BATF (gen) - BATF (gene)

BATF
Identifikátory
Aliasy	BATF, B-ATF, BATF1, SFA-2, SFA2, základní leucinový zip ATF-podobný transkripční faktor
Externí ID	OMIM: 612476 MGI: 1859147 HomoloGene: 4666 Genové karty: BATF
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	75,546,993 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	85,709,087 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Diferenciace buněk T-pomocníka 2; • produkce cytokinů; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53; • diferenciace myeloidních dendritických buněk; • diferenciace lymfoidních progenitorových buněk; • Závazek T-helper 17 buněčné linie; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • diferenciace hematopoetických kmenových buněk; • přepínání izotypů; • Diferenciace buněk T-pomocníka 17; • obranná reakce na prvoky; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10538
	53314
	ENSG00000156127
	ENSMUSG00000034266
	Q16520
	O35284
	NM_006399
	NM_016767
	NP_006390
	NP_058047
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Základní transkripční faktor leucinového zipu, podobný ATF, také známý jako BATF, je protein který je u lidí kódován BATF gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je nukleární základní leucinový zip (bZIP ) protein, který patří do AP-1 /ATF nadčeleď transkripční faktory. Leucinový zip tohoto proteinu zprostředkovává dimerizaci se členy Červen rodina proteinů. Tento protein je považován za negativní regulátor transkripčních událostí AP-1 / ATF.^[7]

Myši bez genu BATF (BATF knockout myši ) chyběl typ zánětlivých imunitních buněk (Čt17 ) a byly odolné vůči podmínkám, které normálně indukují autoimunitní stav podobný roztroušená skleróza.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že BATF (gen) komunikovat s IFI35.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156127 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034266 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dorsey MJ, Tae HJ, Sollenberger KG, Mascarenhas NT, Johansen LM, Taparowsky EJ (prosinec 1995). „B-ATF: nový lidský protein bZIP, který se asociuje se členy rodiny transkripčních faktorů AP-1“. Onkogen. 11 (11): 2255–65. PMID 8570175.
^ Hasegawa H, Utsunomiya Y, Kishimoto K, Tange Y, Yasukawa M, Fujita S (květen 1996). „SFA-2, nový bZIP transkripční faktor indukovaný virem lidské leukémie typu T buněk I, je vysoce exprimován ve zralých lymfocytech.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 222 (1): 164–70. doi:10.1006 / bbrc.1996.0700. PMID 8630063.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BATF základní transkripční faktor leucinového zipu, podobný ATF“.
^ Schraml BU, Hildner K, Ise W, Lee WL, Smith WA, Solomon B, Sahota G, Sim J, Mukasa R, Cemerski S, Hatton RD, Stormo GD, Weaver CT, Russell JH, Murphy TL, Murphy KM (červenec 2009 ). „Transkripční faktor AP-1 Batf řídí diferenciaci TH17“. Příroda. 460 (7253): 405–9. doi:10.1038 / nature08114. PMC 2716014. PMID 19578362. Shrnutí ležel – eurekalert.org (2009-07-16).
^ Wang X, Johansen LM, Tae HJ, Taparowsky EJ (1996). „IFP 35 tvoří komplexy s B-ATF, členem rodiny transkripčních faktorů AP1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229 (1): 316–22. doi:10.1006 / bbrc.1996.1799. PMID 8954125.

Další čtení

Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Deppmann CD, Thornton TM, Utama FE, Taparowsky EJ (2003). „Fosforylace BATF reguluje vazbu DNA: nový mechanismus regulace AP-1 (aktivátorový protein-1)“. Biochem. J. 374 (Pt 2): 423–31. doi:10.1042 / BJ20030455. PMC 1223616. PMID 12809553.
Johansen LM, CD Deppmann, Erickson KD, Coffin WF, Thornton TM, Humphrey SE, Martin JM, Taparowsky EJ (2003). „EBNA2 a aktivovaný zářez indukují expresi BATF“. J. Virol. 77 (10): 6029–40. doi:10.1128 / JVI.77.10.6029-6040.2003. PMC 154003. PMID 12719594.
Williams KL, Zullo AJ, Kaplan MH, Brutkiewicz RR, CD Deppmann, Vinson C, Taparowsky EJ (2003). „BATF transgenní myši odhalují roli aktivátorového proteinu-1 při vývoji NKT buněk“. J. Immunol. 170 (5): 2417–26. doi:10,4049 / jimmunol.170.5.2417. PMID 12594265.
Echlin DR, Tae HJ, Mitin N, Taparowsky EJ (2000). „B-ATF funguje jako negativní regulátor transkripce zprostředkované AP-1 a blokuje buněčnou transformaci pomocí Ras a Fos“. Onkogen. 19 (14): 1752–63. doi:10.1038 / sj.onc.1203491. PMID 10777209.
Meyer NP, Johansen LM, Tae HJ, Budde PP, Williams KL, Taparowsky EJ (1998). „Genomická organizace lidského B-ATF, cíl regulace pomocí EBV a HTLV-1“. Mamm. Genom. 9 (10): 849–52. doi:10,1007 / s003359900881. PMID 9745044. S2CID 36362547.
Wang X, Johansen LM, Tae HJ, Taparowsky EJ (1997). „IFP 35 tvoří komplexy s B-ATF, členem rodiny transkripčních faktorů AP1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229 (1): 316–22. doi:10.1006 / bbrc.1996.1799. PMID 8954125.
Hasegawa H, Utsunomiya Y, Kishimoto K, Tange Y, Yasukawa M, Fujita S (1996). „SFA-2, nový transkripční faktor bZIP indukovaný virem lidské leukémie typu T buněk I, je vysoce exprimován ve zralých lymfocytech.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 222 (1): 164–70. doi:10.1006 / bbrc.1996.0700. PMID 8630063.
Dorsey MJ, Tae HJ, Sollenberger KG, Mascarenhas NT, Johansen LM, Taparowsky EJ (1996). „B-ATF: nový lidský protein bZIP, který se asociuje se členy rodiny transkripčních faktorů AP-1“. Onkogen. 11 (11): 2255–65. PMID 8570175.

externí odkazy

BATF + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook BATF
Člověk BATF umístění genomu a BATF stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156127 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034266 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8570175-5] Dorsey MJ, Tae HJ, Sollenberger KG, Mascarenhas NT, Johansen LM, Taparowsky EJ (prosinec 1995). „B-ATF: nový lidský protein bZIP, který se asociuje se členy rodiny transkripčních faktorů AP-1“. Onkogen. 11 (11): 2255–65. PMID 8570175.

[pmid8630063-6] Hasegawa H, Utsunomiya Y, Kishimoto K, Tange Y, Yasukawa M, Fujita S (květen 1996). „SFA-2, nový bZIP transkripční faktor indukovaný virem lidské leukémie typu T buněk I, je vysoce exprimován ve zralých lymfocytech.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 222 (1): 164–70. doi:10.1006 / bbrc.1996.0700. PMID 8630063.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: BATF základní transkripční faktor leucinového zipu, podobný ATF“.

[pmid19578362-8] Schraml BU, Hildner K, Ise W, Lee WL, Smith WA, Solomon B, Sahota G, Sim J, Mukasa R, Cemerski S, Hatton RD, Stormo GD, Weaver CT, Russell JH, Murphy TL, Murphy KM (červenec 2009 ). „Transkripční faktor AP-1 Batf řídí diferenciaci TH17“. Příroda. 460 (7253): 405–9. doi:10.1038 / nature08114. PMC 2716014. PMID 19578362. Shrnutí ležel – eurekalert.org (2009-07-16).

[pmid8954125-9] Wang X, Johansen LM, Tae HJ, Taparowsky EJ (1996). „IFP 35 tvoří komplexy s B-ATF, členem rodiny transkripčních faktorů AP1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229 (1): 316–22. doi:10.1006 / bbrc.1996.1799. PMID 8954125.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Regulome
Inhibuje	AP-1, BZLF1