Decorin - Decorin

DCN
Identifikátory
Aliasy	DCN, Dcn, DC, DSPG2, PG40, PGII, PGS2, SLRR1B, mDcn, CSCD, dekorin
Externí ID	OMIM: 125255 MGI: 94872 HomoloGene: 22430 Genové karty: DCN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	91,182,824 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	97,518,143 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kolagenu; • vazba N-konce proteinu; • aktivita inhibitoru proteinkinázy; • vazba glykosaminoglykanu; • vazba extracelulární matrice; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • strukturní složka extracelulární matrice udělující kompresní odolnost;
Buněčná složka	• cytoplazma; • extracelulární matrix; • lysozomální lumen; • Golgiho lumen; • ořezávač kolagenu typu VI; • extracelulární; • extracelulární oblast; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• metabolický proces glykosaminoglykanu; • pozitivní regulace mitochondriálního štěpení; • negativní regulace aktivity proteinkinázy; • pozitivní regulace autofagie; • vývoj ledvin; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • placentace; • proces biosyntézy chondroitin sulfátu; • reakce na mechanický podnět; • stárnutí; • demontáž extracelulární matice; • organizace extracelulární matice; • hojení ran; • negativní regulace migrace endoteliálních buněk; • pozitivní regulace makroautofagie; • reakce na lipopolysacharid; • pozitivní regulace mitochondriální depolarizace; • morfogeneze zvířecích orgánů; • katabolický proces chondroitin sulfátu; • negativní regulace angiogeneze; • pozitivní regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • zesíťování peptidů přes chondroitin 4-sulfát glykosaminoglykan; • negativní regulace signální dráhy vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • proces biosyntézy dermatansulfátu; • vývoj tkáně kosterního svalstva; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace kaskády JAK-STAT;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1634
	13179
	ENSG00000011465
	ENSMUSG00000019929
	P07585
	P28654
NM_001920; NM_133503; NM_133504; NM_133505; NM_133506;
	NM_133507
	NM_001190451; NM_007833
NP_001911; NP_598010; NP_598011; NP_598012; NP_598013;
	NP_598014
	NP_001177380; NP_031859
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Decorin je protein že u lidí je kódován DCN gen.

Decorin je proteoglykan to je v průměru 90 - 140 kilodaltonů (kDa) v molekulové hmotnosti. Patří do malé rodiny proteoglykanů bohatých na leucin (SLRP) a skládá se z proteinového jádra obsahujícího leucin se opakuje s glykosaminoglykan (GAG) řetězec skládající se z obou chondroitin sulfát (CS) nebo dermatan sulfát (DS).

Decorin je malý buněčný nebo pericelulární matrix proteoglykan a jeho struktura je úzce spjata s biglycan protein. Decorin a biglycan jsou považovány za výsledek a genová duplikace. Tento protein je součástí pojivová tkáň, váže se na kolagen typu I. fibrily, a hraje roli v matice shromáždění.^[5]

Pojmenování

Název Decorin je odvozen od skutečnosti, že „zdobí“ kolagen typu I a že interaguje s pásy „d“ a „e“ fibril tohoto kolagenu.

Funkce

Zdá se, že dekor ovlivňuje fibrillogeneze, a také komunikuje s fibronektin, trombospondin, složka doplňku C1q, receptor epidermálního růstového faktoru (EGFR) a transformující růstový faktor-beta (TGF-beta ).

Bylo prokázáno, že dekorin buď zvyšuje, nebo inhibuje aktivitu TGF-beta 1. Primární funkce dekorinu zahrnuje regulaci během buněčný cyklus.

Podílí se na regulaci autofagie, z endoteliální buňka a inhibuje angiogeneze. Tento proces je zprostředkován vysoce afinitní interakcí s VEGFR2 (receptor vaskulárního endoteliálního růstového faktoru), který vede ke zvýšeným hladinám tzv. tumor supresorového genu PEG3.^[6] Další angiogenní růstové faktory, které dekrin inhibuje, jsou angiopoetin, růstový faktor hepatocytů (HGF) a růstový faktor odvozený z krevních destiček (PDGF ).^[7]

Decorin byl nedávno založen jako myokin. V této roli podporuje svaly hypertrofie vazbou s myostatin.^[8]

Klinický význam

Keloidní jizvy mají sníženou expresi dekorinu ve srovnání se zdravými kůže.^[9] Vývoj vrozená stromální dystrofie rohovky je závislá na exportu a extracelulární depozici zkráceného dekoru. ^[10]

Studie na zvířatech

Ukázalo se, že infuze dekrinu do experimentálních poranění míchy hlodavců potlačuje tvorbu jizev a podporuje růst axonů.

Ukázalo se, že dekorin má protinádorové vlastnosti v experimentálním modelu myšího nádoru a je schopen potlačit růst různých nádorových buněčných linií. ^[11] Nedostatek dekorinu knockout myš vykazuje snížené zánětlivé reakce během kontaktní dermatitida kvůli závadě v leukocyty nábor a změněn interferon gama funkce. ^[12] ^[13]

Interakce

Bylo prokázáno, že dekor komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011465 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019929 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: DCN decorin“.
^ Buraschi S, Neill T, Goyal A, Poluzzi C, Smythies J, Owens RT a kol. (Červenec 2013). „Dekorin způsobuje autofagii v endoteliálních buňkách prostřednictvím Peg3“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (28): E2582-91. Bibcode:2013PNAS..110E2582B. doi:10.1073 / pnas.1305732110. PMC 3710796. PMID 23798385.
^ Järveläinen H, Sainio A, Wight TN (duben 2015). „Stěžejní role dekorinu v angiogenezi“. Matrix Biology. 43: 15–26. doi:10.1016 / j.matbio.2015.01.023. PMC 4560244. PMID 25661523.
^ Kanzleiter T, Rath M, Görgens SW, Jensen J, Tangen DS, Kolnes AJ a kol. (Červenec 2014). „Myokinový dekrin je regulován kontrakcí a podílí se na svalové hypertrofii“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 450 (2): 1089–94. doi:10.1016 / j.bbrc.2014.06.123. PMID 24996176.
^ Jumper N, Paus R, Bayat A (září 2015). "Funkční histopatologie keloidní choroby". Histologie a histopatologie. 30 (9): 1033–57. doi:10,14670 / HH-11-624. PMID 25900252.
^ Mellgren AE, Bruland O, Vedeler A, Saraste J, Schönheit J, Bredrup C a kol. (Květen 2015). „Vývoj vrozené stromální dystrofie rohovky závisí na exportu a extracelulární depozici zkráceného dekrinu“. Investigativní oftalmologie a vizuální věda. 56 (5): 2909–15. doi:10.1167 / iovs.14-16014. PMID 26029887.
^ Sofeu Feugaing DD, Götte M, Viola M (leden 2013). „Více než matice: mnohostranná role dekorinu v rakovině“. European Journal of Cell Biology. 92 (1): 1–11. doi:10.1016 / j.ejcb.2012.08.004. PMID 23058688.
^ Seidler DG, Mohamed NA, Bocian C, Stadtmann A, Hermann S, Schäfers K a kol. (Prosinec 2011). „Role dekorinu při přecitlivělosti zpožděného typu“. Journal of Immunology. 187 (11): 6108–19. doi:10,4049 / jimmunol.1100373. PMC 5070385. PMID 22043007.
^ Bocian C, Urbanowitz AK, Owens RT, Iozzo RV, Götte M, Seidler DG (květen 2013). „Decorin potencuje aktivitu interferonu-y v modelu alergického zánětu“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (18): 12699–711. doi:10,1074 / jbc.M112.419366. PMC 3642316. PMID 23460644.
^ ^A ^b Schönherr E, Broszat M, Brandan E, Bruckner P, Kresse H (červenec 1998). „Fragment jádra bílkoviny dekorinu Leu155-Val260 interaguje s TGF-beta, ale nekonkuruje o vazbu dekrininu na kolagen typu I.“. Archivy biochemie a biofyziky. 355 (2): 241–8. doi:10.1006 / abbi.1998.0720. PMID 9675033.
^ Santra M, Reed CC, Iozzo RV (září 2002). „Decorin se váže na úzkou oblast receptoru epidermálního růstového faktoru (EGF), částečně se překrývající, ale odlišnou od epitopu vázajícího EGF“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (38): 35671–81. doi:10,1074 / jbc.M205317200. PMID 12105206. S2CID 20575381.
^ Iozzo RV, Moscatello DK, McQuillan DJ, Eichstetter I (únor 1999). „Decorin je biologický ligand pro receptor epidermálního růstového faktoru“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (8): 4489–92. doi:10.1074 / jbc.274.8.4489. PMID 9988678. S2CID 32175802.
^ Hildebrand A, Romarís M, Rasmussen LM, Heinegård D, Twardzik DR, Border WA, Ruoslahti E (září 1994). „Interakce malých intersticiálních proteoglykanů biglykan, dekrin a fibromodulin s transformujícím růstovým faktorem beta“. The Biochemical Journal. 302 (Pt 2) (2): 527–34. doi:10.1042 / bj3020527. PMC 1137259. PMID 8093006.
^ Takeuchi Y, Kodama Y, Matsumoto T (prosinec 1994). „Dekrin Bone matrix váže transformující růstový faktor-beta a zvyšuje jeho bioaktivitu“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (51): 32634–8. PMID 7798269.
^ ^A ^b Merline R, Moreth K, Beckmann J, Nastase MV, Zeng-Brouwers J, Tralhão JG a kol. (Listopad 2011). „Signalizace pomocí matricového proteoglykanového dekrinu reguluje zánět a rakovinu prostřednictvím PDCD4 a MicroRNA-21“. Vědecká signalizace. 4 (199): ra75. doi:10.1126 / scisignal.2001868. PMC 5029092. PMID 22087031.

Další čtení

Ständer M, Naumann U, Wick W, Weller M (květen 1999). „Transformující růstový faktor-beta a p-21: více molekulárních cílů dekrinem zprostředkované suprese neoplastického růstu“. Výzkum buněk a tkání. 296 (2): 221–7. doi:10,1007 / s004410051283. PMID 10382266. S2CID 20282995.
Fujisawa R (březen 2002). "[Nedávný pokrok ve výzkumu proteinů kostní matrice]". Nihon Rinsho. Japonský žurnál klinické medicíny. 60 Suppl 3: 72–8. PMID 11979972.
Krumdieck R, Höök M, Rosenberg LC, Volanakis JE (prosinec 1992). „Proteoglykanový dekrin váže C1q a inhibuje aktivitu komplexu C1“. Journal of Immunology. 149 (11): 3695–701. PMID 1431141.
Winnemöller M, Schön P, Vischer P, Kresse H (říjen 1992). "Interakce mezi trombospondinem a malým proteoglykanovým dekrinem: interference s připojením buněk". European Journal of Cell Biology. 59 (1): 47–55. PMID 1468447.
Murphy-Ullrich JE, Schultz-Cherry S, Höök M (únor 1992). „Transformace komplexů růstového faktoru-beta s trombospondinem“. Molekulární biologie buňky. 3 (2): 181–8. doi:10,1091 / mbc. 3.2.281. PMC 275517. PMID 1550960.
Pulkkinen L, Alitalo T, Krusius T, Peltonen L (1992). "Exprese dekrinu v lidských tkáních a buněčných liniích a definované chromozomální přiřazení lokusu genu (DCN)". Cytogenetika a genetika buněk. 60 (2): 107–11. doi:10.1159/000133314. PMID 1611907.
McBride OW, Fisher LW, Young MF (únor 1990). „Lokalizace genů PGI (biglykan, BGN) a PGII (dekrin, DCN, PG-40) na lidských chromozomech Xq13-qter, respektive 12q“. Genomika. 6 (2): 219–25. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90560-H. PMID 1968422.
Fleischmajer R, Fisher LW, MacDonald ED, Jacobs L, Perlish JS, Termine JD (únor 1991). „Decorin interaguje s fibrilárním kolagenem embryonální a dospělé lidské kůže“. Journal of Structural Biology. 106 (1): 82–90. doi:10.1016/1047-8477(91)90065-5. PMID 2059554.
Pulkkinen L, Kainulainen K, Krusius T, Mäkinen P, Schollin J, Gustavsson KH, Peltonen L (říjen 1990). „Nedostatečná exprese genu kódujícího dekrin v letální formě Marfanova syndromu“. The Journal of Biological Chemistry. 265 (29): 17780–5. PMID 2211661.
Yamaguchi Y, Mann DM, Ruoslahti E (červenec 1990). "Negativní regulace transformujícího růstového faktoru-beta proteoglykanovým dekrinem". Příroda. 346 (6281): 281–4. Bibcode:1990 Natur.346..281Y. doi:10.1038 / 346281a0. PMID 2374594. S2CID 4272333.
Greve H, Blumberg P, Schmidt G, Schlumberger W, Rauterberg J, Kresse H (červenec 1990). „Vliv kolagenové mřížky na metabolismus malého proteoglykanu II kultivovanými fibroblasty“. The Biochemical Journal. 269 (1): 149–55. doi:10.1042 / bj2690149. PMC 1131544. PMID 2375748.
Roughley PJ, White RJ (září 1989). "Dermatan sulfátové proteoglykany lidské kloubní chrupavky. Vlastnosti dermatan sulfátových proteoglykanů I a II". The Biochemical Journal. 262 (3): 823–7. doi:10.1042 / bj2620823. PMC 1133347. PMID 2590169.
Fisher LW, Termine JD, Young MF (březen 1989). „Dedukovaná proteinová sekvence malého proteoglykanu I (biglykanu) v kostech vykazuje homologii s proteoglykanem II (dekrinem) a několika proteiny nesouvisejícími s tkáněmi u různých druhů“. The Journal of Biological Chemistry. 264 (8): 4571–6. PMID 2647739.
Yamaguchi Y, Ruoslahti E (listopad 1988). "Exprese lidského proteoglykanu v buňkách vaječníků čínského křečka inhibuje buněčnou proliferaci". Příroda. 336 (6196): 244–6. Bibcode:1988Natur.336..244Y. doi:10.1038 / 336244a0. PMID 3194009. S2CID 4338095.
Krusius T, Ruoslahti E (říjen 1986). „Primární struktura proteoglykanového jádrového proteinu extracelulární matice odvozená z klonované cDNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 83 (20): 7683–7. Bibcode:1986PNAS ... 83,7683K. doi:10.1073 / pnas.83.20.7683. PMC 386785. PMID 3484330.
Fisher LW, Hawkins GR, Tuross N, Termine JD (červenec 1987). „Čištění a částečná charakterizace malých proteoglykanů I a II, kostních sialoproteinů I a II a osteonektinu z minerální složky vyvíjející se lidské kosti“. The Journal of Biological Chemistry. 262 (20): 9702–8. PMID 3597437.
Lysiak JJ, Hunt J, Pringle GA, Lala PK (duben 1995). "Lokalizace transformujícího růstového faktoru beta a jeho přirozeného inhibitoru dekrin v lidské placentě a listnatém těle během těhotenství". Placenta. 16 (3): 221–31. doi:10.1016/0143-4004(95)90110-8. PMID 7638106.
Takeuchi Y, Kodama Y, Matsumoto T (prosinec 1994). „Dekrin Bone matrix váže transformující růstový faktor-beta a zvyšuje jeho biologickou aktivitu“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (51): 32634–8. PMID 7798269.
Scholzen T, Solursh M, Suzuki S, Reiter R, Morgan JL, Buchberg AM a kol. (Listopad 1994). "Myší dekor. Kompletní klonování cDNA, genomová organizace, přiřazení chromozomů a exprese během organogeneze a diferenciace tkání". The Journal of Biological Chemistry. 269 (45): 28270–81. PMID 7961765.
Danielson KG, Fazzio A, Cohen I, Cannizzaro LA, Eichstetter I, Iozzo RV (leden 1993). "Lidský gen pro dekorin: organizace intron-exon, objev dvou alternativně sestřižených exonů v 5 'nepřekládané oblasti a mapování genu na chromozom 12q23". Genomika. 15 (1): 146–60. doi:10.1006 / geno.1993.1022. PMID 8432526.
Bredrup C, Knappskog PM, Majewski J, Rødahl E, Boman H (únor 2005). "Vrozená stromální dystrofie rohovky způsobená mutací v genu pro dekorin". Investigativní oftalmologie a vizuální věda. 46 (2): 420–6. doi:10.1167 / iovs.04-0804. PMID 15671264.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na vrozenou stromální rohovkovou dystrofii

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011465 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019929 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[Entrez-5] „Entrez Gene: DCN decorin“.

[pmid23798385-6] Buraschi S, Neill T, Goyal A, Poluzzi C, Smythies J, Owens RT a kol. (Červenec 2013). „Dekorin způsobuje autofagii v endoteliálních buňkách prostřednictvím Peg3“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (28): E2582-91. Bibcode:2013PNAS..110E2582B. doi:10.1073 / pnas.1305732110. PMC 3710796. PMID 23798385.

[7] Järveläinen H, Sainio A, Wight TN (duben 2015). „Stěžejní role dekorinu v angiogenezi“. Matrix Biology. 43: 15–26. doi:10.1016 / j.matbio.2015.01.023. PMC 4560244. PMID 25661523.

[8] Kanzleiter T, Rath M, Görgens SW, Jensen J, Tangen DS, Kolnes AJ a kol. (Červenec 2014). „Myokinový dekrin je regulován kontrakcí a podílí se na svalové hypertrofii“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 450 (2): 1089–94. doi:10.1016 / j.bbrc.2014.06.123. PMID 24996176.

[9] Jumper N, Paus R, Bayat A (září 2015). "Funkční histopatologie keloidní choroby". Histologie a histopatologie. 30 (9): 1033–57. doi:10,14670 / HH-11-624. PMID 25900252.

[10] Mellgren AE, Bruland O, Vedeler A, Saraste J, Schönheit J, Bredrup C a kol. (Květen 2015). „Vývoj vrozené stromální dystrofie rohovky závisí na exportu a extracelulární depozici zkráceného dekrinu“. Investigativní oftalmologie a vizuální věda. 56 (5): 2909–15. doi:10.1167 / iovs.14-16014. PMID 26029887.

[11] Sofeu Feugaing DD, Götte M, Viola M (leden 2013). „Více než matice: mnohostranná role dekorinu v rakovině“. European Journal of Cell Biology. 92 (1): 1–11. doi:10.1016 / j.ejcb.2012.08.004. PMID 23058688.

[12] Seidler DG, Mohamed NA, Bocian C, Stadtmann A, Hermann S, Schäfers K a kol. (Prosinec 2011). „Role dekorinu při přecitlivělosti zpožděného typu“. Journal of Immunology. 187 (11): 6108–19. doi:10,4049 / jimmunol.1100373. PMC 5070385. PMID 22043007.

[13] Bocian C, Urbanowitz AK, Owens RT, Iozzo RV, Götte M, Seidler DG (květen 2013). „Decorin potencuje aktivitu interferonu-y v modelu alergického zánětu“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (18): 12699–711. doi:10,1074 / jbc.M112.419366. PMC 3642316. PMID 23460644.

[pmid9675033-14] A ^b Schönherr E, Broszat M, Brandan E, Bruckner P, Kresse H (červenec 1998). „Fragment jádra bílkoviny dekorinu Leu155-Val260 interaguje s TGF-beta, ale nekonkuruje o vazbu dekrininu na kolagen typu I.“. Archivy biochemie a biofyziky. 355 (2): 241–8. doi:10.1006 / abbi.1998.0720. PMID 9675033.

[pmid12105206-15] Santra M, Reed CC, Iozzo RV (září 2002). „Decorin se váže na úzkou oblast receptoru epidermálního růstového faktoru (EGF), částečně se překrývající, ale odlišnou od epitopu vázajícího EGF“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (38): 35671–81. doi:10,1074 / jbc.M205317200. PMID 12105206. S2CID 20575381.

[pmid9988678-16] Iozzo RV, Moscatello DK, McQuillan DJ, Eichstetter I (únor 1999). „Decorin je biologický ligand pro receptor epidermálního růstového faktoru“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (8): 4489–92. doi:10.1074 / jbc.274.8.4489. PMID 9988678. S2CID 32175802.

[pmid8093006-17] Hildebrand A, Romarís M, Rasmussen LM, Heinegård D, Twardzik DR, Border WA, Ruoslahti E (září 1994). „Interakce malých intersticiálních proteoglykanů biglykan, dekrin a fibromodulin s transformujícím růstovým faktorem beta“. The Biochemical Journal. 302 (Pt 2) (2): 527–34. doi:10.1042 / bj3020527. PMC 1137259. PMID 8093006.

[pmid7798269-18] Takeuchi Y, Kodama Y, Matsumoto T (prosinec 1994). „Dekrin Bone matrix váže transformující růstový faktor-beta a zvyšuje jeho bioaktivitu“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (51): 32634–8. PMID 7798269.

[pmid22087031-19] A ^b Merline R, Moreth K, Beckmann J, Nastase MV, Zeng-Brouwers J, Tralhão JG a kol. (Listopad 2011). „Signalizace pomocí matricového proteoglykanového dekrinu reguluje zánět a rakovinu prostřednictvím PDCD4 a MicroRNA-21“. Vědecká signalizace. 4 (199): ra75. doi:10.1126 / scisignal.2001868. PMC 5029092. PMID 22087031.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]