Jaderný faktor zárodečných buněk - Germ cell nuclear factor

NR6A1
Identifikátory
Aliasy	NR6A1, CT150, GCNF, GCNF1, NR61, RTR, hGCNF, hRTR, podrodina jaderného receptoru 6 skupina A člen 1
Externí ID	OMIM: 602778 MGI: 1352459 HomoloGene: 36308 Genové karty: NR6A1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	124,771,311 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	38,927,688 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba kovových iontů; • aktivita receptoru steroidních hormonů; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 aktivita jaderného receptoru; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • generace gamet; • spermatogeneze; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná proliferace; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • signalizační dráha pro intracelulární steroidní hormonový receptor; • intracelulární receptorová signální dráha; • steroidní hormon zprostředkovaná signální dráha; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2649
	14536
	ENSG00000148200
	ENSMUSG00000063972
	Q15406
	Q64249
	NM_001278546; NM_001489; NM_033334; NM_033335
	NM_001159548; NM_001159549; NM_010264
	NP_001265475; NP_001480; NP_201591; NP_201591.2
	NP_001153020; NP_001153021; NP_034394
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The nukleární faktor zárodečných buněk (GCNF), také známý jako RTR (receptor související s retinoidním receptorem související s varlaty) nebo NR6A1 (podrodina jaderného receptoru 6, skupina A, člen 1), je a protein že u lidí je kódován NR6A1 gen.^[5]^[6] GCNF je členem jaderný receptor rodina intracelulární transkripční faktory .

U dospělých je GCNH vyjádřen hlavně v zárodečné buňky z pohlavní žlázy a podílí se na regulaci embryogeneze a zárodečné buňky diferenciace.^[7]

Jeho expresní vzorec naznačuje, že může být zapojen do neurogeneze a vývoje zárodečných buněk. Protein může homodimerizovat a vázat DNA, ale cíle in vivo nebyly identifikovány. Gen exprimuje tři alternativně sestříhané varianty transkriptu.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148200 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000063972 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lei W, Hirose T, Zhang LX, Adachi H, Spinella MJ, Dmitrovsky E, Jetten AM (duben 1997). „Klonování receptoru souvisejícího se zárodočními buňkami lidského osiřelého receptoru / receptoru souvisejícího s retinoidními varlaty a jeho diferenciální regulace během diferenciace buněk embryonálního karcinomu. Journal of Molecular Endocrinology. 18 (2): 167–76. doi:10.1677 / jme.0.0180167. PMID 9134503.
^ Süsens U, Borgmeyer U (prosinec 1996). "Charakterizace genu nukleárního faktoru lidské zárodečné buňky". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1309 (3): 179–82. doi:10.1016 / s0167-4781 (96) 00157-1. PMID 8982251.
^ Zechel C (prosinec 2005). "Jaderný faktor zárodečných buněk (GCNF)". Molekulární reprodukce a vývoj. 72 (4): 550–6. doi:10,1002 / mrd.20377. PMID 16155958. S2CID 39315293.
^ „Entrez Gene: NR6A1 jaderný receptor podčeleď 6, skupina A, člen 1“.

Další čtení

Greschik H, Schüle R (1999). "Jaderný faktor zárodečných buněk: osiřelý receptor s nečekanými vlastnostmi". Journal of Molecular Medicine. 76 (12): 800–10. doi:10,1007 / s001090050284. PMID 9846950. S2CID 9368668.
Hirose T, O'Brien DA, Jetten AM (leden 1995). „RTR: nový člen nadrodiny jaderných receptorů, který je vysoce exprimován v myších varlatech“. Gen. 152 (2): 247–51. doi:10.1016 / 0378-1119 (94) 00656-D. PMID 7835709.
Yan ZH, Medveděv A, Hirose T, Gotoh H, Jetten AM (duben 1997). "Charakterizace prvku odezvy a vazebných vlastností DNA nukleárního osiřelého receptoru zárodečné buňky nukleárního faktoru / receptoru souvisejícího s receptorem retinoidu". The Journal of Biological Chemistry. 272 (16): 10565–72. doi:10.1074 / jbc.272.16.10565. PMID 9099702.
Kapelle M, Krätzschmar J, Husemann M, Schleuning WD (květen 1997). "cDNA klonování dvou úzce souvisejících forem jaderného faktoru lidských zárodečných buněk (GCNF)". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1352 (1): 13–7. doi:10.1016 / s0167-4781 (97) 00043-2. PMID 9177477.
Agoulnik IY, Cho Y, Niederberger C, Kieback DG, Cooney AJ (březen 1998). "Klonování, analýza exprese a chromozomální lokalizace genu lidského jaderného receptoru GCNF". FEBS Dopisy. 424 (1–2): 73–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00142-2. PMID 9537518. S2CID 26848550.
Greschik H, Wurtz JM, Hublitz P, Köhler F, Moras D, Schüle R (leden 1999). „Charakterizace vazebných a dimerizačních vlastností DNA nukleárního faktoru zárodečných buněk nukleárního receptoru pro vzácná onemocnění. Molekulární a buněčná biologie. 19 (1): 690–703. doi:10,1128 / mcb.19.1.690. PMC 83926. PMID 9858592.
Schmitz TP, Süsens U, Borgmeyer U (září 1999). "Vazba DNA, interakce proteinů a diferenciální exprese nukleárního faktoru lidské zárodečné buňky". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1446 (3): 173–80. doi:10.1016 / s0167-4781 (99) 00079-2. PMID 10524192.
Yan Z, Jetten AM (listopad 2000). "Charakterizace represorové funkce nukleárního faktoru spojeného s varlaty souvisejícím s receptorem nukleárního sirotka receptoru / jaderný faktor zárodečných buněk". The Journal of Biological Chemistry. 275 (45): 35077–85. doi:10,1074 / jbc.M005566200. PMID 10940306.
Süsens U, Borgmeyer U (2001). „Genomická struktura genu pro myší nukleární faktor zárodečných buněk (GCNF). II. Srovnání s genomovou strukturou lidského genu GCNF“. Genome Biology. 2 (5): RESEARCH0017. doi:10.1186 / gb-2001-2-5-research0017. PMC 32189. PMID 11387038.
Mehta DV, Kim YS, Dixon D, Jetten AM (duben 2002). „Charakterizace exprese retinoidního receptoru (RTR) v trofoblastech“. Placenta. 23 (4): 281–7. doi:10.1053 / plac.2001.0779. PMID 11969338.
Yan Z, Kim YS, Jetten AM (srpen 2002). „RAP80, nový jaderný protein, který interaguje s receptorem spojeným s retinoidy souvisejícími s varlaty“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (35): 32379–88. doi:10,1074 / jbc.M203475200. PMID 12080054.
Lan ZJ, Chung AC, Xu X, DeMayo FJ, Cooney AJ (prosinec 2002). „Embryonální funkce nukleárního faktoru zárodečných buněk závisí na doméně vázající DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (52): 50660–7. doi:10,1074 / jbc.M209586200. PMID 12381721.
Yang G, Zhang YL, Buchold GM, Jetten AM, O'Brien DA (květen 2003). „Analýza transkriptů jaderných faktorů zárodečných buněk a exprese proteinů během spermatogeneze“. Biologie reprodukce. 68 (5): 1620–30. doi:10.1095 / biolreprod.102.012013. PMID 12606326.
Rajkovic M, Middendorff R, Wetzel MG, Frkovic D, Damerow S, Seitz HJ, Weitzel JM (prosinec 2004). „Jaderný faktor zárodečných buněk uvolňuje cAMP-odezvový prvek modulátorem tau zprostředkovanou aktivaci promotoru specifického pro varlata lidské mitochondriální glycerol-3-fosfát dehydrogenázy“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (50): 52493–9. doi:10,1074 / jbc.M404467200. PMID 15456763.

externí odkazy

NR6A1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148200 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000063972 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9134503-5] Lei W, Hirose T, Zhang LX, Adachi H, Spinella MJ, Dmitrovsky E, Jetten AM (duben 1997). „Klonování receptoru souvisejícího se zárodočními buňkami lidského osiřelého receptoru / receptoru souvisejícího s retinoidními varlaty a jeho diferenciální regulace během diferenciace buněk embryonálního karcinomu. Journal of Molecular Endocrinology. 18 (2): 167–76. doi:10.1677 / jme.0.0180167. PMID 9134503.

[pmid8982251-6] Süsens U, Borgmeyer U (prosinec 1996). "Charakterizace genu nukleárního faktoru lidské zárodečné buňky". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1309 (3): 179–82. doi:10.1016 / s0167-4781 (96) 00157-1. PMID 8982251.

[pmid16155958-7] Zechel C (prosinec 2005). "Jaderný faktor zárodečných buněk (GCNF)". Molekulární reprodukce a vývoj. 72 (4): 550–6. doi:10,1002 / mrd.20377. PMID 16155958. S2CID 39315293.

[entrez-8] „Entrez Gene: NR6A1 jaderný receptor podčeleď 6, skupina A, člen 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]