ACVR1B - ACVR1B

ACVR1B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3H9R, 3MTF, 3OOM, 3Q4U, 4BGG, 4C02, 4DYM
Identifikátory
Aliasy	ACVR1B, ACTRIB, ACVRLK4, ALK4, SKR2, receptor aktivinu A typu 1B
Externí ID	OMIM: 601300 MGI: 1338944 HomoloGene: 20906 Genové karty: ACVR1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	51,997,078 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	101,213,684 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • vazba růstového faktoru; • vazba aktivinu; • vazba kovových iontů; • kinázová aktivita; • aktivita transmembránového receptorového proteinu serin / threonin kináza; • vazba inhibinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita receptoru aktivovaného aktivinem; • ATP vazba; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita receptoru aktivinu, typ I; • SMAD vazba; • aktivita receptoru aktivovaného růstovým faktorem beta; • aktivita receptoru beta transformujícího růstového faktoru, typ I.;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • receptorový komplex; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • komplex aktivinového receptoru; • povrch buňky; • cytosol;
Biologický proces	• vývoj vlasového folikulu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace diferenciace erytrocytů; • vnější apoptotická signální cesta; • fosforylace; • pozitivní regulace fosforylace proteinu SMAD s omezenou cestou; • v embryonálním vývoji dělohy; • negativní regulace genové exprese; • uzlová signální cesta; • pozitivní regulace migrace buněk trofoblastu; • fosforylace bílkovin; • vývoj centrálního nervového systému; • vývoj primárních ženských sexuálních charakteristik; • pozitivní regulace genové exprese; • transmembránový receptorový protein serin / threonin kinázová signální dráha; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru aktivinu; • regulace přenosu signálu; • negativní regulace buněčného růstu; • autofosforylace; • peptidyl-threoninová fosforylace; • signální transdukce; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • signální dráha receptoru aktivinu; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • proces specifikace vzoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	91
	11479
	ENSG00000135503
	ENSMUSG00000000532
	P36896
	Q61271
	NM_004302; NM_020327; NM_020328
	NM_007395
	NP_004293; NP_064732; NP_064733
	NP_031421
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aktivinový receptor typu 1B je protein že u lidí je kódován ACVR1B gen.^[5]^[6]

ACVR1B nebo ALK-4 působí jako převodník aktivin nebo ligandy podobné aktivinu (např. inhibin ) signály. Aktivin se váže na jeden ACVR2A nebo ACVR2B a poté vytvoří komplex s ACVR1B. Tito pokračují v náboru R-SMAD SMAD2 nebo SMAD3.^[7] ACVR1B také přenáší signály z uzlový, GDF-1, a Vg1; na rozdíl od aktivinu však vyžadují jiné molekuly coreceptoru, jako je protein Cripto.^[8]

Funkce

Aktiviny jsou dimerní růstové a diferenciační faktory, které patří k transformující růstový faktor-beta (TGF-beta) nadrodina strukturně příbuzných signálních proteinů. Aktiviny signalizují prostřednictvím heteromerního komplexu receptorových serinkináz, které zahrnují alespoň dva receptory typu I (I a IB) a dva receptory typu II (II a IIB). Tyto receptory jsou všechny transmembránové proteiny, složené z extracelulární domény vázající ligand s oblastí bohatou na cysteiny, transmembránové domény a cytoplazmatické domény s předpokládanou specificitou vůči serinu / threoninu. Receptory typu I jsou nezbytné pro signalizaci a receptory typu II jsou vyžadovány pro vazbu ligandů a pro expresi receptorů typu I. Receptory typu I a II tvoří po vazbě ligandu stabilní komplex, což vede k fosforylace receptorů typu I receptory typu II. Tento gen kóduje receptor aktivinu A typu IB složený z 11 exonů. Alternativní sestřih a alternativní polyadenylace vede ke 3 plně popsaným variantám transkriptu. Exprese mRNA variant 1, 2 a 3 je potvrzena a potenciální čtvrtá varianta obsahuje alternativní exon 8 a chybí mu exony 9 až 11, ale jeho exprese mRNA nebyla potvrzena.^[6]

Interakce

ACVR1B bylo prokázáno komunikovat s

ACVR2A,^[9]^[10] a ACVR2B^[11]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135503 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000532 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ten Dijke P, Ichijo H, Franzén P, Schulz P, Saras J, Toyoshima H, Heldin CH, Miyazono K (říjen 1993). „Kinázy podobné receptoru aktivinu: nová podtřída receptorů na buněčném povrchu s předpokládanou aktivitou serin / threonin kinázy“. Onkogen. 8 (10): 2879–87. PMID 8397373.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ACVR1B receptor aktivinu A, typ IB“.
^ Inman GJ, Nicolás FJ, Callahan JF, Harling JD, Gaster LM, Reith AD, Laping NJ, Hill CS (2002). „SB-431542 je silný a specifický inhibitor transformačních receptorů ALK4, ALK5 a ALK7 transformačního růstového faktoru-beta nadrodiny typu I receptoru kinázy podobné aktivinovým receptorům (ALK). Mol. Pharmacol. 62 (1): 65–74. doi:10,1124 / mol. 62.1.65. PMID 12065756.
^ Harrison CA, Gray PC, Koerber SC, Fischer W, Vale W (2003). „Identifikace funkčního vazebného místa pro aktivin na receptoru ALK4 typu I“. J. Biol. Chem. 278 (23): 21129–35. doi:10,1074 / jbc.M302015200. PMID 12665502.
^ ^A ^b De Winter JP, De Vries CJ, Van Achterberg TA, Ameerun RF, Feijen A, Sugino H, De Waele P, Huylebroeck D, Verschueren K, Van Den Eijden-Van Raaij AJ (květen 1996). „Zkrácené receptory aktivinu typu II inhibují bioaktivitu tvorbou heteromerních komplexů s receptory aktivinu typu I.“. Exp. Cell Res. 224 (2): 323–34. doi:10.1006 / excr.1996.0142. PMID 8612709.
^ Lebrun JJ, Takabe K, Chen Y, Vale W (leden 1999). "Role dráhy specifické a inhibiční Smads v signalizaci receptoru aktivinu". Mol. Endokrinol. 13 (1): 15–23. doi:10.1210 / opravit. 13.1.0218. PMID 9892009.
^ Attisano L, Wrana JL, Montalvo E, Massagué J (březen 1996). "Aktivace signalizace komplexem receptoru aktivinu". Mol. Buňka. Biol. 16 (3): 1066–73. doi:10.1128 / MCB.16.3.1066. PMC 231089. PMID 8622651.

externí odkazy

Člověk ACVR1B umístění genomu a ACVR1B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Welt CK (2002). "Fyziologie a patofyziologie inhibinu, aktivinu a follistatinu v ženské reprodukci". Curr. Opin. Obstet. Gynecol. 14 (3): 317–23. doi:10.1097/00001703-200206000-00012. PMID 12032389. S2CID 44327401.
Liu F, Ventura F, Doody J, Massagué J (1995). „Lidský receptor typu II pro kostní morfogenní proteiny (BMP): rozšíření modelu receptoru dvou kináz na BMP“. Mol. Buňka. Biol. 15 (7): 3479–86. doi:10,1128 / mcb.15.7.3479. PMC 230584. PMID 7791754.
Xu J, Matsuzaki K, McKeehan K, Wang F, Kan M, McKeehan WL (1994). „Genomická struktura a klonované cDNA předpovídají, že čtyři varianty v kinázové doméně receptorů serin / threonin kinázy vznikají alternativním sestřihem a přidáním poly (A)“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (17): 7957–61. Bibcode:1994PNAS ... 91,7957X. doi:10.1073 / pnas.91.17.7957. PMC 44523. PMID 8058741.
Cárcamo J, Weis FM, Ventura F, Wieser R, Wrana JL, Attisano L, Massagué J (1994). „Receptory typu I specifikují růstově inhibiční a transkripční reakce na transformující růstový faktor beta a aktivin“. Mol. Buňka. Biol. 14 (6): 3810–21. doi:10.1128 / MCB.14.6.3810. PMC 358748. PMID 8196624.
De Winter JP, De Vries CJ, Van Achterberg TA, Ameerun RF, Feijen A, Sugino H, De Waele P, Huylebroeck D, Verschueren K, Van Den Eijden-Van Raaij AJ (1996). „Zkrácené receptory aktivinu typu II inhibují bioaktivitu tvorbou heteromerních komplexů s receptory aktivinu typu I.“. Exp. Cell Res. 224 (2): 323–34. doi:10.1006 / excr.1996.0142. PMID 8612709.
Attisano L, Wrana JL, Montalvo E, Massagué J (1996). "Aktivace signalizace komplexem receptoru aktivinu". Mol. Buňka. Biol. 16 (3): 1066–73. doi:10.1128 / MCB.16.3.1066. PMC 231089. PMID 8622651.
Lebrun JJ, Vale WW (1997). „Aktivin a inhibin mají antagonistické účinky na ligand-dependentní heteromerizaci receptorů aktivinu typu I a typu II a diferenciaci lidských erytroidů“. Mol. Buňka. Biol. 17 (3): 1682–91. doi:10.1128 / MCB.17.3.1682. PMC 231893. PMID 9032295.
Röijer E, Miyazono K, Aström AK, Geurts van Kessel A, ten Dijke P, Stenman G (1998). „Chromozomální lokalizace tří lidských genů kódujících členy nadrodiny TGF-beta receptorů serin / threoninkinázy typu I“. Mamm. Genom. 9 (3): 266–8. doi:10,1007 / s003359900745. PMID 9501322. S2CID 21839781.
Souchelnytskyi S, Nakayama T, Nakao A, Morén A, Heldin CH, Christian JL, ten Dijke P (1998). „Fyzická a funkční interakce myší a Xenopus Smad7 s kostními morfogenetickými proteinovými receptory a receptory transformujícího růstového faktoru-beta“. J. Biol. Chem. 273 (39): 25364–70. doi:10.1074 / jbc.273.39.25364. PMID 9738003.
Hashimoto O, Yamato K, Koseki T, Ohguchi M, Ishisaki A, Shoji H, Nakamura T, Hayashi Y, Sugino H, Nishihara T (1998). „Úloha receptorů aktivinu typu I při zastavení aktivace A vyvolaném zastavením růstu a apoptóze v myších hybridomových B-buňkách“. Buňka. Signál. 10 (10): 743–9. doi:10.1016 / S0898-6568 (98) 00021-7. PMID 9884026.
Lebrun JJ, Takabe K, Chen Y, Vale W (1999). "Role dráhy specifické a inhibiční Smads v signalizaci receptoru aktivinu". Mol. Endokrinol. 13 (1): 15–23. doi:10.1210 / opravit. 13.1.0218. PMID 9892009.
Gray PC, Greenwald J, Blount AL, Kunitake KS, Donaldson CJ, Choe S, Vale W (2000). "Identifikace vazebného místa na aktivinovém receptoru typu II pro aktivin a inhibin". J. Biol. Chem. 275 (5): 3206–12. doi:10.1074 / jbc.275.5.3206. PMID 10652306.
Zhou Y, Sun H, Danila DC, Johnson SR, Sigai DP, Zhang X, Klibanski A (2000). „Zkrácené izoformy Alk4 receptoru aktivinu typu I jsou dominantní negativní receptory inhibující signalizaci aktivinu“. Mol. Endokrinol. 14 (12): 2066–75. doi:10.1210 / mě. 14.12.2066. PMID 11117535.
Su GH, Bansal R, Murphy KM, Montgomery E, Yeo CJ, Hruban RH, Kern SE (2001). "ACVR1B (ALK4, aktivinový receptor typu 1B) genové mutace v karcinomu pankreatu". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (6): 3254–7. Bibcode:2001PNAS ... 98.3254S. doi:10.1073 / pnas.051484398. PMC 30640. PMID 11248065.
Chapman SC, Woodruff TK (2001). "Modulace přenosu signálu aktivinu inhibinem B a proteinem vázajícím inhibin (INhBP)". Mol. Endokrinol. 15 (4): 668–79. doi:10.1210 / me.15.4.668. PMID 11266516.
Wurthner JU, Frank DB, Felici A, Green HM, Cao Z, Schneider MD, McNally JG, Lechleider RJ, Roberts AB (2001). „Protein 1 transformující růstový faktor-beta receptor je chadon Smad4“. J. Biol. Chem. 276 (22): 19495–502. doi:10,1074 / jbc.M006473200. PMID 11278302.
Parks WT, Frank DB, Huff C, Renfrew Haft C, Martin J, Meng X, de Caestecker MP, McNally JG, Reddi A, Taylor SI, Roberts AB, Wang T, Lechleider RJ (2001). „Třídění nexinu 6, nového SNX, interaguje s rodinou transformujících růstových faktorů beta receptorových serin-threoninových kináz“. J. Biol. Chem. 276 (22): 19332–9. doi:10,1074 / jbc.M100606200. PMID 11279102.
Birkey Reffey S, Wurthner JU, Parks WT, Roberts AB, Duckett CS (2001). „X-vázaný inhibitor proteinu apoptózy funguje jako kofaktor při transformaci signalizace růstového faktoru-beta“. J. Biol. Chem. 276 (28): 26542–9. doi:10,1074 / jbc.M100331200. PMID 11356828.
Bianco C, Adkins HB, Wechselberger C, Seno M, Normanno N, De Luca A, Sun Y, Khan N, Kenney N, Ebert A, Williams KP, Sanicola M, Salomon DS (2002). „Cripto-1 aktivuje nodální a ALK4-dependentní a nezávislé signální dráhy v prsních epiteliálních buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 22 (8): 2586–97. doi:10.1128 / MCB.22.8.2586-2597.2002. PMC 133714. PMID 11909953.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135503 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000532 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8397373-5] ten Dijke P, Ichijo H, Franzén P, Schulz P, Saras J, Toyoshima H, Heldin CH, Miyazono K (říjen 1993). „Kinázy podobné receptoru aktivinu: nová podtřída receptorů na buněčném povrchu s předpokládanou aktivitou serin / threonin kinázy“. Onkogen. 8 (10): 2879–87. PMID 8397373.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ACVR1B receptor aktivinu A, typ IB“.

[pmid12065756-7] Inman GJ, Nicolás FJ, Callahan JF, Harling JD, Gaster LM, Reith AD, Laping NJ, Hill CS (2002). „SB-431542 je silný a specifický inhibitor transformačních receptorů ALK4, ALK5 a ALK7 transformačního růstového faktoru-beta nadrodiny typu I receptoru kinázy podobné aktivinovým receptorům (ALK). Mol. Pharmacol. 62 (1): 65–74. doi:10,1124 / mol. 62.1.65. PMID 12065756.

[pmid12665502-8] Harrison CA, Gray PC, Koerber SC, Fischer W, Vale W (2003). „Identifikace funkčního vazebného místa pro aktivin na receptoru ALK4 typu I“. J. Biol. Chem. 278 (23): 21129–35. doi:10,1074 / jbc.M302015200. PMID 12665502.

[pmid8612709-9] A ^b De Winter JP, De Vries CJ, Van Achterberg TA, Ameerun RF, Feijen A, Sugino H, De Waele P, Huylebroeck D, Verschueren K, Van Den Eijden-Van Raaij AJ (květen 1996). „Zkrácené receptory aktivinu typu II inhibují bioaktivitu tvorbou heteromerních komplexů s receptory aktivinu typu I.“. Exp. Cell Res. 224 (2): 323–34. doi:10.1006 / excr.1996.0142. PMID 8612709.

[pmid9892009-10] Lebrun JJ, Takabe K, Chen Y, Vale W (leden 1999). "Role dráhy specifické a inhibiční Smads v signalizaci receptoru aktivinu". Mol. Endokrinol. 13 (1): 15–23. doi:10.1210 / opravit. 13.1.0218. PMID 9892009.

[pmid8622651-11] Attisano L, Wrana JL, Montalvo E, Massagué J (březen 1996). "Aktivace signalizace komplexem receptoru aktivinu". Mol. Buňka. Biol. 16 (3): 1066–73. doi:10.1128 / MCB.16.3.1066. PMC 231089. PMID 8622651.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )