SKIL - SKIL - Wikipedia

SKIL
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3EQ5
Identifikátory
Aliasy	SKIL, SNO, SnoA, SnoI, SnoN, protoonkogen podobný SKI, protoonkogen podobný SKI
Externí ID	OMIM: 165340 MGI: 106203 HomoloGene: 3948 Genové karty: SKIL
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	170,396,835 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	31,122,577 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • SMAD vazba; • vazba chromatinu; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Tělo PML; • nukleoplazma; • Akrozom; • buněčné jádro; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• pozitivní regulace vnější apoptotické signální dráhy prostřednictvím receptorů domény smrti; • reakce na cytokiny; • homeostáza lymfocytů; • reakce na antibiotikum; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • tvorba blastocyst; • pozitivní regulace axonogeneze; • homotrimerizace bílkovin; • diferenciace buněk optických vláken; • pozitivní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy v reakci na poškození DNA; • spermatogeneze; • heterotrimerizace bílkovin; • reakce na růstový faktor; • vývoj tkáně kosterního svalstva; • negativní regulace signální dráhy BMP; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • negativní regulace signální dráhy receptoru beta transformujícího růstového faktoru; • vývoj neuronů; • zástava buněčného cyklu; • negativní regulace buněčné diferenciace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6498
	20482
	ENSG00000136603
	ENSMUSG00000027660
	P12757
	Q60665
	NM_001145097; NM_001145098; NM_001248008; NM_005414
	NM_001039090; NM_001271772; NM_011386
	NP_001138569; NP_001138570; NP_001234937; NP_005405
	NP_001034179; NP_001258701; NP_035516
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Lyžařský protein je protein že u lidí je kódován SKIL gen.^[5]^[6]

Interakce

SKIL interaguje s SKI protein,^[7] Matky proti dekapentaplegickému homologu 3^[8]^[9] a Matky proti dekapentaplegickému homologu 2.^[8]^[9]

Rodina bílkovin

SKIL patří do rodiny Ski / Sno / Dac, kterou sdílí SKI protein, Jezevčík, a SKIDA1.^[10] Členové rodiny Ski / Sno / Dac sdílejí doménu o délce přibližně 100 aminokyselin.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136603 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027660 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nomura N; Sasamoto S; Ishii S; Datum T; Matsui M; Ishizaki R (září 1989). "Izolace lidských cDNA klonů lyží a genu souvisejícího s lyží, sno". Nucleic Acids Res. 17 (14): 5489–500. doi:10.1093 / nar / 17.14.5489. PMC 318172. PMID 2762147.
^ „Entrez Gene: SKIL SKI-like oncogene“.
^ Cohen, SB; Zheng G; Heyman HC; Stavnezer E (únor 1999). „Heterodimery onkoproteinů SnoN a Ski se tvoří přednostně před homodimery a jsou účinnějšími transformačními činidly“. Nucleic Acids Res. ANGLIE. 27 (4): 1006–14. doi:10.1093 / nar / 27.4.1006. ISSN 0305-1048. PMC 148280. PMID 9927733.
^ ^A ^b Stroschein, SL; Bonni S; Wrana JL; Luo K (listopad 2001). „Smad3 rekrutuje komplex podporující anafázu pro ubikvitinaci a degradaci SnoN“. Genes Dev. Spojené státy. 15 (21): 2822–36. doi:10,1101 / gad. 912901 (neaktivní 11. 10. 2020). ISSN 0890-9369. PMC 312804. PMID 11691834.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
^ ^A ^b Stroschein, SL; Wang W; Zhou S; Zhou Q; Luo K (říjen 1999). „Negativní zpětnovazební regulace signalizace TGF-beta pomocí onkoproteinu SnoN“. Věda. SPOJENÉ STÁTY. 286 (5440): 771–4. doi:10.1126 / science.286.5440.771. ISSN 0036-8075. PMID 10531062.
^ „Conserved Protein Domain Family Ski_Sno“. NCBI. Citováno 5. května 2019.

Další čtení

Pearson-White S (1993). „SnoI, nová alternativně sestříhaná izoforma homologu lyžařského protoonkogenu, sno“. Nucleic Acids Res. 21 (19): 4632–8. doi:10.1093 / nar / 21.19.4632. PMC 311202. PMID 8233802.
Pearson-White S; Crittenden R (1997). „Exprese protoonkogenu Sno, alternativní izoformy a okamžitá časná odezva séra“. Nucleic Acids Res. 25 (14): 2930–7. doi:10.1093 / nar / 25.14.2930. PMC 146803. PMID 9207045.
Cohen SB; Zheng G; Heyman HC; Stavnezer E (1999). „Heterodimery onkoproteinů SnoN a Ski se tvoří přednostně před homodimery a jsou účinnějšími transformačními činidly“. Nucleic Acids Res. 27 (4): 1006–14. doi:10.1093 / nar / 27.4.1006. PMC 148280. PMID 9927733.
Stroschein SL, Wang W, Zhou S a kol. (1999). „Negativní zpětnovazební regulace signalizace TGF-beta pomocí onkoproteinu SnoN“. Věda. 286 (5440): 771–4. doi:10.1126 / science.286.5440.771. PMID 10531062.
Bonni S, Wang HR, Causing CG a kol. (2001). „TGF-beta indukuje sestavení komplexu ubikvitin ligázy Smad2-Smurf2, který je zaměřen na degradaci SnoN“. Nat. Cell Biol. 3 (6): 587–95. doi:10.1038/35078562. PMID 11389444. S2CID 23270947.
Imoto I, Pimkhaokham A, Fukuda Y a kol. (2001). „SNO je pravděpodobný cíl pro genovou amplifikaci v 3q26 v karcinomech dlaždicových buněk jícnu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 286 (3): 559–65. doi:10.1006 / bbrc.2001.5428. PMID 11511096.
Stroschein SL; Bonni S; Wrana JL; Luo K (2001). „Smad3 rekrutuje komplex podporující anafázu pro ubikvitinaci a degradaci SnoN“. Genes Dev. 15 (21): 2822–36. doi:10,1101 / gad. 912901 (neaktivní 11. 10. 2020). PMC 312804. PMID 11691834.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
Mizuide M, Hara T, Furuya T a kol. (2003). „Dva krátké segmenty Smad3 jsou důležité pro specifickou interakci Smad3 s c-Ski a SnoN“. J. Biol. Chem. 278 (1): 531–6. doi:10.1074 / jbc.C200596200. PMID 12426322.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Tomsig JL; Snyder SL; Creutz CE (2003). "Identifikace cílů pro vápníkovou signalizaci prostřednictvím kopinové rodiny proteinů. Charakterizace vazebného motivu kopin-vazba na kopin". J. Biol. Chem. 278 (12): 10048–54. doi:10,1074 / jbc.M212632200. PMID 12522145.
He J, Tegen SB, Krawitz AR a kol. (2003). „Transformační aktivita Ski a SnoN závisí na jejich schopnosti potlačovat aktivitu proteinů Smad“ (PDF). J. Biol. Chem. 278 (33): 30540–7. doi:10,1074 / jbc.M304016200. PMID 12764135. S2CID 31081406.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Sarker KP; Wilson SM; Bonni S (2005). „SnoN je mediátor specifický pro buněčný typ transformačních reakcí růstového faktoru-beta“. J. Biol. Chem. 280 (13): 13037–46. doi:10,1074 / jbc.M409367200. PMID 15677458.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Sci ... 307.1621B. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Poser I, Rothhammer T, Dooley S a kol. (2005). "Charakterizace Sno exprese u maligního melanomu". Int. J. Oncol. 26 (5): 1411–7. doi:10.3892 / ijo.26.5.1411. PMID 15809735.
Krakowski AR, Laboureau J, Mauviel A, et al. (2005). „Cytoplazmatický SnoN v normálních tkáních a nemaligních buňkách antagonizuje signalizaci TGF-β sekvestrací proteinů Smad“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (35): 12437–42. Bibcode:2005PNAS..10212437K. doi:10.1073 / pnas.0504107102. PMC 1194926. PMID 16109768.
Zhu Q; Pearson-White S; Luo K (2006). „Požadavek na onkoprotein SnoN při transformaci růstového faktoru β-indukované onkogenní transformace buněk fibroblastů“. Mol. Buňka. Biol. 25 (24): 10731–44. doi:10.1128 / MCB.25.24.10731-10744.2005. PMC 1316959. PMID 16314499.
Briones-Orta MA, Sosa-Garrocho M, Moreno-Alvarez P a kol. (2006). "SnoN ko-represor váže a potlačuje promotor genu smad7". Biochem. Biophys. Res. Commun. 341 (3): 889–94. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.01.041. PMID 16442497.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136603 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027660 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2762147-5] Nomura N; Sasamoto S; Ishii S; Datum T; Matsui M; Ishizaki R (září 1989). "Izolace lidských cDNA klonů lyží a genu souvisejícího s lyží, sno". Nucleic Acids Res. 17 (14): 5489–500. doi:10.1093 / nar / 17.14.5489. PMC 318172. PMID 2762147.

[entrez-6] „Entrez Gene: SKIL SKI-like oncogene“.

[pmid9927733-7] Cohen, SB; Zheng G; Heyman HC; Stavnezer E (únor 1999). „Heterodimery onkoproteinů SnoN a Ski se tvoří přednostně před homodimery a jsou účinnějšími transformačními činidly“. Nucleic Acids Res. ANGLIE. 27 (4): 1006–14. doi:10.1093 / nar / 27.4.1006. ISSN 0305-1048. PMC 148280. PMID 9927733.

[pmid11691834-8] A ^b Stroschein, SL; Bonni S; Wrana JL; Luo K (listopad 2001). „Smad3 rekrutuje komplex podporující anafázu pro ubikvitinaci a degradaci SnoN“. Genes Dev. Spojené státy. 15 (21): 2822–36. doi:10,1101 / gad. 912901 (neaktivní 11. 10. 2020). ISSN 0890-9369. PMC 312804. PMID 11691834.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)

[pmid10531062-9] A ^b Stroschein, SL; Wang W; Zhou S; Zhou Q; Luo K (říjen 1999). „Negativní zpětnovazební regulace signalizace TGF-beta pomocí onkoproteinu SnoN“. Věda. SPOJENÉ STÁTY. 286 (5440): 771–4. doi:10.1126 / science.286.5440.771. ISSN 0036-8075. PMID 10531062.

[10] „Conserved Protein Domain Family Ski_Sno“. NCBI. Citováno 5. května 2019.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]