E2F4 - E2F4

E2F4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1CF7
Identifikátory
Aliasy	E2F4, E2F-4, E2F transkripční faktor 4
Externí ID	OMIM: 600659 MGI: 103012 HomoloGene: 1471 Genové karty: E2F4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	67,198,918 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	105,305,370 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • promotor-specifická chromatinová vazba; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • nukleární chromatin; • buněčné jádro; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• regulace velikosti buněk; • vývoj epiteliálních buněk; • homeostáza objemu buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • diferenciace epiteliálních buněk s více řasinkami; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce zapojené do přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • krevní oběh; • organizace projekce buněk; • regulace buněčné proliferace; • morfogeneze zvířecích orgánů; • buněčný cyklus; • pohyblivá sestava cilium; • shromáždění centriole; • transkripce, chráněná DNA; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • cilium morfogeneze; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1874
	104394
	ENSG00000205250
	ENSMUSG00000014859
	Q16254
	Q8R0K9
	NM_001950
	NM_148952
	NP_001941
	NP_683754
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor E2F4 je protein že u lidí je kódován E2F4 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem E2F rodina transkripční faktory. Rodina E2F hraje při kontrole klíčovou roli buněčný cyklus a působení nádorových supresorových proteinů a je také terčem transformujících se proteinů malých nádorových virů DNA. Tento protein se váže na všechny tři nádorově potlačující proteiny pRB, p107 a p130, ale s vyšší afinitou k posledním dvěma. Hraje důležitou roli při potlačení genů spojených s proliferací a jeho genová mutace a zvýšená exprese mohou být spojeny s lidskou rakovinou.^[7]

Struktura

Proteiny E2F obsahují několik evolučně konzervovaných domén nalezených u většiny členů rodiny. Mezi tyto domény patří a DNA vazebná doména, a dimerizace doména, která určuje interakci s diferenciačně regulovanými proteiny transkripčního faktoru (DP), a transaktivace doména obohacená o kyselé aminokyseliny (Asp + Glu ) a asociační doména nádorového supresorového proteinu, která je zabudována do transaktivační domény.

Interakce

E2F4 bylo prokázáno komunikovat s Smad3.^[8]

Viz také

E2F

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000205250 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014859 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ginsberg D, Vairo G, Chittenden T, Xiao ZX, Xu G, Wydner KL, DeCaprio JA, Lawrence JB, Livingston DM (prosinec 1994). „E2F-4, nový člen rodiny transkripčních faktorů E2F, interaguje s p107“. Genes Dev. 8 (22): 2665–79. doi:10,1101 / gad.8.22.2665. PMID 7958924.
^ Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Geng Y, Onufryk C, Chen A, Weinberg RA (duben 1995). „E2F-4 a E2F-5, dva členové rodiny E2F, jsou exprimováni v raných fázích buněčného cyklu“. Proc Natl Acad Sci U S A. 92 (6): 2403–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.2403S. doi:10.1073 / pnas.92.6.2403. PMC 42492. PMID 7892279.
^ „Entrez Gene: E2F4 E2F transkripční faktor 4, vazba p107 / p130“.
^ Chen CR, Kang Y, Siegel PM, Massagué J (červenec 2002). „E2F4 / 5 a p107 jako Smad kofaktory spojující receptor TGFbeta s represí c-myc“. Buňka. 110 (1): 19–32. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00801-2. PMID 12150994. S2CID 8945574.

Další čtení

Bandyopadhyay D, Timchenko N, Suwa T a kol. (2001). „Lidský melanocyt: modelový systém ke studiu složitosti buněčného stárnutí a transformace v nefibroblastických buňkách“. Exp. Gerontol. 36 (8): 1265–75. doi:10.1016 / S0531-5565 (01) 00098-5. PMID 11602203. S2CID 26041753.
Beijersbergen RL, Kerkhoven RM, Zhu L a kol. (1994). „E2F-4, nový člen rodiny genů E2F, má onkogenní aktivitu a asociuje se s p107 in vivo“. Genes Dev. 8 (22): 2680–90. doi:10,1101 / gad.8.22.2680. PMID 7958925.
Xiao ZX, Ginsberg D, Ewen M, Livingston DM (1996). "Regulace proteinu p107 souvisejícího s proteinem retinoblastomu kinázami spojenými s G1 cyklinem". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (10): 4633–7. Bibcode:1996PNAS ... 93,4633X. doi:10.1073 / pnas.93.10.4633. PMC 39330. PMID 8643455.
Moberg K, Starz MA, Lees JA (1996). „E2F-4 přepíná z p130 na p107 a pRB v reakci na reentry buněčného cyklu“. Mol. Buňka. Biol. 16 (4): 1436–49. doi:10,1128 / mcb.16.4.1436. PMC 231128. PMID 8657117.
Vidal M, Brachmann RK, Fattaey A, et al. (1996). „Reverzní dvouhybridní a jednohybridní systémy k detekci disociace interakcí protein-protein a DNA-protein“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (19): 10315–20. Bibcode:1996PNAS ... 9310315V. doi:10.1073 / pnas.93.19.10315. PMC 38381. PMID 8816797.
Williams CD, Linch DC, Sørensen TS a kol. (1997). „Převládající komplex E2F v lidských primárních hemopoetických buňkách a v blastech AML obsahuje E2F-4, DP-1 a p130“. Br. J. Haematol. 96 (4): 688–96. doi:10.1046 / j.1365-2141.1997.d01-2086.x. PMID 9074408. S2CID 23265759.
Lindeman GJ, Gaubatz S, Livingston DM, Ginsberg D (1997). „Subcelulární lokalizace E2F-4 je závislá na buněčném cyklu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (10): 5095–100. Bibcode:1997PNAS ... 94.5095L. doi:10.1073 / pnas.94.10.5095. PMC 24637. PMID 9144196.
Wang H, Shao N, Ding QM a kol. (1997). „Proteiny BRCA1 jsou transportovány do jádra v nepřítomnosti sérových a sestřihových variant BRCA1a, BRCA1b jsou tyrosin fosfoproteiny, které se asociují s E2F, cykliny a cyklin dependentními kinázami“. Onkogen. 15 (2): 143–57. doi:10.1038 / sj.onc.1201252. PMID 9244350.
Müller H, Moroni MC, Vigo E a kol. (1997). „Indukce vstupu S-fáze transkripčními faktory E2F závisí na jejich nukleární lokalizaci“. Mol. Buňka. Biol. 17 (9): 5508–20. doi:10,1128 / mcb.17,9.5508. PMC 232399. PMID 9271426.
Pierce AM, Schneider-Broussard R, Philhower JL, Johnson DG (1998). "Diferenciální aktivity členů rodiny E2F: jedinečné funkce při regulaci transkripce". Mol. Karcinogen. 22 (3): 190–8. doi:10.1002 / (SICI) 1098-2744 (199807) 22: 3 <190 :: AID-MC7> 3.0.CO; 2-P. PMID 9688145.
Ferreira R, Magnaghi-Jaulin L, Robin P a kol. (1998). „Tři členové rodiny kapesních proteinů sdílejí schopnost potlačovat aktivitu E2F prostřednictvím náboru histon-deacetylázy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (18): 10493–8. Bibcode:1998PNAS ... 9510493F. doi:10.1073 / pnas.95.18.10493. PMC 27922. PMID 9724731.
Timchenko NA, Wilde M, Darlington GJ (1999). „C / EBPalfa reguluje tvorbu komplexů E2F-p107 specifických pro S-fázi v játrech novorozených myší“. Mol. Buňka. Biol. 19 (4): 2936–45. doi:10,1128 / mcb.19.4.2936. PMC 84088. PMID 10082561.
Zheng N, Fraenkel E, Pabo CO, Pavletich NP (1999). "Strukturní základ rozpoznávání DNA heterodimerním transkripčním faktorem buněčného cyklu E2F-DP". Genes Dev. 13 (6): 666–74. doi:10,1101 / gad.13.6.666. PMC 316551. PMID 10090723.
Furukawa Y, Iwase S, Kikuchi J a kol. (1999). „Transkripční represe genu E2F-1 interferonem-alfa je zprostředkována indukcí komplexů E2F-4 / pRB a E2F-4 / p130“. Onkogen. 18 (11): 2003–14. doi:10.1038 / sj.onc.1202500. PMID 10208422.
Lam EW, Glassford J, van der Sman J a kol. (1999). "Modulace aktivity E2F v primárních myších B buňkách po stimulaci povrchovými receptory IgM a CD40". Eur. J. Immunol. 29 (10): 3380–9. doi:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199910) 29:10 <3380 :: AID-IMMU3380> 3.0.CO; 2-C. PMID 10540350.
Zhong X, Hemmi H, Koike J a kol. (2000). "Různá počty opakování AGC v kódující oblasti genu lidského transkripčního faktoru E2F-4". Hučení. Mutat. 15 (3): 296–7. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200003) 15: 3 <296 :: AID-HUMU18> 3.0.CO; 2-X. PMID 10679953.
Takahashi Y, Rayman JB, Dynlacht BD (2000). „Analýza vazby promotoru rodinami E2F a pRB in vivo: odlišné proteiny E2F zprostředkovávají aktivaci a represi“. Genes Dev. 14 (7): 804–16. doi:10,1101 / gad.14.7.804 (neaktivní 2020-10-04). PMC 316494. PMID 10766737.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
Schwemmle S, Pfeifer GP (2000). "Genomická struktura a screening mutací genu E2F4 v lidských nádorech". Int. J. Cancer. 86 (5): 672–7. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (20000601) 86: 5 <672 :: AID-IJC11> 3.0.CO; 2-X. PMID 10797289.

externí odkazy

E2F4 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook E2F4
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidský transkripční faktor E2F4

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000205250 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014859 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7958924-5] Ginsberg D, Vairo G, Chittenden T, Xiao ZX, Xu G, Wydner KL, DeCaprio JA, Lawrence JB, Livingston DM (prosinec 1994). „E2F-4, nový člen rodiny transkripčních faktorů E2F, interaguje s p107“. Genes Dev. 8 (22): 2665–79. doi:10,1101 / gad.8.22.2665. PMID 7958924.

[pmid7892279-6] Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Geng Y, Onufryk C, Chen A, Weinberg RA (duben 1995). „E2F-4 a E2F-5, dva členové rodiny E2F, jsou exprimováni v raných fázích buněčného cyklu“. Proc Natl Acad Sci U S A. 92 (6): 2403–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.2403S. doi:10.1073 / pnas.92.6.2403. PMC 42492. PMID 7892279.

[entrez-7] „Entrez Gene: E2F4 E2F transkripční faktor 4, vazba p107 / p130“.

[pmid12150994-8] Chen CR, Kang Y, Siegel PM, Massagué J (červenec 2002). „E2F4 / 5 a p107 jako Smad kofaktory spojující receptor TGFbeta s represí c-myc“. Buňka. 110 (1): 19–32. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00801-2. PMID 12150994. S2CID 8945574.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]