BCL11A - BCL11A
B-buněčný lymfom / leukémie 11A je protein že u lidí je kódován BCL11A gen.[5][6][7]
Funkce
The BCL11A Gen kóduje regulační protein typu C2H2 typu zinek-prst, který se může vázat na DNA. Bylo popsáno pět alternativně sestříhaných transkriptových variant tohoto genu, které kódují odlišné izoformy.[7] Protein se spojuje s Komplex SWI / SNF, který reguluje genovou expresi prostřednictvím remodelace chromatinu.[8]
BCL11A je vysoce exprimován v několika hematopoetických liniích a hraje roli při přechodu z γ- až β-globin výraz u plodu dospělému erytropoéza přechod.[9]
Kromě toho je BCL11A exprimován v mozku, kde tvoří proteinový komplex s CASK pro regulaci růstu a rozvětvení axonu.[10] V neokortex, BCL11A se váže na TBR1 regulační oblast a inhibuje expresi TBR1.[11]
Klinický význam
Korespondence Bcl11a myší gen je běžným místem retrovirová integrace v myeloidní leukémie, a může fungovat jako gen leukemické choroby, částečně prostřednictvím své interakce s BCL6. Během diferenciace hematopoetických buněk je tento gen down-regulován. Možná se účastní patogeneze lymfomu, protože translokace spojené s malignitami B-buněk také deregulují jeho expresi. Kromě toho bylo zjištěno, že BCL11A hraje roli při potlačení produkce hemoglobinu u plodu. Terapeutické strategie zaměřené na zvýšení produkce globinu plodu u nemocí, jako je beta talasémie a srpkovitá anémie inhibicí BCL11A jsou v současné době zkoumány.
Dále heterozygotní de novo mutace v BCL11A byly identifikovány v porucha intelektuálního postižení, doprovázené globálním zpožděním vývoje a poruchou autistického spektra.[12] Tyto mutace narušují BCL11A homodimerizaci a transkripční regulaci.
Interakce
Ukázalo se, že BCL11A interaguje s řadou proteinů. BCL11A byl původně objeven jako COUP-TFI interagující protein.[13] V jádru tvoří BCL11A paraspeckles, které se spolu lokalizují NE.[12] V neuronech BCL11A interaguje s SUD regulovat cílové geny.[10] Kromě toho BCL11A interaguje s neuronově specifickým proteinem TBR1, což se také týká intelektuálního postižení a poruchy autistického spektra.[14]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000119866 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000000861 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Satterwhite E, Sonoki T, Willis TG, Harder L, Nowak R, Arriola EL, Liu H, Price HP, Gesk S, Steinemann D, Schlegelberger B, Oscier DG, Siebert R, Tucker PW, Dyer MJ (prosinec 2001). „Rodina genů BCL11: zapojení BCL11A do lymfoidních malignit“. Krev. 98 (12): 3413–20. doi:10.1182 / krev. V98.12.3413. PMID 11719382.
- ^ Uda M, Galanello R, Sanna S, Lettre G, Sankaran VG, Chen W a kol. (Únor 2008). „Studie asociace na celém genomu ukazuje, že BCL11A je spojen s perzistentním fetálním hemoglobinem a zlepšením fenotypu beta-talasémie“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 105 (5): 1620–5. Bibcode:2008PNAS..105.1620U. doi:10.1073 / pnas.0711566105. PMC 2234194. PMID 18245381.
- ^ A b „Entrezův gen: BCL11A B-buněčný CLL / lymfom 11A (protein se zinkovým prstem)“.
- ^ Kadoch C, Hargreaves DC, Hodges C, Elias L, Ho L, Ranish J, Crabtree GR (červen 2013). „Proteomická a bioinformatická analýza komplexů savců SWI / SNF identifikuje rozsáhlé role v lidské malignitě“. Genetika přírody. 45 (6): 592–601. doi:10,1038 / ng.2628. PMC 3667980. PMID 23644491.
- ^ Smith EC, Luc S, Croney DM, Woodworth MB, Greig LC, Fujiwara Y, Nguyen M, Sher F, Macklis JD, Bauer DE, Orkin SH (listopad 2016). „Bcl11a erythroid enhancer“. Krev. 128 (19): 2338–2342. doi:10.1182 / krev-2016-08-736249. PMC 5106112. PMID 27707736.
- ^ A b Kuo TY, Hong CJ, Chien HL, Hsueh YP (srpen 2010). „X-vázaný gen pro mentální retardaci CASK interaguje s Bcl11A / CTIP1 a reguluje větvení a růst axonů“. Journal of Neuroscience Research (v němčině). 88 (11): 2364–73. doi:10.1002 / jnr.22407. PMID 20623620. S2CID 19810502.
- ^ Cánovas J, Berndt FA, Sepúlveda H, Aguilar R, Veloso FA, Montecino M, Oliva C, Maass JC, Sierralta J, Kukuljan M (květen 2015). „Specifikace neuronů kortikální subcerebrální projekce závisí na přímé represi TBR1 pomocí CTIP1 / BCL11a“. The Journal of Neuroscience. 35 (19): 7552–64. doi:10.1523 / JNEUROSCI.0169-15.2015. PMC 6705430. PMID 25972180.
- ^ A b Dias C, Estruch SB, Graham SA, McRae J, Sawiak SJ, Hurst JA, Joss SK, Holder SE, Morton JE, Turner C, Thevenon J, Mellul K, Sánchez-Andrade G, Ibarra-Soria X, Deriziotis P, Santos RF, Lee SC, Faivre L, Kleefstra T, Liu P, Hurles ME, Fisher SE, Logan DW (srpen 2016). „Haploinsufficiita BCL11A způsobuje syndrom mentálního postižení a dysreguluje transkripci“. American Journal of Human Genetics. 99 (2): 253–74. doi:10.1016 / j.ajhg.2016.05.030. PMC 4974071. PMID 27453576.
- ^ Avram D, Fields A, Senawong T, Topark-Ngarm A, Leid M (prosinec 2002). „COUP-TF (kuřecí ovalbuminový upstream promotorový transkripční faktor) protein 1 (CTIP1) je sekvenčně specifický protein vázající DNA“. The Biochemical Journal. 368 (Pt 2): 555–63. doi:10.1042 / bj20020496. PMC 1223006. PMID 12196208.
- ^ den Hoed J, Sollis E, Venselaar H, Estruch SB, Deriziotis P, Fisher SE (září 2018). "Funkční charakterizace variant TBR1 u neurodevelopmentální poruchy". Vědecké zprávy. 8 (1): 14279. Bibcode:2018NatSR ... 814279D. doi:10.1038 / s41598-018-32053-6. PMC 6155134. PMID 30250039.
Další čtení
- Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (listopad 1998). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Výzkum genomu. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
- Avram D, Fields A, Pretty On Top K, Nevrivy DJ, Ishmael JE, Leid M (duben 2000). „Izolace nové rodiny proteinů C (2) H (2) se zinkovým prstem podílejících se na transkripční represi zprostředkované kuřecím ovalbuminem upstream promotor transkripční faktor (COUP-TF) osiřelé jaderné receptory“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (14): 10315–22. doi:10.1074 / jbc.275.14.10315. PMC 2819356. PMID 10744719.
- Nakamura T, Yamazaki Y, Saiki Y, Moriyama M, Largaespada DA, Jenkins NA, Copeland NG (květen 2000). „Evi9 kóduje nový protein se zinkovým prstem, který fyzicky interaguje s BCL6, známým proto-onkogenním produktem lidských B-buněk“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (9): 3178–86. doi:10.1128 / MCB.20.9.3178-3186.2000. PMC 85612. PMID 10757802.
- Saiki Y, Yamazaki Y, Yoshida M, Katoh O, Nakamura T (prosinec 2000). „Lidský EVI9, homolog myšího genu pro myeloidní leukémii, je exprimován v hematopoetických progenitorech a je down-regulován během myeloidní diferenciace buněk HL60.“ Genomika. 70 (3): 387–91. doi:10,1006 / geno.2000.6385. PMID 11161790.
- Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (duben 2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 8 (2): 85–95. doi:10.1093 / dnares / 8.2.85. PMID 11347906.
- Martín-Subero JI, Gesk S, Harder L, Sonoki T, Tucker PW, Schlegelberger B, Grote W, Novo FJ, Calasanz MJ, Hansmann ML, Dyer MJ, Siebert R (únor 2002). „Opakované postižení lokusů REL a BCL11A v klasickém Hodgkinově lymfomu“. Krev. 99 (4): 1474–7. doi:10.1182 / krev. V99.4.1474. PMID 11830502.
- Küppers R, Sonoki T, Satterwhite E, Gesk S, Harder L, Oscier DG, Tucker PW, Dyer MJ, Siebert R (květen 2002). „Nedostatek somatické hypermutace genů IG V (H) u lymfoidních malignit s translokací t (2; 14) (p13; q32) zahrnující gen BCL11A“. Leukémie. 16 (5): 937–9. doi:10.1038 / sj.leu.2402480. PMID 11986957.
- Senawong T, Peterson VJ, Leid M (únor 2005). „Nábor SIRT1 závislý na BCL11A do promotorového templátu v savčích buňkách vede k deacetylaci histonu a transkripční represi“. Archivy biochemie a biofyziky. 434 (2): 316–25. doi:10.1016 / j.abb.2004.10.028. PMC 2819353. PMID 15639232.
- Liu H, Ippolito GC, Wall JK, Niu T, Probst L, Lee BS, Pulford K, Banham AH, Stockwin L, Shaffer AL, Staudt LM, Das C, Dyer MJ, Tucker PW (květen 2006). „Funkční studie BCL11A: charakterizace konzervované sestřihové varianty BCL11A-XL a její interakce s BCL6 v nukleárních parazitech B buněk zárodečných center“. Molekulární rakovina. 5: 18. doi:10.1186/1476-4598-5-18. PMC 1526750. PMID 16704730.
- Weniger MA, Pulford K, Gesk S, Ehrlich S, Banham AH, Lyne L, Martin-Subero JI, Siebert R, Dyer MJ, Möller P, Barth TF (říjen 2006). „Zisky protoonkogenu BCL11A a jaderná akumulace proteinu BCL11A (XL) jsou časté u primárního mediastinálního B-buněčného lymfomu“. Leukémie. 20 (10): 1880–2. doi:10.1038 / sj.leu.2404324. PMID 16871282.
- Szafranski K, Schindler S, Taudien S, Hiller M, Huse K, Jahn N, Schreiber S, Backofen R, Platzer M (2007). „Porušení pravidel spojování: TG dinukleotidy fungují jako alternativní 3 'spojovací místa v intronech závislých na U2“. Genome Biology. 8 (8): R154. doi:10.1186 / gb-2007-8-8-r154. PMC 2374985. PMID 17672918.
externí odkazy
- BCL11A + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- FactorBook BCL11A
- Člověk BCL11A umístění genomu a BCL11A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.
Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |