Receptor kyseliny retinové beta - Retinoic acid receptor beta

RARB
Protein RARB PDB 1dsz.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRARB, HAP, MCOPS12, NR1B2, RRB2, RARbeta1, receptor kyseliny retinové beta
Externí IDOMIM: 180220 MGI: 97857 HomoloGene: 68100 Genové karty: RARB
Umístění genu (člověk)
Chromozom 3 (lidský)
Chr.Chromozom 3 (lidský)[1]
Chromozom 3 (lidský)
Genomické umístění pro RARB
Genomické umístění pro RARB
Kapela3p24.2Start25,174,332 bp[1]
Konec25,597,932 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RARB 205080 na fs.png

PBB GE RARB 208412 s na fs.png

PBB GE RARB 208530 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5915

218772

Ensembl

ENSG00000077092

ENSMUSG00000017491

UniProt

P10826
Q5QHG3

P22605

RefSeq (mRNA)

NM_001289760
NM_001289761
NM_001289762
NM_011243

RefSeq (protein)

NP_001276689
NP_001276690
NP_001276691
NP_035373

Místo (UCSC)Chr 3: 25,17 - 25,6 MbChr 14: 16,43 - 16,82 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Receptor kyseliny retinové beta (RAR-beta), také známý jako NR1B2 (podrodina jaderného receptoru 1, skupina B, člen 2) je a jaderný receptor že u lidí je kódován RARB gen.[5][6]

Funkce

Tento gen kóduje beta receptor receptoru kyseliny retinové, který je členem nadrodiny receptorů štítné žlázy a steroidních hormonů regulátorů nukleární transkripce. Tento receptor se lokalizuje do cytoplazmy a do subjaderných kompartmentů. Váže kyselinu retinovou, biologicky aktivní formu vitamin A. který zprostředkovává buněčnou signalizaci v embryonální morfogenezi, buněčném růstu a diferenciaci. Předpokládá se, že tento protein omezuje růst mnoha typů buněk regulací genové exprese. Gen byl poprvé identifikován v hepatocelulárním karcinomu, kde boky a žloutenka typu B web pro integraci virů. Deregulace tohoto genu byla také detekována v děloze karcinom děložního hrdla preneoplastické léze.[7] Gen exprimuje alespoň dvě varianty transkriptu; byl popsán jeden další přepis, ale jeho úplná povaha nebyla stanovena.[5]

Epigenetika

Aberantní promotor beta receptoru kyseliny retinové Hypermethylace DNA byla pozorována v souvislosti s nástupem / progresí rakoviny. Opravdu, toto nevhodné epigenetický fenomén byl pozorován u žen postižených Vulvar spinocelulární karcinom vznikl z vulver lichen sclerosus.[8] Methylace promotoru beta receptoru kyseliny retinové může být markerem rizika rakoviny u pacientů postižených tímto onemocněním.[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že beta receptor pro kyselinu retinovou komunikovat s NR4A2.[9]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077092 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017491 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b "Entrez Gene: RARB retinoic acid receptor, beta".
  6. ^ Mattei MG, de Thé H, Mattei JF, Marchio A, Tiollais P, Dejean A (říjen 1988). „Přiřazení genu pro receptor RAR beta pro lidskou kyselinu retinovou do pásma p24 chromozomu 3“. Genetika člověka. 80 (2): 189–90. doi:10.1007 / BF00702867. PMID  2844650. S2CID  23090420.
  7. ^ Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). "Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID  25205602. S2CID  24986454.
  8. ^ A b Rotondo JC, Borghi A, Selvatici R, Mazzoni E, Bononi I, Corazza M, Kussini J, Montinari E, Gafà R, Tognon M, Martini F (2018). „Sdružení genu receptoru kyseliny retinové β s nástupem a progresí vulválního spinocelulárního karcinomu spojeného s lišejníkovým sklerosem“. JAMA Dermatologie. 154 (7): 819–823. doi:10.1001 / jamadermatol.2018.1373. PMC  6128494. PMID  29898214.
  9. ^ Perlmann T, Jansson L (duben 1995). „Nová cesta pro signalizaci vitaminu A zprostředkovanou heterodimerizací RXR s NGFI-B a NURR1“. Geny a vývoj. 9 (7): 769–82. doi:10,1101 / gad. 9.7.769. PMID  7705655.

Další čtení

  • Dejean A, de Thé H (červen 1990). "Virus hepatitidy B jako inzertní mutagen v lidském hepatocelulárním karcinomu". Molekulární biologie a medicína. 7 (3): 213–22. PMID  2170809.
  • Sun SY (leden 2004). "Receptor kyseliny retinové beta a rakovina tlustého střeva". Biologie a terapie rakoviny. 3 (1): 87–8. doi:10,4161 / cbt. 3.1.1866. PMID  14726690.
  • Saba N, Jain S, Khuri F (2004). "Chemoprevence u rakoviny plic". Aktuální problémy s rakovinou. 28 (5): 287–306. doi:10.1016 / j.currproblcancer.2004.05.005. PMID  15375805.
  • Klein O, Grignon Y, Civit T, Auque J, Marchal JC (září 2005). „[Metylační stav promotoru genu RARbeta v cerebrálním gliomu nízkého a vysokého stupně. Srovnání s normální tkání. Imunohistochemická studie exprese jaderného RARbeta v buňkách cerebrálního gliomu nízkého a vysokého stupně. Porovnání s normálními buňkami. 48 nádorů]“. Neuro-Chirurgie. 51 (3–4 Pt 1): 147–54. doi:10.1016 / S0028-3770 (05) 83470-8. PMID  16389900.
  • Katahira M, Knegtel RM, Boelens R, Eib D, Schilthuis JG, van der Saag PT, Kaptein R (červenec 1992). „Homo- a heteronukleární NMR studie vazebné domény DNA k receptoru lidské kyseliny retinové beta: sekvenční přiřazení a identifikace prvků sekundární struktury“. Biochemie. 31 (28): 6474–80. doi:10.1021 / bi00143a017. PMID  1321662.
  • Berrodin TJ, Marks MS, Ozato K, Linney E, Lazar MA (září 1992). „Heterodimerizace mezi receptorem hormonu štítné žlázy, receptorem kyseliny retinové, receptorem retinoidu X, kuřecím ovalbuminem proti směru transkripčního faktoru promotoru a endogenním jaterním proteinem“. Molekulární endokrinologie. 6 (9): 1468–78. doi:10.1210 / me.6.9.1468. PMID  1331778.
  • van der Leede BJ, Folkers GE, Kruyt FA, van der Saag PT (říjen 1992). "Genomická organizace lidského receptoru kyseliny retinové beta 2". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 188 (2): 695–702. doi:10.1016 / 0006-291X (92) 91112-4. PMID  1332705.
  • Prentice A, Matthews CJ, Thomas EJ, Redfern CP (květen 1992). "Exprese receptorů kyseliny retinové v kultivovaných lidských stromálních buňkách endometria a účinky kyseliny retinové". Lidská reprodukce. 7 (5): 692–700. doi:10.1093 / oxfordjournals.humrep.a 137721. PMID  1379266.
  • Shen S, Kruyt FA, den Hertog J, van der Saag PT, Kruijer W (1992). "Myší a humánní promotory beta 2 receptoru kyseliny retinové: srovnání sekvencí a lokalizace reakce kyseliny retinové". Sekvence DNA. 2 (2): 111–9. doi:10.3109/10425179109039679. PMID  1663808.
  • de Thé H, Vivanco-Ruiz MM, Tiollais P, Stunnenberg H, Dejean A (leden 1990). "Identifikace prvku reagujícího na kyselinu retinovou v genu beta receptoru pro kyselinu retinovou". Příroda. 343 (6254): 177–80. Bibcode:1990 Natur.343..177D. doi:10.1038 / 343177a0. PMID  2153268. S2CID  4314508.
  • Hoffmann B, Lehmann JM, Zhang XK, Hermann T, Husmann M, Graupner G, Pfahl M (listopad 1990). „Prvek specifický pro receptor kyseliny retinové řídí promotor beta-receptoru kyseliny retinové“. Molekulární endokrinologie. 4 (11): 1727–36. doi:10.1210 / oprava-4-11-1727. PMID  2177841.
  • de Thé H, Marchio A, Tiollais P, Dejean A (1988). „Nový gen související s receptorem steroidního hormonu štítné žlázy nevhodně exprimovaný v lidském hepatocelulárním karcinomu“. Příroda. 330 (6149): 667–70. doi:10.1038 / 330667a0. PMID  2825037. S2CID  4327614.
  • Značka N, Petkovich M, Krust A, Chambon P, de Thé H, Marchio A, Tiollais P, Dejean A (duben 1988). "Identifikace druhého lidského receptoru kyseliny retinové". Příroda. 332 (6167): 850–3. Bibcode:1988Natur.332..850B. doi:10.1038 / 332850a0. PMID  2833708. S2CID  4349193.
  • Benbrook D, Lernhardt E, Pfahl M (červen 1988). "Nový receptor kyseliny retinové identifikovaný z hepatocelulárního karcinomu". Příroda. 333 (6174): 669–72. Bibcode:1988Natur.333..669B. doi:10.1038 / 333669a0. PMID  2836738. S2CID  4313063.
  • Dejean A, Bougueleret L, Grzeschik KH, Tiollais P (1986). „Integrace DNA viru hepatitidy B v sekvenci homologní s geny v-erb-A a steroidních receptorů v hepatocelulárním karcinomu“. Příroda. 322 (6074): 70–2. Bibcode:1986 Natur.322 ... 70D. doi:10.1038 / 322070a0. PMID  3014347. S2CID  4355348.
  • Si SP, Tsou HC, Lee X, Peacocke M (červenec 1995). "Vliv buněčné stárnutí a kyseliny retinové na expresi buněčných proteinů vázajících kyselinu retinovou v kožních fibroblastech". Experimentální výzkum buněk. 219 (1): 243–8. doi:10.1006 / excr.1995.1224. PMID  7628539.
  • Houle B, Pelletier M, Wu J, Goodyer C, Bradley WE (leden 1994). „Fetální izoforma lidského beta receptoru kyseliny retinové exprimovaná v malobuněčných liniích rakoviny plic“. Výzkum rakoviny. 54 (2): 365–9. PMID  8275470.
  • Knegtel RM, Katahira M, Schilthuis JG, Bonvin AM, Boelens R, Eib D, van der Saag PT, Kaptein R (leden 1993). "Struktura roztoku lidské vazebné domény receptoru beta kyseliny retinové-DNA". Journal of Biomolecular NMR. 3 (1): 1–17. doi:10.1007 / BF00242472. PMID  8383553. S2CID  24063437.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.