FOXJ1 - FOXJ1

FOXJ1
Identifikátory
AliasyFOXJ1, FKHL13, HFH-4, HFH4, skříň vidlice J1, CILD43
Externí IDOMIM: 602291 MGI: 1347474 HomoloGene: 1117 Genové karty: FOXJ1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro FOXJ1
Genomické umístění pro FOXJ1
Kapela17q25.1Start76,136,333 bp[1]
Konec76,141,245 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

2302

15223

Ensembl

ENSG00000129654

ENSMUSG00000034227

UniProt

Q92949

Q61660

RefSeq (mRNA)

NM_001454

NM_008240

RefSeq (protein)

NP_001445

NP_032266

Místo (UCSC)Chr 17: 76,14 - 76,14 MbChr 11: 116,33 - 116,34 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Forkhead box protein J1 je protein že u lidí je kódován FOXJ1 gen.[5] Je členem Forkhead / okřídlené šroubovice (LIŠKA ) rodina transkripční faktory který je zapojen do ciliogeneze.[6] FOXJ1 je exprimován v řasinkách plic,[7] choroidalis plexus,[8] reprodukční trakt,[9] stádium embryonálních ledvin a pre-somitových embryí.[10]

Umístění genu

Člověk FOXJ1 Gen se nachází na dlouhém rameni chromozomu 17, oblast 2, pásmo 5, dílčí pásmo 1.[11]

Struktura

FOXJ1 má konzervovanou 100 aminokyselin dlouhou doménu vázající DNA.[12]

Funkce

Tento gen kóduje člena vidlice rodina transkripčních faktorů. Ukázalo se, že podobné geny u zebrafish a myší regulují transkripci genů, které řídí produkci pohyblivých řasinek. Myší ortolog funguje také při určování levo-pravá asymetrie.[5]

Ciliogeneze

Hlavní ciliogeneze je závislý na FOXJ1 a tento transkripční faktor je vyžadován pro pohyblivost řasený diferenciace buněk. Nástup exprese FOXJ1 je indikativní pro buňky, jejichž osud se stane buňkami pohyblivými cilemi.[13] Buňky se před aktivací FOXJ1 zavázaly k ciliogenezi. Aktivace podporuje bazální tělo obchodování, zakotvení u apikální membrána a následující axoném růst.[14] Protein p73, který je členem protein p53 rodina přímo reguluje FOXJ1 a je požadavkem na tvorbu řasinkových buněk. 10 000 bp dlouhý začátek transkripce FOXJ1 obsahuje tři sekvenčně specifická vazebná místa pro p73.[15]

Imunitní systém

V buňkách savců bylo prokázáno, že FOXJ1 potlačuje NFκB, klíčový regulátor imunitní odpovědi[16] a také inhibuje humorální odpověď v B-buňky. K tomu dochází regulací inhibiční složky NFκB zvané IκBβ a IL-6.[17]

Rozvoj

FOXJ1 je exprimován v různých bodech během embryonálního vývoje ve vztahu k klíčení zubů, sklovině, ústní dutině a jazyku epitel tvorba a tvorba sub-mandibulárních slinných žláz a vlasových folikulů.[18] Absence exprese FOXJ1 klesá kalpastatin, inhibitor proteázy calpain. Dysregulace kalpainu ovlivňuje ukotvení bazálního těla k apikálnímu cytoskeletu ovlivňující tvorbu axeonemů.[19] Exprese FOXJ1 je inhibována IL-13.[20]

Klinický význam

Polymorfismy v tomto genu jsou spojeny s systémový lupus erythematodes a alergická rýma.[5]

Bylo zjištěno, že virové infekce dýchacího systému snižují expresi FOXJ1. To ovlivňuje ciliogenezi a dopady slizniční akce.[21]

Rakovina prsu

Studie lidských linií prsní tkáně a primárních nádorů prsu zjistily, že gen FOXJ1 jsou aberantně hypermethylovaní v primárních nádorech. Tato hypermethylace slouží k umlčení produkce proteinu FOXJ1 a byla navržena jako potenciálně důležitá událost při tvorbě nádoru.[22]

Jasný karcinom ledvin

Bylo prokázáno, že exprese FOXJ1 je zvýšená u pacientů s jasným buněčným renálním karcinomem a svědčí o stadiu nádoru, histologické stupeň a velikost nádoru. Vysoká exprese FOXJ1 u pacientů s CRCC byla spojena se špatnou prognózou. Existuje potenciál, aby FOXJ1 fungoval jako onkogen marker pro pacienty s CRCC a má hodnotu jako terapeutický cíl.[23]

Axenfeld – Riegerův syndrom

Axenfeld – Riegerův syndrom pacienti mají bodovou mutaci PITX2 regulační protein z FOXJ1 gen. PITX2 vedle LEF-1 a β-katenin regulovat FOXJ1. FOXJ1 zase interaguje s PITX2 a vytváří mechanismus pozitivní zpětné vazby. V bodě PITX2 mutant, zatímco je schopen se vázat s FOXJ1 postrádá schopnost aktivovat FOXJ1 Výsledkem je nesprávná orofaciální morfogeneze, faktor v ARS.[24]

Hydrocefalus

Mutace v tomto genu byly spojeny s autozomálně dominantním syndromem, který zahrnuje hydrocefalus a randomizace levé / pravé asymetrie těla.[25]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129654 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034227 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C „Entrez Gene: forkhead box J1“.
  6. ^ Yu X, Ng CP, Habacher H, Roy S (prosinec 2008). "Foxj1 transkripční faktory jsou hlavními regulátory pohyblivého ciliogenního programu". Genetika přírody. 40 (12): 1445–53. doi:10,1038 / ng.263. PMID  19011630. S2CID  205347068.
  7. ^ Blatt EN, Yan XH, Wuerffel MK, Hamilos DL, Brody SL (srpen 1999). "Forkhead transkripční faktor HFH-4 exprese dočasně souvisí s ciliogenezí". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 21 (2): 168–76. CiteSeerX  10.1.1.317.9961. doi:10.1165 / ajrcmb.21.2.3691. PMID  10423398.
  8. ^ Lim L, Zhou H, Costa RH (duben 1997). „Transkripční faktor helixu s křídly HFH-4 je exprimován během vývoje epitelu choroidního plexu v myším embryu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (7): 3094–9. Bibcode:1997PNAS ... 94.3094L. doi:10.1073 / pnas.94.7.3094. PMC  20327. PMID  9096351.
  9. ^ Hackett BP, Brody SL, Liang M, Zeitz ID, Bruns LA, Gitlin JD (květen 1995). „Primární struktura hepatologického nukleárního faktoru / homologu vidlice 4 a charakterizace genové exprese ve vyvíjejícím se respiračním a reprodukčním epitelu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (10): 4249–53. Bibcode:1995PNAS ... 92,4249H. doi:10.1073 / pnas.92.10.4249. PMC  41921. PMID  7753791.
  10. ^ Pelletier GJ, Brody SL, Liapis H, White RA, Hackett BP (březen 1998). "Transkripční faktor lidské vidlice / křídlové šroubovice vyjádřený ve vývoji plicního a ledvinového epitelu". Americký žurnál fyziologie. 274 (3 Pt 1): L351–9. doi:10.1152 / ajplung.1998.274.3.L351. PMID  9530170.
  11. ^ Jackson BC, Carpenter C, Nebert DW, Vasiliou V (červen 2010). „Aktualizace genových rodin člověka a myši s vidlicí (FOX)“. Lidská genomika. 4 (5): 345–52. doi:10.1186/1479-7364-4-5-345. PMC  3500164. PMID  20650821.
  12. ^ Clevidence DE, Overdier DG, Tao W, Qian X, Pani L, Lai E, Costa RH (květen 1993). „Identifikace devíti tkáňově specifických transkripčních faktorů rodiny hepatocytárního jaderného faktoru 3 / vidlice DNA-vazebné domény“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (9): 3948–52. Bibcode:1993PNAS ... 90.3948C. doi:10.1073 / pnas.90.9.3948. PMC  46423. PMID  7683413.
  13. ^ Jain R, Pan J, Driscoll JA, Wisner JW, Huang T, Gunsten SP, You Y, Brody SL (prosinec 2010). „Časový vztah mezi primární a pohyblivou ciliogenezí v epiteliálních buňkách dýchacích cest“. American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 43 (6): 731–9. doi:10.1165 / rcmb.2009-0328OC. PMC  2993092. PMID  20118219.
  14. ^ You Y, Huang T, Richer EJ, Schmidt JE, Zabner J, Borok Z, Brody SL (duben 2004). "Role f-box faktoru foxj1 v diferenciaci řasinkami epiteliálních buněk dýchacích cest". American Journal of Physiology. Plicní buněčná a molekulární fyziologie. 286 (4): L650–7. doi:10.1152 / ajplung.00170.2003. PMID  12818891. S2CID  17661686.
  15. ^ Marshall CB, Mays DJ, Beeler JS, Rosenbluth JM, Boyd KL, Santos Guasch GL, Shaver TM, Tang LJ, Liu Q, Shyr Y, Venters BJ, Magnuson MA, Pietenpol JA (březen 2016). „p73 je vyžadován pro multiciliogenezi a reguluje genovou síť spojenou s Foxj1“. Zprávy buněk. 14 (10): 2289–300. doi:10.1016 / j.celrep.2016.02.035. PMC  4794398. PMID  26947080.
  16. ^ Lin L, Spoor MS, Gerth AJ, Brody SL, Peng SL (únor 2004). "Modulace aktivace Th1 a zánětu NF-kappaB represorem Foxj1". Věda. 303 (5660): 1017–20. Bibcode:2004Sci ... 303.1017L. doi:10.1126 / science.1093889. PMID  14963332. S2CID  85412475.
  17. ^ Lin L, Brody SL, Peng SL (červenec 2005). "Omezení aktivace B buněk antagonismem NF-kappa B a IL-6 zprostředkovaným Foxj1". Journal of Immunology. 175 (2): 951–8. doi:10,4049 / jimmunol.175.2.951. PMID  16002694.
  18. ^ Venugopalan SR, Amen MA, Wang J, Wong L, Cavender AC, D'Souza RN, Akerlund M, Brody SL, Hjalt TA, Amendt BA (prosinec 2008). „Nová exprese a regulace transkripce FoxJ1 během orofaciální morfogeneze“. Lidská molekulární genetika. 17 (23): 3643–54. doi:10,1093 / hmg / ddn258. PMC  2733810. PMID  18723525.
  19. ^ Gomperts BN, Gong-Cooper X, Hackett BP (březen 2004). „Foxj1 reguluje ukotvení bazálního těla k cytoskeletu ciliovaných plicních epiteliálních buněk“. Journal of Cell Science. 117 (Pt 8): 1329–37. doi:10.1242 / jcs.00978. PMID  14996907.
  20. ^ Gomperts BN, Kim LJ, Flaherty SA, Hackett BP (září 2007). „IL-13 reguluje ztrátu řasinek a expresi foxj1 v epitelu dýchacích cest člověka“. American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 37 (3): 339–46. doi:10.1165 / rcmb.2006-0400OC. PMC  2720122. PMID  17541011.
  21. ^ Podívejte se na DC, Walter MJ, Williamson MR, Pang L, You Y, Sreshta JN, Johnson JE, Zander DS, Brody SL (prosinec 2001). "Účinky paramyxovirové infekce na expresi Foxj1 v epiteliálních buňkách dýchacích cest, ciliogenezi a mukociliární funkci". American Journal of Pathology. 159 (6): 2055–69. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63057-X. PMC  1850590. PMID  11733356.
  22. ^ Demircan B, Dyer LM, Gerace M, Lobenhofer EK, Robertson KD, Brown KD (leden 2009). "Srovnávací epigenomika lidských a myších nádorů mléčné žlázy". Geny, chromozomy a rakovina. 48 (1): 83–97. doi:10,1002 / gcc.20620. PMC  2929596. PMID  18836996.
  23. ^ Zhu P, Piao Y, Dong X, Jin Z (září 2015). „Exprese J1 boxu Forkhead je upregulovaná a korelovaná s prognózou u pacientů s jasným buněčným karcinomem renálních buněk“. Onkologické dopisy. 10 (3): 1487–1494. doi:10.3892 / ol.2015.3376. PMC  4533638. PMID  26622696.
  24. ^ Venugopalan SR, Amen MA, Wang J, Wong L, Cavender AC, D'Souza RN, Akerlund M, Brody SL, Hjalt TA, Amendt BA (prosinec 2008). "Nová exprese a regulace transkripce FoxJ1 během orofaciální morfogeneze". Lidská molekulární genetika. 17 (23): 3643–54. doi:10,1093 / hmg / ddn258. PMC  2733810. PMID  18723525.
  25. ^ Wallmeier, Julia; Frank, Diana; Shoemark, Amelia; Nöthe-Menchen, Tabea; Cindric, Sandra; Olbrich, Heike; Loges, Niki T .; Aprea, Isabella; Dougherty, Gerard W .; Pennekamp, ​​Petra; Kaiser, Thomas (listopad 2019). „De Novo mutace v FOXJ1 vedou k pohyblivé ciliopatii s hydrocefalem a randomizaci asymetrie levého / pravého těla“. American Journal of Human Genetics. 105 (5): 1030–1039. doi:10.1016 / j.ajhg.2019.09.022. ISSN  0002-9297. PMC  6849114. PMID  31630787.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.