IRX2 - IRX2

IRX2
Identifikátory
Aliasy	IRX2, IRXA2, iroquois homeobox 2
Externí ID	OMIM: 606198 MGI: 1197526 HomoloGene: 56490 Genové karty: IRX2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	2,751,677 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	72,634,198 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• specifikace smyčky Henle identity; • vývoj metanephros; • regulace transkripce, DNA-šablony; • tvorba proximálního / distálního vzorce podílející se na vývoji metanefrického nefronu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	153572
	16372
	ENSG00000170561
	ENSMUSG00000001504
	Q9BZI1
	P81066
	NM_001134222; NM_033267
	NM_010574
	NP_001127694; NP_150366
	NP_034704
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeodoménový protein IRX-2 třídy Iroquois, také známý jako Iroquois homeobox protein 2, je protein že u lidí je kódován IRX2 gen.^[5]^[6]

Funkce

IRX2 je členem Iroquois homeobox genová rodina. Zdá se, že členové této rodiny hrají během formování embryí obratlovců několik rolí.^[5]

Rakovina

Gen IRX2 byl pozorován progresivně downregulovaný v Lidsky papillomavirus -pozitivní neoplastické keratinocyty odvozeno z děložního čípku preneoplastické léze na různých úrovních malignity. ^[7] Z tohoto důvodu je IRX2 pravděpodobně spojen s tumorigenezí a může být potenciálním prognostickým markerem pro děložní děložní hrdlo. preneoplastické léze postup. ^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170561 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001504 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: iroquois homeobox 2“.
^ Ogura K, Matsumoto K, Kuroiwa A, Isobe T, Otoguro T, Jurecic V, Baldini A, Matsuda Y, Ogura T (2001). "Klonování a mapování chromozomů lidských a kuřecích genů Iroquois (IRX)". Cytogenet. Cell Genet. 92 (3–4): 320–5. doi:10.1159/000056921. PMID 11435706. S2CID 46509502.
^ ^A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). „Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů“. J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

Další čtení

Lam CY, Tam PO, Fan DS a kol. (2008). „Genomové skenování mapuje nový lokus vysoké myopie na 5p15“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 49 (9): 3768–78. doi:10.1167 / iovs.07-1126. PMID 18421076.
Cirulli ET, Kasperavičiūtė D, Attix DK a kol. (2010). „Společná genetická variace a výkonnost při standardizovaných kognitivních testech“. European Journal of Human Genetics. 18 (7): 815–20. doi:10.1038 / ejhg.2010.2. PMC 2987367. PMID 20125193.
Adamowicz M, Radlwimmer B, Rieker RJ a kol. (2006). "Časté amplifikace a hojná exprese TRIO, NKD2 a IRX2 v sarkomech měkkých tkání". Geny Chromozomy Rakovina. 45 (9): 829–38. doi:10,1002 / gcc.20343. PMID 16752383. S2CID 24491021.
Matsumoto K, Nishihara S, Kamimura M a kol. (2004). „Prepatternní transkripční faktor Irx2, cíl kaskády kinázy FGF8 / MAP, se podílí na tvorbě mozečku“. Nat. Neurosci. 7 (6): 605–12. doi:10.1038 / nn1249. PMID 15133517. S2CID 23807922.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Lewis MT, Ross S, Strickland PA a kol. (1999). "Regulované expresní vzorce IRX-2, genu homeoboxu třídy Iroquois, v lidské prsu". Cell Tissue Res. 296 (3): 549–54. doi:10,1007 / s004410051316. PMID 10370142. S2CID 37046813.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170561 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001504 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: iroquois homeobox 2“.

[pmid11435706-6] Ogura K, Matsumoto K, Kuroiwa A, Isobe T, Otoguro T, Jurecic V, Baldini A, Matsuda Y, Ogura T (2001). "Klonování a mapování chromozomů lidských a kuřecích genů Iroquois (IRX)". Cytogenet. Cell Genet. 92 (3–4): 320–5. doi:10.1159/000056921. PMID 11435706. S2CID 46509502.

[Rotondo_2015-7] A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). „Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů“. J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]