YY1 - YY1
YY1 (Jin Jang 1)[5] je transkripční represor protein u lidí, který je kódován YY1 gen.[6][7]
Funkce
YY1 je všudypřítomně distribuovaný transkripční faktor patřící do třídy proteinů se zinkovým prstem GLI-Kruppel. Protein se podílí na represi a aktivaci různého počtu promotorů. Proto YY v názvu znamená „Yin Yang „YY1 může směrovat histon-deacetylázy a histon-acetyltransferázy na promotor, aby aktivoval nebo potlačil promotor, což implikuje modifikaci histonu ve funkci YY1.[8] YY1 podporuje smyčky zesilovače-promotoru chromatinu tvorbou dimerů a podporou interakcí DNA. Jeho dysregulace narušuje smyčky zesilovače-promotoru a genovou expresi.[9][10]
Klinický význam
YY1 heterozygotní delece, missense a nesmyslné mutace způsobují Gabriele-DeVriesův syndrom (GADEVS) [11] [12], autozomálně dominantní neurovývojová porucha charakterizovaná mentálním postižením, dysmorfickými rysy obličeje, problémy s krmením, omezením nitroděložního růstu, variabilním kognitivním poškozením, problémy s chováním a dalšími vrozenými vadami.[10] Je k dispozici webová stránka, která umožňuje shromažďovat a sdílet klinické informace mezi lékaři a rodinami postižených osob.[13]
Interakce
YY1 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100811 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000021264 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Thiaville MM, Kim J (2011). „Onkogenní potenciál jin-jangu 1 zprostředkovaný kontrolou potištěných genů“. Kritické recenze v onkogenezi. 16 (3–4): 199–209. doi:10.1615 / critrevoncog.v16.i3-4,40. PMC 3392609. PMID 22248054.
- ^ Shi Y, Seto E, Chang LS, Shenk T (říjen 1991). „Transkripční represe YY1, lidským proteinem souvisejícím s GLI-Krüppelem, a úleva od represe adenovirovým proteinem E1A“. Buňka. 67 (2): 377–88. doi:10.1016/0092-8674(91)90189-6. PMID 1655281. S2CID 19399858.
- ^ Zhu W, Lossie AC, Camper SA, Gumucio DL (duben 1994). "Chromozomální lokalizace transkripčního faktoru YY1 u myší a lidí". Savčí genom. 5 (4): 234–6. doi:10.1007 / BF00360552. hdl:2027.42/47010. PMID 7912122. S2CID 27296553.
- ^ „Entrez Gene: YY1 YY1 transkripční faktor“.
- ^ Weintraub AS, Li CH, Zamudio AV, Sigova AA, Hannett NM, Day DS a kol. (Prosinec 2017). „YY1 Is a Structural Regulator of Enhancer-Promoter Loops“. Buňka. 171 (7): 1573–1588.e28. doi:10.1016 / j.cell.2017.11.008. PMC 5785279. PMID 29224777.
- ^ A b Gabriele M, Vulto-van Silfhout AT, Germain PL, Vitriolo A, Kumar R, Douglas E a kol. (Červen 2017). „YY1 haploinsufficiency způsobuje syndrom mentálního postižení s transkripční a chromatinovou dysfunkcí“. American Journal of Human Genetics. 100 (6): 907–925. doi:10.1016 / j.ajhg.2017.05.006. PMC 5473733. PMID 28575647.
- ^ „OMIM: GABRIELE-DE VRIES SYNDROME“.
- ^ Nabais Sá, M. J .; Gabriele, M .; Testa, G .; de Vries BBA; Adam, M. P .; Ardinger, H. H .; Pagon, R. A .; Wallace, S.E .; Fazole LJH; Stephens, K .; Amemiya, A. (1993). „Gabriele-de Vriesův syndrom“. PMID 31145572. Citovat deník vyžaduje
| deník =
(Pomoc) - ^ „YY1 - Shromažďování informací o řízení klinik a výzkumných projektech“. YY1.
- ^ Li M, Baumeister P, Roy B, Phan T, Foti D, Luo S, Lee AS (červenec 2000). „ATF6 jako aktivátor transkripce stresového prvku endoplazmatického retikula: změny vyvolané stresem thapsigarginem a synergické interakce s NF-Y a YY1“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (14): 5096–106. doi:10.1128 / mcb.20.14.5096-5106.2000. PMC 85959. PMID 10866666.
- ^ A b C Yao YL, Yang WM, Seto E (září 2001). "Regulace transkripčního faktoru YY1 acetylací a deacetylací". Molekulární a buněčná biologie. 21 (17): 5979–91. doi:10.1128 / mcb.21.17.5979-5991.2001. PMC 87316. PMID 11486036.
- ^ Lee JS, Galvin KM, viz RH, Eckner R, Livingston D, Moran E, Shi Y (květen 1995). „Úleva od transkripce YY1 adenovirem E1A je zprostředkována proteinem p300 asociovaným s E1A“. Geny a vývoj. 9 (10): 1188–98. doi:10.1101 / gad.9.10.1188. PMID 7758944.
- ^ Yang WM, Yao YL, Seto E (září 2001). „Protein 25 vázající FK506 se funkčně asociuje s histonovými deacetylázami a s transkripčním faktorem YY1“. Časopis EMBO. 20 (17): 4814–25. doi:10.1093 / emboj / 20.17.4814. PMC 125595. PMID 11532945.
- ^ A b Yang WM, Yao YL, Sun JM, Davie JR, Seto E (říjen 1997). „Izolace a charakterizace cDNA odpovídající dalšímu členu rodiny genů lidské histonové deacetylázy“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (44): 28001–7. doi:10.1074 / jbc.272.44.28001. PMID 9346952.
- ^ Kalenik JL, Chen D, Bradley ME, Chen SJ, Lee TC (únor 1997). „Kvasinkové dvouhybridní klonování nového proteinu se zinkovým prstem, který interaguje s multifunkčním transkripčním faktorem YY1“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (4): 843–9. doi:10.1093 / nar / 25.4.843. PMC 146511. PMID 9016636.
- ^ Shrivastava A, Saleque S, Kalpana GV, Artandi S, Goff SP, Calame K (prosinec 1993). "Inhibice transkripčního regulátoru Yin-Yang-1 spojením s c-Myc". Věda. 262 (5141): 1889–92. Bibcode:1993Sci ... 262.1889S. doi:10.1126 / science.8266081. PMID 8266081.
- ^ Yeh TS, Lin YM, Hsieh RH, Tseng MJ (říjen 2003). „Sdružení transkripčního faktoru YY1 s vysokomolekulárním Notch komplexem potlačuje transaktivační aktivitu Notch“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (43): 41963–9. doi:10,1074 / jbc.M304353200. PMID 12913000.
- ^ García E, Marcos-Gutiérrez C, del Mar Lorente M, Moreno JC, Vidal M (červen 1999). „RYBP, nový represorový protein, který interaguje se složkami savčího komplexu Polycomb a s transkripčním faktorem YY1“. Časopis EMBO. 18 (12): 3404–18. doi:10.1093 / emboj / 18.12.3404. PMC 1171420. PMID 10369680.
- ^ Huang NE, Lin CH, Lin YS, Yu WC (červen 2003). Msgstr "Modulace aktivity YY1 pomocí SAP30". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 306 (1): 267–75. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 00966-5. PMID 12788099.
- ^ Fu CY, Wang P, Tsai HJ (listopad 2017). „Konkurenční vazba mezi komplexem Seryl-tRNA syntetáza / YY1 a NFKB1 v distálním segmentu vede k diferenciální regulaci aktivity promotoru lidské vegfa během angiogeneze“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (5): 2423–2437. doi:10.1093 / nar / gkw1187. PMC 5389716. PMID 27913726.
Další čtení
- Thomas MJ, Seto E (srpen 1999). "Odblokování mechanismů transkripčního faktoru YY1: jsou klíčem enzymy modifikující chromatin?". Gen. 236 (2): 197–208. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00261-9. PMID 10452940.
- Park K, Atchison ML (listopad 1991). „Izolace potenciálního represoru / aktivátoru, NF-E1 (YY-1, delta), který se váže na zesilovač 3 'imunoglobulinu a místo E1 těžkého řetězce imunoglobulinu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (21): 9804–8. Bibcode:1991PNAS ... 88.9804P. doi:10.1073 / pnas.88.21.9804. PMC 52809. PMID 1946405.
- Yang WM, Inouye CJ, Seto E (červen 1995). „Cyklofilin A a FKBP12 interagují s YY1 a mění jeho transkripční aktivitu.“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (25): 15187–93. doi:10.1074 / jbc.270.25.15187. PMID 7541038.
- Lee JS, Galvin KM, viz RH, Eckner R, Livingston D, Moran E, Shi Y (květen 1995). „Úleva od transkripce YY1 adenovirem E1A je zprostředkována proteinem p300 asociovaným s E1A“. Geny a vývoj. 9 (10): 1188–98. doi:10.1101 / gad.9.10.1188. PMID 7758944.
- Zhou Q, Gedrich RW, Engel DA (červenec 1995). „Transkripční represe genu c-fos pomocí YY1 je zprostředkována přímou interakcí s ATF / CREB“. Journal of Virology. 69 (7): 4323–30. doi:10.1128 / JVI.69.7.4323-4330.1995. PMC 189172. PMID 7769693.
- Shrivastava A, Saleque S, Kalpana GV, Artandi S, Goff SP, Calame K (prosinec 1993). "Inhibice transkripčního regulátoru Yin-Yang-1 spojením s c-Myc". Věda. 262 (5141): 1889–92. Bibcode:1993Sci ... 262.1889S. doi:10.1126 / science.8266081. PMID 8266081.
- Becker KG, Swergold GD, Ozato K, Thayer RE (říjen 1993). "Vazba všudypřítomného nukleárního transkripčního faktoru YY1 na cis regulační sekvenci v lidském LINE-1 transponovatelném prvku". Lidská molekulární genetika. 2 (10): 1697–702. doi:10,1093 / hmg / 2.10.1697. PMID 8268924.
- Margolis DM, Somasundaran M, Green MR (únor 1994). „Lidský transkripční faktor YY1 potlačuje transkripci viru lidské imunodeficience typu 1 a produkci virionů“. Journal of Virology. 68 (2): 905–10. doi:10.1128 / JVI.68.2.905-910.1994. PMC 236527. PMID 8289393.
- Lee JS, Galvin KM, Shi Y (červenec 1993). „Důkazy o fyzické interakci mezi transkripčními faktory zinkového prstu YY1 a Sp1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (13): 6145–9. Bibcode:1993PNAS ... 90.6145L. doi:10.1073 / pnas.90.13.6145. PMC 46884. PMID 8327494.
- Yang WM, Inouye C, Zeng Y, Bearss D, Seto E (listopad 1996). „Transkripční represe prostřednictvím YY1 je zprostředkována interakcí s savčím homologem kvasinkového globálního regulátoru RPD3“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (23): 12845–50. Bibcode:1996PNAS ... 9312845Y. doi:10.1073 / pnas.93.23.12845. PMC 24008. PMID 8917507.
- Houbaviy HB, Usheva A, Shenk T, Burley SK (listopad 1996). "Kokrystalická struktura YY1 vázaná na iniciátor viru P5 spojený s adeno". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (24): 13577–82. Bibcode:1996PNAS ... 9313577H. doi:10.1073 / pnas.93.24.13577. PMC 19349. PMID 8942976.
- Kalenik JL, Chen D, Bradley ME, Chen SJ, Lee TC (únor 1997). „Kvasinkové dvouhybridní klonování nového proteinu se zinkovým prstem, který interaguje s multifunkčním transkripčním faktorem YY1“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (4): 843–9. doi:10.1093 / nar / 25.4.843. PMC 146511. PMID 9016636.
- Cole EG, Gaston K (září 1997). „Funkční vazebné místo YY1 je nezbytné a dostatečné k aktivaci aktivity promotoru Surf-1 v reakci na růstové faktory v séru.“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (18): 3705–11. doi:10.1093 / nar / 25.18.3705. PMC 146936. PMID 9278494.
- Yang WM, Yao YL, Sun JM, Davie JR, Seto E (říjen 1997). „Izolace a charakterizace cDNA odpovídající dalšímu členu rodiny genů lidské histonové deacetylázy“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (44): 28001–7. doi:10.1074 / jbc.272.44.28001. PMID 9346952.
- Romerio F, Gabriel MN, Margolis DM (prosinec 1997). „Represe viru lidské imunodeficience typu 1 prostřednictvím nové spolupráce lidských faktorů YY1 a LSF“. Journal of Virology. 71 (12): 9375–82. doi:10.1128 / JVI.71.12.9375-9382.1997. PMC 230241. PMID 9371597.
- McNeil S, Guo B, Stein JL, Lian JB, Bushmeyer S, Seto E, Atchison ML, Penman S, van Wijnen AJ, Stein GS (březen 1998). „Cílení transkripčního faktoru YY1 na jádro a jadernou matrici in situ: C-konec je hlavním určujícím činitelem pro jaderný obchod“. Journal of Cellular Biochemistry. 68 (4): 500–10. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980315) 68: 4 <500 :: AID-JCB9> 3.0.CO; 2-U. PMID 9493912.
- Viles JH, Patel SU, Mitchell JB, Moody CM, Justice DE, Uppenbrink J, Doyle PM, Harris CJ, Sadler PJ, Thornton JM (červen 1998). "Design, syntéza a struktura zinkového prstu s umělou beta zatáčkou". Journal of Molecular Biology. 279 (4): 973–86. doi:10.1006 / jmbi.1998.1764. PMID 9642075.
- Yao YL, Dupont BR, Ghosh S, Fang Y, Leach RJ, Seto E (srpen 1998). „Klonování, chromozomální lokalizace a analýza promotoru lidského transkripčního faktoru YY1“. Výzkum nukleových kyselin. 26 (16): 3776–83. doi:10.1093 / nar / 26.16.3776. PMC 147783. PMID 9685495.