Malý heterodimerový partner - Small heterodimer partner

NR0B2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1YUC, 2Q3Y, 2Z4J, 4DOR, 4ONI
Identifikátory
Aliasy	NR0B2, SHP, SHP1, podrodina jaderného receptoru 0 člen skupiny B 2
Externí ID	OMIM: 604630 MGI: 1346344 HomoloGene: 8030 Genové karty: NR0B2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	26,913,975 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	133,556,536 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • aktivita homodimerizace proteinu; • specifické vazby na proteinovou doménu; • aktivita receptoru steroidních hormonů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • transkripční faktor vazba; • vazba na receptor retinové kyseliny; • vazba na receptor aktivovaná proliferátorem peroxisomu; • vazba na retinoid X receptor; • vazba na receptory hormonů štítné žlázy;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytoplazma; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • metabolický proces cholesterolu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • reakce na glukózu; • negativní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • negativní regulace genové exprese; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace genové exprese; • regenerace zvířecích orgánů; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace sekrece inzulínu; • steroidní hormon zprostředkovaná signální dráha; • cirkadiánní rytmus; • cirkadiánní regulace genové exprese; • rytmický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8431
	23957
	ENSG00000131910
	ENSMUSG00000037583
	Q15466
	Q62227
	NM_021969
	NM_011850
	NP_068804
	NP_035980
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The malý heterodimerový partner (SHP) také známý jako NR0B2 (podrodina nukleárního receptoru 0, skupina B, člen 2) je a protein že u lidí je kódován NR0B2 gen.^[5] SHP je členem jaderný receptor rodina intracelulární transkripční faktory.^[6] SHP je neobvyklý pro jaderný receptor v tom, že postrádá a DNA vazebná doména. Proto to technicky není ani transkripční faktor, ani jaderný receptor, ale přesto je stále klasifikován jako takový kvůli relativně vysoké homologii sekvence s ostatními členy rodiny nukleárních receptorů.

Funkce

Zdá se, že hlavní rolí SHP je represe jiných jaderných receptorů prostřednictvím asociace k produkci neproduktivního heterodimeru.^[7] Protein byl také identifikován jako zprostředkující faktor v metabolických cirkadiánních hodinách ^[8] Výzkum ukazuje, že interaguje s retinoid a receptory hormonů štítné žlázy, inhibující jejich ligand-dependentní transkripční aktivaci. Kromě toho byla prokázána interakce s estrogenovými receptory, což vede k inhibici funkce. Studie naznačují, že protein potlačuje zprostředkovaný receptorem jaderných hormonů transaktivace prostřednictvím dvou samostatných kroků: konkurence s koaktivátory a přímé účinky funkce transkripčního represoru.^[5]

Struktura a ligandy

Byla získána krystalová struktura SHP obsahující pouze LBD, generovaná kokrystalizací s EID1. Místo toho, aby se navázal na obvyklé místo AF-2, vyplní EID1 místo toho, co je obvykle spirála α1 LBD, a činí SHP rozpustnějším. Celková struktura se podobá apo (ligandless) forma jiných LBD. Některé syntetické retinoid ligandy se mohou vázat na LBD SHP a podporovat jeho interakci s corepressory obsahujícími LXXLL pomocí místa AF-2.^[9]

Interakce

Ukázalo se, že malý heterodimerový partner komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131910 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037583 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: NR0B2 jaderný receptor podčeleď 0, skupina B, člen 2".
^ Lee HK, Lee YK, Park SH, Kim YS, Park SH, Lee JW a kol. (Červen 1998). "Struktura a exprese genu SHP pro osiřelý jaderný receptor". The Journal of Biological Chemistry. 273 (23): 14398–402. doi:10.1074 / jbc.273.23.14398. PMID 9603951.
^ Båvner A, Sanyal S, Gustafsson JA, Treuter E (prosinec 2005). "Transkripční korekce pomocí SHP: molekulární mechanismy a fyziologické důsledky". Trendy v endokrinologii a metabolismu. 16 (10): 478–88. doi:10.1016 / j.tem.2005.10.005. PMID 16275121.
^ Wu N, Kim KH, Zhou Y, Lee JM, Kettner NM, Mamrosh JL a kol. (Září 2016). „Malý partner Heterodimer (NR0B2) koordinuje výživovou signalizaci a cirkadiánní hodiny u myší“. Molekulární endokrinologie. 30 (9): 988–95. doi:10.1210 / me.2015-1295. PMC 5004116. PMID 27427832.
^ ^A ^b Zhi X, Zhou XE, He Y, Zechner C, Suino-Powell KM, Kliewer SA a kol. (Leden 2014). „Strukturální pohledy na represi genů pomocí osiřelého jaderného receptoru SHP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (2): 839–44. doi:10.1073 / pnas.1322827111. PMID 24379397.
^ Gobinet J, Auzou G, Nicolas JC, Sultan C, Jalaguier S (prosinec 2001). "Charakterizace interakce mezi androgenním receptorem a novým transkripčním inhibitorem, SHP". Biochemie. 40 (50): 15369–77. doi:10.1021 / bi011384o. PMID 11735420.
^ Klinge CM, Jernigan SC, Risinger KE (březen 2002). „Agonistická aktivita tamoxifenu je inhibována krátkým heterodimerovým partnerem pro vzácný jaderný receptor v lidských buňkách rakoviny endometria“. Endokrinologie. 143 (3): 853–67. doi:10.1210 / en.143.3.853. PMID 11861507.
^ ^A ^b Lee YK, Dell H, Dowhan DH, Hadzopoulou-Cladaras M, Moore DD (leden 2000). „Osiřelý jaderný receptor SHP inhibuje hepatocytový jaderný faktor 4 a transaktivaci receptoru retinoidu X: dva mechanismy pro represi“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (1): 187–95. doi:10.1128 / MCB.20.1.187-195.2000. PMC 85074. PMID 10594021.
^ ^A ^b ^C Brendel C, Schoonjans K, Botrugno OA, Treuter E, Auwerx J (září 2002). „Malý heterodimerový partner interaguje s jaterním X receptorem alfa a potlačuje jeho transkripční aktivitu.“. Molekulární endokrinologie. 16 (9): 2065–76. doi:10.1210 / me.2001-0194. PMID 12198243.
^ Lee YK, Moore DD (leden 2002). „Duální mechanismy pro represi homologního proteinu 1 jaterního receptoru monomerního osiřelého receptoru malým heterodimerovým partnerem pro vzácná onemocnění“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2463–7. doi:10,1074 / jbc.M105161200. PMID 11668176.
^ Nishizawa H, Yamagata K, Shimomura I, Takahashi M, Kuriyama H, Kishida K a kol. (Leden 2002). „Malý heterodimerový partner, osiřelý jaderný receptor, zvyšuje gamma transaktivaci receptoru aktivovaného peroxisomovým proliferátorem“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (2): 1586–92. doi:10,1074 / jbc.M104301200. PMID 11696534.
^ Seol W, Choi HS, Moore DD (květen 1996). „Sirotčí jaderný hormonální receptor, kterému chybí doména vázající DNA a heterodimerizuje se s jinými receptory“. Věda. 272 (5266): 1336–9. doi:10.1126 / science.272.5266.1336. PMID 8650544.
^ Seol W, Hanstein B, Brown M, Moore DD (říjen 1998). „Inhibice působení estrogenového receptoru na osiřelý receptor SHP (krátký heterodimerový partner)“. Molekulární endokrinologie. 12 (10): 1551–7. doi:10.1210 / me.12.10.1551. PMID 9773978.

Další čtení

Seol W, Choi HS, Moore DD (květen 1996). „Sirotčí jaderný hormonový receptor, kterému chybí doména vázající DNA a heterodimerizuje se s jinými receptory“. Věda. 272 (5266): 1336–9. doi:10.1126 / science.272.5266.1336. PMID 8650544.
Seol W, Hanstein B, Brown M, Moore DD (říjen 1998). „Inhibice působení estrogenového receptoru na osiřelý receptor SHP (krátký heterodimerový partner)“. Molekulární endokrinologie. 12 (10): 1551–7. doi:10.1210 / me.12.10.1551. PMID 9773978.
Lee YK, Dell H, Dowhan DH, Hadzopoulou-Cladaras M, Moore DD (leden 2000). „Osiřelý jaderný receptor SHP inhibuje hepatocytový jaderný faktor 4 a transaktivaci receptoru retinoidu X: dva mechanismy pro represi“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (1): 187–95. doi:10.1128 / MCB.20.1.187-195.2000. PMC 85074. PMID 10594021.
Johansson L, Båvner A, Thomsen JS, Färnegårdh M, Gustafsson JA, Treuter E (únor 2000). „Osiřelý jaderný receptor SHP využívá konzervované motivy související s LXXLL pro interakce s estrogenovými receptory aktivovanými ligandem“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (4): 1124–33. doi:10.1128 / MCB.20.4.1124-1133.2000. PMC 85230. PMID 10648597.
Lu TT, Makishima M, Repa JJ, Schoonjans K, Kerr TA, Auwerx J, Mangelsdorf DJ (září 2000). "Molekulární základ pro zpětnovazební regulaci syntézy žlučových kyselin jadernými receptory". Molekulární buňka. 6 (3): 507–15. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00050-2. PMID 11030331.
Nishigori H, Tomura H, Tonooka N, Kanamori M, Yamada S, Sho K a kol. (Leden 2001). „Mutace v genu malého heterodimerového partnera jsou u japonských subjektů spojeny s mírnou obezitou“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (2): 575–80. doi:10.1073 / pnas.021544398. PMC 14629. PMID 11136233.
Lee YK, Moore DD (leden 2002). „Duální mechanismy pro represi homologního proteinu 1 jaterního receptoru monomerního osiřelého receptoru malým heterodimerovým partnerem pro vzácná onemocnění“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2463–7. doi:10,1074 / jbc.M105161200. PMID 11668176.
Nishizawa H, Yamagata K, Shimomura I, Takahashi M, Kuriyama H, Kishida K a kol. (Leden 2002). „Malý heterodimerový partner, osiřelý jaderný receptor, zvyšuje gamma transaktivaci receptoru aktivovaného peroxisomovým proliferátorem“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (2): 1586–92. doi:10,1074 / jbc.M104301200. PMID 11696534.
Sanyal S, Kim JY, Kim HJ, Takeda J, Lee YK, Moore DD, Choi HS (leden 2002). „Diferenciální regulace promotoru genu malého heterodimerního partnera (SHP) pro osiřelý jaderný receptor izoformami ERR pro osiřelý jaderný receptor“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (3): 1739–48. doi:10,1074 / jbc.M106140200. PMID 11705994.
Gobinet J, Auzou G, Nicolas JC, Sultan C, Jalaguier S (prosinec 2001). "Charakterizace interakce mezi androgenním receptorem a novým transkripčním inhibitorem, SHP". Biochemie. 40 (50): 15369–77. doi:10.1021 / bi011384o. PMID 11735420.
Klinge CM, Jernigan SC, Risinger KE (březen 2002). „Agonistická aktivita tamoxifenu je inhibována krátkým heterodimerovým partnerem pro vzácný jaderný receptor v lidských buňkách rakoviny endometria“. Endokrinologie. 143 (3): 853–67. doi:10.1210 / en.143.3.853. PMID 11861507.
Ogata M, Awaji T, Iwasaki N, Miyazaki S, Bell GI, Iwamoto Y (březen 2002). "Nukleární translokace SHP a vizualizace interakce s HNF-4alfa v živých buňkách". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 292 (1): 8–12. doi:10.1006 / bbrc.2002.6593. PMID 11890664.
Cao H, Hegele RA (2002). „Identifikace polymorfismů v lidském genu SHP1“. Journal of Human Genetics. 47 (8): 445–7. doi:10,1007 / s100380200062. PMID 12181644.
Brendel C, Schoonjans K, Botrugno OA, Treuter E, Auwerx J (září 2002). „Malý heterodimerový partner interaguje s jaterním X receptorem alfa a potlačuje jeho transkripční aktivitu.“. Molekulární endokrinologie. 16 (9): 2065–76. doi:10.1210 / me.2001-0194. PMID 12198243.
Borgius LJ, Steffensen KR, Gustafsson JA, Treuter E (prosinec 2002). „Signalizace glukokortikoidů je narušena atypickým receptorem pro vzácná onemocnění a korektorem SHP“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (51): 49761–6. doi:10,1074 / jbc.M205641200. PMID 12324453.
Hung CC, Farooqi IS, Ong K, Luan J, Keogh JM, Pembrey M a kol. (Květen 2003). „Příspěvek variant v genu malého heterodimerového partnera k porodní hmotnosti, adipozitě a hladinám inzulínu: mutační analýza a asociační studie u více populací“. Cukrovka. 52 (5): 1288–91. doi:10 2337 / cukrovka. 52.5.1288. PMID 12716767.
Lai K, Harnish DC, Evans MJ (září 2003). „Estrogenový receptor alfa reguluje expresi malého heterodimerového partnera osiřelého receptoru“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (38): 36418–29. doi:10,1074 / jbc.M303913200. PMID 12842887.
Kovacic A, Speed CJ, Simpson ER, Clyne CD (leden 2004). „Inhibice transkripce aromatázy prostřednictvím promotoru II krátkým heterodimerovým partnerem v lidských preadipocytech“. Molekulární endokrinologie. 18 (1): 252–9. doi:10.1210 / me.2003-0211. PMID 14593077.

externí odkazy

malý + heterodimer + partner + protein v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131910 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037583 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: NR0B2 jaderný receptor podčeleď 0, skupina B, člen 2".

[pmid9603951-6] Lee HK, Lee YK, Park SH, Kim YS, Park SH, Lee JW a kol. (Červen 1998). "Struktura a exprese genu SHP pro osiřelý jaderný receptor". The Journal of Biological Chemistry. 273 (23): 14398–402. doi:10.1074 / jbc.273.23.14398. PMID 9603951.

[pmid16275121-7] Båvner A, Sanyal S, Gustafsson JA, Treuter E (prosinec 2005). "Transkripční korekce pomocí SHP: molekulární mechanismy a fyziologické důsledky". Trendy v endokrinologii a metabolismu. 16 (10): 478–88. doi:10.1016 / j.tem.2005.10.005. PMID 16275121.

[8] Wu N, Kim KH, Zhou Y, Lee JM, Kettner NM, Mamrosh JL a kol. (Září 2016). „Malý partner Heterodimer (NR0B2) koordinuje výživovou signalizaci a cirkadiánní hodiny u myší“. Molekulární endokrinologie. 30 (9): 988–95. doi:10.1210 / me.2015-1295. PMC 5004116. PMID 27427832.

[pmid24379397-9] A ^b Zhi X, Zhou XE, He Y, Zechner C, Suino-Powell KM, Kliewer SA a kol. (Leden 2014). „Strukturální pohledy na represi genů pomocí osiřelého jaderného receptoru SHP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (2): 839–44. doi:10.1073 / pnas.1322827111. PMID 24379397.

[pmid11735420-10] Gobinet J, Auzou G, Nicolas JC, Sultan C, Jalaguier S (prosinec 2001). "Charakterizace interakce mezi androgenním receptorem a novým transkripčním inhibitorem, SHP". Biochemie. 40 (50): 15369–77. doi:10.1021 / bi011384o. PMID 11735420.

[pmid11861507-11] Klinge CM, Jernigan SC, Risinger KE (březen 2002). „Agonistická aktivita tamoxifenu je inhibována krátkým heterodimerovým partnerem pro vzácný jaderný receptor v lidských buňkách rakoviny endometria“. Endokrinologie. 143 (3): 853–67. doi:10.1210 / en.143.3.853. PMID 11861507.

[pmid10594021-12] A ^b Lee YK, Dell H, Dowhan DH, Hadzopoulou-Cladaras M, Moore DD (leden 2000). „Osiřelý jaderný receptor SHP inhibuje hepatocytový jaderný faktor 4 a transaktivaci receptoru retinoidu X: dva mechanismy pro represi“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (1): 187–95. doi:10.1128 / MCB.20.1.187-195.2000. PMC 85074. PMID 10594021.

[pmid12198243-13] A ^b ^C Brendel C, Schoonjans K, Botrugno OA, Treuter E, Auwerx J (září 2002). „Malý heterodimerový partner interaguje s jaterním X receptorem alfa a potlačuje jeho transkripční aktivitu.“. Molekulární endokrinologie. 16 (9): 2065–76. doi:10.1210 / me.2001-0194. PMID 12198243.

[pmid11668176-14] Lee YK, Moore DD (leden 2002). „Duální mechanismy pro represi homologního proteinu 1 jaterního receptoru monomerního osiřelého receptoru malým heterodimerovým partnerem pro vzácná onemocnění“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2463–7. doi:10,1074 / jbc.M105161200. PMID 11668176.

[pmid11696534-15] Nishizawa H, Yamagata K, Shimomura I, Takahashi M, Kuriyama H, Kishida K a kol. (Leden 2002). „Malý heterodimerový partner, osiřelý jaderný receptor, zvyšuje gamma transaktivaci receptoru aktivovaného peroxisomovým proliferátorem“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (2): 1586–92. doi:10,1074 / jbc.M104301200. PMID 11696534.

[pmid8650544-16] Seol W, Choi HS, Moore DD (květen 1996). „Sirotčí jaderný hormonální receptor, kterému chybí doména vázající DNA a heterodimerizuje se s jinými receptory“. Věda. 272 (5266): 1336–9. doi:10.1126 / science.272.5266.1336. PMID 8650544.

[pmid9773978-17] Seol W, Hanstein B, Brown M, Moore DD (říjen 1998). „Inhibice působení estrogenového receptoru na osiřelý receptor SHP (krátký heterodimerový partner)“. Molekulární endokrinologie. 12 (10): 1551–7. doi:10.1210 / me.12.10.1551. PMID 9773978.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]