ATF1 - ATF1

ATF1
Identifikátory
Aliasy	ATF1, EWS-FUS / ATF-1, TREB36, aktivující transkripční faktor 1
Externí ID	OMIM: 123803 MGI: 3037720 HomoloGene: 3790 Genové karty: ATF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	50,821,162 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • identická vazba na protein; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• Komplex transkripčních faktorů ATF1-ATF4; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • reakce na organickou cyklickou sloučeninu; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace replikace DNA; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů; • reakce na kobaltový ion; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • sestava buněčného makromolekulárního komplexu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	466
	100040260
	ENSG00000123268
	n / a
	P18846
	n / a
	NM_005171
	n / a
	NP_005162
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cyklický transkripční faktor závislý na AMP ATF-1 je protein že u lidí je kódován ATF1 gen.

Tento gen kóduje aktivující transkripční faktor, který patří do podrodiny ATF a bZIP rodina (leucinový zip se základní oblastí). Ovlivňuje buněčné fyziologické procesy regulací exprese následných cílových genů, které souvisejí s růstem, přežitím a dalšími buněčnými aktivitami. Tento protein je fosforylován na serinu 63 ve své kinem indukovatelné doméně serin / threonin kinázami, cAMP-dependentní proteinovou kinázou A, kalmodulin-dependentní proteinovou kinázou I / II, mitogenem a stresem aktivovaná protein kináza a cyklin-dependentní kináza 3 (CDK-3). Jeho fosforylace zvyšuje jeho transaktivaci a transkripční aktivity a zvyšuje buněčnou transformaci.^[4]

Klinický význam

Fúze tohoto genu a FUS na chromozomu 16 nebo EWSR1 na chromozomu 22 indukovaný translokací generuje chimérické proteiny v angiomatoidní vláknitý histiocytom a jasný buněčný sarkom. Tento gen má na chromozomu 6 pseudogen.^[4]^[5]

Viz také

Aktivující transkripční faktor

Interakce

Bylo prokázáno, že ATF1 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123268 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ATF1 aktivující transkripční faktor 1“.
^ Zucman J, Delattre O, Desmaze C, Epstein AL, Stenman G, Speleman F, Fletchers CD, Aurias A, Thomas G (listopad 1993). „Fúze genu EWS a ATF-1 vyvolaná translokací t (12; 22) v maligním melanomu měkkých částí“. Nat Genet. 4 (4): 341–5. doi:10.1038 / ng0893-341. PMID 8401579. S2CID 10944105.
^ Houvras Y, Benezra M, Zhang H, Manfredi JJ, Weber BL, Licht JD (listopad 2000). „BRCA1 fyzicky a funkčně interaguje s ATF1“. J. Biol. Chem. 275 (46): 36230–7. doi:10,1074 / jbc.M002539200. PMID 10945975.
^ ^A ^b Yamaguchi Y, Wada T, Suzuki F, Takagi T, Hasegawa J, Handa H (srpen 1998). „Kasein kináza II interaguje s doménami bZIP několika transkripčních faktorů“. Nucleic Acids Res. 26 (16): 3854–61. doi:10.1093 / nar / 26.16.3854. PMC 147779. PMID 9685505.
^ Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (leden 1996). „Gen EWS-ATF-1 zapojený do maligního melanomu měkkých částí s translokací chromozomu t (12; 22) kóduje konstitutivní transkripční aktivátor.“ Onkogen. 12 (1): 159–67. PMID 8552387.

Další čtení

Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (leden 1996). „Gen EWS-ATF-1 zapojený do maligního melanomu měkkých částí s translokací chromozomu t (12; 22) kóduje konstitutivní transkripční aktivátor.“ Onkogen. 12 (1): 159–67. PMID 8552387.
Fujimura Y, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (říjen 2001). „Chimérický protein EWS-ATF-1 v čirém buněčném sarkomu měkkých tkání se asociuje s proteinem vázajícím CREB a interferuje s p53 zprostředkovanou transaktivační funkcí“. Onkogen. 20 (46): 6653–9. doi:10.1038 / sj.onc.1204684. PMID 11709699.
Rehfuss RP, Walton KM, Loriaux MM, Goodman RH (1991). „CAMP regulovaný protein vázající zesilovač ATF-1 aktivuje transkripci v reakci na cAMP-dependentní proteinovou kinázu A.“. J. Biol. Chem. 266 (28): 18431–4. PMID 1655749.
Yoshimura T, Fujisawa J, Yoshida M (1990). „Několik cDNA klonů kódujících jaderné proteiny, které se vážou na daňově závislý zesilovač HTLV-1: všechny obsahují strukturu leucinového zipu a bazickou aminokyselinovou doménu“. EMBO J.. 9 (8): 2537–42. doi:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07434.x. PMC 552284. PMID 2196176.
Hai TW, Liu F, Coukos WJ, Green MR (1990). „Klony cDNA transkripčního faktoru ATF: rozsáhlá rodina proteinů leucinového zipu schopných selektivně vytvářet heterodimery vázající DNA“. Genes Dev. 3 (12B): 2083–90. doi:10.1101 / gad.3.12b.2083. PMID 2516827.
Pongubala JM, Atchison ML (1995). „Aktivační transkripční faktor 1 a modulátor elementu cyklické reakce AMP mohou modulovat aktivitu imunoglobulinového zesilovače kappa 3 '“. J. Biol. Chem. 270 (17): 10304–13. doi:10.1074 / jbc.270.17.10304. PMID 7730336.
Liu F, Thompson MA, Wagner S a kol. (1993). „Aktivační transkripční faktor-1 může zprostředkovat aktivaci transkripce indukovanou Ca (2 +) - a cAMP“. J. Biol. Chem. 268 (9): 6714–20. PMID 8384217.
Dorsey MJ, Tae HJ, Sollenberger KG a kol. (1996). „B-ATF: nový lidský protein bZIP, který se asociuje se členy rodiny transkripčních faktorů AP-1“. Onkogen. 11 (11): 2255–65. PMID 8570175.
Sun P, Lou L, Maurer RA (1996). „Regulace aktivačního transkripčního faktoru-1 a proteinu vázajícího se na prvek odezvy cAMP pomocí Ca2 + / kalmodulin-dependentních proteinových kináz typu I, II a IV“. J. Biol. Chem. 271 (6): 3066–73. doi:10.1074 / jbc.271.6.3066. PMID 8621702.
Shimomura A, Ogawa Y, Kitani T a kol. (1996). „Protein kináza II závislá na kalmodulinu potencuje transkripční aktivaci aktivací transkripčního faktoru 1, ale nikoli cAMP protein vázající prvek“. J. Biol. Chem. 271 (30): 17957–60. doi:10.1074 / jbc.271.30.17957. PMID 8663317.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Kobayashi M, Shimomura A, Hagiwara M, Kawakami K (1997). „Fosforylace ATF-1 zvyšuje jeho vazbu na DNA a transkripci promotoru genu podjednotky Na, K-ATPázy alfa 1“. Nucleic Acids Res. 25 (4): 877–82. doi:10.1093 / nar / 25.4.877. PMC 146500. PMID 9016641.
Soubt MK, Marksitzer R, Menoud PA, Nagamine Y (1998). „Role tkáňově specifického transkripčního faktoru LFB3 v cyklickém zesilovači reagujícím na AMP genu aktivátoru plasminogenu urokinázového typu v buňkách LLC-PK1“. Mol. Buňka. Biol. 18 (8): 4698–706. doi:10,1128 / mcb.18.8.4698. PMC 109056. PMID 9671480.
Yamaguchi Y, Wada T, Suzuki F a kol. (1998). „Kasein kináza II interaguje s doménami bZIP několika transkripčních faktorů“. Nucleic Acids Res. 26 (16): 3854–61. doi:10.1093 / nar / 26.16.3854. PMC 147779. PMID 9685505.
Pellín A, Monteagudo C, López-Ginés C a kol. (1999). "Nový typ produktu chimérické fúze mezi geny EWS a ATFI v čirém buněčném sarkomu (maligní melanom měkkých částí)". Geny Chromozomy Rakovina. 23 (4): 358–60. doi:10.1002 / (SICI) 1098-2264 (199812) 23: 4 <358 :: AID-GCC11> 3.0.CO; 2-3. PMID 9824209.
Kabe Y, Goto M, Shima D a kol. (1999). „Role lidského MBF1 jako transkripčního koaktivátoru“. J. Biol. Chem. 274 (48): 34196–202. doi:10.1074 / jbc.274.48.34196. PMID 10567391.
Sawada J, Simizu N, Suzuki F a kol. (2000). „Synergická transkripční aktivace hGABP a vybrané členy rodiny proteinů vázajících se na aktivační transkripční faktor / cAMP. J. Biol. Chem. 274 (50): 35475–82. doi:10.1074 / jbc.274.50.35475. PMID 10585419.
Houvras Y, Benezra M, Zhang H a kol. (2000). „BRCA1 fyzicky a funkčně interaguje s ATF1“. J. Biol. Chem. 275 (46): 36230–7. doi:10,1074 / jbc.M002539200. PMID 10945975.
Knöfler M, Saleh L, Bauer S a kol. (2000). „Prvky promotoru a transkripční faktory podílející se na diferenciačně závislé expresi lidského chorionického gonadotropinu-alfa messenger ribonukleové kyseliny termínu vilózní trofoblasty“. Endokrinologie. 141 (10): 3737–48. doi:10.1210 / en.141.10.3737. PMID 11014230.
Arthur JS, Cohen P (2000). „MSK1 je vyžadován pro fosforylaci CREB v reakci na mitogeny v myších embryonálních kmenových buňkách“. FEBS Lett. 482 (1–2): 44–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02031-7. PMID 11018520. S2CID 30094202.
Andreucci JJ, Grant D, Cox DM a kol. (2002). "Složení a funkce transkripčních komplexů AP-1 během diferenciace svalových buněk". J. Biol. Chem. 277 (19): 16426–32. doi:10,1074 / jbc.M110891200. PMID 11877423.

externí odkazy

ATF1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk ATF1 umístění genomu a ATF1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

^ Shimomura A, Ogawa Y, Kitani T, Fujisawa H, Hagiwara M (červenec 1996). „Protein kináza II závislá na kalmodulinu potencuje transkripční aktivaci aktivací transkripčního faktoru 1, ale nikoli cAMP protein vázající prvek“. J. Biol. Chem. 271 (30): 17957–60. doi:10.1074 / jbc.271.30.17957. PMID 8663317.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123268 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: ATF1 aktivující transkripční faktor 1“.

[pmid8401579-5] Zucman J, Delattre O, Desmaze C, Epstein AL, Stenman G, Speleman F, Fletchers CD, Aurias A, Thomas G (listopad 1993). „Fúze genu EWS a ATF-1 vyvolaná translokací t (12; 22) v maligním melanomu měkkých částí“. Nat Genet. 4 (4): 341–5. doi:10.1038 / ng0893-341. PMID 8401579. S2CID 10944105.

[pmid10945975-6] Houvras Y, Benezra M, Zhang H, Manfredi JJ, Weber BL, Licht JD (listopad 2000). „BRCA1 fyzicky a funkčně interaguje s ATF1“. J. Biol. Chem. 275 (46): 36230–7. doi:10,1074 / jbc.M002539200. PMID 10945975.

[pmid9685505-7] A ^b Yamaguchi Y, Wada T, Suzuki F, Takagi T, Hasegawa J, Handa H (srpen 1998). „Kasein kináza II interaguje s doménami bZIP několika transkripčních faktorů“. Nucleic Acids Res. 26 (16): 3854–61. doi:10.1093 / nar / 26.16.3854. PMC 147779. PMID 9685505.

[pmid8552387-8] Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (leden 1996). „Gen EWS-ATF-1 zapojený do maligního melanomu měkkých částí s translokací chromozomu t (12; 22) kóduje konstitutivní transkripční aktivátor.“ Onkogen. 12 (1): 159–67. PMID 8552387.

[pmid8663317_group=note-9] Shimomura A, Ogawa Y, Kitani T, Fujisawa H, Hagiwara M (červenec 1996). „Protein kináza II závislá na kalmodulinu potencuje transkripční aktivaci aktivací transkripčního faktoru 1, ale nikoli cAMP protein vázající prvek“. J. Biol. Chem. 271 (30): 17957–60. doi:10.1074 / jbc.271.30.17957. PMID 8663317.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[1]

Regulome
Aktivuje se	fosfolipáza D
Aktivuje se	CaMK II^[1]