C-Raf - C-Raf

„RAF1“ přeadresuje tady. Informace o motoru letadla viz RAF 1.

RAF1
Protein RAF1 PDB 1c1y.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRAF1, Proto-onkogen Raf-1, serin / threonin kináza, CMD1NN, CRAF, NS5, Raf-1, c-Raf
Externí IDOMIM: 164760 MGI: 97847 HomoloGene: 48145 Genové karty: RAF1
Exprese RNA vzor
PBB GE RAF1 201244 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5894

110157

Ensembl

ENSG00000132155

ENSMUSG00000000441

UniProt

P04049

Q99N57

RefSeq (mRNA)

NM_002880

NM_029780
NM_001356333
NM_001356334

RefSeq (protein)

NP_084056
NP_001343262
NP_001343263

Místo (UCSC)n / aChr 6: 115,62 - 115,68 Mb
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protoonkogenní serin / threonin-protein kináza RAF, také známý jako proto-onkogenní c-RAF nebo jednoduše c-Raf nebo dokonce Raf-1, je enzym[4] to u lidí je kódovaný podle RAF1 gen.[5][6] Protein c-Raf je součástí ERK1 / 2 cesta jako MAP kináza (MAP3K), která funguje po proudu od Ras podčeleď membránových GTPáz.[7] C-Raf je členem Raf kináza rodina serin / threonin-specifické proteinové kinázy ze skupiny kináz TKL (tyrosin-kinázy podobné).

Objev

První gen Raf, v-Raf byl nalezen v roce 1983. Byl izolován od myšího retrovirus nesoucí číslo 3611. Brzy se ukázalo, že je schopen transformovat fibroblasty hlodavců na rakovinové buněčné linie, takže tento gen dostal jméno Virusem indukovaný Rapidly Accelerated Fibrosarcoma (V-RAF).[5] O rok později byl u ptačího retroviru MH2 nalezen další transformující gen s názvem v-Mil - který se ukázal být velmi podobný v-Raf.[8] Vědci dokázali prokázat, že tyto geny kódují enzymy, které mají aktivitu serin-threonin kinázy.[9] Normální buněčné homology v-Raf a v-Mil byly brzy nalezeny v genomu myši i kuřete (odtud název c-Raf pro normální buněčný Raf gen), a bylo jasné, že i tyto hrály roli v regulaci růstu a dělení buněk.[10][11] Nyní víme, že c-Raf je hlavní součástí prvního popsaného mitogenem aktivovaná protein kináza Cesta (MAPK): Signalizace ERK1 / 2.[12] Působí jako kináza MAP3 a iniciuje celou kinázu kaskády. Následující experimenty ukázaly, že normální buněčné geny Raf mohou také mutovat, aby se staly onkogeny, a to „overdriving“ MEK1 / 2 a ERK1 / 2 aktivitou.[13] Ve skutečnosti genomy obratlovců obsahují více genů Raf. O několik let později po objevu c-Raf byly popsány dvě další příbuzné kinázy: A-Raf a B-Raf. Ta se v posledních letech stala předmětem výzkumu, protože velká část lidských nádorů nese onkogenní „hnací“ mutace v genu B-Raf.[14] Tyto mutace indukují nekontrolovanou vysokou aktivitu enzymů Raf. Diagnostický a terapeutický zájem o kinázy Raf dosáhl nového vrcholu v posledních letech.[15]

Struktura

Lidský gen c-Raf je umístěn na chromozom 3. Nejméně dvě izoformy mRNA byly popsány (vyplývající ze zahrnutí nebo odebrání souboru alternativní exon ), které zobrazují pouze nepatrné rozdíly. Kratší hlavní izoforma - skládající se z 17 exony - kóduje a protein kináza 648 aminokyselin.[16]

Schematická architektura lidského proteinu c-Raf

Podobně jako mnoho jiných MAPKKKs, c-Raf je a vícedoménový protein, s několika dalšími domén na podporu regulace jeho katalytické aktivita. Na svém N-terminálním segmentu se vedle sebe nacházejí doména vázající Ras (RBD) a homologní doména C-kinázy 1 (doména C1). Struktury obou konzervovaných domén byly vyřešeny v posledních desetiletích a osvětlily mechanismy jejich regulace.

The Ras vázající doména zobrazuje záhyb podobný ubikvitinu (jako mnoho jiných malých domén asociovaných s G-proteinem) a selektivně váže pouze proteiny Ras vázané na GTP.[17][18][19] (Tuto interakci můžete velmi podrobně vidět v rámečku PDB připojeném k článku. Zobrazuje Rap1 v komplexu s RBD c-Raf.)

The C1 doména - bezprostředně za vazebnou doménou Ras - je speciální zinkový prst, bohatý na cysteiny a stabilizovaný dvěma ionty zinku. Je to podobné jako s C1 doménami vázajícími diacylglycerol protein kináza C. (PKC) enzymy.[20][21] Ale na rozdíl od PKC se C1 domény kináz rodiny Raf neváží na diacylglycerol.[22] Místo toho interagují s jinými lipidy, jako je ceramid[22] nebo kyselina fosfatidová,[23] a dokonce i pomoc při rozpoznávání aktivovaného Ras (GTP-Ras).[21][24]

Blízká blízkost těchto dvou domén, jakož i několik linií experimentálních dat naznačují, že fungují jako jedna jednotka k negativní regulaci aktivity proteinkinázové domény přímou fyzickou interakcí.[25] Historicky byl tento autoinhibiční blok označen jako oblast CR1 ("Konzervovaná oblast 1"), pantová oblast byla pojmenována CR2 a kinázová doména CR3. Přesná struktura autoinhibované kinázy bohužel zůstává neznámá.

Mezi blokem autoinhibiční domény a doménou katalytické kinázy lze nalézt dlouhý segment - charakteristický pro všechny proteiny Raf. Je velmi obohacen serin aminokyseliny, ale je to přesné sekvence je špatně konzervovaný napříč příbuznými geny Raf. Zdá se, že tato oblast je vnitřně nestrukturovaná a velmi flexibilní. Jeho nejpravděpodobnější rolí je působit jako přirozený „závěs“ mezi pevně složenými autoinhibičními a katalytickými doménami, což umožňuje složité pohyby a hluboké konformační přesmyky uvnitř molekuly.[26] Tato oblast závěsu obsahuje malou, konzervovanou ostrov aminokyselin, které jsou odpovědné za 14-3-3 bílkovin rozpoznání, ale pouze když je kritický serin (Ser259 v lidském c-Raf) fosforylován. Druhý podobný motiv se nachází na extrémním C-konci (soustředěném kolem fosforylovatelného Ser 621) všech enzymů Raf, ale za kinázovou doménou.

C-koncová polovina c-Raf se složí do jediné proteinové domény, zodpovědné za katalytickou aktivitu. Struktura tohoto kinázová doména je dobře známý z obou c-Raf[27] a B-Raf.[28] Je velmi podobný ostatním kinázám Raf a KSR proteinům a výrazně podobný některým dalším kinázám MAP3, jako je rodina kináz smíšených linií (MLK). Společně tvoří skupinu proteinových kináz jako tyrosinkináza (TKL). Ačkoli některé rysy spojují jejich katalytické domény s proteinovými tyrosinkinázami, aktivita TKL je omezena na fosforylaci serinových a threoninových zbytků v cílových proteinech. Nejdůležitějším substrátem kináz Raf (kromě sebe) jsou MKK1 a MKK2 kinázy, jejichž aktivita přísně závisí na fosforylačních událostech prováděných Rafsem.

Evoluční vztahy

Hlavní článek: Raf kináza

Lidský c-Raf je členem větší rodiny příbuzných proteinových kináz. Dva další členové - nalezení u většiny obratlovců - patří do stejné rodiny: B-Raf a A-Raf. Kromě rozdílné délky jejich nekonzervovaných N- a C-koncových koncovek sdílejí všechny stejnou doménovou architekturu, strukturu a regulaci. Ve srovnání s relativně známými c-Raf a B-Raf je velmi málo známo o přesné funkci A-Raf, ale také se předpokládá, že je podobná jako u ostatních dvou členů rodiny. Předpokládá se, že všechny tyto geny jsou produktem duplikací úplného genu nebo genomu na úsvitu evoluce obratlovců z jediného genu Raf předků. Většina ostatních živočišných organismů vlastní pouze jeden gen Raf. V Drosophile se tomu říká Phl nebo Draf[29] a Lin-45 v C. elegans.[30]

Rodina kináz Raf (schematické architektury)

Mnohobuněčná zvířata mají také typ kinázy úzce související s Raf: jedná se o kinázový supresor Ras (KSR). Obratlovci jako savci mají dva, paralogní Geny KSR místo jednoho: KSR1 a KSR2. Jejich C-koncová kinázová doména je velmi podobná Raf (původně nazývaná CA5 v KSR a CR3 v Raf), ale N-koncová regulační oblast se liší. Ačkoli mají před sebou také flexibilní závěs (CA4 v KSR) a doménu C1 (CA3 v KSR), doménám KSR zcela chybí doména vázající Ras. Místo toho mají na svých N-koncích jedinečné regulační oblasti, původně nazývané CA1 („konzervovaná oblast 1“) a CA2. Po dlouhou dobu byla struktura domény CA1 záhadou. V roce 2012 však byla struktura regionu CA1 v KSR1 vyřešena: ukázalo se, že se liší SAM doména (sterilní alfa motiv), doplněná o svinuté cívky (CC-SAM): má to pomoci KSR při vazbě na membránu.[31] KSR, stejně jako Rafs, mají také dvojité asociační motivy 14-3-3 (které závisí na fosforylaci), ale také mají nové MAPK-vazebné motivy na svých pantových oblastech. U typické sekvence Phe-x-Phe-Pro (FxFP) jsou tyto motivy důležité pro regulaci zpětné vazby kináz Raf v ERK1 / 2 cesta. Podle našich současných znalostí se KSR rovněž účastní stejné cesty jako Raf, i když hrají pouze pomocnou roli. S velmi špatnou vnitřní kinázovou aktivitou se dlouho myslelo, že jsou neaktivní, dokud se jejich katalytická aktivita v posledních letech konečně neprojevila.[32][33] Ale i tak k tomu přispívají jen zanedbatelně MKK1 a MKK2 fosforylace. Zdá se, že hlavní rolí KSR je poskytnout heterodimerizačnímu partnerovi enzymy Raf, což značně usnadňuje jejich aktivaci pomocí allostery. Podobné jevy byly popsány pro jiné MAP3 kinázy. Například ASK2 je sám o sobě špatným enzymem a zdá se, že jeho aktivita je vázána na heterodimerizaci ASK1 / ASK2.[34]

Kinázy podobné Raf jsou v plísních zcela nepřítomné. Ale nedávné pořadí jiných opisthokonts (např. Capsaspora owczarzaki ) odhalil přítomnost skutečných kináz Raf v jednobuněčných eukaryotech. Proto je možné, že proteiny Raf jsou starodávným dědictvím a předci hub sekundárně ztratili signalizaci závislou na Raf. Houba Dráhy kinázy MAP které jsou homologní se savci Cesta ERK1 / 2 (Fus3 a Kss1 v kvasinkách) jsou aktivovány kinázami souvisejícími s MEKK (např. Stell v kvasinkách) místo enzymů Raf.

Raf kinázy nalezené v retrovirech (jako je myší v-Raf) jsou sekundárně odvozeny z odpovídajících genů obratlovců jejich hostitelů. Tyto geny Raf kódují silně zkrácené proteiny, které postrádají celou N-koncovou autoinhibiční doménu a vazebné motivy 14-3-3. Je známo, že takové závažné zkrácení indukují nekontrolovanou aktivitu Raf kináz: to je přesně to, co virus může potřebovat pro efektivní reprodukci.

Regulace činnosti

Umělecký dojem z autoinhibovaného stavu c-Raf, posílen přidruženými proteinovými dimery 14-3-3, navázaný na fosforylované dvojité motivy.[35][36]

Jak bylo uvedeno výše, regulace aktivity c-Raf je složitá. Jako "strážce brány" ERK1 / 2 cesta, je udržován pod kontrolou mnoha inhibičními mechanismy a normálně jej nelze aktivovat v jediném kroku. Nejdůležitější regulační mechanismus zahrnuje přímé fyzické spojení N-koncového autoinhibičního bloku s kinázovou doménou c-Raf. Výsledkem je okluze katalytického místa a úplné zastavení aktivity kinázy.[25] Tento „uzavřený“ stav může být uvolněn, pouze pokud autoinhibiční doména Raf zabírá partnera soutěžícího s jeho vlastní kinázovou doménou, nejdůležitější je GTP-vázaný Ras. Aktivované malé G-proteiny tak mohou rozbít intramolekulární interakce: výsledkem je konformační změna („otevření“) c-Raf[37] nezbytné pro aktivaci kinázy a vazbu substrátu.

14-3-3 bílkovin také přispívají k autoinhibici. Jelikož je známo, že 14-3-3 proteiny tvoří konstitutivní dimery, jejich sestavy mají dvě vazebná místa.[38] Dimer tak funguje jako „molekulární pouta“, blokuje své vazebné partnery ve pevné vzdálenosti a orientaci. Když jsou přesně umístěné dvojité vazebné motivy 14-3-3 zapojeny do jediného dimeru proteinu 14-3-3 (například 14-3-3 zeta), uzamknou se do konformace, která podporuje autoinhibici a neumožňuje uvolnění autoinhibičních a katalytických domén.[39] Toto „uzamčení“ c-Raf (a dalších Raf, stejně jako KSR) je řízeno fosforylací motivů. Fosforylované asociační motivy 14-3-3 se neváží na své partnery: musí se nejprve fosforylovat na konzervované seriny (Ser 259 a Ser 621), jinými proteinovými kinázami. Nejdůležitější kináza zapojená do této události je Kináza aktivovaná TGF-beta 1 (TAK1) a enzymy určené k odstranění těchto fosfátů jsou proteinová fosfatáza 1 (PP1) a komplexy proteinové fosfatázy 2A (PP2A).[40][41]

Všimněte si, že vazba 14-3-3 enzymů Raf nemusí být nutně inhibiční: jakmile je Raf otevřený a dimerizuje, mohou se 14-3-3 také vázat trans, přemostění dvou kináz a "pouta" dohromady, aby zesílily dimer, místo aby je udržovaly stranou od sebe.[42] Existují také další způsoby interakcí 14-3-3 s c-Raf, ale jejich role není dobře známa.[43]

Dimerizace je dalším důležitým mechanismem pro regulaci aktivity c-Raf a je vyžadována pro Raf aktivační smyčka fosforylace. Normálně se na dimerizaci účastní pouze „otevřené“ kinázové domény. Na rozdíl od B-Raf, který snadno tvoří homodimery sám se sebou, c-Raf preferuje heterodimerizaci buď s B-Raf nebo KSR1.[Citace je zapotřebí ] Homodimery a heterodimery se chovají podobně.[33] Struktura B-Raf homodimer kinázové domény jasně ukazuje, že aktivační smyčky (které řídí katalytickou aktivitu všech známých proteinových kináz) jsou umístěny v aktivně podobné konformaci v dimeru. To je způsobeno alosterickým účinkem vazby jiné molekuly na „zadní“ stranu kinázy; takové dimery jsou symetrické a mají dvě, částečně aktivní katalytická místa. V této fázi je aktivita Raf kináz nízká a nestabilní.

Aktivační cyklus savčích proteinů Raf, jehož příkladem je B-Raf (výrazně zjednodušený přehled, nezobrazující všechny kroky).[35][36]

K dosažení plné aktivity a stabilizaci aktivního stavu je třeba fosforylovat aktivační smyčku c-Raf. Jedinými kinázami, o nichž je v současnosti známo, že provádějí tento čin, jsou samotné kinázy rodiny Raf. Ale některé další kinázy, jako je PAK1, mohou fosforylovat další zbytky poblíž kinázové domény c-Raf: přesná role těchto pomocných kináz není známa. V souvislosti s c-Raf jsou pro krok „transfosforylace“ potřebné jak c-Raf, tak KSR1. Kvůli architektuře dimerů může tato fosforylace probíhat pouze v trans (tj. jeden dimer fosforyluje jiný ve čtyřčlenném přechodném komplexu).[44] Interakcí se konzervovanými zbytky Arg a Lys v kinázové doméně fosforylované aktivační smyčky posunou konformaci a stanou se uspořádanými a trvale zablokují kinázovou doménu do plně aktivního stavu, dokud nedojde k defosforylaci. Fosforylované aktivační smyčky také činí kinázu necitlivou na přítomnost její autoinhibiční domény.[45] KSR nemohou tento poslední krok podstoupit, protože jim chybí aktivační smyčky fosforylovatelných zbytků. Jakmile je však c-Raf plně aktivován, není třeba to již dělat: aktivní enzymy Raf nyní mohou zabírat své substráty.[46] Stejně jako většina proteinových kináz má i c-Raf více substrátů. ŠPATNÝ (Bcl2-atagonista buněčné smrti) je přímo fosforylován pomocí c-Raf,[47] spolu s několika typy adenylátcyklázy,[48] myosin fosfatáza (MYPT),[49] srdeční sval troponin T (TnTc),[50] atd retinoblastomový protein (pRb) a Cdc25 fosfatáza byly také navrženy jako možné substráty.[51]

Nejdůležitější cíle všech enzymů Raf jsou MKK1 (MEK1) a MKK2 (MEK2). I když struktura komplexu enzym-substrát c-Raf: MKK1 není známa, lze ji přesně modelovat po komplexu KSR2: MKK1.[33] Zde nedochází k žádné skutečné katalýze, ale předpokládá se, že je velmi podobná způsobu, jakým se Raf váže na své substráty. Hlavní interakční rozhraní poskytují C-koncové laloky obou kinázových domén; velká, neuspořádaná smyčka bohatá na prolin MKK1 a MKK2 hraje také důležitou roli při jeho umístění na Raf (a KSR).[52] Tyto MKK se po navázání na Raf fosforylují na alespoň dvou místech v jejich aktivačních smyčkách: tím se také aktivují. Cíle kinázové kaskády jsou ERK1 a ERK2, které jsou selektivně aktivovány MKK1 nebo MKK2. ERK mají v buňkách četné substráty; jsou také schopné translokace do jádra za účelem aktivace faktorů nukleárního přepisu. Aktivované ERK jsou pleiotropními efektory buněčné fyziologie a hrají důležitou roli při kontrole genové exprese zapojené do cyklu dělení buněk, migrace buněk, inhibice apoptózy a buněčné diferenciace.

Přidružené lidské nemoci

Dědičné mutace funkce c-Raf s funkcí zesílení jsou zahrnuty v některých vzácných, ale závažných syndromech. Většina z těchto mutací zahrnuje změny jedné aminokyseliny v jednom ze dvou vazebných motivů 14-3-3.[53][54] Mutace c-Raf je jednou z možných příčin Noonanův syndrom: postižení jedinci mají vrozené srdeční vady, nízký a dysmorfický vzrůst a několik dalších deformit. Podobné mutace v c-Raf mohou také způsobit související stav, nazývaný LEOPARD syndrom (Lentigo, Elektrokardiografické abnormality, Oční hypertelorismus, Plicní stenóza, Abnormální genitálie, Zpomalený růst, Hluchota), s komplexním spojením vad.

Role v rakovině

Ačkoli je c-Raf v experimentálních podmínkách velmi jasně schopen mutace na onkogen, a dokonce i v několika lidských nádorech,[55][56] její sesterská kináza B-Raf je skutečným významným hráčem v karcinogenezi u lidí.[57]

Mutace B-Raf

Přibližně 20% všech zkoumaných vzorků lidských nádorů vykazuje mutovaný gen B-Raf.[58] Drtivá většina těchto mutací zahrnuje výměnu jedné aminokyseliny: Val 600 za Glu a tento aberantní genový produkt (BRAF-V600E) lze vizualizovat imunohistochemicky pro klinickou molekulární diagnostiku[59][60] Aberace může napodobovat fosforylaci aktivační smyčky a - skokem všech řídicích kroků při normální aktivaci - okamžitě učinit kinázovou doménu plně aktivní.[61] Jelikož se B-Raf může také aktivovat homodimerizací a c-Raf heterodimerizací, má tato mutace katastrofický účinek otočením dráhy ERK1 / 2 konstitutivně aktivně a řízením nekontrolovaného procesu buněčného dělení.[62]

Jako terapeutický cíl

Vzhledem k důležitosti mutací Ras i B-Raf v tumorigenezi bylo vyvinuto několik inhibitorů Raf pro boj s rakovinou, zejména proti B-Raf vykazujícím mutaci V600E. Sorafenib byl prvním klinicky užitečným činidlem, které poskytuje farmakologickou alternativu k léčbě dříve převážně neléčitelných malignit, jako je karcinom ledvinových buněk a melanom.[63] Následovalo několik dalších molekul, jako např Vemurafenib, Regorafenib, Dabrafenib, atd.

Bohužel, ATP konkurenceschopné Inhibitory B-Raf může mít nežádoucí účinek na rakoviny závislé na K-Ras: Jsou prostě příliš selektivní pro B-Raf. I když dokonale dobře inhibují aktivitu B-Raf v případě, že primárním viníkem je mutantní B-Raf, také podporují homo- a heterodimerizaci B-Raf se sebou a c-Raf. To vlastně bude zlepšit Aktivace c-Raf místo její inhibice v případě, že nedojde k žádné mutaci v žádném genu Raf, ale jejich společný upstream aktivátor K-Ras protein je mutovaný.[27] Tato „paradoxní“ aktivace c-Raf vyžaduje potřebu vyšetřit mutace B-Raf u pacientů (genetickou diagnostikou) před zahájením léčby inhibitorem B-Raf.[64]

Seznam interagujících proteinů

Ukázalo se, že C-Raf komunikovat s:

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000441 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ Li P, Wood K, Mamon H, Haser W, Roberts T (únor 1991). "Raf-1: kináza v současné době bez příčiny, ale bez účinků". Buňka. 64 (3): 479–82. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90228-Q. PMID  1846778. S2CID  37427156.
  5. ^ A b Rapp UR, MD Goldsborough, Mark GE, Bonner TI, Groffen J, Reynolds FH, Stephenson JR (červenec 1983). „Struktura a biologická aktivita v-raf, jedinečného onkogenu transdukovaného retrovirem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 80 (14): 4218–22. Bibcode:1983PNAS ... 80.4218R. doi:10.1073 / pnas.80.14.4218. PMC  384008. PMID  6308607.
  6. ^ Bonner T, O'Brien SJ, Nash WG, Rapp UR, Morton CC, Leder P (leden 1984). "Lidské homology raf (mil) onkogenu se nacházejí na lidských chromozomech 3 a 4". Věda. 223 (4631): 71–4. Bibcode:1984Sci ... 223 ... 71B. doi:10.1126 / science.6691137. PMID  6691137.
  7. ^ "Entrez Gene: RAF1 v-raf-1 myší leukémie virový onkogen homolog 1".
  8. ^ Sutrave P, Bonner TI, Rapp UR, Jansen HW, Patschinsky T, Bister K (1984). „Nukleotidová sekvence ptačího retrovirového onkogenu v-mil: homolog myšího retrovirového onkogenu v-raf“. Příroda. 309 (5963): 85–8. Bibcode:1984 Natur.309 ... 85S. doi:10.1038 / 309085a0. PMID  6325930. S2CID  4357047.
  9. ^ Moelling K, Heimann B, Beimling P, Rapp UR, Sander T (1984). „Serin- a threonin-specifické proteinkinázové aktivity čištěných proteinů gag-mil a gag-raf“. Příroda. 312 (5994): 558–61. Bibcode:1984Natur.312..558M. doi:10.1038 / 312558a0. PMID  6438534. S2CID  4269749.
  10. ^ Kolch W, Heidecker G, Lloyd P, Rapp UR (leden 1991). „Proteinová kináza Raf-1 je nutná pro růst indukovaných buněk NIH / 3T3“. Příroda. 349 (6308): 426–8. Bibcode:1991 Natur.349..426K. doi:10.1038 / 349426a0. PMID  1992343. S2CID  4368936.
  11. ^ Mark GE, Rapp UR (duben 1984). "Primární struktura v-raf: příbuznost k rodině onkogenů src". Věda. 224 (4646): 285–9. Bibcode:1984Sci ... 224..285M. doi:10.1126 / science.6324342. PMID  6324342.
  12. ^ Kyriakis JM, App H, Zhang XF, Banerjee P, Brautigan DL, Rapp UR, Avruch J (červenec 1992). "Raf-1 aktivuje MAP kinázu-kinázu". Příroda. 358 (6385): 417–21. Bibcode:1992 Natur.358..417K. doi:10.1038 / 358417a0. PMID  1322500. S2CID  4335307.
  13. ^ Shimizu K, Nakatsu Y, Nomoto S, Sekiguchi M (1986). "Struktura aktivovaného genu c-raf-1 z lidské rakoviny žaludku". Int. Symp. Princess Takamatsu Cancer Res. Fond. 17: 85–91. PMID  2843497.
  14. ^ Davies H, Bignell GR, Cox C, Stephens P, Edkins S, Clegg S, Teague J, Woffendin H, Garnett MJ, Bottomley W, Davis N, Dicks E, Ewing R, Floyd Y, Gray K, Hall S, Hawes R , Hughes J, Kosmidou V, Menzies A, Mold C, Parker A, Stevens C, Watt S, Hooper S, Wilson R, Jayatilake H, Gusterson BA, Cooper C, Shipley J, Hargrave D, Pritchard-Jones K, Maitland N , Chenevix-Trench G, Riggins GJ, Bigner DD, Palmieri G, Cossu A, Flanagan A, Nicholson A, Ho JW, Leung SY, Yuen ST, Weber BL, Seigler HF, Darrow TL, Paterson H, Marais R, Marshall CJ , Wooster R, Stratton MR, Futreal PA (červen 2002). „Mutace genu BRAF u lidské rakoviny“ (PDF). Příroda. 417 (6892): 949–54. Bibcode:2002 Natur.417..949D. doi:10.1038 / nature00766. PMID  12068308. S2CID  3071547.
  15. ^ Sridhar SS, Hedley D, Siu LL (duben 2005). „Raf kináza jako cíl protirakovinných terapeutik“. Mol. Cancer Ther. 4 (4): 677–85. doi:10.1158 / 1535-7163.MCT-04-0297. PMID  15827342.
  16. ^ Dozier C, Ansieau S, Ferreira E, Coll J, Stehelin D (srpen 1991). „Alternativně sestřižená mRNA c-mil / raf je převážně exprimována ve svalových tkáních kuřete a konzervována mezi druhy obratlovců“. Onkogen. 6 (8): 1307–11. PMID  1886707.
  17. ^ A b Nassar N, Horn G, Herrmann C, Scherer A, McCormick F, Wittinghofer A (červen 1995). „Krystalová struktura 2.2 A vazebné domény Ras serin / threonin kinázy c-Raf1 v komplexu s Rap1A a analogem GTP“. Příroda. 375 (6532): 554–60. Bibcode:1995 Natur.375..554N. doi:10.1038 / 375554a0. PMID  7791872. S2CID  4347807.
  18. ^ Emerson SD, Madison VS, Palermo RE, Waugh DS, Scheffler JE, Tsao KL, Kiefer SE, Liu SP, Fry DC (květen 1995). "Struktura řešení vazebné domény Ras c-Raf-1 a identifikace jejího povrchu interakce Ras". Biochemie. 34 (21): 6911–8. doi:10.1021 / bi00021a001. PMID  7766599.
  19. ^ Moodie SA, Willumsen BM, Weber MJ, Wolfman A (červen 1993). "Komplexy Ras.GTP s Raf-1 a mitogenem aktivovanou protein kinázou kinázy". Věda. 260 (5114): 1658–61. Bibcode:1993Sci ... 260,1658 mil. doi:10.1126 / science.8503013. PMID  8503013.
  20. ^ Mott HR, Carpenter JW, Zhong S, Ghosh S, Bell RM, Campbell SL (srpen 1996). „Struktura řešení domény bohaté na cystein Raf-1: nové vazebné místo pro ras a fosfolipidy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (16): 8312–7. Bibcode:1996PNAS ... 93,8312 mil. doi:10.1073 / pnas.93.16.8312. PMC  38667. PMID  8710867.
  21. ^ A b Daub M, Jöckel J, Quack T, Weber CK, Schmitz F, Rapp UR, Wittinghofer A, blok C (listopad 1998). „Doména bohatá na cysteiny RafC1 obsahuje několik odlišných regulačních epitopů, které řídí aktivaci Raf závislou na Ras“. Mol. Buňka. Biol. 18 (11): 6698–710. doi:10.1128 / mcb.18.11.6698. PMC  109253. PMID  9774683.
  22. ^ A b Yin X, Zafrullah M, Lee H, Haimovitz-Friedman A, Fuks Z, Kolesnick R (2009). „Doména C1 vázající ceramid zprostředkovává kinázový supresor translokace membrány ras“. Buňka. Physiol. Biochem. 24 (3–4): 219–30. doi:10.1159/000233248. PMC  2978518. PMID  19710537.
  23. ^ Kraft CA, Garrido JL, Fluharty E, Leiva-Vega L, Romero G (prosinec 2008). „Role kyseliny fosfatidové ve vazbě kaskády ERK“. J. Biol. Chem. 283 (52): 36636–45. doi:10,1074 / jbc.M804633200. PMC  2606017. PMID  18952605.
  24. ^ Brtva TR, Drugan JK, Ghosh S, Terrell RS, Campbell-Burk S, Bell RM, Der CJ (duben 1995). „Dvě odlišné domény Raf zprostředkovávají interakci s Rasem“. J. Biol. Chem. 270 (17): 9809–12. doi:10.1074 / jbc.270.17.9809. PMID  7730360.
  25. ^ A b Cutler RE, Stephens RM, Saracino MR, Morrison DK (srpen 1998). "Autoregulace serin / threonin kinázy Raf-1". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (16): 9214–9. Bibcode:1998PNAS ... 95.9214C. doi:10.1073 / pnas.95.16.9214. PMC  21318. PMID  9689060.
  26. ^ Hmitou I, Druillennec S, Valluet A, Peyssonnaux C, Eychène A (leden 2007). „Diferenciální regulace izoforem B-raf pomocí fosforylace a autoinhibičních mechanismů“. Mol. Buňka. Biol. 27 (1): 31–43. doi:10.1128 / MCB.01265-06. PMC  1800654. PMID  17074813.
  27. ^ A b Hatzivassiliou G, Song K, Yen I, Brandhuber BJ, Anderson DJ, Alvarado R, Ludlam MJ, Stokoe D, Gloor SL, Vigers G, Morales T, Aliagas I, Liu B, Sideris S, Hoeflich KP, Jaiswal BS, Seshagiri S , Koeppen H, Belvin M, Friedman LS, Malek S (březen 2010). „Inhibitory RAF připravují divoký typ RAF k aktivaci dráhy MAPK a zvýšení růstu“. Příroda. 464 (7287): 431–5. Bibcode:2010Natur.464..431H. doi:10.1038 / nature08833. PMID  20130576.
  28. ^ Wan PT, Garnett MJ, Roe SM, Lee S, Niculescu-Duvaz D, Good VM, Jones CM, Marshall CJ, Springer CJ, Barford D, Marais R (březen 2004). „Mechanismus aktivace signální dráhy RAF-ERK onkogenními mutacemi B-RAF“. Buňka. 116 (6): 855–67. doi:10.1016 / S0092-8674 (04) 00215-6. PMID  15035987. S2CID  126161.
  29. ^ Mark GE, MacIntyre RJ, Digan ME, Ambrosio L, Perrimon N (červen 1987). „Homology Drosophila melanogaster z raf onkogenu“. Mol. Buňka. Biol. 7 (6): 2134–40. doi:10,1128 / mcb. 7.6.2134. PMC  365335. PMID  3037346.
  30. ^ Chong H, Vikis HG, Guan KL (květen 2003). "Mechanismy regulace rodiny kináz Raf." Buňka. Signál. 15 (5): 463–9. doi:10.1016 / S0898-6568 (02) 00139-0. PMID  12639709.
  31. ^ Koveal D, Schuh-Nuhfer N, Ritt D, Page R, Morrison DK, Peti W (prosinec 2012). „CC-SAM, pro stočený cívkový sterilní α motiv, doména cílí lešení KSR-1 na specifická místa v plazmatické membráně“. Sci signál. 5 (255): ra94. doi:10.1126 / scisignal.2003289. PMC  3740349. PMID  23250398.
  32. ^ Hu J, Yu H, Kornev AP, Zhao J, Filbert EL, Taylor SS, Shaw AS (duben 2011). „Mutace, která blokuje vazbu ATP, vytváří pseudokinázu stabilizující funkci lešení potlačujícího kinázu Ras, CRAF a BRAF“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 108 (15): 6067–72. Bibcode:2011PNAS..108,6067H. doi:10.1073 / pnas.1102554108. PMC  3076888. PMID  21441104.
  33. ^ A b C Brennan DF, Dar AC, Hertz NT, Chao WC, Burlingame AL, Shokat KM, Barford D (duben 2011). „Alosterický přechod KSR indukovaný Raf stimuluje fosforylaci MEK“. Příroda. 472 (7343): 366–9. Bibcode:2011Natur.472..366B. doi:10.1038 / nature09860. PMID  21441910. S2CID  18818.
  34. ^ Ortner E, Moelling K (říjen 2007). „Heteromerní tvorba komplexu ASK2 a ASK1 reguluje stresem indukovanou signalizaci“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 362 (2): 454–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.08.006. PMID  17714688.
  35. ^ A b Matallanas D, Birtwistle M, Romano D, Zebisch A, Rauch J, von Kriegsheim A, Kolch W (2011). „Rodinné kinázy Raf: staří psi se naučili nové triky“. Geny pro rakovinu. 2 (3): 232–60. doi:10.1177/1947601911407323. PMC  3128629. PMID  21779496.
  36. ^ A b Alexa A, Varga J, Reményi A (2010). "Lešení jsou 'aktivními' regulátory signalizačních modulů". FEBS J. 277 (21): 4376–82. doi:10.1111 / j.1742-4658.2010.07867.x. PMID  20883493.
  37. ^ Terai K, Matsuda M (březen 2005). „Vazba Ras otevírá c-Raf a odhaluje dokovací místo pro mitogenem aktivovanou proteinkinázu kinázu“. EMBO Rep. 6 (3): 251–5. doi:10.1038 / sj.embor.7400349. PMC  1299259. PMID  15711535.
  38. ^ Liu D, Bienkowska J, Petosa C, Collier RJ, Fu H, Liddington R (červenec 1995). "Krystalová struktura zeta izoformy proteinu 14-3-3". Příroda. 376 (6536): 191–4. Bibcode:1995 Natur.376..191L. doi:10.1038 / 376191a0. PMID  7603574. S2CID  4366970.
  39. ^ Fischer A, Baljuls A, Reinders J, Nekhoroshkova E, Sibilski C, Metz R, Albert S, Rajalingam K, Hekman M, Rapp UR (leden 2009). „Regulace aktivity RAF proteiny 14-3-3: kinázy RAF se funkčně sdružují s homo- i heterodimerními formami proteinů 14-3-3“. J. Biol. Chem. 284 (5): 3183–94. doi:10,1074 / jbc.M804795200. PMID  19049963.
  40. ^ Rodriguez-Viciana P, Oses-Prieto J, Burlingame A, Fried M, McCormick F (duben 2006). „Fosfatázový holoenzym složený z Shoc2 / Sur8 a katalytická podjednotka PP1 funguje jako M-Ras efektor pro modulaci aktivity Raf.“ Mol. Buňka. 22 (2): 217–30. doi:10.1016 / j.molcel.2006.03.027. PMID  16630891.
  41. ^ Jaumot M, Hancock JF (červenec 2001). „Proteinové fosfatázy 1 a 2A podporují aktivaci Raf-1 regulací interakcí 14-3-3“. Onkogen. 20 (30): 3949–58. doi:10.1038 / sj.onc.1204526. PMID  11494123. S2CID  8800975.
  42. ^ Tzivion G, Luo Z, Avruch J (červenec 1998). „Dimerní protein 14-3-3 je nezbytným kofaktorem pro aktivitu kinázy Raf.“ Příroda. 394 (6688): 88–92. Bibcode:1998 Natur.394 ... 88T. doi:10.1038/27938. PMID  9665134. S2CID  204998340.
  43. ^ Molzan M, Ottmann C (listopad 2012). „Synergická vazba fosforylovaných vazebných míst S233- a S259 C-RAF na jeden 14-3-3ζ dimer“. J. Mol. Biol. 423 (4): 486–95. doi:10.1016 / j.jmb.2012.08.009. PMID  22922483.
  44. ^ McKay MM, Freeman AK, Morrison DK (2011). "Složitost funkce KSR odhalena studiemi inhibitoru Raf a KSR". Malé GTPasy. 2 (5): 276–281. doi:10,4161 / sgtp.2.5.17740. PMC  3265819. PMID  22292131.
  45. ^ Chong H, Guan KL (září 2003). „Regulace Raf prostřednictvím fosforylace a interakce N-konec-C“. J. Biol. Chem. 278 (38): 36269–76. doi:10,1074 / jbc.M212803200. PMID  12865432.
  46. ^ Shi F, Lemmon MA (květen 2011). „Biochemie. KSR hraje CRAF-ty“. Věda. 332 (6033): 1043–4. Bibcode:2011Sci ... 332.1043S. doi:10.1126 / science.1208063. PMID  21617065. S2CID  38639290.
  47. ^ Ye DZ, Jin S, Zhuo Y, Field J (2011). Bauer JA (ed.). „p21-aktivovaná kináza 1 (Pak1) fosforyluje BAD přímo na serinu 111 in vitro a nepřímo prostřednictvím Raf-1 na serinu 112“. PLOS ONE. 6 (11): e27637. Bibcode:2011PLoSO ... 627637Y. doi:10.1371 / journal.pone.0027637. PMC  3214075. PMID  22096607.
  48. ^ Ding Q, Gros R, Gray ID, Taussig R, Ferguson SS, Feldman RD (říjen 2004). „Raf kinázová aktivace adenylylcykláz: selektivní regulace podle izoforem“. Mol. Pharmacol. 66 (4): 921–8. doi:10,1124 / mol 66,6,921. PMID  15385642. S2CID  9876605.
  49. ^ Broustas CG, Grammatikakis N, Eto M, Dent P, Brautigan DL, Kasid U (leden 2002). "Fosforylace myosin vázající podjednotky myosin fosfatázy pomocí Raf-1 a inhibice aktivity fosfatázy". J. Biol. Chem. 277 (4): 3053–9. doi:10,1074 / jbc.M106343200. PMID  11719507.
  50. ^ Pfleiderer P, Sumandea MP, Rybin VO, Wang C, Steinberg SF (2009). „Raf-1: nová srdeční troponinová T kináza“. J. Muscle Res. Buňka. Motil. 30 (1–2): 67–72. doi:10.1007 / s10974-009-9176-r. PMC  2893395. PMID  19381846.
  51. ^ Hindley A, Kolch W (duben 2002). „Extracelulární signální funkce regulovaná kinázou (ERK) / mitogenem aktivovanou proteinovou kinázou (MAPK) Raf kináz“. J. Cell Sci. 115 (Pt 8): 1575–81. PMID  11950876.
  52. ^ Catling AD, Schaeffer HJ, Reuter CW, Reddy GR, Weber MJ (říjen 1995). „Pro vázání rafů je nutná sekvence bohatá na prolin jedinečná pro MEK1 a MEK2 a reguluje funkci MEK.“. Mol. Buňka. Biol. 15 (10): 5214–25. doi:10,1128 / mcb.15.10.5214. PMC  230769. PMID  7565670.
  53. ^ Pandit B, Sarkozy A, Pennacchio LA, Carta C, Oishi K, Martinelli S, Pogna EA, Schackwitz W, Ustaszewska A, Landstrom A, Bos JM, Ommen SR, Esposito G, Lepri F, Faul C, Mundel P, López Siguero JP, Tenconi R, Selicorni A, Rossi C, Mazzanti L, Torrente I, Marino B, Digilio MC, Zampino G, Ackerman MJ, Dallapiccola B, Tartaglia M, Gelb BD (srpen 2007). „Zisk funkce mutací RAF1 způsobuje Noonan a LEOPARD syndromy s hypertrofickou kardiomyopatií“. Nat. Genet. 39 (8): 1007–12. doi:10.1038 / ng2073. PMID  17603483. S2CID  19335210.
  54. ^ Molzan M, Schumacher B, Ottmann C, Baljuls A, Polzien L, Weyand M, Thiel P, Rose R, Rose M, Kuhenne P, Kaiser M, Rapp UR, Kuhlmann J, Ottmann C (říjen 2010). „Narušená vazba 14-3-3 na C-RAF u Noonanova syndromu naznačuje nové přístupy u onemocnění se zvýšenou signalizací Ras“. Mol. Buňka. Biol. 30 (19): 4698–711. doi:10.1128 / MCB.01636-09. PMC  2950525. PMID  20679480.
  55. ^ Storm SM, Rapp UR (duben 1993). „Aktivace onkogenu: mutace genu c-raf-1 v experimentálních a přirozeně se vyskytujících nádorech“. Toxicol. Lett. 67 (1–3): 201–10. doi:10.1016/0378-4274(93)90056-4. PMID  8451761.
  56. ^ Zebisch A, Staber PB, Delavar A, Bodner C, Hiden K, Fischereder K, Janakiraman M, Linkesch W, Auner HW, Emberger W, Windpassinger C, Schimek MG, Hoefler G, Troppmair J, Sill H (duben 2006). „Dvě transformující zárodečné linie mutace C-RAF identifikované u pacientů s akutní myeloidní leukémií související s léčbou“. Cancer Res. 66 (7): 3401–8. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0115. PMID  16585161.
  57. ^ Emuss V, Garnett M, Mason C, Marais R (listopad 2005). „Mutace C-RAF jsou u lidské rakoviny vzácné, protože C-RAF má nízkou bazální kinázovou aktivitu ve srovnání s B-RAF“. Cancer Res. 65 (21): 9719–26. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-1683. PMID  16266992.
  58. ^ Forbes SA, Bindal N, Bamford S, Cole C, Kok CY, Beare D, Jia M, Shepherd R, Leung K, Menzies A, Teague JW, Campbell PJ, Stratton MR, Futreal PA (leden 2011). "COSMIC: těžba kompletních genomů rakoviny v katalogu somatických mutací v rakovině". Nucleic Acids Res. 39 (Problém s databází): D945–50. doi:10.1093 / nar / gkq929. PMC  3013785. PMID  20952405.
  59. ^ Capper D, Berghoff AS, Magerle M, Ilhan A, Wöhrer A, Hackl M, Pichler J, Pusch S, Meyer J, Habel A, Petzelbauer P, Birner P, von Deimling A, Preusser M (2012). „Imunohistochemické testování stavu BRAF V600E u 1120 vzorků nádorové tkáně pacientů s mozkovými metastázami“. Acta Neuropathol. 123 (2): 223–33. doi:10.1007 / s00401-011-0887-r. PMID  22012135. S2CID  35623183.
  60. ^ Capper D, Preusser M, Habel A, Sahm F, Ackermann U, Schindler G, Pusch S, Mechtersheimer G, Zentgraf H, von Deimling A (2011). "Hodnocení stavu mutace BRAF V600E pomocí imunohistochemie s monoklonální protilátkou specifickou pro mutaci". Acta Neuropathol. 122 (1): 11–9. doi:10.1007 / s00401-011-0841-z. PMID  21638088. S2CID  25647782.
  61. ^ Tran NH, Wu X, Frost JA (duben 2005). „B-Raf a Raf-1 jsou regulovány odlišnými autoregulačními mechanismy“. J. Biol. Chem. 280 (16): 16244–53. doi:10,1074 / jbc.M501185200. PMID  15710605.
  62. ^ Garnett MJ, Rana S, Paterson H, Barford D, Marais R (prosinec 2005). "Divoký typ a mutantní B-RAF aktivují C-RAF prostřednictvím odlišných mechanismů zahrnujících heterodimerizaci". Mol. Buňka. 20 (6): 963–9. doi:10.1016 / j.molcel.2005.10.022. PMID  16364920.
  63. ^ Maurer G, Tarkowski B, Baccarini M (srpen 2011). „Raf kinázy v roli rakoviny a terapeutické příležitosti“. Onkogen. 30 (32): 3477–88. doi:10.1038 / dne 2011.160. PMID  21577205.
  64. ^ Kim DH, Sim T (březen 2012). "Nové inhibitory kinázy Raf s malou molekulou pro cílená léčení rakoviny". Oblouk. Pharm. Res. 35 (4): 605–15. doi:10.1007 / s12272-012-0403-5. PMID  22553052. S2CID  26714490.
  65. ^ Zimmermann S, Moelling K (listopad 1999). "Fosforylace a regulace Raf pomocí Akt (protein kináza B)". Věda. 286 (5445): 1741–4. doi:10.1126 / science.286.5445.1741. PMID  10576742.
  66. ^ Chen J, Fujii K, Zhang L, Roberts T, Fu H (červenec 2001). „Raf-1 podporuje přežití buněk antagonizací kinázy 1 regulující signál apoptózy prostřednictvím mechanismu nezávislého na MEK-ERK“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (14): 7783–8. Bibcode:2001PNAS ... 98.7783C. doi:10.1073 / pnas.141224398. PMC  35419. PMID  11427728.
  67. ^ Wang HG, Takayama S, Rapp UR, Reed JC (červenec 1996). „Protein interagující s Bcl-2, BAG-1, se váže na kinázu Raf-1 a aktivuje ji“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (14): 7063–8. Bibcode:1996PNAS ... 93,7063W. doi:10.1073 / pnas.93.14.7063. PMC  38936. PMID  8692945.
  68. ^ Weber CK, Slupsky JR, Kalmes HA, Rapp UR (květen 2001). "Aktivní Ras indukuje heterodimerizaci cRaf a BRaf". Cancer Res. 61 (9): 3595–8. PMID  11325826.
  69. ^ Wang HG, Rapp UR, Reed JC (listopad 1996). „Bcl-2 cílí na proteinovou kinázu Raf-1 do mitochondrií“. Buňka. 87 (4): 629–38. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81383-5. PMID  8929532. S2CID  16559750.
  70. ^ Galaktionov K, Jessus C, Beach D (May 1995). "Raf1 interaction with Cdc25 phosphatase ties mitogenic signal transduction to cell cycle activation". Genes Dev. 9 (9): 1046–58. doi:10.1101/gad.9.9.1046. PMID  7744247.
  71. ^ Huang TS, Shu CH, Yang WK, Whang-Peng J (July 1997). "Activation of CDC 25 phosphatase and CDC 2 kinase involved in GL331-induced apoptosis". Cancer Res. 57 (14): 2974–8. PMID  9230211.
  72. ^ Kataoka T, Budd RC, Holler N, Thome M, Martinon F, Irmler M, Burns K, Hahne M, Kennedy N, Kovacsovics M, Tschopp J (June 2000). "The caspase-8 inhibitor FLIP promotes activation of NF-kappaB and Erk signaling pathways". Curr. Biol. 10 (11): 640–8. doi:10.1016/s0960-9822(00)00512-1. PMID  10837247. S2CID  14819939.
  73. ^ A b Cleghon V, Morrison DK (July 1994). "Raf-1 interacts with Fyn and Src in a non-phosphotyrosine-dependent manner". J. Biol. Chem. 269 (26): 17749–55. PMID  7517401.
  74. ^ Nantel A, Huber M, Thomas DY (December 1999). "Localization of endogenous Grb10 to the mitochondria and its interaction with the mitochondrial-associated Raf-1 pool". J. Biol. Chem. 274 (50): 35719–24. doi:10.1074/jbc.274.50.35719. PMID  10585452.
  75. ^ Nantel A, Mohammad-Ali K, Sherk J, Posner BI, Thomas DY (April 1998). "Interaction of the Grb10 adapter protein with the Raf1 and MEK1 kinases". J. Biol. Chem. 273 (17): 10475–84. doi:10.1074/jbc.273.17.10475. PMID  9553107.
  76. ^ Stang S, Bottorff D, Stone JC (červen 1997). „Interakce aktivovaného Ras se samotným Raf-1 může být dostatečná pro transformaci buněk potkana2“. Mol. Buňka. Biol. 17 (6): 3047–55. doi:10.1128 / MCB.17.6.3047. PMC  232157. PMID  9154803.
  77. ^ Germani A, Prabel A, Mourah S, Podgorniak MP, Di Carlo A, Ehrlich R, Gisselbrecht S, Varin-Blank N, Calvo F, Bruzzoni-Giovanelli H (December 2003). "SIAH-1 interacts with CtIP and promotes its degradation by the proteasome pathway". Onkogen. 22 (55): 8845–51. doi:10.1038/sj.onc.1206994. PMID  14654780.
  78. ^ Mitin NY, Ramocki MB, Zullo AJ, Der CJ, Konieczny SF, Taparowsky EJ (May 2004). "Identification and characterization of rain, a novel Ras-interacting protein with a unique subcellular localization". J. Biol. Chem. 279 (21): 22353–61. doi:10.1074/jbc.M312867200. PMID  15031288.
  79. ^ Vargiu P, De Abajo R, Garcia-Ranea JA, Valencia A, Santisteban P, Crespo P, Bernal J (January 2004). "The small GTP-binding protein, Rhes, regulates signal transduction from G protein-coupled receptors". Onkogen. 23 (2): 559–68. doi:10.1038/sj.onc.1207161. PMID  14724584.
  80. ^ A b Yuryev A, Wennogle LP (February 2003). "Novel raf kinase protein-protein interactions found by an exhaustive yeast two-hybrid analysis". Genomika. 81 (2): 112–25. doi:10.1016/s0888-7543(02)00008-3. PMID  12620389.
  81. ^ A b C d Li W, Han M, Guan KL (April 2000). "The leucine-rich repeat protein SUR-8 enhances MAP kinase activation and forms a complex with Ras and Raf". Genes Dev. 14 (8): 895–900. PMC  316541. PMID  10783161.
  82. ^ A b Kiyono M, Kato J, Kataoka T, Kaziro Y, Satoh T (September 2000). "Stimulation of Ras guanine nucleotide exchange activity of Ras-GRF1/CDC25(Mm) upon tyrosine phosphorylation by the Cdc42-regulated kinase ACK1". J. Biol. Chem. 275 (38): 29788–93. doi:10.1074/jbc.M001378200. PMID  10882715.
  83. ^ Janoueix-Lerosey I, Pasheva E, de Tand MF, Tavitian A, de Gunzburg J (March 1998). "Identification of a specific effector of the small GTP-binding protein Rap2". Eur. J. Biochem. 252 (2): 290–8. doi:10.1046/j.1432-1327.1998.2520290.x. PMID  9523700.
  84. ^ Boettner B, Govek EE, Cross J, Van Aelst L (August 2000). "The junctional multidomain protein AF-6 is a binding partner of the Rap1A GTPase and associates with the actin cytoskeletal regulator profilin". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (16): 9064–9. Bibcode:2000PNAS...97.9064B. doi:10.1073/pnas.97.16.9064. PMC  16822. PMID  10922060.
  85. ^ Karbowniczek M, Robertson GP, Henske EP (September 2006). "Rheb inhibits C-raf activity and B-raf/C-raf heterodimerization". J. Biol. Chem. 281 (35): 25447–56. doi:10.1074/jbc.M605273200. PMID  16803888.
  86. ^ A b Han L, Colicelli J (March 1995). "A human protein selected for interference with Ras function interacts directly with Ras and competes with Raf1". Mol. Buňka. Biol. 15 (3): 1318–23. doi:10.1128/mcb.15.3.1318. PMC  230355. PMID  7862125.
  87. ^ Jelinek T, Catling AD, Reuter CW, Moodie SA, Wolfman A, Weber MJ (December 1994). "RAS and RAF-1 form a signalling complex with MEK-1 but not MEK-2". Mol. Buňka. Biol. 14 (12): 8212–8. doi:10.1128/mcb.14.12.8212. PMC  359360. PMID  7969158.
  88. ^ Romero F, Martínez-A C, Camonis J, Rebollo A (June 1999). "Aiolos transcription factor controls cell death in T cells by regulating Bcl-2 expression and its cellular localization". EMBO J.. 18 (12): 3419–30. doi:10.1093/emboj/18.12.3419. PMC  1171421. PMID  10369681.
  89. ^ Morcos P, Thapar N, Tusneem N, Stacey D, Tamanoi F (May 1996). "Identification of neurofibromin mutants that exhibit allele specificity or increased Ras affinity resulting in suppression of activated ras alleles". Mol. Buňka. Biol. 16 (5): 2496–503. doi:10.1128/mcb.16.5.2496. PMC  231238. PMID  8628317.
  90. ^ Hu CD, Kariya K, Tamada M, Akasaka K, Shirouzu M, Yokoyama S, Kataoka T (December 1995). "Cysteine-rich region of Raf-1 interacts with activator domain of post-translationally modified Ha-Ras". J. Biol. Chem. 270 (51): 30274–7. doi:10.1074/jbc.270.51.30274. PMID  8530446.
  91. ^ Rodriguez-Viciana P, Warne PH, Khwaja A, Marte BM, Pappin D, Das P, Waterfield MD, Ridley A, Downward J (May 1997). "Role of phosphoinositide 3-OH kinase in cell transformation and control of the actin cytoskeleton by Ras". Buňka. 89 (3): 457–67. doi:10.1016/s0092-8674(00)80226-3. PMID  9150145. S2CID  14459536.
  92. ^ Huang YZ, Zang M, Xiong WC, Luo Z, Mei L (January 2003). "Erbin suppresses the MAP kinase pathway". J. Biol. Chem. 278 (2): 1108–14. doi:10.1074/jbc.M205413200. PMID  12379659.
  93. ^ A b Dogan T, Harms GS, Hekman M, Karreman C, Oberoi TK, Alnemri ES, Rapp UR, Rajalingam K (December 2008). "X-linked and cellular IAPs modulate the stability of C-RAF kinase and cell motility". Nat. Cell Biol. 10 (12): 1447–55. doi:10.1038/ncb1804. PMID  19011619. S2CID  6553549.
  94. ^ Stancato LF, Chow YH, Hutchison KA, Perdew GH, Jove R, Pratt WB (October 1993). "Raf exists in a native heterocomplex with hsp90 and p50 that can be reconstituted in a cell-free system". J. Biol. Chem. 268 (29): 21711–6. PMID  8408024.
  95. ^ A b C Yeung K, Janosch P, McFerran B, Rose DW, Mischak H, Sedivy JM, Kolch W (květen 2000). "Mechanismus potlačení dráhy Raf / MEK / extracelulárního signálu regulované kinázy proteinem inhibitoru raf kinázy". Mol. Buňka. Biol. 20 (9): 3079–85. doi:10,1128 / mcb. 20.9.3079-3085.2000. PMC  85596. PMID  10757792.
  96. ^ Karandikar M, Xu S, Cobb MH (prosinec 2000). „MEKK1 váže raf-1 a kaskádové komponenty ERK2“. J. Biol. Chem. 275 (51): 40120–7. doi:10,1074 / jbc.M005926200. PMID  10969079.
  97. ^ English JM, Pearson G, Hockenberry T, Shivakumar L, White MA, Cobb MH (October 1999). "Contribution of the ERK5/MEK5 pathway to Ras/Raf signaling and growth control". J. Biol. Chem. 274 (44): 31588–92. doi:10.1074/jbc.274.44.31588. PMID  10531364.
  98. ^ Kuboki Y, Ito M, Takamatsu N, Yamamoto KI, Shiba T, Yoshioka K (December 2000). "A scaffold protein in the c-Jun NH2-terminal kinase signaling pathways suppresses the extracellular signal-regulated kinase signaling pathways". J. Biol. Chem. 275 (51): 39815–8. doi:10.1074/jbc.C000403200. PMID  11044439.
  99. ^ Ito M, Yoshioka K, Akechi M, Yamashita S, Takamatsu N, Sugiyama K, Hibi M, Nakabeppu Y, Shiba T, Yamamoto KI (November 1999). "JSAP1, a novel jun N-terminal protein kinase (JNK)-binding protein that functions as a Scaffold factor in the JNK signaling pathway". Mol. Buňka. Biol. 19 (11): 7539–48. doi:10.1128/mcb.19.11.7539. PMC  84763. PMID  10523642.
  100. ^ Zang M, Hayne C, Luo Z (February 2002). "Interaction between active Pak1 and Raf-1 is necessary for phosphorylation and activation of Raf-1". J. Biol. Chem. 277 (6): 4395–405. doi:10.1074/jbc.M110000200. PMID  11733498.
  101. ^ A b Wang S, Nath N, Fusaro G, Chellappan S (November 1999). "Rb and prohibitin target distinct regions of E2F1 for repression and respond to different upstream signals". Mol. Buňka. Biol. 19 (11): 7447–60. doi:10.1128/mcb.19.11.7447. PMC  84738. PMID  10523633.
  102. ^ A b C d E F Van Der Hoeven PC, Van Der Wal JC, Ruurs P, Van Dijk MC, Van Blitterswijk J (January 2000). "14-3-3 isotypes facilitate coupling of protein kinase C-zeta to Raf-1: negative regulation by 14-3-3 phosphorylation". Biochem. J. 345 (2): 297–306. doi:10.1042/0264-6021:3450297. PMC  1220759. PMID  10620507.
  103. ^ Hu CD, Kariya K, Okada T, Qi X, Song C, Kataoka T (January 1999). "Effect of phosphorylation on activities of Rap1A to interact with Raf-1 and to suppress Ras-dependent Raf-1 activation". J. Biol. Chem. 274 (1): 48–51. doi:10.1074/jbc.274.1.48. PMID  9867809.
  104. ^ Okada T, Hu CD, Jin TG, Kariya K, Yamawaki-Kataoka Y, Kataoka T (September 1999). "The strength of interaction at the Raf cysteine-rich domain is a critical determinant of response of Raf to Ras family small GTPases". Mol. Buňka. Biol. 19 (9): 6057–64. doi:10.1128/mcb.19.9.6057. PMC  84512. PMID  10454553.
  105. ^ Long X, Lin Y, Ortiz-Vega S, Yonezawa K, Avruch J (April 2005). "Rheb binds and regulates the mTOR kinase". Curr. Biol. 15 (8): 702–13. doi:10.1016/j.cub.2005.02.053. PMID  15854902. S2CID  3078706.
  106. ^ Karbowniczek M, Cash T, Cheung M, Robertson GP, Astrinidis A, Henske EP (July 2004). "Regulation of B-Raf kinase activity by tuberin and Rheb is mammalian target of rapamycin (mTOR)-independent". J. Biol. Chem. 279 (29): 29930–7. doi:10.1074/jbc.M402591200. PMID  15150271.
  107. ^ Yee WM, Worley PF (February 1997). "Rheb interacts with Raf-1 kinase and may function to integrate growth factor- and protein kinase A-dependent signals". Mol. Buňka. Biol. 17 (2): 921–33. doi:10.1128/mcb.17.2.921. PMC  231818. PMID  9001246.
  108. ^ Movilla N, Crespo P, Bustelo XR (October 1999). "Signal transduction elements of TC21, an oncogenic member of the R-Ras subfamily of GTP-binding proteins". Onkogen. 18 (43): 5860–9. doi:10.1038/sj.onc.1202968. PMID  10557073.
  109. ^ A b Wang S, Ghosh RN, Chellappan SP (December 1998). "Raf-1 physically interacts with Rb and regulates its function: a link between mitogenic signaling and cell cycle regulation". Mol. Buňka. Biol. 18 (12): 7487–98. doi:10.1128/mcb.18.12.7487. PMC  109329. PMID  9819434.
  110. ^ Ayroldi E, Zollo O, Macchiarulo A, Di Marco B, Marchetti C, Riccardi C (November 2002). "Glucocorticoid-induced leucine zipper inhibits the Raf-extracellular signal-regulated kinase pathway by binding to Raf-1". Mol. Buňka. Biol. 22 (22): 7929–41. doi:10.1128/mcb.22.22.7929-7941.2002. PMC  134721. PMID  12391160.
  111. ^ Truong AB, Masters SC, Yang H, Fu H (November 2002). "Role of the 14-3-3 C-terminal loop in ligand interaction". Proteiny. 49 (3): 321–5. doi:10.1002/prot.10210. PMID  12360521.
  112. ^ Yuryev A, Ono M, Goff SA, Macaluso F, Wennogle LP (July 2000). "Isoform-specific localization of A-RAF in mitochondria". Mol. Buňka. Biol. 20 (13): 4870–8. doi:10.1128/mcb.20.13.4870-4878.2000. PMC  85938. PMID  10848612.
  113. ^ A b C Vincenz C, Dixit VM (August 1996). "14-3-3 proteins associate with A20 in an isoform-specific manner and function both as chaperone and adapter molecules". J. Biol. Chem. 271 (33): 20029–34. doi:10.1074/jbc.271.33.20029. PMID  8702721.
  114. ^ A b Conklin DS, Galaktionov K, Beach D (August 1995). "14-3-3 proteins associate with cdc25 phosphatases". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (17): 7892–6. Bibcode:1995PNAS...92.7892C. doi:10.1073/pnas.92.17.7892. PMC  41252. PMID  7644510.
  115. ^ A b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC  1847948. PMID  17353931.
  116. ^ Autieri MV, Carbone CJ (July 1999). "14-3-3Gamma interacts with and is phosphorylated by multiple protein kinase C isoforms in PDGF-stimulated human vascular smooth muscle cells". DNA Cell Biol. 18 (7): 555–64. doi:10.1089/104454999315105. PMID  10433554.
  117. ^ Ichimura T, Wakamiya-Tsuruta A, Itagaki C, Taoka M, Hayano T, Natsume T, Isobe T (April 2002). "Phosphorylation-dependent interaction of kinesin light chain 2 and the 14-3-3 protein". Biochemie. 41 (17): 5566–72. doi:10.1021/bi015946f. PMID  11969417.
  118. ^ Liu YC, Elly C, Yoshida H, Bonnefoy-Berard N, Altman A (June 1996). "Activation-modulated association of 14-3-3 proteins with Cbl in T cells". J. Biol. Chem. 271 (24): 14591–5. doi:10.1074/jbc.271.24.14591. PMID  8663231.
  119. ^ Clark GJ, Drugan JK, Rossman KL, Carpenter JW, Rogers-Graham K, Fu H, Der CJ, Campbell SL (August 1997). "14-3-3 zeta negatively regulates raf-1 activity by interactions with the Raf-1 cysteine-rich domain". J. Biol. Chem. 272 (34): 20990–3. doi:10.1074/jbc.272.34.20990. PMID  9261098.
  120. ^ Tzivion G, Luo ZJ, Avruch J (September 2000). "Calyculin A-induced vimentin phosphorylation sequesters 14-3-3 and displaces other 14-3-3 partners in vivo". J. Biol. Chem. 275 (38): 29772–8. doi:10.1074/jbc.M001207200. PMID  10887173.
  121. ^ Koyama S, Williams LT, Kikuchi A (July 1995). "Characterization of the interaction of Raf-1 with ras p21 or 14-3-3 protein in intact cells". FEBS Lett. 368 (2): 321–5. doi:10.1016/0014-5793(95)00686-4. PMID  7628630. S2CID  29625141.
  122. ^ Chow CW, Davis RJ (January 2000). "Integration of calcium and cyclic AMP signaling pathways by 14-3-3". Mol. Buňka. Biol. 20 (2): 702–12. doi:10.1128/MCB.20.2.702-712.2000. PMC  85175. PMID  10611249.

Další čtení

externí odkazy