Aryl uhlovodíkový receptor nukleární translokátor - Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator

ARNT
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2
Identifikátory
Aliasy	ARNT, Nukleární translokátor, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl uhlovodíkový receptor
Externí ID	OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 Genové karty: ARNT
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	150,876,708 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	95,497,240 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba aryl uhlovodíkových receptorů; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • aktivita homodimerizace proteinu; • sekvenčně specifické dvouvláknové vázání DNA; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 aktivita jaderného receptoru;
Buněčná složka	• cytoplazma; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II; • buněčné jádro; • jaderné těleso;
Biologický proces	• pozitivní regulace signální dráhy receptoru vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • diferenciace buněk; • reakce na hypoxii; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace proliferace endoteliálních buněk; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na oxidační stres; • pozitivní regulace diferenciace erytrocytů; • vývoj embryonální placenty; • transkripce mRNA z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace sumoylace proteinů; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • intracelulární receptorová signální dráha; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • pozitivní regulace produkce vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • pozitivní regulace glykolytického procesu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace procesu biosyntézy hormonů; • xenobiotický metabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	405
	11863
	ENSG00000143437
	ENSMUSG00000015522
	P27540
	P53762
NM_001197325; NM_001286035; NM_001286036; NM_001668; NM_178426;
	NM_178427; NM_001350224; NM_001350225; NM_001350226
	NM_001037737; NM_009709
NP_001184254; NP_001272964; NP_001272965; NP_001659; NP_848514;
	NP_001337153; NP_001337154; NP_001337155
	NP_001032826; NP_033839
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The ARNT gen kóduje nukleární translokátor aryl uhlovodíkových receptorů protein který tvoří komplex s vázaným ligandem aryl uhlovodíkový receptor (AhR) a je vyžadován pro funkci receptoru. Kódovaný protein byl také identifikován jako beta podjednotka heterodimerního transkripčního faktoru, hypoxií indukovatelný faktor 1 (HIF1). Translokace t (1; 12) (q21; p13), která vede k TEL-ARNT fúzní protein, Je spojená s akutní myeloblastická leukémie. Pro tento gen byly popsány tři alternativně sestříhané varianty kódující různé izoformy.

Aryl uhlovodíkový receptor (AhR) se účastní indukce několika enzymy které se účastní xenobiotikum metabolismus. Bez ligandů, cytosolický forma aryl uhlovodíkový receptor je v komplexu protein tepelného šoku 90. Vazba ligandu, která zahrnuje dioxin a polycyklické aromatické uhlovodíky, vede k translokaci podjednotky vázající ligand pouze do^[5] jádro. Indukce enzymů zapojených do xenobiotického metabolismu nastává prostřednictvím vazby ligandu vázaného AhR na xenobiotické responzivní prvky v promotorech genů pro tyto enzymy.

Interakce

Ukázalo se, že jaderný translokátor arylových uhlovodíkových receptorů komunikovat s:

AIP,^[6]^[7]
AHR,^[8]^[9]^[10]^[11]
EPAS1,^[12]
HIF1A,^[12]^[13]
NCOA2,^[14]
SIM1,^[13]^[15] a
SIM2.^[13]^[15]^[16]^[17]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143437 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hughes, D .; Guttenplan, J. B .; Marcus, C. B .; Subbaramaiah, K .; Dannenberg, A. J. (2008). „Inhibitory proteinu Heat Shock 90 potlačují aktivaci aryl uhlovodíkových receptorů zprostředkovanou aktivací transkripce CYP1A1 a CYP1B1 a tvorby DNA aduktu“. Výzkum prevence rakoviny. 1 (6): 485–493. doi:10.1158 / 1940-6207.CAPR-08-0149. PMC 2680610. PMID 19138996.
^ Carver LA, Bradfield CA (duben 1997). „Ligandově závislá interakce arylového uhlovodíkového receptoru s novým imunofilinovým homologem in vivo“. J. Biol. Chem. 272 (17): 11452–6. doi:10.1074 / jbc.272.17.11452. PMID 9111057.
^ Kazlauskas A, Sundström S, Poellinger L, Pongratz I (duben 2001). „Chaperonový komplex hsp90 reguluje intracelulární lokalizaci dioxinového receptoru“. Mol. Buňka. Biol. 21 (7): 2594–607. doi:10.1128 / MCB.21.7.2594-2607.2001. PMC 86890. PMID 11259606.
^ Lindebro MC, Poellinger L, Whitelaw ML (červenec 1995). „Interakce protein-protein přes PAS domény: role PAS domény v pozitivní a negativní regulaci komplexu transkripčního faktoru bHLH / PAS dioxinový receptor-Arnt“. EMBO J.. 14 (14): 3528–39. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07359.x. PMC 394421. PMID 7628454.
^ Whitelaw M, Pongratz I, Wilhelmsson A, Gustafsson JA, Poellinger L (duben 1993). „Nábor arntového regulátoru závislý na ligandu určuje rozpoznání DNA receptorem dioxinu“. Mol. Buňka. Biol. 13 (4): 2504–14. doi:10.1128 / MCB.13.4.2504. PMC 359572. PMID 8384309.
^ Yamaguchi Y, Kuo MT (říjen 1995). „Funkční analýza interakcí nukleárních translokátorů aryl-uhlovodíkových receptorů s aryl-uhlovodíkovým receptorem v kvasinkovém dvouhybridním systému“. Biochem. Pharmacol. 50 (8): 1295–302. doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. PMID 7488247.
^ Mimura J, Ema M, Sogawa K, Fujii-Kuriyama Y (leden 1999). "Identifikace nového mechanismu regulace funkce receptoru Ah (dioxin)". Genes Dev. 13 (1): 20–5. doi:10.1101 / gad.13.1.20. PMC 316371. PMID 9887096.
^ ^A ^b Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M, Perdew GH, Bradfield CA (březen 1997). "Charakterizace podmnožiny nadrodiny základní-spirála-smyčka-spirála-PAS, která interaguje se složkami dioxinové signalizační dráhy". J. Biol. Chem. 272 (13): 8581–93. doi:10.1074 / jbc.272.13.8581. PMID 9079689.
^ ^A ^b ^C Woods SL, Whitelaw ML (březen 2002). „Diferenciální aktivity myší single minded 1 (SIM1) a SIM2 na prvku hypoxické odpovědi. Cross-talk mezi základními transkripčními faktory homologie helix-loop-helix / per-Arnt-Sim“. J. Biol. Chem. 277 (12): 10236–43. doi:10,1074 / jbc.M110752200. PMID 11782478.
^ Beischlag TV, Wang S, Rose DW, Torchia J, Reisz-Porszasz S, Muhammad K, Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O (červen 2002). „Nábor rodiny NCoA / SRC-1 / p160 transkripčních koaktivátorů nukleárním translokátorovým komplexem aryl uhlovodíkový receptor / aryl uhlovodíkový receptor“. Mol. Buňka. Biol. 22 (12): 4319–33. doi:10.1128 / mcb.22.12.4319-4333.2002. PMC 133867. PMID 12024042.
^ ^A ^b Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (únor 1997). „Dva myší homology jednomyslného proteinu Drosophila, které interagují s nukleárním translokátorovým proteinem myšího arylového uhlovodíkového receptoru“. J. Biol. Chem. 272 (7): 4451–7. doi:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID 9020169.
^ Ooe N, Saito K, Mikami N, Nakatuka I, Kaneko H (leden 2004). „Identifikace nového základního faktoru helix-loop-helix-PAS, NXF, odhaluje konkurenční pozitivní regulační roli Sim2 v expresi genu dendritického cytoskeletu modulátoru drebrinu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (2): 608–16. doi:10.1128 / mcb.24.2.608-616.2004. PMC 343817. PMID 14701734.
^ Moffett P, Reece M, Pelletier J (září 1997). „Myší produkt genu Sim-2 inhibuje transkripci aktivní represí a funkční interferencí“. Mol. Buňka. Biol. 17 (9): 4933–47. doi:10,1128 / mcb.17.9.4933. PMC 232345. PMID 9271372.

Další čtení

Haase VH (2006). „Hypoxií indukovatelné faktory v ledvinách“. Dopoledne. J. Physiol. Renal Physiol. 291 (2): F271–81. doi:10.1152 / ajprenal.00071.2006. PMC 4232221. PMID 16554418.
Reyes H, Reisz-Porszasz S, Hankinson O (1992). „Identifikace jaderného translokátorového proteinu Ah receptoru (Arnt) jako složky formy vázající DNA na Ah receptor“. Věda. 256 (5060): 1193–5. Bibcode:1992Sci ... 256.1193R. doi:10.1126 / science.256.5060.1193. PMID 1317062. S2CID 34075046.
Hoffman EC, Reyes H, Chu FF, Sander F, Conley LH, Brooks BA, Hankinson O (1991). "Klonování faktoru požadovaného pro aktivitu receptoru Ah (dioxin)". Věda. 252 (5008): 954–8. Bibcode:1991Sci ... 252..954H. doi:10.1126 / science.1852076. PMID 1852076.
Yamaguchi Y, Kuo MT (1995). „Funkční analýza interakcí nukleárních translokátorů aryl-uhlovodíkových receptorů s aryl-uhlovodíkovým receptorem v kvasinkovém dvouhybridním systému“. Biochem. Pharmacol. 50 (8): 1295–302. doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. PMID 7488247.
Wang GL, Jiang BH, Rue EA, Semenza GL (1995). „Faktor 1 indukovatelný hypoxií je heterodimer základní helix-smyčka-helix-PAS regulovaný buněčným napětím O2“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (12): 5510–4. Bibcode:1995PNAS ... 92,5510W. doi:10.1073 / pnas.92.12.5510. PMC 41725. PMID 7539918.
Lindebro MC, Poellinger L, Whitelaw ML (1995). „Interakce protein-protein prostřednictvím PAS domén: role PAS domény v pozitivní a negativní regulaci komplexu transkripčního faktoru bHLH / PAS dioxinový receptor-Arnt“. EMBO J.. 14 (14): 3528–39. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07359.x. PMC 394421. PMID 7628454.
Abbott BD, Probst MR, Perdew GH (1995). "Imunohistochemické dvojité barvení pro Ah receptor a ARNT v lidských embryonálních patrových regálech". Teratologie. 50 (5): 361–6. doi:10,1002 / tera.1420500507. PMID 7716743.
Reisz-Porszasz S, Probst MR, Fukunaga BN, Hankinson O (1994). „Identifikace funkčních domén nukleárního translokátorového proteinu arylovodíkového receptoru (ARNT)“. Mol. Buňka. Biol. 14 (9): 6075–86. doi:10,1128 / mcb.14,9,6075. PMC 359134. PMID 8065341.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Johnson B, Brooks BA, Heinzmann C, Diep A, Mohandas T, Sparkes RS, Reyes H, Hoffman E, Lange E, Gatti RA (1993). „Ah receptorový nukleární translokátorový gen (ARNT) se nachází na q21 lidského chromozomu 1 a na myším chromozomu 3 poblíž Cf-3.“ Genomika. 17 (3): 592–8. doi:10.1006 / geno.1993.1377. PMID 8244375.
Whitelaw M, Pongratz I, Wilhelmsson A, Gustafsson JA, Poellinger L (1993). „Nábor arntového regulátoru závislý na ligandu určuje rozpoznání DNA receptorem dioxinu“. Mol. Buňka. Biol. 13 (4): 2504–14. doi:10.1128 / MCB.13.4.2504. PMC 359572. PMID 8384309.
Jiang BH, Rue E, Wang GL, Roe R, Semenza GL (1996). „Dimerizace, vazba DNA a transaktivační vlastnosti hypoxií indukovatelného faktoru 1“. J. Biol. Chem. 271 (30): 17771–8. doi:10.1074 / jbc.271.30.17771. PMID 8663540.
Rowlands JC, McEwan IJ, Gustafsson JA (1996). „Trans-aktivace lidským aryl-uhlovodíkovým receptorem a aryl-uhlovodíkovým receptorem pro nukleární translokátorové proteiny: přímé interakce s bazálními transkripčními faktory“. Mol. Pharmacol. 50 (3): 538–48. PMID 8794892.
Ema M, Morita M, Ikawa S, Tanaka M, Matsuda Y, Gotoh O, Saijoh Y, Fujii H, Hamada H, Kikuchi Y, Fujii-Kuriyama Y (1996). „Dva noví členové rodiny genů myšího Sima jsou transkripční represory a vykazují různé vzorce exprese během myší embryogeneze“. Mol. Buňka. Biol. 16 (10): 5865–75. doi:10.1128 / MCB.16.10.5865. PMC 231588. PMID 8927054.
Swanson HI, Yang Jh (1997). "Mapování kontaktních míst protein / DNA receptoru Ah a nukleárního translokátoru receptoru Ah". J. Biol. Chem. 271 (49): 31657–65. doi:10.1074 / jbc.271.49.31657. PMID 8940186.
Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (1997). „Dva myší homology jednomyslného proteinu Drosophila, které interagují s nukleárním translokátorovým proteinem myšího arylového uhlovodíkového receptoru“. J. Biol. Chem. 272 (7): 4451–7. doi:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID 9020169.
Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M, Perdew GH, Bradfield CA (1997). "Charakterizace podmnožiny nadrodiny základní-spirála-smyčka-spirála-PAS, která interaguje se složkami dioxinové signalizační dráhy". J. Biol. Chem. 272 (13): 8581–93. doi:10.1074 / jbc.272.13.8581. PMID 9079689.
Carver LA, Bradfield CA (1997). „Ligandově závislá interakce arylového uhlovodíkového receptoru s novým imunofilinovým homologem in vivo“. J. Biol. Chem. 272 (17): 11452–6. doi:10.1074 / jbc.272.17.11452. PMID 9111057.
Ema M, Taya S, Yokotani N, Sogawa K, Matsuda Y, Fujii-Kuriyama Y (1997). „Nový bHLH-PAS faktor s blízkou sekvenční podobností s hypoxií indukovatelným faktorem 1alfa reguluje expresi VEGF a je potenciálně zapojen do vývoje plic a cév“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (9): 4273–8. doi:10.1073 / pnas.94.9.4273. PMC 20712. PMID 9113979.
Moffett P, Reece M, Pelletier J (1997). „Myší produkt genu Sim-2 inhibuje transkripci aktivní represí a funkční interferencí“. Mol. Buňka. Biol. 17 (9): 4933–47. doi:10,1128 / mcb.17.9.4933. PMC 232345. PMID 9271372.

externí odkazy

Aryl + uhlovodík + receptor + jaderný + translokátor v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143437 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[HSP90-2009-5] Hughes, D .; Guttenplan, J. B .; Marcus, C. B .; Subbaramaiah, K .; Dannenberg, A. J. (2008). „Inhibitory proteinu Heat Shock 90 potlačují aktivaci aryl uhlovodíkových receptorů zprostředkovanou aktivací transkripce CYP1A1 a CYP1B1 a tvorby DNA aduktu“. Výzkum prevence rakoviny. 1 (6): 485–493. doi:10.1158 / 1940-6207.CAPR-08-0149. PMC 2680610. PMID 19138996.

[pmid9111057-6] Carver LA, Bradfield CA (duben 1997). „Ligandově závislá interakce arylového uhlovodíkového receptoru s novým imunofilinovým homologem in vivo“. J. Biol. Chem. 272 (17): 11452–6. doi:10.1074 / jbc.272.17.11452. PMID 9111057.

[pmid11259606-7] Kazlauskas A, Sundström S, Poellinger L, Pongratz I (duben 2001). „Chaperonový komplex hsp90 reguluje intracelulární lokalizaci dioxinového receptoru“. Mol. Buňka. Biol. 21 (7): 2594–607. doi:10.1128 / MCB.21.7.2594-2607.2001. PMC 86890. PMID 11259606.

[pmid7628454-8] Lindebro MC, Poellinger L, Whitelaw ML (červenec 1995). „Interakce protein-protein přes PAS domény: role PAS domény v pozitivní a negativní regulaci komplexu transkripčního faktoru bHLH / PAS dioxinový receptor-Arnt“. EMBO J.. 14 (14): 3528–39. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07359.x. PMC 394421. PMID 7628454.

[pmid8384309-9] Whitelaw M, Pongratz I, Wilhelmsson A, Gustafsson JA, Poellinger L (duben 1993). „Nábor arntového regulátoru závislý na ligandu určuje rozpoznání DNA receptorem dioxinu“. Mol. Buňka. Biol. 13 (4): 2504–14. doi:10.1128 / MCB.13.4.2504. PMC 359572. PMID 8384309.

[pmid7488247-10] Yamaguchi Y, Kuo MT (říjen 1995). „Funkční analýza interakcí nukleárních translokátorů aryl-uhlovodíkových receptorů s aryl-uhlovodíkovým receptorem v kvasinkovém dvouhybridním systému“. Biochem. Pharmacol. 50 (8): 1295–302. doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. PMID 7488247.

[pmid9887096-11] Mimura J, Ema M, Sogawa K, Fujii-Kuriyama Y (leden 1999). "Identifikace nového mechanismu regulace funkce receptoru Ah (dioxin)". Genes Dev. 13 (1): 20–5. doi:10.1101 / gad.13.1.20. PMC 316371. PMID 9887096.

[pmid9079689-12] A ^b Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M, Perdew GH, Bradfield CA (březen 1997). "Charakterizace podmnožiny nadrodiny základní-spirála-smyčka-spirála-PAS, která interaguje se složkami dioxinové signalizační dráhy". J. Biol. Chem. 272 (13): 8581–93. doi:10.1074 / jbc.272.13.8581. PMID 9079689.

[pmid11782478-13] A ^b ^C Woods SL, Whitelaw ML (březen 2002). „Diferenciální aktivity myší single minded 1 (SIM1) a SIM2 na prvku hypoxické odpovědi. Cross-talk mezi základními transkripčními faktory homologie helix-loop-helix / per-Arnt-Sim“. J. Biol. Chem. 277 (12): 10236–43. doi:10,1074 / jbc.M110752200. PMID 11782478.

[pmid12024042-14] Beischlag TV, Wang S, Rose DW, Torchia J, Reisz-Porszasz S, Muhammad K, Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O (červen 2002). „Nábor rodiny NCoA / SRC-1 / p160 transkripčních koaktivátorů nukleárním translokátorovým komplexem aryl uhlovodíkový receptor / aryl uhlovodíkový receptor“. Mol. Buňka. Biol. 22 (12): 4319–33. doi:10.1128 / mcb.22.12.4319-4333.2002. PMC 133867. PMID 12024042.

[pmid9020169-15] A ^b Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (únor 1997). „Dva myší homology jednomyslného proteinu Drosophila, které interagují s nukleárním translokátorovým proteinem myšího arylového uhlovodíkového receptoru“. J. Biol. Chem. 272 (7): 4451–7. doi:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID 9020169.

[pmid14701734-16] Ooe N, Saito K, Mikami N, Nakatuka I, Kaneko H (leden 2004). „Identifikace nového základního faktoru helix-loop-helix-PAS, NXF, odhaluje konkurenční pozitivní regulační roli Sim2 v expresi genu dendritického cytoskeletu modulátoru drebrinu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (2): 608–16. doi:10.1128 / mcb.24.2.608-616.2004. PMC 343817. PMID 14701734.

[pmid9271372-17] Moffett P, Reece M, Pelletier J (září 1997). „Myší produkt genu Sim-2 inhibuje transkripci aktivní represí a funkční interferencí“. Mol. Buňka. Biol. 17 (9): 4933–47. doi:10,1128 / mcb.17.9.4933. PMC 232345. PMID 9271372.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]