Homolog receptoru jater - Liver receptor homolog-1

NR5A2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4RWV, 1YOK, 1YUC, 1ZDU, 2A66, 3PLZ, 3TX7, 4DOR, 4DOS, 4IS8, 4ONI, 4PLD, 4PLE
Identifikátory
Aliasy	NR5A2, B1F, B1F2, CPF, FTF, FTZ-F1, FTZ-F1beta, LRH-1, LRH1, hB1F-2, jaderná podrodina receptoru 5 skupina A člen 2
Externí ID	OMIM: 604453 MGI: 1346834 HomoloGene: 20827 Genové karty: NR5A2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	200,177,420 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	136,960,448 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba chromatinu; • transkripční regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • vazba kovových iontů; • aktivita receptoru steroidních hormonů; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 aktivita jaderného receptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • dvouřetězcová vazba DNA; • vazba fosfolipidů; • vazba lipidů; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • diferenciace epiteliálních buněk; • morfogeneze slinivky břišní; • metabolický proces žlučových kyselin; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • intracelulární receptorová signální dráha; • regulace buněčné proliferace; • histogeneze; • hormonálně zprostředkovaná signální dráha; • homeostáza cholesterolu; • pozitivní regulace replikace virového genomu; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • steroidní hormon zprostředkovaná signální dráha; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • homeostatický proces; • kalcineurinem zprostředkovaná signalizace; • buněčná odpověď na faktor inhibující leukémii; • vývoj embryí končící narozením nebo líhnutím vajec;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2494
	26424
	ENSG00000116833
	ENSMUSG00000026398
	O00482
	P45448
	NM_001276464; NM_003822; NM_205860
	NM_001159769; NM_030676
	NP_001263393; NP_003813; NP_995582
	NP_001153241; NP_109601
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The homolog-1 jaterního receptoru (LRH-1) také známý jako NR5A2 (podrodina jaderného receptoru 5, skupina A, člen 2) je a protein že u lidí je kódován NR5A2 gen.^[5]^[6] LRH-1 je členem jaderný receptor rodina intracelulární transkripční faktory.

LRH-1 hraje při regulaci kritickou roli rozvoj, cholesterol doprava, žlučová kyselina homeostáza a steroidogeneze.^[7]^[8]^[9]

LRH-1 je důležitý pro udržení pluripotence kmenových buněk během embryonálního vývoje.^[10]

Interakce

Bylo prokázáno, že homolog-1 jaterního receptoru je komunikovat s malý heterodimerový partner.^[11]^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116833 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026398 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bernier D, Thomassin H, Allard D, Guertin M, Hamel D, Blaquière M, Beauchemin M, LaRue H, Estable-Puig M, Bélanger L (březen 1993). „Funkční analýza vývojově regulovaných chromatin-hypersenzitivních domén nesoucích promotor genu alfa 1-fetoproteinu a intergenní enhancer albuminu / alfa 1-fetoproteinu“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (3): 1619–33. doi:10.1128 / mcb.13.3.1619. PMC 359474. PMID 7680097.
^ Galarneau L, Drouin R, Bélanger L (1998). "Přiřazení genu pro fetoproteinový transkripční faktor (FTF) k lidskému chromozomovému pásmu 1q32.11 hybridizací in situ". Cytogenetika a genetika buněk. 82 (3–4): 269–70. doi:10.1159/000015116. PMID 9858833.
^ Fayard E, Auwerx J, Schoonjans K (květen 2004). „LRH-1: osiřelý jaderný receptor zapojený do vývoje, metabolismu a steroidogeneze“. Trendy v buněčné biologii. 14 (5): 250–60. doi:10.1016 / j.tcb.2004.03.008. PMID 15130581.
^ Luo Y, Liang CP, Tall AR (červenec 2001). „Sirotčí jaderný receptor LRH-1 potencuje sterolem zprostředkovanou indukci lidského genu CETP jaterním X receptorem“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (27): 24767–73. doi:10,1074 / jbc.M100912200. PMID 11331284.
^ Nitta M, Ku S, Brown C, Okamoto AY, Shan B (červen 1999). „CPF: osiřelý jaderný receptor, který reguluje jaterně specifickou expresi lidského genu pro cholesterol 7alfa-hydroxylázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (12): 6660–5. doi:10.1073 / pnas.96.12.6660. PMC 21971. PMID 10359768.
^ Gu P, Goodwin B, Chung AC, Xu X, Wheeler DA, Price RR, Galardi C, Peng L, Latour AM, Koller BH, Gossen J, Kliewer SA, Cooney AJ (květen 2005). „Sirotčí jaderný receptor LRH-1 je nutný k udržení exprese Oct4 ve fázi epiblastu embryonálního vývoje“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (9): 3492–505. doi:10.1128 / MCB.25.9.3492-3505.2005. PMC 1084298. PMID 15831456.
^ Brendel C, Schoonjans K, Botrugno OA, Treuter E, Auwerx J (září 2002). „Malý heterodimerový partner interaguje s jaterním X receptorem alfa a potlačuje jeho transkripční aktivitu.“. Molekulární endokrinologie. 16 (9): 2065–76. doi:10.1210 / me.2001-0194. PMID 12198243.
^ Lee YK, Moore DD (leden 2002). „Duální mechanismy pro represi homologního proteinu-1 monomerního osiřelého receptoru jaterního receptoru malým osiřelým heterodimerovým partnerem“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2463–7. doi:10,1074 / jbc.M105161200. PMID 11668176.

Další čtení

Wong M, Ramayya MS, Chrousos GP, Driggers PH, Parker KL (říjen 1996). "Klonování a sekvenční analýza lidského genu kódujícího steroidogenní faktor 1". Journal of Molecular Endocrinology. 17 (2): 139–47. doi:10.1677 / jme.0.0170139. PMID 8938589.
Li M, Xie YH, Kong YY, Wu X, Zhu L, Wang Y (říjen 1998). „Klonování a charakterizace nového lidského transkripčního faktoru hepatocytů, hB1F, který se váže a aktivuje enhancer II viru hepatitidy B“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (44): 29022–31. doi:10.1074 / jbc.273.44.29022. PMID 9786908.
Nitta M, Ku S, Brown C, Okamoto AY, Shan B (červen 1999). „CPF: osiřelý jaderný receptor, který reguluje jaterně specifickou expresi lidského genu pro cholesterol 7alfa-hydroxylázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (12): 6660–5. doi:10.1073 / pnas.96.12.6660. PMC 21971. PMID 10359768.
Goodwin B, Jones SA, Price RR, Watson MA, McKee DD, Moore LB, Galardi C, Wilson JG, Lewis MC, Roth ME, Maloney PR, Willson TM, Kliewer SA (září 2000). „Regulační kaskáda jaderných receptorů FXR, SHP-1 a LRH-1 potlačuje biosyntézu žlučových kyselin“. Molekulární buňka. 6 (3): 517–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00051-4. PMID 11030332.
Wang ZN, Bassett M, Rainey WE (říjen 2001). „Homolog-1 jaterního receptoru je exprimován v nadledvinách a může regulovat transkripci 11 beta-hydroxylázy“. Journal of Molecular Endocrinology. 27 (2): 255–8. doi:10.1677 / jme.0.0270255. PMID 11564608.
Zhang CK, Lin W, Cai YN, Xu PL, Dong H, Li M, Kong YY, Fu G, Xie YH, Huang GM, Wang Y (srpen 2001). "Charakterizace genomové struktury a tkáňově specifického promotoru genu lidského jaderného receptoru NR5A2 (hB1F)". Gen. 273 (2): 239–49. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00586-8. PMID 11595170.
Lee YK, Moore DD (leden 2002). „Duální mechanismy pro represi homologního proteinu 1 jaterního receptoru monomerního osiřelého receptoru malým heterodimerovým partnerem pro vzácná onemocnění“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2463–7. doi:10,1074 / jbc.M105161200. PMID 11668176.
Clyne CD, Speed CJ, Zhou J, Simpson ER (červen 2002). "Jaterní receptorový homolog-1 (LRH-1) reguluje expresi aromatázy v preadipocytech". The Journal of Biological Chemistry. 277 (23): 20591–7. doi:10,1074 / jbc.M201117200. PMID 11927588.
Brendel C, Gelman L, Auwerx J (červen 2002). „Multiproteinový můstkový faktor-1 (MBF-1) je kofaktorem pro jaderné receptory, které regulují metabolismus lipidů“. Molekulární endokrinologie. 16 (6): 1367–77. doi:10.1210 / oprava.16.6.0843. PMID 12040021.
Sirianni R, Seely JB, Attia G, Stocco DM, Carr BR, Pezzi V, Rainey WE (září 2002). „Jaterní homolog receptoru 1 je exprimován v lidských steroidogenních tkáních a aktivuje transkripci genů kódujících steroidogenní enzymy.“. The Journal of Endocrinology. 174 (3): R13–7. doi:10.1677 / joe.0.174R013. PMID 12208674.
Sablin EP, Krylova IN, Fletterick RJ, Ingraham HA (červen 2003). "Strukturální základ pro ligandově nezávislou aktivaci osiřelého jaderného receptoru LRH-1". Molekulární buňka. 11 (6): 1575–85. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00236-3. PMID 12820970.
Privalsky ML (červenec 2003). Msgstr "Vtělená aktivace". Vývojová buňka. 5 (1): 1–2. doi:10.1016 / S1534-5807 (03) 00196-5. PMID 12852843.
Fayard E, Schoonjans K, Annicotte JS, Auwerx J (září 2003). „Homolog 1 receptoru jater řídí expresi lipázy karboxylesteru“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (37): 35725–31. doi:10,1074 / jbc.M302370200. PMID 12853459.
Annicotte JS, Fayard E, Swift GH, Selander L, Edlund H, Tanaka T, Kodama T, Schoonjans K, Auwerx J (říjen 2003). „Homeobox 1 pankreatu a duodena reguluje expresi homologu 1 jaterního receptoru během vývoje pankreatu“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (19): 6713–24. doi:10.1128 / MCB.23.19.6713-6724.2003. PMC 193920. PMID 12972592.
Peng N, Kim JW, Rainey WE, Carr BR, Attia GR (prosinec 2003). „Úloha osiřelého jaderného receptoru, homologu jaterního receptoru-1, při regulaci lidského žlutého tělíska 3beta-hydroxysteroid dehydrogenázy typu II“. The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 88 (12): 6020–8. doi:10.1210 / jc.2003-030880. PMID 14671206.
Cai YN, Zhou Q, Kong YY, Li M, Viollet B, Xie YH, Wang Y (prosinec 2003). „LRH-1 / hB1F a HNF1 synergicky regulují transkripci genů viru hepatitidy B a replikaci DNA“. Cell Research. 13 (6): 451–8. doi:10.1038 / sj.cr.7290187. PMID 14728801.
Saxena D, Safi R, Little-Ihrig L, Zeleznik AJ (srpen 2004). „Jaterní receptor homolog-1 stimuluje biosyntetickou dráhu progesteronu během diferenciace granulózových buněk vyvolané folikuly stimulujícími hormony“. Endokrinologie. 145 (8): 3821–9. doi:10.1210 / cs.2004-0423. PMID 15117876.

externí odkazy

NR5A2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116833 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026398 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7680097-5] Bernier D, Thomassin H, Allard D, Guertin M, Hamel D, Blaquière M, Beauchemin M, LaRue H, Estable-Puig M, Bélanger L (březen 1993). „Funkční analýza vývojově regulovaných chromatin-hypersenzitivních domén nesoucích promotor genu alfa 1-fetoproteinu a intergenní enhancer albuminu / alfa 1-fetoproteinu“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (3): 1619–33. doi:10.1128 / mcb.13.3.1619. PMC 359474. PMID 7680097.

[pmid9858833-6] Galarneau L, Drouin R, Bélanger L (1998). "Přiřazení genu pro fetoproteinový transkripční faktor (FTF) k lidskému chromozomovému pásmu 1q32.11 hybridizací in situ". Cytogenetika a genetika buněk. 82 (3–4): 269–70. doi:10.1159/000015116. PMID 9858833.

[pmid15130581-7] Fayard E, Auwerx J, Schoonjans K (květen 2004). „LRH-1: osiřelý jaderný receptor zapojený do vývoje, metabolismu a steroidogeneze“. Trendy v buněčné biologii. 14 (5): 250–60. doi:10.1016 / j.tcb.2004.03.008. PMID 15130581.

[CETP-8] Luo Y, Liang CP, Tall AR (červenec 2001). „Sirotčí jaderný receptor LRH-1 potencuje sterolem zprostředkovanou indukci lidského genu CETP jaterním X receptorem“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (27): 24767–73. doi:10,1074 / jbc.M100912200. PMID 11331284.

[cholesterolhydroxylase-9] Nitta M, Ku S, Brown C, Okamoto AY, Shan B (červen 1999). „CPF: osiřelý jaderný receptor, který reguluje jaterně specifickou expresi lidského genu pro cholesterol 7alfa-hydroxylázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (12): 6660–5. doi:10.1073 / pnas.96.12.6660. PMC 21971. PMID 10359768.

[10] Gu P, Goodwin B, Chung AC, Xu X, Wheeler DA, Price RR, Galardi C, Peng L, Latour AM, Koller BH, Gossen J, Kliewer SA, Cooney AJ (květen 2005). „Sirotčí jaderný receptor LRH-1 je nutný k udržení exprese Oct4 ve fázi epiblastu embryonálního vývoje“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (9): 3492–505. doi:10.1128 / MCB.25.9.3492-3505.2005. PMC 1084298. PMID 15831456.

[pmid12198243-11] Brendel C, Schoonjans K, Botrugno OA, Treuter E, Auwerx J (září 2002). „Malý heterodimerový partner interaguje s jaterním X receptorem alfa a potlačuje jeho transkripční aktivitu.“. Molekulární endokrinologie. 16 (9): 2065–76. doi:10.1210 / me.2001-0194. PMID 12198243.

[pmid11668176-12] Lee YK, Moore DD (leden 2002). „Duální mechanismy pro represi homologního proteinu-1 monomerního osiřelého receptoru jaterního receptoru malým osiřelým heterodimerovým partnerem“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2463–7. doi:10,1074 / jbc.M105161200. PMID 11668176.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]