NRF1 - NRF1

NRF1
Identifikátory
Aliasy	NRF1, ALPHA-PAL, nukleární respirační faktor 1
Externí ID	OMIM: 600879 MGI: 1332235 HomoloGene: 3674 Genové karty: NRF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	129,757,082 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	30,153,458 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba DNA specifické pro sekvenci jádrového promotoru; • Vazba specifické pro sekvenci jádra promotoru RNA polymerázy II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • nukleoplazma; • cytosol; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • organizace mitochondrií; • generace prekurzorových metabolitů a energie; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4899
	18181
	ENSG00000106459
	ENSMUSG00000058440
	Q16656
	Q9WU00
	NM_005011; NM_001040110; NM_001293163; NM_001293164
NM_001164226; NM_001164227; NM_001164228; NM_001164229; NM_001164230;
	NM_010938; NM_001361692; NM_001361693; NM_001361694; NM_001361695
	NP_001035199; NP_001280092; NP_001280093; NP_005002
NP_001157698; NP_001157699; NP_001157700; NP_001157701; NP_001157702;
	NP_035068; NP_001348621; NP_001348622; NP_001348623; NP_001348624
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Jaderný respirační faktor 1, také známý jako Nrf1, Nrf-1, NRF1 a NRF-1, kóduje protein, který homodimerizuje a funguje jako transkripční faktor který aktivuje výraz nějakého klíče metabolické geny regulace buněčného růstu a jaderných genů potřebných pro dýchání, biosyntéza hemu, a mitochondriální DNA transkripce a replikace. Protein byl také spojován s regulací neurit růst. Střídat transkripční sestřihové varianty, které kódují stejný protein, byly charakterizovány. Další varianty kódující odlišný protein izoformy byly popsány, ale nebyly plně charakterizovány. V bibliografických databázích došlo ke zmatku kvůli sdílenému symbolu NRF1 pro tento gen a kvůli „nukleárnímu faktoru (odvozenému od erytroidu 2) jako 1“, který má oficiální symbol NFE2L1.^{[Citace je zapotřebí ]}

Funkce

Nrf1 funguje jako transkripční faktor, který aktivuje expresi některých klíčových metabolických genů regulujících buněčný růst a jaderné geny potřebné pro mitochondriální dýchání a mitochondriální DNA transkripce a replikace. Nrf1, společně s Nrf2, zprostředkovává biogenomická koordinace mezi jadernými a mitochondriálními genomy přímou regulací exprese několika jaderně kódovaných ATD proteiny a nepřímo reguluje tři mitochondriálně kódované KORMIDELNÍK geny podjednotky aktivací mtTFA, mtTFB1, a mtTFB2.

Nrf1 je spojen s regulací neurit růst.^[5]

Byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty, které kódují stejný protein. Byly popsány další varianty kódující různé proteinové izoformy, ale nebyly plně charakterizovány.^[6]

Cyklin D1-dependentní kináza prostřednictvím fosforylace NRF-1 na S47 koordinuje syntézu nukleární DNA a mitochondriální funkci.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že NRF1 komunikovat s DYNLL1,^[8] PPARGC1A,^[9] a PPRC1.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106459 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058440 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chang WT, Chen HI, Chiou RJ, Chen CY, Huang AM (srpen 2005). "Nová funkce transkripčního faktoru alfa-Pal / NRF-1: zvyšující se růst neuritů". Biochem. Biophys. Res. Commun. 334 (1): 199–206. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.079. PMID 15992771.
^ „Entrez Gene: NRF1 nukleární respirační faktor 1“.
^ Wang C, Li Z, Lu Y, Du R, Katiyar S, Yang J, Fu M, vůdce JE, Quong A, Novikoff PM, Pestell RG (2006). „Represe cyklinu D1 na nukleární respirační faktor 1 integruje syntézu nukleární DNA a mitochondriální funkci“. Sborník Národní akademie věd. 103 (31): 11567–72. Bibcode:2006PNAS..10311567W. doi:10.1073 / pnas.0603363103. JSTOR 30051572. PMC 1518800. PMID 16864783.
^ Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (prosinec 2000). „Dyneinový lehký řetězec interaguje s NRF-1 a EWG, strukturně a funkčně souvisejícími transkripčními faktory z člověka a drosophily.“ J. Cell Sci. 113 (23): 4263–73. PMID 11069771.
^ Wu Z, Puigserver P, Andersson U, Zhang C, Adelmant G, Mootha V, Troy A, Cinti S, Lowell B, Scarpulla RC, Spiegelman BM (červenec 1999). „Mechanismy řídící mitochondriální biogenezi a dýchání pomocí termogenního koaktivátoru PGC-1“. Buňka. 98 (1): 115–24. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80611-X. PMID 10412986. S2CID 16143809.
^ Andersson U, Scarpulla RC (květen 2001). „Koaktivátor související s PGC-1, nový sérem indukovatelný koaktivátor transkripce závislé na nukleárním respiračním faktoru 1 v buňkách savců“. Mol. Buňka. Biol. 21 (11): 3738–49. doi:10.1128 / MCB.21.11.3738-3749.2001. PMC 87014. PMID 11340167.

Další čtení

Tiranti V, Rossi E, Rocchi M, DiDonato S, Zuffardi O, Zeviani M (1995). „Gen (NFE2L1) pro lidský NRF-1, aktivátor podílející se na jaderně-mitochondriálních interakcích, se mapuje na 7q32“. Genomika. 27 (3): 555–7. doi:10.1006 / geno.1995.1094. PMID 7558044.
Gopalakrishnan L, Scarpulla RC (1995). „Struktura, exprese a přiřazení chromozomů lidského genu kódujícího nukleární respirační faktor 1“. J. Biol. Chem. 270 (30): 18019–25. doi:10.1074 / jbc.270.30.18019. PMID 7629110.
Efiok BJ, Chiorini JA, Safer B (1994). „Klíčový transkripční faktor pro eukaryotický iniciační faktor-2 alfa je silně homologní s vývojovými transkripčními faktory a může spojovat metabolické geny s buněčným růstem a vývojem.“ J. Biol. Chem. 269 (29): 18921–30. PMID 8034649.
Virbasius JV, Scarpulla RC (1994). „Aktivace genu lidského mitochondriálního transkripčního faktoru A nukleárními respiračními faktory: potenciální regulační spojení mezi expresí jaderného a mitochondriálního genu v biogenezi organel“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (4): 1309–13. Bibcode:1994PNAS ... 91.1309V. doi:10.1073 / pnas.91.4.1309. PMC 43147. PMID 8108407.
Virbasius CA, Virbasius JV, Scarpulla RC (1994). „NRF-1, aktivátor podílející se na jaderně-mitochondriálních interakcích, využívá novou doménu vázající DNA konzervovanou v rodině vývojových regulátorů“. Genes Dev. 7 (12A): 2431–45. doi:10,1101 / gad.7.12a.2431. PMID 8253388.
Spelbrink JN, Van den Bogert C (1996). „Pre-mRNA jaderného respiračního faktoru 1, regulátor mitochondriální biogeneze, je alternativně sestříhána v lidských tkáních a buněčných liniích.“ Hučení. Mol. Genet. 4 (9): 1591–6. doi:10,1093 / hmg / 4,9,1591. PMID 8541844.
Johnsen O, Skammelsrud N, Luna L, Nishizawa M, Prydz H, Kolstø AB (1996). „Malé proteiny Maf interagují s lidským transkripčním faktorem TCF11 / Nrf1 / LCR-F1“. Nucleic Acids Res. 24 (21): 4289–97. doi:10.1093 / nar / 24.21.4289. PMC 146217. PMID 8932385.
Venugopal R, Jaiswal AK (1997). „Nrf1 a Nrf2 pozitivně a c-Fos a Fra1 negativně regulují lidskou antioxidační odezvu zprostředkovanou expresi genu NAD (P) H: chinon oxidoreduktázy1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (25): 14960–5. Bibcode:1996PNAS ... 9314960V. doi:10.1073 / pnas.93.25.14960. PMC 26245. PMID 8962164.
Chen S, Nagy PL, Zalkin H (1997). "Role NRF-1 v obousměrné transkripci lidského lokusu biosyntézy purinu GPAT-AIRC". Nucleic Acids Res. 25 (9): 1809–16. doi:10.1093 / nar / 25.9.1809. PMC 146651. PMID 9108165.
Toki T, Itoh J, Kitazawa J, Arai K, Hatakeyama K, Akasaka J, Igarashi K, Nomura N, Yokoyama M, Yamamoto M, Ito E (1997). „Lidské malé proteiny Maf tvoří heterodimery s transkripčními faktory rodiny CNC a rozpoznávají motiv NF-E2“. Onkogen. 14 (16): 1901–10. doi:10.1038 / sj.onc.1201024. PMID 9150357.
Marini MG, Chan K, Casula L, Kan YW, Cao A, Moi P (1997). „hMAF, malý lidský transkripční faktor, který se specificky heterodimerizuje s Nrf1 a Nrf2“. J. Biol. Chem. 272 (26): 16490–7. doi:10.1074 / jbc.272.26.16490. PMID 9195958.
Gugneja S, Scarpulla RC (1997). „Fosforylace serinu ve stručné amino-terminální doméně v nukleárním respiračním faktoru 1 zvyšuje vazbu DNA“. J. Biol. Chem. 272 (30): 18732–9. doi:10.1074 / jbc.272.30.18732. PMID 9228045.
Johnsen O, Murphy P, Prydz H, Kolsto AB (1998). „Interakce faktoru CNC-bZIP TCF11 / LCR-F1 / Nrf1 s MafG: výběr vazebného místa a regulace transkripce“. Nucleic Acids Res. 26 (2): 512–20. doi:10.1093 / nar / 26.2.512. PMC 147270. PMID 9421508.
Au HC, Scheffler IE (1998). „Promotorová analýza genu železo-protein lidská sukcinátdehydrogenáza - jsou vyžadovány jak nukleární respirační faktory NRF-1, tak NRF-2“. Eur. J. Biochem. 251 (1–2): 164–74. doi:10.1046 / j.1432-1327.1998.2510164.x. PMID 9492280.
Miranda S, Foncea R, Guerrero J, Leighton F (1999). "Oxidační stres a upregulace mitochondriálních genů biogeneze v mitochondriálních DNA ochuzených buňkách HeLa". Biochem. Biophys. Res. Commun. 258 (1): 44–9. doi:10.1006 / bbrc.1999.0580. PMID 10222232.
Li B, Holloszy JO, Semenkovich CF (1999). „Respirační rozpojení indukuje expresi delta-aminolevulinát syntázy prostřednictvím mechanismu závislého na nukleárním respiračním faktoru 1 v buňkách HeLa“. J. Biol. Chem. 274 (25): 17534–40. doi:10.1074 / jbc.274.25.17534. PMID 10364186.
Wu Z, Puigserver P, Andersson U, Zhang C, Adelmant G, Mootha V, Troy A, Cinti S, Lowell B, Scarpulla RC, Spiegelman BM (1999). „Mechanismy řídící mitochondriální biogenezi a dýchání pomocí termogenního koaktivátoru PGC-1“. Buňka. 98 (1): 115–24. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80611-X. PMID 10412986. S2CID 16143809.
Solecki D, Bernhardt G, Lipp M, Wimmer E (2000). „Identifikace vazebného místa pro nukleární respirační faktor 1 v jádrovém promotoru genu pro lidský polio virusový receptor / CD155“. J. Biol. Chem. 275 (17): 12453–62. doi:10.1074 / jbc.275.17.12453. PMID 10777530.
Kumari D, Usdin K (2001). „Interakce transkripčních faktorů USF1, USF2 a alfa-Pal / Nrf-1 s promotorem FMR1. Důsledky pro syndrom mentální retardace Fragile X“. J. Biol. Chem. 276 (6): 4357–64. doi:10,1074 / jbc.M009629200. PMID 11058604.

externí odkazy

NRF1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook Nrf1

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106459 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058440 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15992771-5] Chang WT, Chen HI, Chiou RJ, Chen CY, Huang AM (srpen 2005). "Nová funkce transkripčního faktoru alfa-Pal / NRF-1: zvyšující se růst neuritů". Biochem. Biophys. Res. Commun. 334 (1): 199–206. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.079. PMID 15992771.

[entrez-6] „Entrez Gene: NRF1 nukleární respirační faktor 1“.

[7] Wang C, Li Z, Lu Y, Du R, Katiyar S, Yang J, Fu M, vůdce JE, Quong A, Novikoff PM, Pestell RG (2006). „Represe cyklinu D1 na nukleární respirační faktor 1 integruje syntézu nukleární DNA a mitochondriální funkci“. Sborník Národní akademie věd. 103 (31): 11567–72. Bibcode:2006PNAS..10311567W. doi:10.1073 / pnas.0603363103. JSTOR 30051572. PMC 1518800. PMID 16864783.

[pmid11069771-8] Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (prosinec 2000). „Dyneinový lehký řetězec interaguje s NRF-1 a EWG, strukturně a funkčně souvisejícími transkripčními faktory z člověka a drosophily.“ J. Cell Sci. 113 (23): 4263–73. PMID 11069771.

[pmid10412986-9] Wu Z, Puigserver P, Andersson U, Zhang C, Adelmant G, Mootha V, Troy A, Cinti S, Lowell B, Scarpulla RC, Spiegelman BM (červenec 1999). „Mechanismy řídící mitochondriální biogenezi a dýchání pomocí termogenního koaktivátoru PGC-1“. Buňka. 98 (1): 115–24. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80611-X. PMID 10412986. S2CID 16143809.

[pmid11340167-10] Andersson U, Scarpulla RC (květen 2001). „Koaktivátor související s PGC-1, nový sérem indukovatelný koaktivátor transkripce závislé na nukleárním respiračním faktoru 1 v buňkách savců“. Mol. Buňka. Biol. 21 (11): 3738–49. doi:10.1128 / MCB.21.11.3738-3749.2001. PMC 87014. PMID 11340167.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]