KLF6 - KLF6 - Wikipedia

KLF6
Identifikátory
Aliasy	KLF6, BCD1, CBA1, COPEB, CPBP, GBF, PAC1, ST12, ZF9, Kruppelův faktor 6, Kruppelův faktor 6
Externí ID	OMIM: 602053 MGI: 1346318 HomoloGene: 996 Genové karty: KLF6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	3,785,281 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	5,870,394 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • dvouřetězcová vazba DNA;
Buněčná složka	• fibrilární centrum; • buněčné jádro; • jádro; • cytosol; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • Diferenciace B buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1316
	23849
	ENSG00000067082
	ENSMUSG00000000078
	Q99612
	O08584; Q8BPQ2
	NM_001008490; NM_001160124; NM_001160125; NM_001300
	NM_011803
	NP_001153596; NP_001153597; NP_001291
	NP_035933
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Krueppelův faktor 6 je protein že u lidí je kódován KLF6 gen.^[5]

Je to gen potlačující nádor.^[6]

Funkce

Tento gen kóduje jaderný protein, který má na konci své C-koncové domény tři zinkové prsty, centrální oblast bohatou na serin / threonin a kyselou doménu ležící v N-koncové oblasti. Zinkové prsty tohoto proteinu jsou zodpovědné za specifickou vazbu DNA s prvky promotoru jádra bohatými na guanin. Centrální oblast může být zapojena do aktivace nebo posttranslačních regulačních drah a kyselá N-koncová doména může hrát důležitou roli v procesu transkripční aktivace. Je schopen aktivovat transkripci přibližně 4krát buď na homologních nebo heterologních promotorech. DNA vazebná a transkripční aktivita tohoto proteinu ve spojení s jeho vzorem exprese naznačuje, že tento protein se může podílet na regulaci a / nebo udržování bazální exprese genů glykoproteinu specifických pro těhotenství a případně dalších genů TATA bez krabičky. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující stejný protein.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že KLF6 komunikovat s Transkripční faktor Sp1.^[8]

Viz také

Faktory podobné Kruppelovi

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000067082 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000078 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Onyango P, Koritschoner NP, Patrito LC, Zenke M, Weith A (únor 1998). „Přiřazení genu kódujícího protein vázající se na jádrový promotorový prvek (COPEB) k lidskému chromozomu 10p15 somatickou hybridní analýzou a fluorescenční in situ hybridizací“. Genomika. 48 (1): 143–4. doi:10.1006 / geno.1997.5124. PMID 9503030.
^ Li D, Yea S, Dolios G, Martignetti JA, Narla G, Wang R, Walsh MJ, Friedman SL (říjen 2005). „Regulace aktivity supresoru tumoru podobného faktoru 6 pomocí acetylace“. Výzkum rakoviny. 65 (20): 9216–25. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-1040. PMID 16230382.
^ „Entrez Gene: KLF6 Kruppel-like factor 6“.
^ Botella LM, Sánchez-Elsner T, Sanz-Rodriguez F, Kojima S, Shimada J, Guerrero-Esteo M, Cooreman MP, Ratziu V, Langa C, Vary CP, Ramirez JR, Friedman S, Bernabéu C (prosinec 2002). „Transkripční aktivace endoglinu a transformační signální komponenty růstového faktoru-beta kooperativní interakcí mezi Sp1 a KLF6: jejich potenciální role v reakci na vaskulární poranění“. Krev. 100 (12): 4001–10. doi:10.1182 / krev. V100.12.4001. PMID 12433697.

Další čtení

Narla G, Friedman SL, Martignetti JA (duben 2003). „Krüppel ochromuje rakovinu prostaty: pokrok a vyhlídky KLF6“. American Journal of Pathology. 162 (4): 1047–52. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63901-6. PMC 1851219. PMID 12651597.
El Rouby S, Newcomb EW (prosinec 1996). "Identifikace Bcd, nového protoonkogenu exprimovaného v B-buňkách". Onkogen. 13 (12): 2623–30. PMID 9000136.
Koritschoner NP, Bocco JL, Panzetta-Dutari GM, Dumur CI, Flury A, Patrito LC (duben 1997). „Nový lidský protein se zinkovým prstem, který interaguje s hlavním promotorovým prvkem genu TATA bez krabičky“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (14): 9573–80. doi:10.1074 / jbc.272.14.9573. PMID 9083102.
Suzuki T, Yamamoto T, Kurabayashi M, Nagai R, Yazaki Y, Horikoshi M (srpen 1998). „Izolace a počáteční charakterizace GBF, nového proteinu zinkového prstu vázajícího DNA, který se váže na vazebná místa bohatá na GC promotoru HIV-1“. Journal of Biochemistry. 124 (2): 389–95. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022124. PMID 9685731.
Ratziu V, Lalazar A, Wong L, Dang Q, Collins C, Shaulian E, Jensen S, Friedman SL (srpen 1998). „Zf9, transkripční faktor podobný Kruppelovi regulovaný in vivo během časné jaterní fibrózy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (16): 9500–5. doi:10.1073 / pnas.95.16.9500. PMC 21367. PMID 9689109.
Okano J, Opitz OG, Nakagawa H, Jenkins TD, Friedman SL, Rustgi AK (květen 2000). „Transkripční faktory podobné Krüppelům Zf9 a GKLF koaktivují promotor lidského keratinu 4 a fyzicky interagují“. FEBS Dopisy. 473 (1): 95–100. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01468-X. PMID 10802067. S2CID 34923598.
Narla G, Heath KE, Reeves HL, Li D, Giono LE, Kimmelman AC, Glucksman MJ, Narla J, Eng FJ, Chan AM, Ferrari AC, Martignetti JA, Friedman SL (prosinec 2001). "KLF6, kandidátní tumor supresorový gen mutovaný v rakovině prostaty". Věda. 294 (5551): 2563–6. doi:10.1126 / science.1066326. PMID 11752579. S2CID 31619019.
Botella LM, Sánchez-Elsner T, Sanz-Rodriguez F, Kojima S, Shimada J, Guerrero-Esteo M, Cooreman MP, Ratziu V, Langa C, Vary CP, Ramirez JR, Friedman S, Bernabéu C (prosinec 2002). „Transkripční aktivace endoglinu a transformační signální komponenty růstového faktoru-beta kooperativní interakcí mezi Sp1 a KLF6: jejich potenciální role v reakci na vaskulární poranění“. Krev. 100 (12): 4001–10. doi:10.1182 / krev. V100.12.4001. PMID 12433697.
Chen HK, Liu XQ, Lin J, Chen TY, Feng QS, Zeng YX (říjen 2002). "[Mutační analýza genu KLF6 v lidských nazofaryngeálních karcinomech]". AI Zheng = Aizheng = Čínský žurnál o rakovině. 21 (10): 1047–50. PMID 12508640.
Warke VG, poslanec Nambiar, Krishnan S, Tenbrock K, Geller DA, Koritschoner NP, Atkins JL, Farber DL, Tsokos GC (duben 2003). „Transkripční aktivace lidského indukovatelného promotoru syntázy oxidu dusnatého faktorem 6 podobným Kruppelovi“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (17): 14812–9. doi:10,1074 / jbc.M300787200. PMID 12590140.
Chen C, Hyytinen ER, Sun X, Helin HJ, Koivisto PA, Frierson HF, Vessella RL, Dong JT (duben 2003). „Delece, mutace a ztráta exprese KLF6 u lidské rakoviny prostaty“. American Journal of Pathology. 162 (4): 1349–54. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63930-2. PMC 1851229. PMID 12651626.
Jeng YM, Hsu HC (červenec 2003). „KLF6, domnělý gen potlačující nádor, je mutován v astrocytárních gliomech“. International Journal of Cancer. 105 (5): 625–9. doi:10.1002 / ijc.11123. PMID 12740910. S2CID 25600692.
Bayat A, Watson JS, Stanley JK, Ferguson MW, Ollier WE (červen 2003). "Genetická náchylnost k dupuytrenové nemoci: asociace genu transkripčního faktoru Zf9". Plastická a rekonstrukční chirurgie. 111 (7): 2133–9. doi:10.1097 / 01.PRS.0000060531.98180.32. PMID 12794452. S2CID 22210744.
Reeves HL, Narla G, Ogunbiyi O, Haq AI, Katz A, Benzeno S, Hod E, Harpaz N, Goldberg S, Tal-Kremer S, Eng FJ, Arthur MJ, Martignetti JA, Friedman SL (duben 2004). „Kruppelův faktor 6 (KLF6) je tumor potlačující gen často inaktivovaný u kolorektálního karcinomu“. Gastroenterologie. 126 (4): 1090–103. doi:10.1053 / j.gastro.2004.01.005. PMID 15057748.
Kimmelman AC, Qiao RF, Narla G, Banno A, Lau N, Bos PD, Nuñez Rodriguez N, Liang BC, Guha A, Martignetti JA, Friedman SL, Chan AM (červen 2004). „Potlačení tumorigenicity glioblastomu transkripčním faktorem podobným Kruppel KLF6“. Onkogen. 23 (29): 5077–83. doi:10.1038 / sj.onc.1207662. PMID 15064720.
Glinsky GV, Glinskii AB, Stephenson AJ, Hoffman RM, Gerald WL (březen 2004). „Profilování genové exprese předpovídá klinický výsledek rakoviny prostaty“. The Journal of Clinical Investigation. 113 (6): 913–23. doi:10.1172 / JCI20032. PMC 362118. PMID 15067324.
Rubinstein M, Idelman G, Plymate SR, Narla G, Friedman SL, Werner H (srpen 2004). „Transkripční aktivace genu receptoru pro růstový faktor podobný inzulínu pomocí tumor supresorového proteinu podobného faktoru 6 (KLF6): potenciální interakce mezi KLF6 a p53“. Endokrinologie. 145 (8): 3769–77. doi:10.1210 / cs.2004-0173. PMID 15131018.

externí odkazy

KLF6 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000067082 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000078 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9503030-5] Onyango P, Koritschoner NP, Patrito LC, Zenke M, Weith A (únor 1998). „Přiřazení genu kódujícího protein vázající se na jádrový promotorový prvek (COPEB) k lidskému chromozomu 10p15 somatickou hybridní analýzou a fluorescenční in situ hybridizací“. Genomika. 48 (1): 143–4. doi:10.1006 / geno.1997.5124. PMID 9503030.

[pmid16230382-6] Li D, Yea S, Dolios G, Martignetti JA, Narla G, Wang R, Walsh MJ, Friedman SL (říjen 2005). „Regulace aktivity supresoru tumoru podobného faktoru 6 pomocí acetylace“. Výzkum rakoviny. 65 (20): 9216–25. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-1040. PMID 16230382.

[entrez-7] „Entrez Gene: KLF6 Kruppel-like factor 6“.

[pmid12433697-8] Botella LM, Sánchez-Elsner T, Sanz-Rodriguez F, Kojima S, Shimada J, Guerrero-Esteo M, Cooreman MP, Ratziu V, Langa C, Vary CP, Ramirez JR, Friedman S, Bernabéu C (prosinec 2002). „Transkripční aktivace endoglinu a transformační signální komponenty růstového faktoru-beta kooperativní interakcí mezi Sp1 a KLF6: jejich potenciální role v reakci na vaskulární poranění“. Krev. 100 (12): 4001–10. doi:10.1182 / krev. V100.12.4001. PMID 12433697.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]