C10“.
^ Ansari KI, Hussain I, Kasiri S, Mandal SS (únor 2012). „HOXC10 je nadměrně exprimován u rakoviny prsu a transkripčně regulován estrogenem prostřednictvím účasti histon methyláz MLL3 a MLL4“. Journal of Molecular Endocrinology. 48 (1): 61–75. doi:10.1530 / JME-11-0078. PMID 22143955.
^ Pathiraja TN, Nayak SR, Xi Y, Jiang S, Garee JP, Edwards DP, Lee AV, Chen J, Shea MJ, Santen RJ, Gannon F, Kangaspeska S, Jelinek J, Issa JP, Richer JK, Elias A, McIlroy M , Young LS, Davidson NE, Schiff R, Li W, Oesterreich S (březen 2014). „Epigenetické přeprogramování HOXC10 u endokrinně rezistentního karcinomu prsu“. Science Translational Medicine. 6 (229): 229ra41. doi:10.1126 / scitranslmed.3008326. PMC 4277862. PMID 24670685.

Další čtení

Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (prosinec 1989). "Lidská genová rodina HOX". Výzkum nukleových kyselin. 17 (24): 10385–402. doi:10.1093 / nar / 17.24.10385. PMC 335308. PMID 2574852.
Rabin M, Ferguson-Smith A, Hart CP, Ruddle FH (prosinec 1986). „Cognate homeo-box loci mapped on homologous human and mouse chromozomes“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 83 (23): 9104–8. doi:10.1073 / pnas.83.23.9104. PMC 387083. PMID 2878432.
Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). "Jemné mapování lidských genových shluků HOX". Cytogenetika a genetika buněk. 73 (1–2): 114–5. doi:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Flagiello D, Gibaud A, Dutrillaux B, kupón MF, Malfoy B (říjen 1997). "Zřetelné vzorce all-trans retinové kyseliny závislé na expresi HOXB a HOXC homeogenů v lidských embryonálních a malobuněčných buněčných liniích karcinomu plic". FEBS Dopisy. 415 (3): 263–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 01118-6. PMID 9357979. S2CID 26075369.
de Stanchina E, Gabellini D, Norio P, Giacca M, Peverali FA, Riva S, Falaschi A, Biamonti G (červen 2000). "Výběr homeotických proteinů pro vazbu na počátek replikace lidské DNA". Journal of Molecular Biology. 299 (3): 667–80. doi:10.1006 / jmbi.2000.3782. PMID 10835276.
Sandrock B, Egly JM (září 2001). „Kvasinkový čtyřhybridní systém identifikuje Cdk-aktivující kinázu jako regulátor XPD helikázy, podjednotky transkripčního faktoru IIH“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (38): 35328–33. doi:10,1074 / jbc.M105570200. PMID 11445587.
Kosaki K, Kosaki R, Suzuki T, Yoshihashi H, Takahashi T, Sasaki K, Tomita M, McGinnis W, Matsuo N (únor 2002). "Kompletní panel pro analýzu mutací 39 lidských genů HOX". Teratologie. 65 (2): 50–62. doi:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Gabellini D, Colaluca IN, Vodermaier HC, Biamonti G, Giacca M, Falaschi A, Riva S, Peverali FA (červenec 2003). „Včasná mitotická degradace homeoproteinu HOXC10 je potenciálně spojena s progresí buněčného cyklu“. Časopis EMBO. 22 (14): 3715–24. doi:10.1093 / emboj / cdg340. PMC 165610. PMID 12853486.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Zhai Y, Kuick R, Nan B, Ota I, Weiss SJ, Trimble CL, Fearon ER, Cho KR (listopad 2007). „Analýza genové exprese preinvazivních a invazivních cervikálních spinocelulárních karcinomů identifikuje HOXC10 jako klíčového mediátora invaze“. Výzkum rakoviny. 67 (21): 10163–72. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-2056. PMID 17974957.

externí odkazy

HOXC10 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000180818 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022484 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1358459-5] Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HOXC10 homeobox C10“.

[7] Ansari KI, Hussain I, Kasiri S, Mandal SS (únor 2012). „HOXC10 je nadměrně exprimován u rakoviny prsu a transkripčně regulován estrogenem prostřednictvím účasti histon methyláz MLL3 a MLL4“. Journal of Molecular Endocrinology. 48 (1): 61–75. doi:10.1530 / JME-11-0078. PMID 22143955.

[8] Pathiraja TN, Nayak SR, Xi Y, Jiang S, Garee JP, Edwards DP, Lee AV, Chen J, Shea MJ, Santen RJ, Gannon F, Kangaspeska S, Jelinek J, Issa JP, Richer JK, Elias A, McIlroy M , Young LS, Davidson NE, Schiff R, Li W, Oesterreich S (březen 2014). „Epigenetické přeprogramování HOXC10 u endokrinně rezistentního karcinomu prsu“. Science Translational Medicine. 6 (229): 229ra41. doi:10.1126 / scitranslmed.3008326. PMC 4277862. PMID 24670685.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]