Receptor aktivovaný proliferátorem peroxizomu - Peroxisome proliferator-activated receptor

V oblasti molekulární biologie, receptory aktivované proliferátorem peroxisomu (PPAR) jsou skupina jaderný receptor bílkoviny že funkce jako transkripční faktory regulující výraz geny.[1] PPARs hrají zásadní roli při regulaci buněčná diferenciace, rozvoj, a metabolismus (uhlohydrát, lipid, protein ),[2] a tumorigeneze[3] vyšších organismů.[4][5]
Nomenklatura a distribuce tkání
Receptor aktivovaný proliferátorem peroxizomu alfa | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||
Symbol | PPARA | ||||||
Alt. symboly | PPAR | ||||||
Gen NCBI | 5465 | ||||||
HGNC | 9232 | ||||||
OMIM | 170998 | ||||||
RefSeq | NM_001001928 | ||||||
UniProt | Q07869 | ||||||
Další údaje | |||||||
Místo | Chr. 22 q12-q13.1 | ||||||
|
Gama receptor aktivovaný proliferátorem peroxizomu | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||
Identifikátory | |||||||
Symbol | PPARG | ||||||
Gen NCBI | 5468 | ||||||
HGNC | 9236 | ||||||
OMIM | 601487 | ||||||
RefSeq | NM_005037 | ||||||
UniProt | P37231 | ||||||
Další údaje | |||||||
Místo | Chr. 3 p25 | ||||||
|
Delta receptoru aktivovaného proliferátorem peroxizomu | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||
Symbol | PPARD | ||||||
Gen NCBI | 5467 | ||||||
HGNC | 9235 | ||||||
OMIM | 600409 | ||||||
RefSeq | NM_006238 | ||||||
UniProt | Q03181 | ||||||
Další údaje | |||||||
Místo | Chr. 6 p21.2 | ||||||
|
Byly identifikovány tři typy PPAR: alfa, gama a delta (beta):[4]
- α (alfa) - vyjádřen v játra, ledviny, srdce, sval, tuková tkáň, a další[6]
- β / δ (beta / delta) - vyjádřeno v mnoha tkáních, ale výrazně v mozek, tuková tkáň, a kůže
- y (gama) - ačkoli je transkribován stejným genem, prochází tímto PPAR alternativní sestřih je vyjádřen ve třech formách:
- γ1 - vyjádřeno prakticky ve všech tkáních, včetně srdce, sval, dvojtečka, ledviny, slinivka břišní, a slezina
- γ2 - vyjádřeno hlavně v tuková tkáň (30 aminokyseliny delší než γ1)
- γ3 - vyjádřeno v makrofágy, tlusté střevo, bílá tuková tkáň.
Dějiny
PPAR byly původně identifikovány v Xenopus žáby jako receptory, které indukují množení peroxisomy v buňkách.[7]První PPAR (PPARα) byl objeven během hledání molekulárního cíle pro skupinu látek, které se pak označují jako proliferátory peroxisomu, protože kromě zlepšení zvýšily počet peroxisomů v tkáni jater hlodavců citlivost na inzulín.[8] Tito agenti, farmakologicky související s fibráty byly objeveny počátkem 80. let. Když se ukázalo, že PPARs hrály v biologii mnohem všestrannější roli, agenti se zase nazývali PPAR ligandy. Nejznámější PPAR ligandy jsou thiazolidindiony; viz níže pro více informací.
Poté, co byl u lidí v roce 1992 identifikován PPARδ (delta),[9] ukázalo se, že to úzce souvisí s PPARβ (beta) dříve popsaným v průběhu téhož roku u jiných zvířat (Xenopus). Název PPARδ se obecně používá v USA, zatímco používání označení PPARβ zůstalo v Evropě, kde byl tento receptor původně objeven v Xenopus.
Fyziologická funkce
Všechny PPAR heterodimerizovat s retinoid X receptor (RXR) a vázat se na konkrétní oblasti na DNA cílových genů. Tyto sekvence DNA se nazývají PPRE (proliferátor peroxisomu) prvky hormonální odpovědi ). DNA konsensuální sekvence je AGGTCANAGGTCA, přičemž N je jakékoli nukleotid. Obecně se tato sekvence vyskytuje v promotorové oblasti a gen, a když PPAR váže svůj ligand, transkripce cílových genů se zvyšuje nebo snižuje v závislosti na genu. RXR také tvoří a heterodimer s řadou dalších receptorů (např. Vitamín D a hormon štítné žlázy ).
Funkce PPAR je modifikována přesným tvarem jejich vazebné domény pro ligand (viz níže) indukovaným vazbou ligandu a řadou koaktivátor a jádrový kompresor proteiny, jejichž přítomnost může stimulovat nebo inhibovat funkci receptoru.[10]
Mezi endogenní ligandy pro PPAR patří volné mastné kyseliny, eikosanoidy a Vitamin B3. PPARy je aktivován PGJ2 (A prostaglandin ) a někteří členové 5-HETE rodina kyselina arachidonová metabolity včetně 5-oxo-15 (S) -HETE a 5-oxo-ETE.[11] Naproti tomu PPARα je aktivován leukotrien B4. Někteří členové Kyselina 15-hydroxyeikosatetraenová rodina metabolitů kyseliny arachidonové, včetně 15 (S) -HETE, 15 (R) -HETE a 15-HpETE, se aktivují v různé míře PPAR alfa, beta / delta a gama.[12] PPARy aktivace agonistou RS5444 může inhibovat růst anaplastického karcinomu štítné žlázy.[13] Vidět[14] pro přezkoumání a kritiku rolí PPAR gama u rakoviny.
Genetika
Tři hlavní formy jsou přepisovány z různých geny:
- PPARα - chromozom 22q 12-13.1 (OMIM 170998 )
- PPARβ / δ - chromozom 6p 21.2-21.1 (OMIM 600409 )
- PPARy - chromozom 3p 25 (OMIM 601487 ).
Byly popsány dědičné poruchy všech PPAR, které obecně vedou ke ztrátě funkce a jsou doprovodné lipodystrofie, rezistence na inzulín a / nebo acanthosis nigricans.[15] Z PPARy, zisk funkce mutace byl popsán a studován (Pro 12Ala ) což snížilo riziko rezistence na inzulín; to je docela převládající (alela frekvence 0,03 - 0,12 u některých populací).[16] V porovnání, pro 115gln Je spojená s obezita. Některé další polymorfismy mají vysoký výskyt v populacích se zvýšenými indexy tělesné hmotnosti.
Struktura
Stejně jako ostatní jaderné receptory mají PPAR modulární strukturu a obsahují následující funkční domény:
- (A / B) N-koncová oblast
- (C) DBD (Doména vázající DNA )
- (D) pružná oblast závěsu
- (E) LBD (doména vázající ligand)
- (F) C-koncová oblast
DBD obsahuje dva zinkový prst motivy, které se vážou na specifické sekvence DNA známé jako prvky hormonální odpovědi když je receptor aktivován. LBD má rozsáhlou sekundární struktura skládající se z 13 alfa helixy a a beta list.[17] Přírodní a syntetické ligandy se vážou také na LBD aktivace nebo potlačující receptor.
Farmakologie a modulátory PPAR
PPARa a PPARy jsou molekulární cíle řady prodávaných léky. Například hypolipidemický fibráty aktivovat PPARα a proti diabetikům thiazolidindiony aktivovat PPARγ. Syntetická chemikálie kyselina perfluoroktanová aktivuje PPARα, zatímco syntetický kyselina perfluoronanová aktivuje jak PPARa, tak PPARy. Berberin aktivuje PPARγ, stejně jako další přírodní sloučeniny z různých chemických tříd.[18][19]
Viz také
Reference
- ^ Michalik L, Auwerx J, Berger JP, Chatterjee VK, Glass CK, Gonzalez FJ, Grimaldi PA, Kadowaki T, Lazar MA, O'Rahilly S, Palmer CN, Plutzky J, Reddy JK, Spiegelman BM, Staels B, Wahli W ( 2006). „International Union of Pharmacology. LXI. Peroxisome proliferator-activated receptors“. Pharmacol. Rev. 58 (4): 726–41. doi:10.1124 / pr.58.4.5. PMID 17132851. S2CID 2240461.
- ^ Dunning, Kylie R .; Anastasi, Marie R .; Zhang, Voueleng J .; Russell, Darryl L .; Robker, Rebecca L. (02.02.2014). „Regulace oxidace mastných kyselin v komplexech myší kumulus-oocyt během zrání a modulace agonisty PPAR“. PLOS ONE. 9 (2): e87327. Bibcode:2014PLoSO ... 987327D. doi:10.1371 / journal.pone.0087327. ISSN 1932-6203. PMC 3914821. PMID 24505284.
- ^ Belfiore A, Genua M, Malaguarnera R (2009). „Agonisté PPAR-gama a jejich účinky na signalizaci receptoru IGF-I: důsledky pro rakovinu“. PPAR Res. 2009: 830501. doi:10.1155/2009/830501. PMC 2709717. PMID 19609453.
- ^ A b Berger J, Moller DE (2002). "Mechanismy působení PPAR". Annu. Rev. Med. 53: 409–35. doi:10.1146 / annurev.med.53.082901.104018. PMID 11818483.
- ^ Feige JN, Gelman L, Michalik L, Desvergne B, Wahli W (2006). „Od molekulárního působení k fyziologickým výstupům: receptory aktivované proliferátorem peroxisomu jsou jaderné receptory na křižovatce klíčových buněčných funkcí“. Prog. Lipid Res. 45 (2): 120–59. doi:10.1016 / j.plipres.2005.12.002. PMID 16476485.
- ^ Tyagi S, Gupta P, Saini AS, Kaushal C, Sharma S (říjen 2011). „Receptor aktivovaný proliferátorem peroxisomu: Rodina jaderných receptorů při různých onemocněních“. J Adv Pharm Technol Res. 2 (4): 236–40. doi:10.4103/2231-4040.90879. PMC 3255347. PMID 22247890.
- ^ Dreyer C, Krey G, Keller H, Givel F, Helftenbein G, Wahli W (1992). "Řízení peroxisomální beta-oxidační dráhy novou rodinou nukleárních hormonálních receptorů". Buňka. 68 (5): 879–87. doi:10.1016/0092-8674(92)90031-7. PMID 1312391. S2CID 3148132.
- ^ Issemann I, Green S (1990). "Aktivace člena nadrodiny receptoru steroidních hormonů proliferátory peroxisomu". Příroda. 347 (6294): 645–50. Bibcode:1990 Natur.347..645I. doi:10.1038 / 347645a0. PMID 2129546. S2CID 4306126.
- ^ Schmidt A, Endo N, Rutledge SJ, Vogel R, Shinar D, Rodan GA (1992). "Identifikace nového člena nadrodiny receptoru steroidních hormonů, který je aktivován proliferátorem peroxisomu a mastnými kyselinami". Mol. Endokrinol. 6 (10): 1634–41. doi:10.1210 / me.6.10.1634. PMID 1333051.
- ^ Yu S, Reddy JK (2007). "Transkripční koaktivátory pro receptory aktivované proliferátorem peroxisomu". Biochim. Biophys. Acta. 1771 (8): 936–51. doi:10.1016 / j.bbalip.2007.01.008. PMID 17306620.
- ^ Biochim. Biophys. Acta 1736: 228-236, 2005
- ^ Mol. Pharmacol. 77-171-184, 2010
- ^ Marlow LA, Reynolds LA, Cleland AS, Cooper SJ, Gumz ML, Kurakata S, Fujiwara K, Zhang Y, Sebo T, Grant C, McIver B, Wadsworth JT, Radisky DC, Smallridge RC, Copland JA (únor 2009). „Reaktivace potlačeného RhoB je kritickým krokem k inhibici růstu anaplastického karcinomu štítné žlázy“. Cancer Res. 69 (4): 1536–44. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-3718. PMC 2644344. PMID 19208833.
- ^ Curr. Mol. Med. 7: 532-540, 2007
- ^ Meirhaeghe A, Amouyel P (2004). "Dopad genetické variace PPARgammy na člověka". Mol. Genet. Metab. 83 (1–2): 93–102. doi:10.1016 / j.ymgme.2004.08.014. PMID 15464424.
- ^ Buzzetti R, Petrone A, Ribaudo MC, Alemanno I, Zavarella S, Mein CA, Maiani F, Tiberti C, Baroni MG, Vecci E, Arca M, Leonetti F, Di Mario U (2004). „Běžná varianta PPAR-gamma2 Pro12Ala je spojena s vyšší citlivostí na inzulín“. European Journal of Human Genetics. 12 (12): 1050–4. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201283. PMID 15367918.
- ^ Zoete V, Grosdidier A, Michielin O (2007). „Struktury receptorů aktivovaných proliferátorem peroxisomu: specificita ligandu, molekulární změna a interakce s regulátory“. Biochim. Biophys. Acta. 1771 (8): 915–25. doi:10.1016 / j.bbalip.2007.01.007. PMID 17317294.
- ^ Atanasov AG, Wang JN, Gu SP, Bu J, Kramer MP, Baumgartner L, Fakhrudin N, Ladurner A, Malainer C, Vuorinen A, Noha SM, Schwaiger S, Rollinger JM, Schuster D, Stuppner H, Dirsch VM, Heiss EH (2013). „Honokiol: neadipogenní agonista PPARγ z přírody“. Biochim. Biophys. Acta. 1830 (10): 4813–9. doi:10.1016 / j.bbagen.2013.06.021. PMC 3790966. PMID 23811337.
- ^ Atanasov AG, Blunder M, Fakhrudin N, Liu X, Noha SM, Malainer C, Kramer MP, Cocic A, Kunert O, Schinkovitz A, Heiss EH, Schuster D, Dirsch VM, Bauer R (2013). „Polyacetyleny z Notopterygium incisum - noví selektivní parciální agonisté receptoru gama aktivovaného proliferátorem peroxisomu“. PLOS ONE. 8 (4): e61755. Bibcode:2013PLoSO ... 861755A. doi:10.1371 / journal.pone.0061755. PMC 3632601. PMID 23630612.
externí odkazy
- [1] (Stránka zdrojů PPAR, Penn State University).
- [2] (Zdroj jaderného receptoru).
- Referenční obrys PPAR (Rutgersova univerzita).
- Peroxisom + receptory aktivované proliferátorem + v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- Proteopedia Peroxisome_Proliferator-Activated_Receptors - struktura receptoru aktivovaného proliferátorem peroxizomu v interaktivním 3D