Doména BZIP - BZIP domain
| transkripční faktor bZIP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 CREB (nahoře) je a transkripční faktor schopné vazby DNA prostřednictvím domény bZIP (dole) a regulace genová exprese. | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | bZIP_1 | ||||||||
| Pfam | PF00170 | ||||||||
| InterPro | IPR011616 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00036 | ||||||||
| SCOP2 | 1ysa / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd14686 | ||||||||
| Membranome | 235 | ||||||||
| |||||||||
The Základní doména leucinového zipu (doména bZIP) se nachází v mnoha DNA vázající eukaryotické proteiny. Jedna část domény obsahuje oblast, která zprostředkovává sekvenčně specifické vlastnosti vázání DNA a leucinový zip které je nutné držet pohromadě (dimerizovat) dvě oblasti vázající DNA. Oblast vázající DNA obsahuje řadu bazických aminokyselin, jako jsou arginin a lysin. Bílkoviny obsahující tuto doménu jsou transkripční faktory.[1][2]
transkripční faktory bZIP
Transkripční faktory bZIP se nacházejí ve všech eukaryotech a tvoří jednu z největších rodin dimerizujících TF.[3][4] Evoluční studie z roku 2008 odhalila, že 4 geny bZIP byly kódovány genomem poslední společný předek všech rostlin.[5] Interakce mezi transkripčními faktory bZIP jsou četné a složité [6][7][3] a hrají důležitou roli ve vývoji rakoviny[8] v epitelových tkáních syntéza steroidních hormonů buňkami endokrinních tkání,[9] faktory ovlivňující reprodukční funkce,[10] a několik dalších jevů, které ovlivňují lidské zdraví.
proteiny obsahující doménu bZIP
- AP-1 fos /červen heterodimer, který tvoří a transkripční faktor
- Červen-B transkripční faktor
- CREB transkripční faktor prvku odezvy cAMP
- OPAQUE2 (O2) transkripční faktor 22-kD zeinového genu, který kóduje třídu zásobních proteinů v endosperm kukuřice (Zea Mays) jádra
- NFE2L2 nebo Nrf2
- Bzip Maf transkripční faktory
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
ATF1; ATF2; ATF4; ATF5; ATF6; ATF7; BACH1; BACH2;BATF; BATF2; CEBPA; CEBPB; CEBPD; CEBPE; CEBPG; CEBPZ; CREB1; CREB3; CREB3L1; CREB3L2; CREB3L3; CREB3L4;CREB5; CREBL1; CREM; E4BP4; FOSL1; FOSL2; ČERVEN; ČERVEN; KOLO; MAFA; MAFB;NFE2; NFE2L2; NFE2L3; SNFT; XBP1
Reference
- ^ Ellenberger T (1994). „Získání uznání v rozpoznávání DNA: struktury leucinového zipu základní oblasti a domény vázající DNA na helix-loop-helix DNA v základní oblasti“. Curr. Opin. Struct. Biol. 4 (1): 12–21. doi:10.1016 / S0959-440X (94) 90054-X.
- ^ Hurst HC (1995). "Transkripční faktory 1: proteiny bZIP". Profil bílkovin. 2 (2): 101–68. PMID 7780801.
- ^ A b Amoutzias, G. D .; Veron, A. S .; Weiner, J .; Robinson-Rechavi, M .; Bornberg-Bauer, E .; Oliver, S. G .; Robertson, D. L. (01.03.2007). „Jedna miliarda let vývoje transkripčního faktoru bZIP: zachování a změna dimerizace a specificita vazebného místa pro DNA“. Molekulární biologie a evoluce. 24 (3): 827–835. doi:10.1093 / molbev / msl211. ISSN 0737-4038. PMID 17194801.
- ^ Amoutzias, Grigoris D .; Robertson, David L .; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. (01.05.2008). "Vyberte si své partnery: dimerizace v eukaryotických transkripčních faktorech". Trendy v biochemických vědách. 33 (5): 220–229. doi:10.1016 / j.tibs.2008.02.002. ISSN 0968-0004. PMID 18406148.
- ^ Corrêa LG, Riaño-Pachón DM, Schrago CG, dos Santos RV, Mueller-Roeber B, Vincentz M (2008). Shiu S (ed.). „Role transkripčních faktorů bZIP v evoluci zelených rostlin: adaptivní funkce vznikající ze čtyř zakladatelských genů“. PLOS ONE. 3 (8): e2944. doi:10.1371 / journal.pone.0002944. PMC 2492810. PMID 18698409.
- ^ Vinson, Charles; Acharya, Asha; Taparowsky, Elizabeth J. (01.01.2006). „Dešifrování interakcí transkripčních faktorů B-ZIP in vitro a in vivo“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1759 (1–2): 4–12. doi:10.1016 / j.bbaexp.2005.12.005. ISSN 0006-3002. PMID 16580748.
- ^ Newman, John R. S .; Keating, Amy E. (2003-06-27). "Komplexní identifikace interakcí lidského bZIP s poli vinutých cívek". Věda. 300 (5628): 2097–2101. doi:10.1126 / science.1084648. ISSN 1095-9203. PMID 12805554. S2CID 36715183.
- ^ Vlahopoulos SA, Logotheti S, Mikas D, Giarika A, Gorgoulis V, Zoumpourlis V (duben 2008). "Role ATF-2 v onkogenezi". BioEssays. 30 (4): 314–27. doi:10.1002 / bies.20734. PMID 18348191. S2CID 678541.
- ^ Manna PR, Dyson MT, Eubank DW, Clark BJ, Lalli E, Sassone-Corsi P, Zeleznik AJ, Stocco DM (leden 2002). „Regulace steroidogeneze a steroidogenního akutního regulačního proteinu členem rodiny proteinových proteinů vázajících se na odezvu cAMP“. Mol. Endokrinol. 16 (1): 184–99. doi:10.1210 / me.16.1.184. PMID 11773448.
- ^ Hoare S, Copland JA, Wood TG, Jeng YJ, Izban MG, Soloff MS (květen 1999). „Identifikace vazebného místa GABP alfa / beta zapojeného do indukce genové exprese oxytocinového receptoru v buňkách lidského prsu, potenciace pomocí c-Fos / c-Jun“. Endokrinologie. 140 (5): 2268–79. doi:10.1210 / en.140.5.2268. PMID 10218980.