Transkripční faktor II D - Transcription factor II D
Transkripční faktor II D (TFIID) je jedním z několika obecné transkripční faktory které tvoří RNA polymeráza II preiniciační komplex. Holoenzym RNA polymerázy II je forma eukaryotický RNA polymeráza II který je získán pro promotéry protein -kódující geny v živých buňkách. Skládá se z RNA polymeráza II, podmnožina obecných transkripční faktory, a regulační proteiny známé jako SRB proteiny. Před začátkem roku transkripce, komplex transkripčního faktoru II D (TFIID) se váže na TATA box v jádrovém promotoru genu.
Funkce
- Koordinuje aktivity více než 70 polypeptidů potřebných pro zahájení transkripce RNA polymerázou II
- Váže se na promotor jádra, aby správně umístil polymerázu
- Slouží jako lešení pro sestavení zbytku transkripčního komplexu
- Funguje jako kanál pro regulační signály
Struktura
TFIISamotný D se skládá z TBP a několika podjednotky volala Protein vázající TATA Související faktory (Faktory spojené s TBPnebo TAF). Ve zkumavce je nutné pouze TBP transkripce na promotéři které obsahují a TATA box.[1] TAF však přidávají selektivitu promotoru, zvláště pokud pro TBP není vázána žádná sekvence TATA boxu.[2] TAF jsou zahrnuty ve dvou odlišných komplexech, TFIID[3] a B-TFIID.[4] Komplex TFIID se skládá z TBP a více než osmi TAF. Většina TBP je však přítomna v komplexu B-TFIID, který se skládá z TBP a TAFII170 (BTAF1 ) v poměru 1: 1.[5] TFIID a B-TFIID nejsou ekvivalentní, protože transkripční reakce využívající TFIID reagují na genově specifické transkripční faktory, jako je SP1, zatímco reakce rekonstituované s B-TFIID nejsou.[5]
Podjednotky v komplexu TFIID zahrnují:[1]
- TBP (Protein vázající TATA) nebo:
- TAF1 (TAFII250)
- TAF2 (CIF150)
- TAF3 (TAFII140)
- TAF4 (TAFII130 / 135)
- TAF4B (TAFII105)
- TAF5 (TAFII100)
- TAF6 (TAFII70 / 80)
- TAF7 (TAFII55)
- TAF8 (TAFII43)
- TAF9 (TAFII31 / 32)
- TAF9B (TAFII31L)
- TAF10 (TAFII30)
- TAF11 (TAFII28)
- TAF12 (TAFII20 / 15)
- TAF13 (TAFII18)
- TAF15 (TAFII68)
Viz také
- Eukaryotická transkripce
- Obecný transkripční faktor
- Preiniciační komplex
- Regulace genové exprese
- Holoenzym RNA polymerázy II
- Protein vázající TATA
- Přepis (genetika)
Reference
- ^ A b Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000). "Transkripce genů kódujících eukaryotický protein". Annu. Genet. 34: 77–137. doi:10.1146 / annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.
- ^ Louder, RK; Ahoj; López-Blanco, JR; Fang, J; Chacón, P; Nogales, E (2016). "Struktura promotorem vázaného TFIID a model sestavení lidského preinicializačního komplexu". Příroda. 531 (7596): 604–609. Bibcode:2016Natur.531..604L. doi:10.1038 / příroda17394. PMC 4856295. PMID 27007846.
- ^ Dynlacht, Brian David; Hoey, Timothy; Tjian, Robert (srpen 1991). „Izolace koaktivátorů spojených s proteinem vázajícím TATA, které zprostředkovávají transkripční aktivaci“. Buňka. 66 (3): 563–576. doi:10.1016/0092-8674(81)90019-2. PMID 1907890. S2CID 5000858.
- ^ „NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 RNA polymeráza II, asociovaný s transkripčním faktorem B-TFIID, 170 kDa (homolog Mot1, S. cerevisiae)“.
- ^ A b Timmers, H .; Meyers, RE; Sharp, PA (září 1992). "Složení transkripčního faktoru B-TFIID". Proc Natl Acad Sci USA. 89 (17): 8140–4. Bibcode:1992PNAS ... 89.8140T. doi:10.1073 / pnas.89.17.8140. PMC 49872. PMID 1387711.
- ^ Duttke, SH (březen 2015). „Vývoj a diverzifikace bazálního transkripčního aparátu“. Trendy v biochemických vědách. 40 (3): 127–9. doi:10.1016 / j.tibs.2015.01.005. PMC 4410091. PMID 25661246.
externí odkazy
- Přepis + faktor + TFIID v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- Struktury 3D elektronové mikroskopie TFIID z EM Data Bank (EMDB)
 | Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |