IRF2 - IRF2

IRF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 IRF, 1IRG, 2IRF
Identifikátory
Aliasy	IRF2, IRF-2, interferonový regulační faktor 2
Externí ID	OMIM: 147576 MGI: 96591 HomoloGene: 1659 Genové karty: IRF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	184,474,580 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	46,847,458 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • ohnisková adheze; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• interferon-gama zprostředkovaná signální dráha; • buněčná proliferace; • srážení krve; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • interferonová signální dráha typu I; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • proces imunitního systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3660
	16363
	ENSG00000168310
	ENSMUSG00000031627
	P14316
	P23906
	NM_002199
	NM_008391
	NP_002190
	NP_032417
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interferonový regulační faktor 2 je protein že u lidí je kódován IRF2 gen.^[5]

Funkce

IRF2 kóduje interferonový regulační faktor 2, člen rodiny interferonového regulačního transkripčního faktoru (IRF). IRF2 kompetitivně inhibuje IRF1 zprostředkovaná transkripční aktivace interferonů alfa a beta a pravděpodobně dalších genů, které pro aktivaci transkripce používají IRF1. IRF2 však také funguje jako transkripční aktivátor histon H4.^[6]

Viz také

Interakce

Bylo prokázáno, že IRF2 komunikovat s BRD7,^[7] EP300^[8] a PCAF.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168310 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031627 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Harada H, Fujita T, Miyamoto M, Kimura Y, Maruyama M, Furia A, Miyata T, Taniguchi T (září 1989). „Strukturálně podobné, ale funkčně odlišné faktory, IRF-1 a IRF-2, se vážou na stejné regulační prvky IFN a IFN-indukovatelných genů“. Buňka. 58 (4): 729–39. doi:10.1016/0092-8674(89)90107-4. PMID 2475256. S2CID 2033941.
^ "Entrez Gene: IRF2 interferon regulační faktor 2".
^ Staal A, Enserink JM, Stein JL, Stein GS, van Wijnen AJ (listopad 2000). "Molekulární charakterizace celtix-1, bromodoménového proteinu interagujícího s transkripčním faktorem interferonovým regulačním faktorem 2". J. Cell. Physiol. 185 (2): 269–79. doi:10.1002 / 1097-4652 (200011) 185: 2 <269 :: AID-JCP12> 3.0.CO; 2-L. PMID 11025449.
^ ^A ^b Masumi A, Ozato K (červen 2001). „Koaktivátor p300 acetyluje interferonový regulační faktor-2 v buňkách U937 po ošetření forbolesterem“. J. Biol. Chem. 276 (24): 20973–80. doi:10,1074 / jbc.M101707200. PMID 11304541.
^ Masumi A, Wang IM, Lefebvre B, Yang XJ, Nakatani Y, Ozato K (březen 1999). „Histonacetyláza PCAF je Phorbol-Esterem indukovatelný koaktivátor rodiny IRF, který poskytuje zvýšenou odezvu na interferony“. Mol. Buňka. Biol. 19 (3): 1810–20. doi:10.1128 / MCB.19.3.1810. PMC 83974. PMID 10022868.

Další čtení

Harada H, Taniguchi T, Tanaka N (1999). "Role interferonových regulačních faktorů v interferonovém systému a kontrole buněčného růstu". Biochimie. 80 (8–9): 641–50. doi:10.1016 / S0300-9084 (99) 80017-0. PMID 9865486.
Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, Hiscott J, Moore PA (1999). „Role interferonových regulačních faktorů (IRF) ve virem zprostředkované signalizaci a regulaci buněčného růstu“. Biochimie. 80 (8–9): 651–8. doi:10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2. PMID 9865487.
Itoh S, Harada H, Fujita T, Mimura T, Taniguchi T (1989). "Pořadí cDNA kódující lidský IRF-2". Nucleic Acids Res. 17 (20): 8372. doi:10.1093 / nar / 17.20.8372. PMC 334978. PMID 2813069.
Harada H, Takahashi E, Itoh S, Harada K, Hori TA, Taniguchi T (1994). „Struktura a regulace genů pro lidský interferonový regulační faktor 1 (IRF-1) a IRF-2: důsledky pro genovou síť v interferonovém systému“. Mol. Buňka. Biol. 14 (2): 1500–9. doi:10.1128 / MCB.14.2.1500. PMC 358505. PMID 7507207.
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). „Počáteční hodnocení diverzity lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Sharf R, Azriel A, Lejbkowicz F, Winograd SS, Ehrlich R, Levi BZ (1995). „Analýza funkční domény interferonového konsensuálního proteinu vázajícího sekvenci (ICSBP) a jeho asociace s regulačními faktory interferonu“. J. Biol. Chem. 270 (22): 13063–9. doi:10.1074 / jbc.270.22.13063. PMID 7768900.
Cha Y, Deisseroth AB (1994). "Lidský interferonový regulační faktor 2 gen. Organizace intron-exon a funkční analýza 5'-přilehlé oblasti". J. Biol. Chem. 269 (7): 5279–87. PMID 8106512.
Harada H, Kitagawa M, Tanaka N, Yamamoto H, Harada K, Ishihara M, Taniguchi T (1993). "Anti-onkogenní a onkogenní potenciály interferonových regulačních faktorů-1 a -2". Věda. 259 (5097): 971–4. Bibcode:1993Sci ... 259..971H. doi:10.1126 / science.8438157. PMID 8438157. S2CID 41036818.
Drew PD, Franzoso G, Carlson LM, Biddison WE, Siebenlist U, Ozato K (1996). „Interferonový regulační faktor-2 fyzicky interaguje s NF-kappa B in vitro a inhibuje indukci NF-kappa B indukce hlavní exprese genu histokompatibility třídy I a beta 2-mikroglobulinu v transfekovaných buňkách lidského neuroblastomu.“. J. Neuroimmunol. 63 (2): 157–62. doi:10.1016/0165-5728(95)00140-9. PMID 8550813. S2CID 53166594.
Birnbaum MJ, van Zundert B, Vaughan PS, Whitmarsh AJ, van Wijnen AJ, Davis RJ, Stein GS, Stein JL (1997). "Fosforylace onkogenního transkripčního faktoru interferonový regulační faktor 2 (IRF2) in vitro a in vivo". J. Cell. Biochem. 66 (2): 175–83. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19970801) 66: 2 <175 :: AID-JCB5> 3.0.CO; 2-N. PMID 9213219.
Masumi A, Wang IM, Lefebvre B, Yang XJ, Nakatani Y, Ozato K (1999). „Histonacetyláza PCAF je Phorbol-Esterem indukovatelný koaktivátor rodiny IRF, který poskytuje zvýšenou odezvu na interferony“. Mol. Buňka. Biol. 19 (3): 1810–20. doi:10.1128 / MCB.19.3.1810. PMC 83974. PMID 10022868.
Li W, Nagineni CN, Hooks JJ, Chepelinsky AB, Egwuagu CE (1999). „Signalizace interferonu-gama v lidských sítnicových pigmentových epiteliálních buňkách zprostředkovaná transkripčními faktory STAT1, ICSBP a IRF-1“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 40 (5): 976–82. PMID 10102295.
Whitney LW, Becker KG, Tresser NJ, Caballero-Ramos CI, Munson PJ, Prabhu VV, Trent JM, McFarland HF, Biddison WE (1999). "Analýza genové exprese v lézích roztroušené sklerózy pomocí cDNA mikročipů". Ann. Neurol. 46 (3): 425–8. doi:10.1002 / 1531-8249 (199909) 46: 3 <425 :: AID-ANA22> 3.0.CO; 2-O. PMID 10482277.
Mild GC, Schmahl GE, Shayan P, Niemeyer CM (2000). "Exprese interferonového regulačního faktoru 1 a 2 v hematopoetických buňkách dětí s juvenilní myelomonocytickou leukémií". Leuku. Lymfom. 35 (5–6): 507–11. doi:10.1080/10428199909169615. PMID 10609788.
Staal A, Enserink JM, Stein JL, Stein GS, van Wijnen AJ (2000). "Molekulární charakterizace celtix-1, bromodoménového proteinu interagujícího s transkripčním faktorem interferonovým regulačním faktorem 2". J. Cell. Physiol. 185 (2): 269–79. doi:10.1002 / 1097-4652 (200011) 185: 2 <269 :: AID-JCP12> 3.0.CO; 2-L. PMID 11025449.
Larrea E, Alberdi A, Castelruiz Y, Boya P, Civeira MP, Prieto J (2001). „Exprese subtypů interferonu-alfa v periferních mononukleárních buňkách od pacientů s chronickou hepatitidou C: role interferonu-alfa5“. J. Virová Hepat. 8 (2): 103–10. doi:10.1046 / j.1365-2893.2001.00273.x. PMID 11264730. S2CID 55595193.
Masumi A, Ozato K (2001). „Koaktivátor p300 acetyluje interferonový regulační faktor-2 v buňkách U937 po ošetření forbolesterem“. J. Biol. Chem. 276 (24): 20973–80. doi:10,1074 / jbc.M101707200. PMID 11304541.