HMG-box - HMG-box

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1aab, 1cg7, 1 ks, 1e7j, 1 gt0, 1 hme, 1 hmf, 1hry, 1 hrz, 1 hsm, 1 hsn, 1i11, 1j3x, 1j46, 1j47, 1j5n, 1k99, 1 lwm, 1 nm, 1nhn, 1o4x, 1qrv, 1 s 9 m, 1sx9, 1v64, 1wgf, 1wxl, 2crj, 2cs1, 2lef

Krabice HMG (skupina s vysokou mobilitou)
	Struktura NMR domény HMG-boxu LEF1 bílkoviny (duhové barvy, N-konec = modrá, C-konec = červená) v komplexu s DNA (hnědá) na základě PDB: 2LEFSouřadnice.
Identifikátory
Symbol	PF00505
Pfam	PF00505
InterPro	IPR009071
SCOP2	1 hsm / Rozsah / SUPFAM
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1aab, 1cg7, 1 ks, 1e7j, 1 gt0, 1 hme, 1 hmf, 1hry, 1 hrz, 1 hsm, 1 hsn, 1i11, 1j3x, 1j46, 1j47, 1j5n, 1k99, 1 lwm, 1 nm, 1nhn, 1o4x, 1qrv, 1 s 9 m, 1sx9, 1v64, 1wgf, 1wxl, 2crj, 2cs1, 2lef

v molekulární biologie, HMG-box (hdobře mobility Group box) je a proteinová doména který je zapojen do Vazba DNA.^[1]

Struktura

Struktura domény HMG-box obsahuje tři alfa helixy oddělené smyčkami (viz obrázek vpravo).^[2]

Funkce

HMG-box obsahující proteiny se vážou pouze naDNA typu B. konformace (zauzlené nebo odvinuté) s vysokou afinitou.^[1] HMG-box domény se nacházejí v skupina s vysokou mobilitou proteiny, které se podílejí na regulaci procesů závislých na DNA, jako je např transkripce, replikace, a Oprava DNA, které všechny vyžadují změnu konformace z chromatin.^[2]Jediný a dvojitý box HMG proteiny mění architekturu DNA indukcí ohybů po navázání.^[3]^[4]

Reference

^ ^A ^b Stros M, Launholt D, Grasser KD (říjen 2007). „Box HMG: univerzální proteinová doména vyskytující se v široké škále proteinů vázajících DNA“. Buňka. Mol. Life Sci. 64 (19–20): 2590–606. doi:10.1007 / s00018-007-7162-3. PMID 17599239. S2CID 28156847.
^ ^A ^b Thomas JO (srpen 2001). „HMG1 a 2: architektonické proteiny vázající DNA“. Biochem. Soc. Trans. 29 (Pt 4): 395–401. doi:10.1042 / BST0290395. PMID 11497996.
^ D. Murugesapillai et al, Přemostění a smyčky DNA pomocí HMO1 poskytují mechanismus pro stabilizaci chromatinu bez nukleosomů, Nucleic Acids Res (2014) 42 (14): 8996-9004
^ D. Murugesapillai et al, Jednomolekulární studie architektonických proteinů ohýbajících DNA skupiny B s vysokou mobilitou, Biophys Rev (2016) doi: 10,1007 / s12551-016-0236-4

externí odkazy

HMG-Box domény v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid17599239-1] A ^b Stros M, Launholt D, Grasser KD (říjen 2007). „Box HMG: univerzální proteinová doména vyskytující se v široké škále proteinů vázajících DNA“. Buňka. Mol. Life Sci. 64 (19–20): 2590–606. doi:10.1007 / s00018-007-7162-3. PMID 17599239. S2CID 28156847.

[pmid11497996-2] A ^b Thomas JO (srpen 2001). „HMG1 a 2: architektonické proteiny vázající DNA“. Biochem. Soc. Trans. 29 (Pt 4): 395–401. doi:10.1042 / BST0290395. PMID 11497996.

[3] D. Murugesapillai et al, Přemostění a smyčky DNA pomocí HMO1 poskytují mechanismus pro stabilizaci chromatinu bez nukleosomů, Nucleic Acids Res (2014) 42 (14): 8996-9004

[4] D. Murugesapillai et al, Jednomolekulární studie architektonických proteinů ohýbajících DNA skupiny B s vysokou mobilitou, Biophys Rev (2016) doi: 10,1007 / s12551-016-0236-4

[1]

[2]

[3]

[4]