FOXA1 - FOXA1

FOXA1
Identifikátory
Aliasy	FOXA1, HNF3A, TCF3A, skříň vidlice A1
Externí ID	OMIM: 602294 MGI: 1347472 HomoloGene: 3307 Genové karty: FOXA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	37,596,059 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	57,546,916 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• mikrovilli; • buněčné jádro; • fibrilární centrum; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • stromální morfogeneze prostaty; • diferenciace dopaminergních neuronů; • pozitivní regulace signální dráhy intracelulárního estrogenového receptoru; • odpověď na estradiol; • regulace transkripce, DNA-šablony; • morfogeneze plic; • homeostáza glukózy; • pozitivní regulace vyhlazené signální dráhy; • vývoj plic; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • specifikace neuronového osudu; • tvorba anatomické struktury podílející se na morfogenezi; • pozitivní regulace mitotického buněčného cyklu; • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • morfogeneze trubice; • sekreční columnal luminární epiteliální buněčná diferenciace podílející se na vývoji prostaty žlázového acinu; • transkripce, chráněná DNA; • regulace buněčného cyklu; • vývoj mnohobuněčných organismů; • morfogeneze epitelu prostaty; • vývoj pojivové tkáně; • pozitivní regulace neuronové diferenciace; • zrání epiteliálních buněk účastnící se vývoje prostaty; • regulace genové exprese; • diferenciace buněk plicního epitelu; • vzorování dorální / ventrální neurální trubice; • epiteliálně-mezenchymální signalizace podílející se na vývoji prostaty; • větvení epiteliální trubice zapojené do morfogeneze plic; • diferenciace bazálních buněk dýchacích cest; • hormonální metabolický proces; • vývoj alveolární sekundární přepážky; • negativní regulace přechodu z epitelu na mezenchym; • pozitivní regulace adheze buněk k buňkám zprostředkovaná kadherinem; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • remodelace chromatinu; • anatomická struktura morfogeneze; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • organizace chromatinu; • diferenciace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3169
	15375
	ENSG00000129514
	ENSMUSG00000035451
	P55317
	P35582
	NM_004496
	NM_008259
	NP_004487
	NP_032285
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Forkhead box protein A1 (FOXA1), také známý jako hepatocytární nukleární faktor 3-alfa (HNF-3A), je a protein že u lidí je kódován FOXA1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

FOXA1 je členem vidlice třída proteinů vázajících DNA. Tyto hepatocytární jaderné faktory jsou transkripční aktivátory pro jaterně specifické transkripty, jako např albumin a transthyretin a také s nimi interagují chromatin jako průkopnický faktor. Podobní členové rodiny u myší mají roli v regulaci metabolismu a v diferenciaci slinivky břišní a jater.^[5]

Marker u rakoviny prsu

FOXA1 v rakovina prsu je vysoce korelován s ERα⁺, GATA3⁺, a PR⁺ proteinová exprese stejně jako endokrinní signalizace. FOXA1 funguje jako průkopnický faktor pro ERa v ERα⁺ rakovina prsu a její exprese může identifikovat ERα⁺ rakoviny, které podstoupí rychlé přeprogramování signalizace ERa, které je spojeno se špatnými výsledky a rezistencí na léčbu.^[8] Naopak v ERα⁻ rakovina prsu FOXA1 vysoce koreluje s morfologií nízkého stupně a zlepšeným přežitím bez onemocnění. FOXA1 je navazujícím cílem GATA3 v mléčné žláze.^[9] Vyjádření v ERα⁻ rakoviny mohou identifikovat podmnožinu nádorů, která reaguje na jiné endokrinní terapie, jako je androgenní receptor léčba antagonisty.^[10]^[11]

Role v rakovině

Mutace v tomto genu byly opakovaně pozorovány v případech rakoviny prostaty.^[12]

Exprese FOXA1 koreluje se dvěma markery EMT, konkrétně Twist1 a E-kadherinem u rakoviny prsu.^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129514 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035451 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: forkhead box A1“.
^ Bingle CD, Gowan S (1996). "Molekulární klonování viditelného transkripčního faktoru HNF-3 alfa z buněčné linie lidského plicního adenokarcinomu". Biochim Biophys Acta. 1307 (1): 17–20. doi:10.1016/0167-4781(96)00058-9. PMID 8652662.
^ Mincheva A, Lichter P, Schütz G, Kaestner KH (1997). „Přiřazení lidských genů pro hepatocytární jaderný faktor 3-alfa, -beta a -gamma (HNF3A, HNF3B, HNF3G) na 14q12-q13, 20p11 a 19q13.2-q13.4“. Genomika. 39 (3): 417–9. doi:10.1006 / geno.1996.4477. PMID 9119385.
^ Ross-Innes CS, Stark R, Teschendorff AE, Holmes KA, Ali HR, Dunning MJ, Brown GD, Gojis O, Ellis IO, Green AR, Ali S, Chin SF, Palmieri C, Caldas C, Carroll JS (4. ledna 2012) ). „Diferenční vazba estrogenových receptorů je spojena s klinickým výsledkem u rakoviny prsu“. Příroda. 481 (7381): 389–93. doi:10.1038 / příroda10730. PMC 3272464. PMID 22217937.
^ Kouros-Mehr H, Slorach EM, Sternlicht MD, Werb Z (prosinec 2006). „GATA-3 udržuje diferenciaci osudu luminálních buněk v mléčné žláze“. Buňka. 127 (5): 1041–55. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.048. PMC 2646406. PMID 17129787.
^ Albergaria A, Paredes J, Sousa B, Milanezi F, Carneiro V, Bastos J, Costa S, Vieira D, Lopes N, Lam EW, Lunet N, Schmitt F (2009). „Exprese FOXA1 a GATA-3 u rakoviny prsu: Prognostický význam u nádorů negativních na hormonální receptory“. Výzkum rakoviny prsu. 11 (3): R40. doi:10.1186 / bcr2327. PMC 2716509. PMID 19549328.
^ Sanga S, Broom BM, Cristini V, Edgerton ME (2009). „Metaanalýza genové exprese podporuje existenci molekulárního apokrinního karcinomu prsu s rolí pro androgenní receptor a implikuje interakce s rodinou ErbB“. BMC Medical Genomics. 2: 59. doi:10.1186/1755-8794-2-59. PMC 2753593. PMID 19747394.
^ Barbieri CE, Baca SC, Lawrence MS, Demichelis F, Blattner M, Theurillat JP, White TA, Stojanov P, Van Allen E, Stransky N, Nickerson E, Chae SS, Boysen G, Auclair D, Onofrio RC, Park K, Kitabayashi N, MacDonald TY, Sheikh K, Vuong T, Guiducci C, Cibulskis K, Sivachenko A, Carter SL, Saksena G, Voet D, Hussain WM, Ramos AH, Winckler W, Redman MC, Ardlie K, Tewari AK, Mosquera JM, Rupp N, Wild PJ, Moch H, Morrissey C, Nelson PS, Kantoff PW, Gabriel SB, Golub TR, Meyerson M, Lander ES, Getz G, Rubin MA, Garraway LA (červen 2012). "Exome sekvenování identifikuje opakující se mutace SPOP, FOXA1 a MED12 u rakoviny prostaty". Nat. Genet. 44 (6): 685–9. doi:10,1038 / ng.2279. PMC 3673022. PMID 22610119.
^ BenAyed-Guerfali, Dorra; Dabbèche-Bouricha, Emna; Ayadi, Wajdi; Trifa, Fatma; Charfi, Slim; Khabir, Abdelmajid; Sellami-Boudawara, Tahia; Mokdad-Gargouri, Raja (2019). „Sdružení markerů FOXA1 a EMT (Twist1 a E-kadherin) u rakoviny prsu“. Zprávy o molekulární biologii. 46 (3): 3247–3255. doi:10.1007 / s11033-019-04784-w. ISSN 0301-4851. PMID 30941644.

Další čtení

Song L, Xu Z, Zhang C a kol. (2009). „Up-regulace HSP72 pomocí Foxa1 v buněčné linii lidské rakoviny prsu MCF-7“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 386 (1): 30–4. doi:10.1016 / j.bbrc.2009.05.120. PMID 19486887.
Zhang Y, Ali TZ, Zhou H a kol. (2010). „ErbB3 vázající protein 1 potlačuje gen 2 podporující metastázy přední gradientový protein 2 u rakoviny prostaty“. Cancer Res. 70 (1): 240–8. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2904. PMC 3724404. PMID 20048076.
McMullin RP, Dobi A, Mutton LN a kol. (2010). „Zesilovač vazby FOXA1 reguluje expresi Hoxb13 v prostatě“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 107 (1): 98–103. doi:10.1073 / pnas.0902001107. PMC 2806740. PMID 20018680.
Sun Q, Yu X, Degraff DJ, Matusik RJ (2009). „Upstream stimulační faktor 2, nový protein interagující s FoxA1, je zapojen do genové exprese specifické pro prostatu“. Mol. Endokrinol. 23 (12): 2038–47. doi:10.1210 / me.2009-0092. PMC 2796152. PMID 19846536.
Liu N, Niu Y, Wang SL a kol. (2010). „[Diagnostický a prognostický význam exprese FOXA1 v molekulárních podtypech duktálních karcinomů invazivních do prsu]“. Zhonghua Yi Xue Za Zhi. 90 (20): 1403–7. PMID 20646630.
Haiman CA, Garcia RR, Hsu C a kol. (2009). „Screening a asociační testování běžné kódující variace v genech pro aktivaci receptoru pro steroidní hormony a korepresorových genů ve vztahu k riziku rakoviny prsu: mnohonárodnostní kohorta“. Rakovina BMC. 9: 43. doi:10.1186/1471-2407-9-43. PMC 2637888. PMID 19183483.
Kohler S, Cirillo LA (2010). „Stabilní vazba chromatinu zabraňuje acetylaci FoxA a zachovává remodelaci FoxA chromatinu“. J. Biol. Chem. 285 (1): 464–72. doi:10.1074 / jbc.M109.063149. PMC 2804194. PMID 19897491.
Malik S, Jiang S, Garee JP a kol. (2010). „Histon deacetyláza 7 a FoxA1 při estrogenem zprostředkované represi RPRM“. Mol. Buňka. Biol. 30 (2): 399–412. doi:10.1128 / MCB.00907-09. PMC 2798473. PMID 19917725.
Motallebipour M, Ameur A, Reddy Bysani MS a kol. (2009). "Diferenční vazebný a společný vazebný vzorec FOXA1 a FOXA3 a jejich vztah k H3K4me3 v buňkách HepG2 odhalený ChIP-seq". Genome Biol. 10 (11): R129. doi:10.1186 / gb-2009-10-11-r129. PMC 3091322. PMID 19919681.
Eeckhoute J, Lupien M, Meyer CA a kol. (2009). „Remodelace selektivního chromatinu buněčného typu definuje aktivní podskupinu zesilovačů vázaných na FOXA1“. Genome Res. 19 (3): 372–80. doi:10.1101 / gr.084582.108. PMC 2661808. PMID 19129543.
Nakshatri H, Badve S (2007). "FOXA1 jako terapeutický cíl pro rakovinu prsu". Znalecký posudek. Ther. Cíle. 11 (4): 507–14. doi:10.1517/14728222.11.4.507. PMID 17373880.
Iacobazzi V, Infantino V, Bisaccia F a kol. (2009). "Role FOXA v expresi genu nosiče citronanu mitochondriálního a sekreci inzulínu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 385 (2): 220–4. doi:10.1016 / j.bbrc.2009.05.030. PMID 19445897.
Nucera C, Eeckhoute J, Finn S a kol. (2009). „FOXA1 je potenciální onkogen v anaplastickém karcinomu štítné žlázy“. Clin. Cancer Res. 15 (11): 3680–9. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-08-3155. PMID 19470727.
Nakshatri H, Badve S (2009). „FOXA1 u rakoviny prsu“. Expert Rev Mol Med. 11: e8. doi:10.1017 / S1462399409001008. PMID 19261198.
Song Y, Washington MK, Crawford HC (2010). „Ztráta FOXA1 / 2 je nezbytná pro přechod epitelu k mezenchymu u rakoviny pankreatu“. Cancer Res. 70 (5): 2115–25. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2979. PMC 2831111. PMID 20160041.
Lee HJ, Chattopadhyay S, Yoon WH a kol. (2010). „Nadměrná exprese hepatocytárního jaderného faktoru-3alfa indukuje apoptózu prostřednictvím upregulace a akumulace cytoplazmatického p53 v buňkách rakoviny prostaty“. Prostata. 70 (4): 353–61. doi:10.1002 / pros.21069. PMID 19866472.
Bernardo GM, Lozada KL, Miedler JD a kol. (2010). „FOXA1 je zásadním determinantem exprese ERalpha a morfogeneze mléčné vývode“. Rozvoj. 137 (12): 2045–54. doi:10.1242 / dev.043299. PMC 2875844. PMID 20501593.
Albergaria A, Paredes J, Sousa B a kol. (2009). „Exprese FOXA1 a GATA-3 u rakoviny prsu: prognostický význam u nádorů negativních na hormonální receptory“. Breast Cancer Res. 11 (3): R40. doi:10.1186 / bcr2327. PMC 2716509. PMID 19549328.
Huang QY, Li GH, Kung AW (2009). „Polymorfismus -9247 T / C v regulační oblasti SOST upstream, který potenciálně ovlivňuje vazbu C / EBPalfa a FOXA1, je spojen s osteoporózou.“ Kost. 45 (2): 289–94. doi:10.1016 / j.bone.2009.03.676. PMID 19371798.
Sano M, Aoyagi K, Takahashi H a kol. (2010). „Forkhead box A1 transkripční dráha v karcinomech dlaždicových buněk exprimujících KRT7 s rozsáhlými metastázami do lymfatických uzlin“. Int. J. Oncol. 36 (2): 321–30. doi:10,3892 / ijo_00000503. PMID 20043065.

externí odkazy

FactorBook FOXA1

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129514 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035451 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: forkhead box A1“.

[pmid8652662-6] Bingle CD, Gowan S (1996). "Molekulární klonování viditelného transkripčního faktoru HNF-3 alfa z buněčné linie lidského plicního adenokarcinomu". Biochim Biophys Acta. 1307 (1): 17–20. doi:10.1016/0167-4781(96)00058-9. PMID 8652662.

[pmid9119385-7] Mincheva A, Lichter P, Schütz G, Kaestner KH (1997). „Přiřazení lidských genů pro hepatocytární jaderný faktor 3-alfa, -beta a -gamma (HNF3A, HNF3B, HNF3G) na 14q12-q13, 20p11 a 19q13.2-q13.4“. Genomika. 39 (3): 417–9. doi:10.1006 / geno.1996.4477. PMID 9119385.

[8] Ross-Innes CS, Stark R, Teschendorff AE, Holmes KA, Ali HR, Dunning MJ, Brown GD, Gojis O, Ellis IO, Green AR, Ali S, Chin SF, Palmieri C, Caldas C, Carroll JS (4. ledna 2012) ). „Diferenční vazba estrogenových receptorů je spojena s klinickým výsledkem u rakoviny prsu“. Příroda. 481 (7381): 389–93. doi:10.1038 / příroda10730. PMC 3272464. PMID 22217937.

[pmid17129787-9] Kouros-Mehr H, Slorach EM, Sternlicht MD, Werb Z (prosinec 2006). „GATA-3 udržuje diferenciaci osudu luminálních buněk v mléčné žláze“. Buňka. 127 (5): 1041–55. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.048. PMC 2646406. PMID 17129787.

[Albergaria_2009-10] Albergaria A, Paredes J, Sousa B, Milanezi F, Carneiro V, Bastos J, Costa S, Vieira D, Lopes N, Lam EW, Lunet N, Schmitt F (2009). „Exprese FOXA1 a GATA-3 u rakoviny prsu: Prognostický význam u nádorů negativních na hormonální receptory“. Výzkum rakoviny prsu. 11 (3): R40. doi:10.1186 / bcr2327. PMC 2716509. PMID 19549328.

[Sanga_2009-11] Sanga S, Broom BM, Cristini V, Edgerton ME (2009). „Metaanalýza genové exprese podporuje existenci molekulárního apokrinního karcinomu prsu s rolí pro androgenní receptor a implikuje interakce s rodinou ErbB“. BMC Medical Genomics. 2: 59. doi:10.1186/1755-8794-2-59. PMC 2753593. PMID 19747394.

[Barbieri_2012-12] Barbieri CE, Baca SC, Lawrence MS, Demichelis F, Blattner M, Theurillat JP, White TA, Stojanov P, Van Allen E, Stransky N, Nickerson E, Chae SS, Boysen G, Auclair D, Onofrio RC, Park K, Kitabayashi N, MacDonald TY, Sheikh K, Vuong T, Guiducci C, Cibulskis K, Sivachenko A, Carter SL, Saksena G, Voet D, Hussain WM, Ramos AH, Winckler W, Redman MC, Ardlie K, Tewari AK, Mosquera JM, Rupp N, Wild PJ, Moch H, Morrissey C, Nelson PS, Kantoff PW, Gabriel SB, Golub TR, Meyerson M, Lander ES, Getz G, Rubin MA, Garraway LA (červen 2012). "Exome sekvenování identifikuje opakující se mutace SPOP, FOXA1 a MED12 u rakoviny prostaty". Nat. Genet. 44 (6): 685–9. doi:10,1038 / ng.2279. PMC 3673022. PMID 22610119.

[13] BenAyed-Guerfali, Dorra; Dabbèche-Bouricha, Emna; Ayadi, Wajdi; Trifa, Fatma; Charfi, Slim; Khabir, Abdelmajid; Sellami-Boudawara, Tahia; Mokdad-Gargouri, Raja (2019). „Sdružení markerů FOXA1 a EMT (Twist1 a E-kadherin) u rakoviny prsu“. Zprávy o molekulární biologii. 46 (3): 3247–3255. doi:10.1007 / s11033-019-04784-w. ISSN 0301-4851. PMID 30941644.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]