KLF9 - KLF9 - Wikipedia

KLF9
Identifikátory
Aliasy	KLF9, BTEB, BTEB1, faktor podobný Kruppel 9, faktor podobný Kruppel 9
Externí ID	OMIM: 602902 MGI: 1333856 HomoloGene: 931 Genové karty: KLF9
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	70,414,624 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	23,168,134 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčná membrána; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na podnět kortizolu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • cirkadiánní rytmus; • negativní regulace množení keratinocytů; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul hormonu štítné žlázy; • rytmický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	687
	16601
	ENSG00000119138
	ENSMUSG00000033863
	Q13886
	O35739; Q8CEC4
	NM_001206
	NM_010638
	NP_001197
	NP_034768
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Krueppelův faktor 9 je protein že u lidí je kódován KLF9 gen.^[5]^[6] Dříve známý jako Protein vázající základní transkripční prvek 1 (BTEB Protein 1), Klf9 je součástí typu Sp1 C2H2 zinkový prst rodina transkripční faktory. Několik předchozích studií ukázalo regulaci vývoje zvířat související s Klf9, včetně buněčné diferenciace B buňky, keratinocyty a neurony.^[7] Klf9 je také klíčovým transkripčním regulátorem pro dělohu endometria proliferace buněk, adheze a diferenciace, to jsou všechny faktory, které jsou zásadní během těhotenství a během kterých jsou vypnuty tumorigeneze.^[8]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je transkripční faktor, který se váže na prvky GC boxu umístěné v promotoru. Vazba kódovaného proteinu na jeden GC box inhibuje expresi mRNA, zatímco vazba na tandemově opakované prvky GC boxu aktivuje transkripci.^[6]

Oxidační stres zvyšuje expresi Klf9 a nadměrná exprese genu Klf9 senzibilizuje buňku na oxidační stres a reaktivní formy kyslíku (ROS)]. ,

Používat krátká vlásenka RNA (shRNA) umlčení exprese Klf9 poskytuje buňce odolnost vůči oxidačnímu stresu a smrti buněk související s ROS. Klf9 je nadregulován ROS a podporuje smrt buněk související s ROS.^[7]

Klf9 vykazuje podobnosti s jinými známými geny oxidačního stresu NQO1 a HMOX1. Když byly vystaveny stejnému množství peroxidu vodíku, jak myší embryonální buňky, tak lidské buňky produkovaly podobná množství Klf9 a NQO1 / HMOX.^[7] Opak tohoto účinku také nastane; Nadměrná exprese Klf9 v buňce vede ke zvýšení intracelulárního ROS. Konečným výsledkem zvýšení intracelulárních ROS a Klf9 je zvýšení buněčné smrti; s nadměrně exprimovaným genem Klf9 umírá více buněk. Podobná buněčná smrt byla nalezena in vivo, když byly myši divokého typu intranazálně vystaveny působení parakvátu oxidativnímu stresu, což potvrdilo expresi Klf9 závislou na oxidačním stresu pouze u buněčných linií.^[7]

Oblasti kolem 10 kb upstream a 1 kb downstream od počátečního místa transkripce Klf9 obsahují konzervované antioxidační prvky (ARE), které jsou vazebnými místy pro Nrf2.^[7] Nrf2 je hlavním regulátorem antioxidační odpovědi na ROS v buňce. Klf9 je nadregulován Nrf2; když je vysoký oxidační stres a vysoká koncentrace intracelulárního ROS, váže se Nrf2 na promotor Klf9, což zvyšuje množství intracelulárního ROS, což vede k buněčné smrti. Když je oxidační stres nízký, prochází Nrf2 svou normální cestou zvýšením množství antioxidačních látek v buňce a snížením množství intracelulárního ROS.^[7]

Studie na zvířatech

Nedostatek Klf9 potlačuje bleomycin -indukovaný fibróza v plicích myší. Zavedením bleomycinu do plicní tkáně tkáň vytvoří ROS a vyvine fibrotickou plicní tkáň, aby bojovala proti poškození způsobenému bleomycinem. Když byl Klf9 vyřazen u těchto myší, nevytvořilo se tolik fibrotické plicní tkáně.^[7] Kvůli tomuto zjištění vědci navrhli, aby manipulace s hladinami Klf9 v těle mohla být platnou léčbou i pro další nemoci, včetně určitých typů rakoviny.^[7]

Interakce

KLF9 bylo prokázáno komunikovat s receptor progesteronu.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000119138 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033863 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Imataka H, Sogawa K, Yasumoto K, Kikuchi Y, Sasano K, Kobayashi A, Hayami M, Fujii-Kuriyama Y (listopad 1992). „Dva regulační proteiny, které se vážou na základní transkripční prvek (BTE), sekvenci GC boxu v promotorové oblasti potkaního genu P-4501A1“. EMBO J.. 11 (10): 3663–71. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05451.x. PMC 556826. PMID 1356762.
^ ^A ^b „Entrez Gene: KLF9 Kruppel-like factor 9“.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h Zucker SN, Fink EE, Bagati A, Mannava S, Bianchi-Smiraglia A, Bogner PN, Wawrzyniak JA, Foley C, Leonova KI, Grimm MJ, Moparthy K, Ionov Y, Wang J, Liu S, Sexton S, Kandel ES, Bakin AV, Zhang Y, Kaminski N, Segal BH, Nikiforov MA (2014). „Nrf2 zesiluje oxidační stres indukcí Klf9“. Mol. Buňka. 53 (6): 916–28. doi:10.1016 / j.molcel.2014.01.033. PMC 4049522. PMID 24613345.
^ Simmen FA, Su Y, Xiao R, Zeng Z, Simmen RC (2008). „Síť s faktorem 9 (KLF9) podobná Krüppel v buňkách karcinomu endometria HEC-1-A naznačuje karcinogenní potenciál dys-regulované exprese KLF9“. Reprod. Biol. Endokrinol. 6: 41. doi:10.1186/1477-7827-6-41. PMC 2542371. PMID 18783612.
^ Zhang XL, Zhang D, Michel FJ, Blum JL, Simmen FA, Simmen RC (červen 2003). „Selektivní interakce faktoru 9 podobného Kruppel / protein vázající základní transkripční prvek s izoformami receptoru progesteronu A a B určují transkripční aktivitu genů reagujících na progesteron v buňkách endometriálního epitelu“. J. Biol. Chem. 278 (24): 21474–82. doi:10.1074 / jbc.M212098200. PMID 12672823.

Další čtení

Kobayashi A, Sogawa K, Imataka H, Fujii-Kuriyama Y (1995). "Analýza funkčních domén proteinu vázajícího se na GC box, BTEB". J. Biochem. 117 (1): 91–5. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124727. PMID 7775404.
Imataka H, Nakayama K, Yasumoto K, Mizuno A, Fujii-Kuriyama Y, Hayami M (1994). "Buněčně specifická translační kontrola exprese transkripčního faktoru BTEB. Role upstream AUG v 5'-nepřekládané oblasti". J. Biol. Chem. 269 (32): 20668–73. PMID 8051167.
Imataka H, Mizuno A, Fujii-Kuriyama Y, Hayami M (1994). "Aktivace dlouhého terminálního opakování viru lidské imunodeficience typu 1 pomocí BTEB, transkripčního faktoru vázajícího se na GC box". AIDS Res. Hučení. Retroviry. 9 (9): 825–31. doi:10.1089 / podpora.1993.9.825. PMID 8257632.
Hashimoto H, Toide K, Kitamura R, Fujita M, Tagawa S, Itoh S, Kamataki T (prosinec 1993). „Genová struktura CYP3A4, forma cytochromu P450 specifická pro dospělé v lidských játrech, a její transkripční kontrola“. Eur. J. Biochem. 218 (2): 585–95. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18412.x. PMID 8269949.
Ohe N, Yamasaki Y, Sogawa K, Inazawa J, Ariyama T, Oshimura M, Fujii-Kuriyama Y (září 1993). "Chromozomální lokalizace a cDNA sekvence lidského BTEB, proteinu vázajícího se na GC box". Somat. Cell Mol. Genet. 19 (5): 499–503. doi:10.1007 / BF01233255. PMID 8291025. S2CID 45624023.
Zhang XL, Zhang D, Michel FJ, Blum JL, Simmen FA, Simmen RC (2003). „Selektivní interakce faktoru 9 podobného Kruppel / protein vázající základní transkripční prvek s izoformami receptoru progesteronu A a B určují transkripční aktivitu genů reagujících na progesteron v buňkách endometriálního epitelu“. J. Biol. Chem. 278 (24): 21474–82. doi:10.1074 / jbc.M212098200. PMID 12672823.
Velarde MC, Iruthayanathan M, Eason RR, Zhang D, Simmen FA, Simmen RC (duben 2006). „Transaktivace receptoru progesteronu genu pro sekreční inhibitor proteázy leukocytů v endometriálních buňkách Ishikawa zahrnuje nábor proteinu-1 vázajícího faktor 9 na základní faktor transkripce“. Endokrinologie. 147 (4): 1969–78. doi:10.1210 / cs.2005-1419. PMID 16384861.

externí odkazy

KLF9 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000119138 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033863 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1356762-5] Imataka H, Sogawa K, Yasumoto K, Kikuchi Y, Sasano K, Kobayashi A, Hayami M, Fujii-Kuriyama Y (listopad 1992). „Dva regulační proteiny, které se vážou na základní transkripční prvek (BTE), sekvenci GC boxu v promotorové oblasti potkaního genu P-4501A1“. EMBO J.. 11 (10): 3663–71. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05451.x. PMC 556826. PMID 1356762.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: KLF9 Kruppel-like factor 9“.

[Zucker_2014-7] A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h Zucker SN, Fink EE, Bagati A, Mannava S, Bianchi-Smiraglia A, Bogner PN, Wawrzyniak JA, Foley C, Leonova KI, Grimm MJ, Moparthy K, Ionov Y, Wang J, Liu S, Sexton S, Kandel ES, Bakin AV, Zhang Y, Kaminski N, Segal BH, Nikiforov MA (2014). „Nrf2 zesiluje oxidační stres indukcí Klf9“. Mol. Buňka. 53 (6): 916–28. doi:10.1016 / j.molcel.2014.01.033. PMC 4049522. PMID 24613345.

[pmid18783612-8] Simmen FA, Su Y, Xiao R, Zeng Z, Simmen RC (2008). „Síť s faktorem 9 (KLF9) podobná Krüppel v buňkách karcinomu endometria HEC-1-A naznačuje karcinogenní potenciál dys-regulované exprese KLF9“. Reprod. Biol. Endokrinol. 6: 41. doi:10.1186/1477-7827-6-41. PMC 2542371. PMID 18783612.

[pmid12672823-9] Zhang XL, Zhang D, Michel FJ, Blum JL, Simmen FA, Simmen RC (červen 2003). „Selektivní interakce faktoru 9 podobného Kruppel / protein vázající základní transkripční prvek s izoformami receptoru progesteronu A a B určují transkripční aktivitu genů reagujících na progesteron v buňkách endometriálního epitelu“. J. Biol. Chem. 278 (24): 21474–82. doi:10.1074 / jbc.M212098200. PMID 12672823.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]