HOXB7 - HOXB7

HOXB7
Identifikátory
Aliasy	HOXB7, HHO.C1, HOX2, HOX2C, Hox-2.3, homeobox B7
Externí ID	OMIM: 142962 MGI: 96188 HomoloGene: 55828 Genové karty: HOXB7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	48,633,572 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	96,290,162 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderné těleso;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • morfogeneze embryonálního kostního systému; • diferenciace myeloidních buněk; • pozitivní regulace větvení účastnící se morfogeneze ureterálních pupenů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • specifikace předního / zadního vzoru; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3217
	15415
	ENSG00000260027
	ENSMUSG00000038721
	P09629
	P09024
	NM_004502
	NM_010460
	NP_004493
	NP_034590
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-B7 je protein že u lidí je kódován HOXB7 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen je členem rodiny homeoboxů Antp a kóduje protein s doménou vázající homeobox DNA. Je obsažen v klastru homeoboxových B genů umístěných na chromozomu 17. Kódovaný jaderný protein funguje jako sekvenčně specifický transkripční faktor, který se podílí na buněčné proliferaci a diferenciaci. Zvýšená exprese tohoto genu je spojena s některými případy melanomu a karcinomu vaječníků.^[7]

Interakce

HOXB7 bylo prokázáno komunikovat s PBX1^[8] a CREB-vazebný protein.^[9]

Viz také

Homeobox

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000260027 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038721 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ McAlpine PJ, Ukazuje TB (srpen 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.
^ Scott MP (prosinec 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–553. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ „Entrez Gene: HOXB7 homeobox B7“.
^ Chang CP, Shen WF, Rozenfeld S, Lawrence HJ, Largman C, Cleary ML (březen 1995). „Proteiny Pbx vykazují kooperativní vazbu DNA závislou na hexapeptidu s podmnožinou proteinů Hox“. Genes Dev. 9 (6): 663–674. doi:10,1101 / gad. 9.6.663. PMID 7729685.
^ Chariot A, van Lint C, Chapelier M, Gielen J, Merville MP, Bours V (červenec 1999). „Inhibice CBP a histon-deacetylázy zvyšuje transaktivační potenciál proteinu obsahujícího homeodoménu HOXB7“. Onkogen. 18 (27): 4007–4014. doi:10.1038 / sj.onc.1202776. PMID 10435624.

Další čtení

Baier LJ, Hannibal MC, Hanley EW, Nabel GJ (1991). "Exprese lymfoidů a vazba TATAA na lidský protein obsahující homeodoménu Antennapedia". Krev. 78 (4): 1047–1055. doi:10.1182 / krev.V78.4.1047.1047. PMID 1678287.
Peverali FA, D'Esposito M, Acampora D, Bunone G, Negri M, Faiella A, Stornaiuolo A, Pannese M, Migliaccio E, Simeone A (1990). "Exprese HOX homeogenů v buněčných kulturních liniích lidského neuroblastomu". Diferenciace. 45 (1): 61–69. doi:10.1111 / j.1432-0436.1990.tb00458.x. PMID 1981366.
Giampaolo A, Acampora D, Zappavigna V, Pannese M, D'Esposito M, Carè A, Faiella A, Stornaiuolo A, Russo G, Simeone A (1989). „Diferenciální exprese lidských genů HOX-2 podél předozadní osy v embryonálním centrálním nervovém systému“. Diferenciace. 40 (3): 191–197. doi:10.1111 / j.1432-0436.1989.tb00598.x. PMID 2570724.
Shen WF, Largman C, Lowney P, Corral JC, Detmer K, Hauser CA, Simonitch TA, Hack FM, Lawrence HJ (1989). „Exprese genů obsahujících homeobox v lidských hematopoetických buněčných liniích omezená na počet řádků“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (21): 8536–8540. Bibcode:1989PNAS ... 86.8536S. doi:10.1073 / pnas.86.21.8536. PMC 298317. PMID 2573064.
Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (1989). "Lidská genová rodina HOX". Nucleic Acids Res. 17 (24): 10385–10402. doi:10.1093 / nar / 17.24.10385. PMC 335308. PMID 2574852.
Boncinelli E, Acampora D, Pannese M, D'Esposito M, Somma R, Gaudino G, Stornaiuolo A, Cafiero M, Faiella A, Simeone A (1989). "Organizace homeoboxních genů lidské třídy I". Genom. 31 (2): 745–756. doi:10,1139 / g89-133. PMID 2576652.
Simeone A, Mavilio F, Acampora D, Giampaolo A, Faiella A, Zappavigna V, D'Esposito M, Pannese M, Russo G, Boncinelli E (1987). „Dva lidské homeoboxové geny, C1 a C8: strukturní analýza a exprese v embryonálním vývoji“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (14): 4914–4918. Bibcode:1987PNAS ... 84.4914S. doi:10.1073 / pnas.84.14.4914. PMC 305217. PMID 2885844.
Lill MC, Fuller JF, Herzig R, Crooks GM, Gasson JC (1995). „Role genu homeoboxu, HOX B7, v lidské myelomonocytové diferenciaci“. Krev. 85 (3): 692–697. doi:10.1182 / krev.V85.3.692.bloodjournal853692. PMID 7530503.
Chang CP, Shen WF, Rozenfeld S, Lawrence HJ, Largman C, Cleary ML (1995). „Proteiny Pbx vykazují kooperativní vazbu DNA závislou na hexapeptidu s podmnožinou proteinů Hox“. Genes Dev. 9 (6): 663–674. doi:10,1101 / gad. 9.6.663. PMID 7729685.
Corsetti MT, Levi G, Lancia F, Sanseverino L, Ferrini S, Boncinelli E, Corte G (1995). "Nukleolární lokalizace tří Hox homeoproteinů". J. Cell Sci. 108 (1): 187–193. PMID 7738096.
Inamori K, Takeshita K, Chiba S, Yazaki Y, Hirai H (1993). "Identifikace genů homeoboxu exprimovaných v lidských T-lymfocytech". Biochem. Biophys. Res. Commun. 196 (1): 203–208. doi:10.1006 / bbrc.1993.2235. PMID 8105782.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–174. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Miano JM, Firulli AB, Olson EN, Hara P, Giachelli CM, Schwartz SM (1996). „Omezená exprese genů homeoboxu odlišuje fetální buňky od buněk hladkého svalstva dospělých lidí“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (2): 900–905. Bibcode:1996PNAS ... 93..900M. doi:10.1073 / pnas.93.2.900. PMC 40155. PMID 8570656.
Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). "Jemné mapování lidských genových shluků HOX". Cytogenet. Cell Genet. 73 (1–2): 114–115. doi:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Caré A, Silvani A, Meccia E, Mattia G, Stoppacciaro A, Parmiani G, Peschle C, Colombo MP (1996). „HOXB7 konstitutivně aktivuje základní růstový faktor fibroblastů u melanomů“. Mol. Buňka. Biol. 16 (9): 4842–4851. doi:10,1128 / mcb.16.9.4842. PMC 231486. PMID 8756643.
LeBrun DP, Matthews BP, Feldman BJ, Cleary ML (1997). „Chimérické onkoproteiny E2A-PBX1 a E2A-HLF jsou koncentrovány ve sférických jaderných doménách“. Onkogen. 15 (17): 2059–2067. doi:10.1038 / sj.onc.1201367. PMID 9366523.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–156. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Stelnicki EJ, Kömüves LG, Kwong AO, Holmes D, Klein P, Rozenfeld S, Lawrence HJ, Adzick NS, Harrison M, Largman C (1998). „Geny homeoboxů HOX vykazují během vývoje lidské kůže prostorové a časové změny v expresi“. J. Invest. Dermatol. 110 (2): 110–115. doi:10.1046 / j.1523-1747.1998.00092.x. PMID 9457903.