NFE2L3 - NFE2L3

NFE2L3
Identifikátory
AliasyNFE2L3, NRF3, nukleární faktor, erytroid 2 jako 3
Externí IDOMIM: 604135 MGI: 1339958 HomoloGene: 3168 Genové karty: NFE2L3
Umístění genu (člověk)
Chromozom 7 (lidský)
Chr.Chromozom 7 (lidský)[1]
Chromozom 7 (lidský)
Genomické umístění pro NFE2L3
Genomické umístění pro NFE2L3
Kapela7p15.2Start26,152,198 bp[1]
Konec26,187,137 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9603

18025

Ensembl

ENSG00000050344

ENSMUSG00000029832

UniProt

Q9Y4A8

Q9WTM4

RefSeq (mRNA)

NM_004289

NM_010903

RefSeq (protein)

NP_004280

NP_035033

Místo (UCSC)Chr 7: 26,15 - 26,19 MbChr 6: 51,43 - 51,46 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Jaderný faktor (erytroid 2) podobný faktoru 3, také známý jako NFE2L3 nebo 'NRF3 ', je transkripční faktor že u lidí je kódován Nfe2l3 gen.[5][6]

Nrf3 je základní leucinový zip (bZIP ) transkripční faktor patřící do rodiny proteinů Cap ‚n‘ Collar (CNC).[7] V roce 1989 první CNC transkripční faktor NFE2L2 byl identifikován. Následně několik souvisejících bílkoviny byly identifikovány, včetně NFE2L1 a NFE2L3 v různých organismech, jako jsou lidé, myši, a zebrafish.[8] Tyto proteiny jsou u lidí specificky kódovány pomocí Nfe2l1 a Nfe2l3 geny.[9][10]

Gen

The Nfe2l3 gen byl mapován do chromozomální polohy 7p15-p14 podle fluorescence in situ hybridizace (RYBA).[9] Pokrývá 34,93 kB od základny 26191830 do 26226754 na přímém řetězci DNA s počtem exonů 4. Gen se nachází poblíž HOXA genový shluk, podobný shlukování p45 NF-E2, NFE2L1, a NFE2L2 v blízkosti genů HOXC, HOXB a HOXD.[7][9] To znamená, že všechny čtyři geny byly pravděpodobně odvozeny od jediného genu předků, který byl duplikován vedle klastru HOX předků, přičemž se rozcházely a vedly ke vzniku čtyř úzce souvisejících transkripčních faktorů.[9]

Člověk Nfe2l3 gen kóduje 694 aminokyselina sekvence zbytků.[7][9] Z bioinformatické Při analýze bylo pozorováno, že protein NRF3 vykazuje vysoký stupeň konzervace evoluční cesta od zebrafish k lidem. Klíč konzervované domény jako N-terminál homologie box 1 (NHB1), N-terminální homologie box 2 (NHB2) a doména CNC se zmiňují o konzervovaných funkčních vlastnostech tohoto transkripčního faktoru.[11]

Subcelulární umístění

NRF3 je a membrána vázaný glykoprotein které lze zaměřit konkrétně na endoplazmatické retikulum (ER) a jaderná membrána.[9] Biochemické studie identifikovaly tři migrující endogenní formy proteinu NRF3 - A, B a C - které jsou konstitutivně degradovány několika proteolytický mechanismy.[9][12] Je známo, že forma „A“ je glykosylovaný, zatímco „B“ je neglykosylovaný a „C“ je generován štěpením „B.“[7][9] Celkem sedm potenciálních míst N-vázané glykosylace [7] byla pozorována ve střední části proteinu NRF3. Další podrobnosti o umístění, regulaci a funkci těchto tří forem v každém buněčném oddělení však zůstávají neznámé.

Úrovně exprese proteinů

Výraz hladiny proteinů NRF3 jsou nejvyšší v placenta.[13] konkrétněji v choriové klky (ve 12. týdnu těhotenství doba) [14] Výraz se jeví jako specifický pro primární placentu cytotrofoblasty, ne placentární fibroblasty. Spolu s placentou byla exprese tohoto proteinu pozorována také u lidí choriokarcinom buněčné linie, z nichž byly odvozeny trofoblastický nádory placenty. NFE2L2 byl také nalezen v srdce, mozek, plíce, ledviny, slinivka břišní, dvojtečka, brzlík, leukocyty, a slezina.[15] U člověka byly zjištěny velmi nízké hladiny exprese megakaryocyty a erytrocyty a u NRF3 nebyla pozorována exprese reprodukční orgány obou pohlaví.[9][16]

Funkce

Specifické funkce proteinu NRF3 jsou stále neznámé, ale některé domnělé funkční vlastnosti byly odvozeny od vlastností NFE2L1 kvůli jejich strukturální podobnosti. Je známo, že NRF3 může heterodimerizovat s malým muskulo-aponeurotickým fibro-sarkomem (MAF geny ) faktory, které se mají vázat antioxidant prvky odezvy v cílových genech.[17]

Přidružené nemoci

RNA microarray data ukazují zapojení NRF3 do různých malignity, s nadměrnou expresí pozorovanou u Hodgkinův lymfom, non-Hodgkinův lymfom, a lymfom z plášťových buněk.[18] Exprese NRF3 je také zvýšená u člověka rakovina prsu buňky a karcinom varlat, z čehož vyplývá, že NRF3 může hrát roli při indukci karcinogeneze.[19]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000050344 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029832 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Entrezův gen: jaderný faktor (2 odvozený od erytroidů) 3“.
  6. ^ Kobayashi A, Ito E, Toki T, Kogame K, Takahashi S, Igarashi K, Hayashi N, Yamamoto M (březen 1999). „Molekulární klonování a funkční charakterizace nového transkripčního faktoru rodiny Cap'n 'límců Nrf3“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (10): 6443–52. doi:10.1074 / jbc.274.10.6443. PMID  10037736.
  7. ^ A b C d E Landschulz WH, Johnson PF, McKnight SL (červen 1988). „Leucinový zip: hypotetická struktura společná pro novou třídu proteinů vázajících DNA“. Věda. 240 (4860): 1759–64. doi:10.1126 / science.3289117. JSTOR  1701639. PMID  3289117.
  8. ^ Derjuga A, Gourley TS, Holm TM, Heng HH, Shivdasani RA, Ahmed R, Andrews NC, Blank V (duben 2004). "Složitost faktorů transkripce CNC, jak je odhaleno genovým cílením lokusu Nrf3". Molekulární a buněčná biologie. 24 (8): 3286–94. doi:10.1128 / mcb.24.8.3286-3294.2004. PMC  381672. PMID  15060151.
  9. ^ A b C d E F G h i Chevillard G, Blank V (říjen 2011). „NFE2L3 (NRF3): Popelka transkripčních faktorů Cap'n'Collar“. Buněčné a molekulární biologické vědy. 68 (20): 3337–48. doi:10.1007 / s00018-011-0747-x. PMID  21687990. S2CID  25006101.
  10. ^ Caterina JJ, Donze D, Sun CW, Ciavatta DJ, Townes TM (červen 1994). „Klonování a funkční charakterizace LCR-F1: transkripční faktor bZIP, který aktivuje erytroidně specifickou expresi lidského globinu v genu“. Výzkum nukleových kyselin. 22 (12): 2383–91. doi:10.1093 / nar / 22.12.2383. PMC  523699. PMID  8036168.
  11. ^ Xiao Q, Pepe AE, Wang G, Luo Z, Zhang L, Zeng L, Zhang Z, Hu Y, Ye S, Xu Q (březen 2012). „Interakce Nrf3-Pla2g7 hraje zásadní roli v diferenciaci hladkého svalstva od kmenových buněk“. Arterioskleróza, trombóza a vaskulární biologie. 32 (3): 730–44. doi:10.1161 / ATVBAHA.111.243188. PMID  22247257.
  12. ^ Chowdhury AMMA, Katoh H, Hatanaka A, Iwanari H, Nakamura N, Hamakubo T, Natsume T, Waku T, Kobayashi A (2017). „Několik regulačních mechanismů biologické funkce NRF3 (NFE2L3) kontroluje množení rakovinných buněk“. Sci Rep. 7 (1): 12494. doi:10.1038 / s41598-017-12675-r. PMC  5624902. PMID  28970512.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  13. ^ Chénais B, Derjuga A, Massrieh W, Red-Horse K, Bellingard V, Fisher SJ, Blank V (leden 2005). „Analýza funkční a placentární exprese lidského transkripčního faktoru NRF3“. Molekulární endokrinologie. 19 (1): 125–37. doi:10.1210 / me.2003-0379. PMID  15388789.
  14. ^ Chevillard G, Paquet M, Blank V (únor 2011). „Nedostatek Nfe2l3 (Nrf3) předurčuje myši k lymfoblastickému lymfomu T-buněk“. Krev. 117 (6): 2005–8. doi:10.1182 / krev-2010-02-271460. PMID  21148084.
  15. ^ Martín-Montalvo, A .; Villalba, J. M .; Navas, P .; de Cabo, R. (3. února 2011). „NRF2, omezení rakoviny a kalorií“ (PDF). Onkogen. 30 (5): 505–520. doi:10.1038 / dne 2010.492. ISSN  1476-5594. PMC  4684645. PMID  21057541.
  16. ^ Venugopal R, Jaiswal AK (prosinec 1998). „Nrf2 a Nrf1 ve spojení s Jun proteiny regulují expresi zprostředkovanou antioxidační odezvou a koordinovanou indukci genů kódujících detoxikační enzymy“. Onkogen. 17 (24): 3145–56. doi:10.1038 / sj.onc.1202237. PMID  9872330.
  17. ^ Blank V, Andrews NC (listopad 1997). "Maf transkripční faktory: regulátory diferenciace". Trendy v biochemických vědách. 22 (11): 437–41. doi:10.1016 / s0968-0004 (97) 01105-5. PMID  9397686.
  18. ^ Willenbrock K, Küppers R, Renné C, Brune V, Eckerle S, Weidmann E, Bräuninger A, Hansmann ML (květen 2006). "Společné rysy a rozdíly v transkriptomu velkobuněčného anaplastického lymfomu a klasického Hodgkinova lymfomu". Haematologica. 91 (5): 596–604. PMID  16670065.
  19. ^ Hayes JD, McMahon M (prosinec 2001). „Molekulární základ pro příspěvek prvku reagujícího na antioxidanty k chemoprevenci rakoviny“. Dopisy o rakovině. 174 (2): 103–13. doi:10.1016 / s0304-3835 (01) 00695-4. PMID  11689285.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.