GFI1 - GFI1

GFI1
Identifikátory
Aliasy	GFI1, GFI-1, GFI1A, SCN2, ZNF163, transkripční represor nezávislý na růstovém faktoru 1
Externí ID	OMIM: 600871 MGI: 103170 HomoloGene: 3854 Genové karty: GFI1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	92,486,925 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	107,726,036 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba kovových iontů; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA;
Buněčná složka	• jaderné těleso; • jaderná matice; • transkripční represorový komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• pozitivní regulace interleukin-6 zprostředkované signální dráhy; • negativní regulace vývoje projekce neuronů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace signální dráhy receptoru podobného mýtnému; • regulace methylace histonu H3-K4; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce podílející se na přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace procesu biosyntézy vitaminu D.; • negativní regulace aktivity kalcidiol 1-monooxygenázy; • GO: virový proces 0022415; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • krvetvorba; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2672
	14581
	ENSG00000162676
	ENSMUSG00000029275
	Q99684
	P70338
	NM_001127215; NM_001127216; NM_005263
	NM_001267621; NM_010278
	NP_001120687; NP_001120688; NP_005254
	NP_001254550; NP_034408
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem Gfi-1 je transkripční represor že u lidí je kódován GFI1 gen.^[5] Je to důležité normální krvetvorba.^[6]

Interakce

GFI1 bylo prokázáno komunikovat s PIAS3^[7] a RUNX1T1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162676 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029275 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bell DW, Taguchi T, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Gilks CB, Zweidler-McKay P, Grimes HL, Tsichlis PN, Testa JR (červenec 1995). „Chromozomální lokalizace genu, GF1, kódujícího nový protein se zinkovým prstem, odhaluje novou syntetickou oblast mezi člověkem a hlodavci“. Cytogenet Cell Genet. 70 (3–4): 263–7. doi:10.1159/000134048. PMID 7789186.
^ „Entrez Gene: GFI1 growth factor independent 1“.
^ Rödel B, Tavassoli K, Karsunky H, Schmidt T, Bachmann M, Schaper F, Heinrich P, Shuai K, Elsässer HP, Möröy T (listopad 2000). „Protein se zinkovým prstem Gfi-1 může zlepšit signalizaci STAT3 interakcí s inhibitorem STAT3 PIAS3“. EMBO J.. 19 (21): 5845–55. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5845. PMC 305799. PMID 11060035.
^ McGhee L, Bryan J, Elliott L, Grimes HL, Kazanjian A, Davis JN, Meyers S (srpen 2003). „Gfi-1 se váže na jadernou matrici, asociuje se s proteiny ETO (MTG8) a histon-deacetylázami a potlačuje transkripci pomocí mechanismu citlivého na TSA.“ J. Cell. Biochem. 89 (5): 1005–18. doi:10.1002 / jcb.10548. PMID 12874834.

Další čtení

Gilks CB, Bear SE, Grimes HL, Tsichlis PN (1993). „Progrese linií lymfomu krysích T-buněk závislých na interleukinu-2 (IL-2) k růstu nezávislému na IL-2 po aktivaci genu (Gfi-1) kódujícího nový protein se zinkovým prstem“. Mol. Buňka. Biol. 13 (3): 1759–68. doi:10.1128 / MCB.13.3.1759. PMC 359488. PMID 8441411.
Zweidler-Mckay PA, Grimes HL, Flubacher MM, Tsichlis PN (1996). „Gfi-1 kóduje protein zinkového prstu, který váže DNA a funguje jako transkripční represor“. Mol. Buňka. Biol. 16 (8): 4024–34. doi:10.1128 / MCB.16.8.4024. PMC 231398. PMID 8754800.
Roberts T, Cowell JK (1997). „Klonování lidského genu Gfi-1 a jeho mapování na oblast chromozomu 1p22“. Onkogen. 14 (8): 1003–5. doi:10.1038 / sj.onc.1200910. PMID 9051000.
Rödel B, Tavassoli K, Karsunky H, Schmidt T, Bachmann M, Schaper F, Heinrich P, Shuai K, Elsässer HP, Möröy T (2000). „Protein se zinkovým prstem Gfi-1 může zlepšit signalizaci STAT3 interakcí s inhibitorem STAT3 PIAS3“. EMBO J.. 19 (21): 5845–55. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5845. PMC 305799. PMID 11060035.
Osawa M, Yamaguchi T, Nakamura Y, Kaneko S, Onodera M, Sawada K, Jegalian A, Wu H, Nakauchi H, Iwama A (2002). „Erythroidní expanze zprostředkovaná proteinem Gfi-1B se zinkovým prstem: role v normální krvetvorbě“. Krev. 100 (8): 2769–77. doi:10.1182 / krev-2002-01-0182. PMID 12351384.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2003 ). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Osoba RE, Li FQ, Duan Z, Benson KF, Wechsler J, Papadaki HA, Eliopoulos G, Kaufman C, Bertolone SJ, Nakamoto B, Papayannopoulou T, Grimes HL, Horwitz M (2003). „Mutace v protoonkogenu GFI1 způsobují lidskou neutropenii a cílovou ELA2“. Nat. Genet. 34 (3): 308–12. doi:10.1038 / ng1170. PMC 2832179. PMID 12778173.
McGhee L, Bryan J, Elliott L, Grimes HL, Kazanjian A, Davis JN, Meyers S (2003). „Gfi-1 se váže na jadernou matrici, asociuje se s proteiny ETO (MTG8) a histon-deacetylázami a potlačuje transkripci pomocí mechanismu citlivého na TSA.“ J. Cell. Biochem. 89 (5): 1005–18. doi:10.1002 / jcb.10548. PMID 12874834.
Doan LL, Porter SD, Duan Z, Flubacher MM, Montoya D, Tsichlis PN, Horwitz M, Gilks CB, Grimes HL (2004). "Cílená transkripční represe Gfi1 pomocí GFI1 a GFI1B v lymfoidních buňkách". Nucleic Acids Res. 32 (8): 2508–19. doi:10.1093 / nar / gkh570. PMC 419458. PMID 15131254.
Dwivedi PP, Anderson PH, Omdahl JL, Grimes HL, Morris HA, květen BK (2005). „Identifikace růstového faktoru independentního-1 (GFI1) jako represoru exprese genu 25-hydroxyvitamin D 1-alfa hydroxylázy (CYP27B1) v lidských buňkách rakoviny prostaty“. Endocr. Relat. Rakovina. 12 (2): 351–65. doi:10.1677 / erc.1.00920. PMID 15947108.
Duan Z, Zarebski A, Montoya-Durango D, Grimes HL, Horwitz M (2005). "Gfi1 koordinuje epigenetickou represi p21Cip / WAF1 získáním histonové lysinmethyltransferázy G9a a histonové deacetylázy 1". Mol. Buňka. Biol. 25 (23): 10338–51. doi:10.1128 / MCB.25.23.10338-10351.2005. PMC 1291230. PMID 16287849.
Marteijn JA, van der Meer LT, Van Emst L, de Witte T, Jansen JH, van der Reijden BA (2007). "Snížená proteazomální degradace vede k akumulaci proteinu Gfi1 v monocytech". Krev. 109 (1): 100–8. doi:10.1182 / krev-2006-02-003590. PMID 16888099.
Dwivedi PP, Anderson PH, Tilley WD, May BK, Morris HA (2007). „Role onkoproteinového růstového faktoru nezávislého-1 (GFI1) při represi 25-hydroxyvitamínu D 1alfa-hydroxylázy (CYP27B1): srovnávací analýza u lidského karcinomu prostaty a ledvinových buněk.“ J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 103 (3–5): 742–6. doi:10.1016 / j.jsbmb.2006.12.014. PMID 17207994. S2CID 30600875.
Nakazawa Y, Suzuki M, Manabe N, Yamada T, Kihara-Negishi F, Sakurai T, Tenen DG, Iwama A, Mochizuki M, Oikawa T (2007). „Kooperativní interakce mezi transkripčními faktory ETS1 a GFI1 při represi genové exprese Bax“. Onkogen. 26 (24): 3541–50. doi:10.1038 / sj.onc.1210140. PMID 17213822.
Khanna-Gupta A, Sun H, Zibello T, Lee HM, Dahl R, Boxer LA, Berliner N (2007). „Růstový faktor nezávislost-1 (Gfi-1) hraje roli při zprostředkování specifického deficitu granulí (SGD) u pacienta, kterému chybí mutace inaktivující gen v genu C / EBPϵ“. Krev. 109 (10): 4181–90. doi:10.1182 / krev-2005-05-022004. PMC 1885490. PMID 17244686.
Marteijn JA, van der Meer LT, van Emst L, van Reijmersdal S, Wissink W, de Witte T, Jansen JH, Van der Reijden BA (2007). „Ubikvitinace Gfi1 a degradace proteazomu jsou inhibovány ubikvitinovou ligázou Triad1“. Krev. 110 (9): 3128–35. doi:10.1182 / krev-2006-11-058602. PMID 17646546.

externí odkazy

GFI1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162676 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029275 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7789186-5] Bell DW, Taguchi T, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Gilks CB, Zweidler-McKay P, Grimes HL, Tsichlis PN, Testa JR (červenec 1995). „Chromozomální lokalizace genu, GF1, kódujícího nový protein se zinkovým prstem, odhaluje novou syntetickou oblast mezi člověkem a hlodavci“. Cytogenet Cell Genet. 70 (3–4): 263–7. doi:10.1159/000134048. PMID 7789186.

[entrez-6] „Entrez Gene: GFI1 growth factor independent 1“.

[pmid11060035-7] Rödel B, Tavassoli K, Karsunky H, Schmidt T, Bachmann M, Schaper F, Heinrich P, Shuai K, Elsässer HP, Möröy T (listopad 2000). „Protein se zinkovým prstem Gfi-1 může zlepšit signalizaci STAT3 interakcí s inhibitorem STAT3 PIAS3“. EMBO J.. 19 (21): 5845–55. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5845. PMC 305799. PMID 11060035.

[pmid12874834-8] McGhee L, Bryan J, Elliott L, Grimes HL, Kazanjian A, Davis JN, Meyers S (srpen 2003). „Gfi-1 se váže na jadernou matrici, asociuje se s proteiny ETO (MTG8) a histon-deacetylázami a potlačuje transkripci pomocí mechanismu citlivého na TSA.“ J. Cell. Biochem. 89 (5): 1005–18. doi:10.1002 / jcb.10548. PMID 12874834.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]