SOX4 - SOX4
Transkripční faktor SOX-4 je protein že u lidí je kódován SOX4 gen.[5][6][7]
Funkce
Tento intronless gen kóduje člena rodiny transkripčních faktorů SOX (SRY-příbuzný HMG-box) podílejících se na regulaci embryonálního vývoje a na určování buněčného osudu. Kódovaný protein může působit jako transkripční regulátor po vytvoření proteinového komplexu s jinými proteiny, jako je například protein vázající syndekan (syntenin). Protein může fungovat v apoptotické dráze vedoucí k buněčné smrti i k tumorigenezi a může zprostředkovat následné účinky parathormonu (PTH) a proteinu souvisejícího s PTH (PTHrP) na vývoj kostí. Struktura roztoku byla vyřešena pro HMG-box podobného myšího proteinu.[7]
Sox4 je exprimován v lymfocytech (B a T) a je nezbytný pro vývoj B lymfocytů.[8]
Klinický význam
Genomická oblast blízko k SOX4 Gen byl spojován s vývojem rakoviny endometria.[9][10]
Interakce
SOX4 bylo prokázáno komunikovat s SDCBP.[11]
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124766 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000076431 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Farr CJ, Easty DJ, Ragoussis J, Collignon J, Lovell-Badge R, Goodfellow PN (leden 1994). "Charakterizace a mapování lidského genu SOX4". Savčí genom. 4 (10): 577–84. doi:10.1007 / BF00361388. PMID 8268656. S2CID 12096721.
- ^ Critcher R, Stitson RN, Wade-Martins R, Easty DJ, Farr CJ (říjen 1998). „Přiřazení Sox4 k myšímu chromozomu 13 pásem A3-A5 pomocí fluorescenční in situ hybridizace; upřesnění polohy lidského SOX4 na 6p22.3 a SOX20 na chromozom 17p12.3“. Cytogenetika a genetika buněk. 81 (3–4): 294–5. doi:10.1159/000015052. PMID 9730625. S2CID 46849443.
- ^ A b „Entrez Gene: SOX4 SRY (oblast určující pohlaví Y) - box 4“.
- ^ Smith E, Sigvardsson M (červen 2004). "Role transkripčních faktorů v závazku, vývoji a transformaci B lymfocytů". Journal of Leukocyte Biology. 75 (6): 973–81. doi:10.1189 / jlb.1103554. PMID 14982952. S2CID 6805071.
- ^ O'Mara TA, Glubb DM, Amant F, Annibali D, Ashton K, Attia J, Auer PL, Beckmann MW a kol. (Srpen 2018). „Identifikace devíti nových lokusů citlivosti na rakovinu endometria“. Příroda komunikace. 9 (1): 3166. Bibcode:2018NatCo ... 9.3166O. doi:10.1038 / s41467-018-05427-7. PMC 6085317. PMID 30093612.
- ^ Chen MM, O'Mara TA, Thompson DJ, Painter JN, Attia J, Black A a kol. (Červen 2016). „GWAS metaanalýza 16 852 žen identifikuje nový lokus citlivosti na rakovinu endometria“. Lidská molekulární genetika. 25 (12): 2612–2620. doi:10,1093 / hmg / ddw092. PMC 5868213. PMID 27008869.
- ^ Geijsen N, Uings IJ, Pals C, Armstrong J, McKinnon M, Raaijmakers JA, Lammers JW, Koenderman L, Coffer PJ (srpen 2001). "Cytokinově specifická transkripční regulace prostřednictvím proteinu interagujícího s IL-5Ralfa". Věda. 293 (5532): 1136–8. doi:10.1126 / science.1059157. PMID 11498591. S2CID 28003281.
Další čtení
- Kamachi Y, Uchikawa M, Kondoh H (duben 2000). "Párování SOX off: s partnery v regulaci embryonálního vývoje". Trendy v genetice. 16 (4): 182–7. doi:10.1016 / S0168-9525 (99) 01955-1. PMID 10729834.
- Bowles J, Schepers G, Koopman P (listopad 2000). "Fylogeneze rodiny SOX vývojových transkripčních faktorů na základě sekvenčních a strukturálních indikátorů". Vývojová biologie. 227 (2): 239–55. doi:10,1006 / dbio.2000.9883. PMID 11071752.
- Wilson M, Koopman P (srpen 2002). „Odpovídající SOX: partnerské proteiny a kofaktory rodiny transkripčních regulátorů SOX“. Aktuální názor na genetiku a vývoj. 12 (4): 441–6. doi:10.1016 / S0959-437X (02) 00323-4. PMID 12100890.
- Schepers GE, Teasdale RD, Koopman P (srpen 2002). "Dvacet párů sox: rozsah, homologie a nomenklatura genových rodin myšího a lidského sox transkripčního faktoru". Vývojová buňka. 3 (2): 167–70. doi:10.1016 / S1534-5807 (02) 00223-X. PMID 12194848.
- Denny P, Swift S, značka N, Dabhade N, Barton P, Ashworth A (červen 1992). "Konzervovaná rodina genů souvisejících s genem určujícím varle, SRY". Výzkum nukleových kyselin. 20 (11): 2887. doi:10.1093 / nar / 20.11.2887. PMC 336939. PMID 1614875.
- Wotton D, Lake RA, Farr CJ, Owen MJ (březen 1995). „Transkripční faktor skupiny s vysokou mobilitou, SOX4, transaktivuje lidský zesilovač CD2“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (13): 7515–22. doi:10.1074 / jbc.270.13.7515. PMID 7706298.
- van de Wetering M, Oosterwegel M, van Norren K, Clevers H (říjen 1993). „Sox-4, sry-like HMG box protein, je transkripční aktivátor v lymfocytech“. Časopis EMBO. 12 (10): 3847–54. doi:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb06063.x. PMC 413668. PMID 8404853.
- van Houte LP, Chuprina VP, van der Wetering M, Boelens R, Kaptein R, Clevers H (prosinec 1995). "Struktura řešení sekvenčně specifického boxu HMG aktivátoru transkripce lymfocytů Sox-4". The Journal of Biological Chemistry. 270 (51): 30516–24. doi:10.1074 / jbc.270.51.30516. PMID 8530483.
- Ahn SG, Cho GH, Jeong SY, Rhim H, Choi JY, Kim IK (červen 1999). „Identifikace cDNA pro Sox-4, protein HMG-Box a nový lidský homolog kvasinkového sestřihového faktoru SSF-1 rozdílně regulovaného během apoptózy indukované prostaglandinem A2 / delta12-PGJ2 v buňkách Hep3B“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 260 (1): 216–21. doi:10.1006 / bbrc.1999.0856. PMID 10381369.
- van Beest M, Dooijes D, van De Wetering M, Kjaerulff S, Bonvin A, Nielsen O, Clevers H (září 2000). „Faktory skupinového boxu specifické pro sekvenci s vysokou mobilitou rozpoznávají motivy drobných drážek 10–12 bází“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (35): 27266–73. doi:10,1074 / jbc.M004102200. PMID 10867006.
- Reppe S, Rian E, Jemtland R, Olstad OK, Gautvik VT, Gautvik KM (prosinec 2000). „Poselská RNA Sox-4 je exprimována v embryonální růstové ploténce a regulována prostřednictvím paratyroidního hormonu / proteinového receptoru souvisejícího s parathyroidem v buňkách podobných osteoblastům. Journal of Bone and Mineral Research. 15 (12): 2402–12. doi:10.1359 / jbmr.2000.15.12.2402. PMID 11127205. S2CID 2013715.
- Geijsen N, Uings IJ, Pals C, Armstrong J, McKinnon M, Raaijmakers JA, Lammers JW, Koenderman L, Coffer PJ (srpen 2001). "Cytokinově specifická transkripční regulace prostřednictvím proteinu interagujícího s IL-5Ralfa". Věda. 293 (5532): 1136–8. doi:10.1126 / science.1059157. PMID 11498591. S2CID 28003281.
- Lee CJ, Appleby VJ, Orme AT, Chan WI, Scotting PJ (květen 2002). "Diferenciální exprese SOX4 a SOX11 v meduloblastomu". Journal of Neuro-Oncology. 57 (3): 201–14. doi:10.1023 / A: 1015773818302. PMID 12125983. S2CID 20719302.
- Ahn SG, Kim HS, Jeong SW, Kim BE, Rhim H, Shim JY, Kim JW, Lee JH, Kim IK (červenec 2002). „Sox-4 je pozitivní regulátor apoptózy buněk Hep3B a HepG2 vyvolané prostaglandinem (PG) A (2) a delta (12) -PGJ (2)“. Experimentální a molekulární medicína. 34 (3): 243–9. doi:10.1038 / emm.2002.34. PMID 12216117.
externí odkazy
- SOX4 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.
Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |