FOXA3 - FOXA3

FOXA3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1VTN
Identifikátory
Aliasy	FOXA3, FKHH3, HNF3G, TCF3G, skříň vidlice A3
Externí ID	OMIM: 602295 MGI: 1347477 HomoloGene: 3308 Genové karty: FOXA3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	45,873,797 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	19,023,538 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • vazba transkripčního faktoru; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • aktinový cytoskelet; • buněčné jádro;
Biologický proces	• homeostáza buněčné glukózy; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na hladovění; • vývoj mnohobuněčných organismů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • spermatogeneze; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • anatomická struktura morfogeneze; • diferenciace buněk; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3171
	15377
	ENSG00000170608
	ENSMUSG00000040891
	P55318
	P35584
	NM_004497
	NM_008260
	NP_004488
	NP_032286
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Hepatocytový jaderný faktor 3-gama (HNF-3G), také známý jako forkhead box protein A3 (FOXA3) nebo transkripční faktor 3G (TCF-3G) je a protein že u lidí je kódován FOXA3 gen.^[5]^[6]

Funkce

HNF-3G je členem třída vidlice proteinů vázajících DNA. Tyto hepatocytární jaderné faktory jsou transkripční aktivátory pro jaterně specifické transkripty, jako je albumin a transthyretin a také s nimi interagují chromatin. Podobní členové rodiny u myší mají roli v regulaci metabolismu a v diferenciaci slinivky břišní a jater.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170608 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040891 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: forkhead box A3“.
^ Mincheva A, Lichter P, Schütz G, Kaestner KH (únor 1997). „Přiřazení lidských genů pro hepatocytární jaderný faktor 3-alfa, -beta a -gamma (HNF3A, HNF3B, HNF3G) na 14q12-q13, 20p11 a 19q13.2-q13.4“. Genomika. 39 (3): 417–9. doi:10.1006 / geno.1996.4477. PMID 9119385.

Další čtení

Corrocher R, Tedesco F, Rabusin P, De Sandre G (1975). "Vliv lidských erytrocytových stromat na aktivaci komplementu". Br. J. Haematol. 29 (2): 235–41. doi:10.1111 / j.1365-2141.1975.tb01817.x. PMID 33. S2CID 45491647.
Verschuur M, de Jong M, Felida L a kol. (2005). „Místo hepatocytárního jaderného faktoru-3 v promotoru fibrinogenu beta je důležité pro expresi indukovanou interleukinem 6 a jeho aktivita je ovlivněna sousedním polymorfismem -148C / T“. J. Biol. Chem. 280 (17): 16763–71. doi:10,1074 / jbc.M501973200. PMID 15737987.
Clark KL, Halay ED, Lai E, Burley SK (1993). „Kokrystalová struktura rozpoznávacího motivu HNF-3 / vidlice hlavy DNA se podobá histonu H5“. Příroda. 364 (6436): 412–20. doi:10.1038 / 364412a0. PMID 8332212. S2CID 4363526.
Qian X, Costa RH (1995). „Analýza domén beta proteinu nukleárního faktoru 3 beta požadovaných pro transkripční aktivaci a cílení na jádro“. Nucleic Acids Res. 23 (7): 1184–91. doi:10.1093 / nar / 23.7.1184. PMC 306829. PMID 7739897.
Rodríguez-Antona C, Bort R, Jover R a kol. (2003). „Transkripční regulace bazální exprese lidského CYP3A4 proteinem alfa vázajícím zesilovač CCAAT a gamma nukleárního faktoru 3 hepatocytů“. Mol. Pharmacol. 63 (5): 1180–9. doi:10,1124 / mol. 63,5.1180. PMID 12695546.
Lamba V, Panetta JC, Strom S, Schuetz EG (2010). „Genetické prediktory interindividuální variability v jaterní expresi CYP3A4“. J. Pharmacol. Exp. Ther. 332 (3): 1088–99. doi:10.1124 / jpet.109.160804. PMC 2835441. PMID 19934400.
Hori Y, Gu X, Xie X, Kim SK (2005). „Diferenciace buněk produkujících inzulín od lidských neurálních progenitorových buněk“. PLOS Med. 2 (4): e103. doi:10.1371 / journal.pmed.0020103. PMC 1087208. PMID 15839736.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Motallebipour M, Ameur A, Reddy Bysani MS a kol. (2009). "Diferenční vazebný a společný vazebný vzorec FOXA1 a FOXA3 a jejich vztah k H3K4me3 v buňkách HepG2 odhalený ChIP-seq". Genome Biol. 10 (11): R129. doi:10.1186 / gb-2009-10-11-r129. PMC 3091322. PMID 19919681.
Zhou B, Zhong Q, Minoo P a kol. (2008). „Foxp2 inhibuje transkripci SP-C zprostředkovanou Nkx2.1 prostřednictvím interakcí s homeodoménou Nkx2.1“. Dopoledne. J. Respir. Cell Mol. Biol. 38 (6): 750–8. doi:10.1165 / rcmb.2007-0350OC. PMC 2396252. PMID 18239190.
Navas MA, Vaisse C, Boger S a kol. (2000). „Lidské geny HNF-3: klonování, parciální sekvence a screening mutací u pacientů se zhoršenou homeostázou glukózy“. Hučení. Hered. 50 (6): 370–81. doi:10.1159/000022943. PMID 10899756. S2CID 24745151.
Kaestner KH (2000). "Rodina hepatocytů nukleárního faktoru 3 (HNF3 nebo FOXA) v metabolismu". Trendy endokrinol. Metab. 11 (7): 281–5. doi:10.1016 / S1043-2760 (00) 00271-X. PMID 10920385. S2CID 40600315.
Lin B, Morris DW, Chou JY (1997). „Role HNF1alpha, HNF3gamma a cyklického AMP v aktivaci genu pro glukózo-6-fosfatázu“. Biochemie. 36 (46): 14096–106. doi:10.1021 / bi9703249. PMID 9369482.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Dintilhac A, Bernués J (2002). „HMGB1 interaguje s mnoha zjevně nesouvisejícími proteiny rozpoznáním krátkých aminokyselinových sekvencí“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7021–8. doi:10,1074 / jbc.M108417200. PMID 11748221.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kaestner KH, Hiemisch H, Schütz G (1998). „Cílené narušení genu kódujícího hepatocytární nukleární faktor 3gamma vede ke snížené transkripci genů specifických pro hepatocyty“. Mol. Buňka. Biol. 18 (7): 4245–51. doi:10,1128 / mcb.18.7.4245. PMC 109008. PMID 9632808.
Hromas R, Moore J, Johnston T a kol. (1993). „Homology Drosophila forkhead jsou exprimovány v lidských krvetvorných buňkách způsobem omezeným na počet řádků“. Krev. 81 (11): 2854–9. doi:10.1182 / krev. V81.11.2854.2854. PMID 8499623.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P55318 (Hepatocytový nukleární faktor 3-gama) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170608 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040891 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: forkhead box A3“.

[pmid9119385-6] Mincheva A, Lichter P, Schütz G, Kaestner KH (únor 1997). „Přiřazení lidských genů pro hepatocytární jaderný faktor 3-alfa, -beta a -gamma (HNF3A, HNF3B, HNF3G) na 14q12-q13, 20p11 a 19q13.2-q13.4“. Genomika. 39 (3): 417–9. doi:10.1006 / geno.1996.4477. PMID 9119385.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]