ZBTB32 - ZBTB32

ZBTB32
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3M5B
Identifikátory
Aliasy	ZBTB32, FAXF, FAZF, Rog, TZFP, ZNF538, zinkový prst a doména BTB obsahující 32
Externí ID	OMIM: 605859 MGI: 1891838 HomoloGene: 8661 Genové karty: ZBTB32
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	35,717,038 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	30,598,909 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • Vazba DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • vazba kovových iontů; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	27033
	58206
	ENSG00000011590
	ENSMUSG00000006310
	Q9Y2Y4
	Q9JKD9
	NM_014383; NM_001316902; NM_001316903
	NM_021397
	NP_001303831; NP_001303832; NP_055198
	NP_067372
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Zinkový prst a protein obsahující doménu BTB 32 je protein že u lidí je kódováno 1960 bp ZBTB32 gen. 52 kDa protein (487 aa) je transkripční represor a gen je exprimován v T a B buňky po aktivaci, ale také významně v buňkách varlat. Je členem Poxviry a Zinc-finger (POZ) a K.rodina proteinů rüppel (POK),^[5]^[6] a byl identifikován na více obrazovkách zahrnujících buď tumorigenezi imunitních buněk, nebo vývoj imunitních buněk.

Protein získává enzymy modifikace histonu na chromatin, aby ovlivnil aktivaci genu.^[7] ZBTB32 získává jádrové kompresory, jako jsou N-VR a HDAC na své cílové geny, indukuje represivní stavy chromatinu a působí kooperativně s jinými proteiny, např. s Blimp-1,^[7] potlačit transkripci genů.^[7]

Obsahuje N-terminál BTB / POZ doména (IPR000210) nebo doména SKP1 / BTB / POZ (IPR011333) a tři C-terminály zinkové prsty, Znf_C2H2_sf. (IPR036236), doména Znf_C2H2_type (IPR013087), doména Znf_RING / FYVE / PHD (IPR013083), následovaná domnělou doménou UBZ4.^[8]

Nomenklatura

Zinkový prst a protein 32 obsahující doménu BTB jsou také známé jako:

Protein zinek z prstů Fanconi (FAZF),
Protein se zinkovými prsty ve varlatech (TZFP),
Protein interagující s FANCC (FAXP),
Protein se zinkovým prstem 538 (ZNF538),
Represor GATA3 (ROG),
Promyelocytová leukémie Zinc Finger and Zbtb16 (PLZF) protein zinkového prstu (PLZP)

Interakce

Zbtb32 bylo prokázáno komunikovat s:

Suplementace Fanconiho anémie skupina C (Fancc)^[9]^[10]
Thioredoxin interagující protein (Txnip), ale interakce může být nespecifická; zdá se však, že vitamin D3 upregulovaný protein 1 (VDUP1) interaguje ^[11]
Zinekový prst a protein obsahující BTB doménu 16 (Zbtb16)^[5]
Proteinový doménový protein 2 se zinkovým prstem související s lokty (Zpo2)^[12]
GATA vázající protein (Gata2)^[13]

Imunitní systém

Exprese ZBTB32 je indukována zánětlivé cytokiny a podporuje šíření přírodní zabiják buňky.^[14]

Zbtb32 knockout myši ukázat trend rozvoje cukrovka 1. typu, i když rozdíl není statisticky odlišný. Zbtb32 dále nevykazují rozdíl v lymfocyt šíření, pravděpodobně kvůli kompenzaci z jiných genů.^[15]

Rakovina

ZBTB32 je vysoce exprimované spermatogoniální kmenové buňky v hematopoetických kmenových a progenitorových buňkách (viz také vzor exprese RNA vpravo), v difúzní velký B-buněčný lymfom (DLBCL) a zdá se, že potlačuje imunitní systém umlčením CIITA gen.^[16]

Gen transkripčního faktoru GATA3 se mění u nádorů mléčné žlázy. Down-regulace GATA3 exprese a aktivita proteinem prolinové domény 2 se zinkovým prstem souvisejícím s lokty (Zpo2), zatímco Zbtb32 usnadňuje cílení Zpo2 na GATA3 promotor, vede k rozvoji agresivních rakovin prsu.^[12]

Síť DNA methylační korelace byla vytvořena na základě metylační korelace mezi odlišně methylovanými geny. Byla provedena analýza přežití kandidátských biomarkerů. Jeden z osmi biomarkerů a hub genů identifikovaných v rakovině tlustého střeva je ZBTB32.^[17]

Exprese Zbtb32 je po expozici zvýšena cisplatina.^[18]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011590 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006310 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Hoatlin ME, Zhi Y, Ball H, Silvey K, Melnick A, Stone S, Arai S, Hawe N, Owen G, Zelent A, Licht JD (prosinec 1999). "Nový BTB / POZ transkripční represorový protein interaguje s Fanconiho anemickým proteinem skupiny C a PLZF". Krev. 94 (11): 3737–47. doi:10,1182 / krev. V94.11.3737. PMID 10572087.
^ „Entrez Gene: ZBTB32 zinkový prst a doména BTB obsahující 32“.
^ ^A ^b ^C Yoon HS, Scharer CD, Majumder P, Davis CW, Butler R, Zinzow-Kramer W, Skountzou I, Koutsonanos DG, Ahmed R, Boss JM (2012). „ZBTB32 je časným represorem exprese genu CIITA a MHC třídy II během diferenciace B buněk na plazmatické buňky“. Journal of Immunology. 189 (5): 2393–403. doi:10,4049 / jimmunol. 1103371. PMC 3424359. PMID 22851713.
^ Rizzo AA, Salerno PE, Bezsonova I, Korzhnev DM (září 2014). „NMR struktura lidského zinkového prstu Rad18 v komplexu s ubikvitinem definuje třídu UBZ domén v proteinech spojených s odpovědí na poškození DNA“. Biochemie. 53 (37): 5895–906. doi:10.1021 / bi500823h. PMID 25162118.
^ Hoatlin ME, Zhi Y, Ball H, Silvey K, Melnick A, Stone S, Arai S, Hawe N, Owen G, Zelent A, Licht JD (prosinec 1999). „Nový BTB / POZ transkripční represorový protein interaguje s Fanconiho anemickým proteinem skupiny C a PLZF“. Krev. 94 (11): 3737–47. doi:10,1182 / krev. V94.11.3737. PMID 10572087.
^ Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, Zhi Y, Herterich S, Hoehn H, Gross HJ, Joenje H, Hoatlin ME, Mathew CG, Huber PA (říjen 2003). „Kvasinkové dvouhybridní testy znamenají účast proteinů anémie Fanconi na regulaci transkripce, buněčné signalizaci, oxidačním metabolismu a buněčném transportu“. Experimentální výzkum buněk. 289 (2): 211–21. doi:10.1016 / s0014-4827 (03) 00261-1. PMID 14499622.
^ Han SH, Jeon JH, Ju HR, Jung U, Kim KY, Yoo HS, Lee YH, Song KS, Hwang HM, Na YS, Yang Y, Lee KN, Choi I (červen 2003). „VDUP1 upregulovaný TGF-beta1 a 1,25-dihydorxyvitamin D3 inhibuje růst nádorových buněk blokováním progrese buněčného cyklu“. Onkogen. 22 (26): 4035–46. doi:10.1038 / sj.onc.1206610. PMID 12821938.
^ ^A ^b Shahi P, Wang CY, Lawson DA, Slorach EM, Lu A, Yu Y, Lai MD, Gonzalez Velozo H, Werb Z (2017). „ZNF503 / Zpo2 řídí agresivní progresi rakoviny prsu down-regulací exprese GATA3“. Proc Natl Acad Sci U S A. 114 (12): 3169–3174. doi:10.1073 / pnas.1701690114. PMC 5373372. PMID 28258171.
^ Tsuzuki S, Enver T (květen 2002). „Interakce GATA-2 s proteinem promyelocytární leukemie se zinkovým prstem (PLZF), jeho homologem FAZF a s onkoproteinem generovaným receptorem kyseliny PLZF-retinové (t; 11; 17). Krev. 99 (9): 3404–10. doi:10,1182 / krev. V99.9.3404. PMID 11964310.
^ Beaulieu AM, Madera S, Sun JC (2015). "Molekulární programování imunologické paměti v buňkách přirozených zabijáků". Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 850: 81–91. doi:10.1007/978-3-319-15774-0_7. ISBN 978-3-319-15773-3. PMID 26324348.
^ Coley WD, Zhao Y, Benck CJ, Liu Y, Hotta-Iwamura C, Rahman MJ, Tarbell KV (2018). „Ztráta Zbtb32 u NOD myší významně nemění reakce T buněk“. F1000Výzkum. 7: 318. doi:10.12688 / F1000Research.13864.1. PMC 5909056. PMID 29707204.
^ Zhu C, Chen G, Zhao Y, Gao XM, Wang J (2018). "Regulace vývoje a funkce B buněk transkripčními faktory ZBTB". Hranice v imunologii. 9: 580. doi:10.3389 / fimmu.2018.00580. PMC 5869932. PMID 29616049.
^ Zhang C, Zhao H, Li J, Liu H, Wang F, Wei Y, Su J, Zhang D, Liu T, Zhang Y (2015). „Identifikace specifických vzorců methylace u různých typů rakoviny“. PLOS ONE. 10 (3): e0120361. Bibcode:2015PLoSO..1020361Z. doi:10.1371 / journal.pone.0120361. PMC 4361543. PMID 25774687.
^ Sourisseau T, Helissey C, Lefebvre C, Ponsonnailles F, Malka-Mahieu H, Olaussen KA, André F, Vagner S, Soria JC (2016). „Translační regulace mRNA kódující ubikvitinovou peptidázu USP1 podílející se na poškození DNA jako determinant rezistence na cisplatinu“. Buněčný cyklus. 15 (2): 295–302. doi:10.1080/15384101.2015.1120918. PMC 4825832. PMID 26825230.

Další čtení

Lin W, Lai CH, Tang CJ, Huang CJ, Tang TK (listopad 1999). "Identifikace a genová struktura nového genu transkripčního faktoru souvisejícího s lidským PLZF, TZFP". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 264 (3): 789–95. doi:10.1006 / bbrc.1999.1594. PMID 10544010.
Dai MS, Chevallier N, Stone S, Heinrich MC, McConnell M, Reuter T, Broxmeyer HE, Licht JD, Lu L, Hoatlin ME (červenec 2002). „Účinky Fanconiho anemického zinkového prstu (FAZF) na buněčný cyklus, apoptózu a proliferaci jsou specifické pro jednotlivé fáze diferenciace“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (29): 26327–34. doi:10,1074 / jbc.M201834200. PMID 11986317.
Han SH, Jeon JH, Ju HR, Jung U, Kim KY, Yoo HS, Lee YH, Song KS, Hwang HM, Na YS, Yang Y, Lee KN, Choi I (červen 2003). „VDUP1 upregulovaný TGF-beta1 a 1,25-dihydorxyvitamin D3 inhibuje růst nádorových buněk blokováním progrese buněčného cyklu“. Onkogen. 22 (26): 4035–46. doi:10.1038 / sj.onc.1206610. PMID 12821938.
Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, Zhi Y, Herterich S, Hoehn H, Gross HJ, Joenje H, Hoatlin ME, Mathew CG, Huber PA (říjen 2003). „Kvasinkové dvouhybridní testy naznačují účast proteinů anémie Fanconi na regulaci transkripce, buněčné signalizaci, oxidačním metabolismu a buněčném transportu“. Experimentální výzkum buněk. 289 (2): 211–21. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00261-1. PMID 14499622.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Ikeda R, Yoshida K, Inoue I (květen 2007). „Identifikace FAZF jako nového transkripčního faktoru indukovaného BMP2 během osteoblastické diferenciace“. Journal of Cellular Biochemistry. 101 (1): 147–54. doi:10.1002 / jcb.21165. PMID 17171645. S2CID 46504508.

externí odkazy

ZBTB32 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011590 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006310 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10572087-5] A ^b Hoatlin ME, Zhi Y, Ball H, Silvey K, Melnick A, Stone S, Arai S, Hawe N, Owen G, Zelent A, Licht JD (prosinec 1999). "Nový BTB / POZ transkripční represorový protein interaguje s Fanconiho anemickým proteinem skupiny C a PLZF". Krev. 94 (11): 3737–47. doi:10,1182 / krev. V94.11.3737. PMID 10572087.

[entrez-6] „Entrez Gene: ZBTB32 zinkový prst a doména BTB obsahující 32“.

[Yoon_2012-7] A ^b ^C Yoon HS, Scharer CD, Majumder P, Davis CW, Butler R, Zinzow-Kramer W, Skountzou I, Koutsonanos DG, Ahmed R, Boss JM (2012). „ZBTB32 je časným represorem exprese genu CIITA a MHC třídy II během diferenciace B buněk na plazmatické buňky“. Journal of Immunology. 189 (5): 2393–403. doi:10,4049 / jimmunol. 1103371. PMC 3424359. PMID 22851713.

[pmid25162118-8] Rizzo AA, Salerno PE, Bezsonova I, Korzhnev DM (září 2014). „NMR struktura lidského zinkového prstu Rad18 v komplexu s ubikvitinem definuje třídu UBZ domén v proteinech spojených s odpovědí na poškození DNA“. Biochemie. 53 (37): 5895–906. doi:10.1021 / bi500823h. PMID 25162118.

[autogenerated1-9] Hoatlin ME, Zhi Y, Ball H, Silvey K, Melnick A, Stone S, Arai S, Hawe N, Owen G, Zelent A, Licht JD (prosinec 1999). „Nový BTB / POZ transkripční represorový protein interaguje s Fanconiho anemickým proteinem skupiny C a PLZF“. Krev. 94 (11): 3737–47. doi:10,1182 / krev. V94.11.3737. PMID 10572087.

[pmid14499622-10] Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, Zhi Y, Herterich S, Hoehn H, Gross HJ, Joenje H, Hoatlin ME, Mathew CG, Huber PA (říjen 2003). „Kvasinkové dvouhybridní testy znamenají účast proteinů anémie Fanconi na regulaci transkripce, buněčné signalizaci, oxidačním metabolismu a buněčném transportu“. Experimentální výzkum buněk. 289 (2): 211–21. doi:10.1016 / s0014-4827 (03) 00261-1. PMID 14499622.

[pmid12821938-11] Han SH, Jeon JH, Ju HR, Jung U, Kim KY, Yoo HS, Lee YH, Song KS, Hwang HM, Na YS, Yang Y, Lee KN, Choi I (červen 2003). „VDUP1 upregulovaný TGF-beta1 a 1,25-dihydorxyvitamin D3 inhibuje růst nádorových buněk blokováním progrese buněčného cyklu“. Onkogen. 22 (26): 4035–46. doi:10.1038 / sj.onc.1206610. PMID 12821938.

[pmid28258171-12] A ^b Shahi P, Wang CY, Lawson DA, Slorach EM, Lu A, Yu Y, Lai MD, Gonzalez Velozo H, Werb Z (2017). „ZNF503 / Zpo2 řídí agresivní progresi rakoviny prsu down-regulací exprese GATA3“. Proc Natl Acad Sci U S A. 114 (12): 3169–3174. doi:10.1073 / pnas.1701690114. PMC 5373372. PMID 28258171.

[pmid11964310-13] Tsuzuki S, Enver T (květen 2002). „Interakce GATA-2 s proteinem promyelocytární leukemie se zinkovým prstem (PLZF), jeho homologem FAZF a s onkoproteinem generovaným receptorem kyseliny PLZF-retinové (t; 11; 17). Krev. 99 (9): 3404–10. doi:10,1182 / krev. V99.9.3404. PMID 11964310.

[pmid26324348-14] Beaulieu AM, Madera S, Sun JC (2015). "Molekulární programování imunologické paměti v buňkách přirozených zabijáků". Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 850: 81–91. doi:10.1007/978-3-319-15774-0_7. ISBN 978-3-319-15773-3. PMID 26324348.

[pmid29707204-15] Coley WD, Zhao Y, Benck CJ, Liu Y, Hotta-Iwamura C, Rahman MJ, Tarbell KV (2018). „Ztráta Zbtb32 u NOD myší významně nemění reakce T buněk“. F1000Výzkum. 7: 318. doi:10.12688 / F1000Research.13864.1. PMC 5909056. PMID 29707204.

[Zhu-16] Zhu C, Chen G, Zhao Y, Gao XM, Wang J (2018). "Regulace vývoje a funkce B buněk transkripčními faktory ZBTB". Hranice v imunologii. 9: 580. doi:10.3389 / fimmu.2018.00580. PMC 5869932. PMID 29616049.

[pmid25774687-17] Zhang C, Zhao H, Li J, Liu H, Wang F, Wei Y, Su J, Zhang D, Liu T, Zhang Y (2015). „Identifikace specifických vzorců methylace u různých typů rakoviny“. PLOS ONE. 10 (3): e0120361. Bibcode:2015PLoSO..1020361Z. doi:10.1371 / journal.pone.0120361. PMC 4361543. PMID 25774687.

[Sourisseau_2016-18] Sourisseau T, Helissey C, Lefebvre C, Ponsonnailles F, Malka-Mahieu H, Olaussen KA, André F, Vagner S, Soria JC (2016). „Translační regulace mRNA kódující ubikvitinovou peptidázu USP1 podílející se na poškození DNA jako determinant rezistence na cisplatinu“. Buněčný cyklus. 15 (2): 295–302. doi:10.1080/15384101.2015.1120918. PMC 4825832. PMID 26825230.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]