HOXD3 - HOXD3

HOXD3
Identifikátory
Aliasy	HOXD3, HOX1D, HOX4, HOX4A, Hox-4.1, homeobox D3
Externí ID	OMIM: 142980 MGI: 96207 HomoloGene: 5034 Genové karty: HOXD3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	176,173,102 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	74,748,442 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• agresivní; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • jaderné těleso;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • morfogeneze glossofaryngeálního nervu; • morfogeneze embryonálního kostního systému; • vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj štítné žlázy; • vývoj chrupavky; • pozitivní regulace genové exprese; • buněčná matice adheze; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace neuronové diferenciace; • transkripce, chráněná DNA; • specifikace předního / zadního vzoru; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3232
	15434
	ENSG00000128652
	ENSMUSG00000079277
	P31249
	P09027
	NM_006898
	NM_010468
	NP_008829
	NP_034598
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-D3 je protein že u lidí je kódován HOXD3 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen patří do rodiny genů homeoboxů. Geny homeoboxu kódují vysoce konzervovanou rodinu transkripčních faktorů, které hrají důležitou roli v morfogenezi ve všech mnohobuněčných organismech. Savci mají čtyři podobné klastry homeoboxových genů, HOXA, HOXB, HOXC a HOXD, umístěné na různých chromozomech, skládající se z 9 až 11 genů uspořádaných do tandemu. Tento gen je jedním z několika homeoboxových HOXD genů umístěných v chromozomových oblastech 2q31-2q37. Delece, které odstranily celý shluk genů HOXD nebo 5 'konec tohoto shluku, byly spojeny se závažnými abnormalitami končetin a genitálií. Protein kódovaný tímto genem může hrát roli v regulaci procesů buněčné adheze.^[7]

Viz také

Homeobox

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128652 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079277 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ McAlpine PJ, Ukazuje TB (červenec 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.
^ Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HOXD3 homeobox D3“.

Další čtení

Taniguchi Y, Fujii A, Moriuchi T (říjen 1992). "Klonování a sekvenování lidského genu homeoboxu HOX4A". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1132 (3): 332–4. doi:10.1016 / 0167-4781 (92) 90173-w. PMID 1358204.
Magli MC, Barba P, Celetti A, De Vita G, Cillo C, Boncinelli E (červenec 1991). „Souřadnicová regulace genů HOX v lidských hematopoetických buňkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (14): 6348–52. Bibcode:1991PNAS ... 88,6348M. doi:10.1073 / pnas.88.14.6348. PMC 52080. PMID 1712489.
Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (prosinec 1989). "Lidská genová rodina HOX". Výzkum nukleových kyselin. 17 (24): 10385–402. doi:10.1093 / nar / 17.24.10385. PMC 335308. PMID 2574852.
Boncinelli E, Acampora D, Pannese M, D'Esposito M, Somma R, Gaudino G, Stornaiuolo A, Cafiero M, Faiella A, Simeone A (1990). "Organizace homeoboxních genů lidské třídy I". Genom. 31 (2): 745–56. doi:10,1139 / g89-133. PMID 2576652.
Cannizzaro LA, Croce CM, Griffin CA, Simeone A, Boncinelli E, Huebner K (červenec 1987). „Lidské geny obsahující homeo box umístěné v chromozomových oblastech 2q31 ---- 2q37 a 12q12 ---- 12q13“. American Journal of Human Genetics. 41 (1): 1–15. PMC 1684175. PMID 2886047.
Taniguchi Y, Komatsu N, Moriuchi T (květen 1995). „Nadměrná exprese genu homeoboxu HOX4A (HOXD3) v lidských HEL buňkách erytroleukémie vede ke změně adhezivních vlastností“. Krev. 85 (10): 2786–94. doi:10.1182 / krev.V85.10.2786.bloodjournal85102786. PMID 7742539.
Guazzi S, Lonigro R, Pintonello L, Boncinelli E, Di Lauro R, Mavilio F (červenec 1994). „Gen transkripčního faktoru 1 štítné žlázy je kandidátským cílem pro regulaci Hox proteiny“. Časopis EMBO. 13 (14): 3339–47. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06636.x. PMC 395231. PMID 7913891.
Manley NR, Capecchi MR (březen 1998). "Hox skupina 3 paralogy regulují vývoj a migraci brzlíku, štítné žlázy a příštítných tělísek". Vývojová biologie. 195 (1): 1–15. doi:10.1006 / dbio.1997.8827. PMID 9520319.
Del Campo M, Jones MC, Veraksa AN, Curry CJ, Jones KL, Mascarello JT, Ali-Kahn-Catts Z, Drumheller T, McGinnis W (červenec 1999). „Monodaktylové končetiny a abnormální genitálie jsou spojeny s hemizygotností pro lidskou oblast 2q31, která zahrnuje klastr HOXD“. American Journal of Human Genetics. 65 (1): 104–10. doi:10.1086/302467. PMC 1378080. PMID 10364522.
Myers C, Charboneau A, Boudreau N (leden 2000). „Homeobox B3 podporuje kapilární morfogenezi a angiogenezi“. The Journal of Cell Biology. 148 (2): 343–51. doi:10.1083 / jcb.148.2.343. PMC 2174277. PMID 10648567.
Limongi MZ, Pelliccia F, Gaddini L, Rocchi A (2000). "Shlukování dvou křehkých míst a sedmi genů homeoboxu v oblasti lidského chromozomu 2q31 -> q32.1". Cytogenetika a genetika buněk. 90 (1–2): 151–3. doi:10.1159/000015651. PMID 11060466. S2CID 35579702.
Kosaki K, Kosaki R, Suzuki T, Yoshihashi H, Takahashi T, Sasaki K, Tomita M, McGinnis W, Matsuo N (únor 2002). "Kompletní panel pro analýzu mutací 39 lidských genů HOX". Teratologie. 65 (2): 50–62. doi:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Okubo Y, Hamada J, Takahashi Y, Tada M, Tsutsumida A, Furuuchi K, Aoyama T, Sugihara T, Moriuchi T (2002). „Transdukce HOXD3-antisense do buněk lidského melanomu vede ke snížení invazivních a pohyblivých aktivit“. Klinická a experimentální metastáza. 19 (6): 503–11. doi:10.1023 / A: 1020346211686. PMID 12405287. S2CID 2728036.
Boudreau NJ, Varner JA (únor 2004). „Homeoboxový transkripční faktor Hox D3 podporuje expresi a funkci integrinu alfa5beta1 během angiogeneze“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (6): 4862–8. doi:10,1074 / jbc.M305190200. PMID 14610084.
Hansen SL, Myers CA, Charboneau A, Young DM, Boudreau N (prosinec 2003). „HoxD3 urychluje hojení ran u diabetických myší“. American Journal of Pathology. 163 (6): 2421–31. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63597-3. PMC 1892363. PMID 14633614.
Chen Y, Xu B, Arderiu G, Hashimoto T, Young WL, Boudreau N, Yang GY (listopad 2004). „Retrovirové dodání genu homeoboxu D3 indukuje cerebrální angiogenezi u myší“. Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism. 24 (11): 1280–7. doi:10.1097 / 01.WCB.0000141770.09022.AB. PMID 15545924.

externí odkazy

HOXD3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128652 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079277 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Ukazuje TB (červenec 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HOXD3 homeobox D3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]