E2F2 - E2F2

E2F2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1N4M
Identifikátory
Aliasy	E2F2, E2F-2, E2F transkripční faktor 2
Externí ID	OMIM: 600426 MGI: 1096341 HomoloGene: 48264 Genové karty: E2F2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	23,531,233 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	136,196,057 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita dimerizace bílkovin; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001158 promotor jádra promotoru vázaný na sekvenci proximální oblasti DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• regulace buněčného cyklu; • buněčný cyklus; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • apoptotický proces čočkových vláken; • vnitřní apoptotická signální cesta zprostředkovatelem třídy p53; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace klíčící angiogeneze; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1870
	242705
	ENSG00000007968; ENSG00000282899
	ENSMUSG00000018983
	Q14209
	P56931
	NM_004091
	NM_177733; NM_183301; NM_001305399
	NP_004082
	NP_001292328; NP_808401
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor E2F2 je protein že u lidí je kódován E2F2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny E2F transkripční faktory. Rodina E2F hraje při kontrole klíčovou roli buněčný cyklus a akce supresor nádoru proteiny a je také terčem transformujících se proteinů malých nádorových virů DNA. Proteiny E2F obsahují několik evolučně konzervovaných domén nalezených u většiny členů rodiny. Tyto domény zahrnují doménu vázající DNA, dimerizační doménu, která určuje interakci s proteiny diferenciačně regulovaného transkripčního faktoru (DP), transaktivační doménu obohacenou o kyselé aminokyseliny a doménu asociace tumor-supresorového proteinu, která je zabudována do transaktivační domény. Tento protein a další 2 členové, E2F1 a E2F3, mít další cyklin vazebná doména. Tento protein se váže konkrétně na retinoblastomový protein pRB způsobem závislým na buněčném cyklu a vykazuje celkově 46% aminokyselinovou identitu s E2F1.^[7]

Interakce

E2F2 bylo prokázáno komunikovat s:

Viz také

E2F

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000282899 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000007968, ENSG00000282899 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018983 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ivey-Hoyle M, Conroy R, Huber HE, Goodhart PJ, Oliff A, Heimbrook DC (leden 1994). „Klonování a charakterizace E2F-2, nového proteinu s biochemickými vlastnostmi transkripčního faktoru E2F“. Mol Cell Biol. 13 (12): 7802–12. doi:10.1128 / MCB.13.12.7802. PMC 364852. PMID 8246995.
^ Lees JA, Saito M, Vidal M, Valentine M, Look T, Harlow E, Dyson N, Helin K (leden 1994). „Protein retinoblastomu se váže na rodinu transkripčních faktorů E2F“. Mol Cell Biol. 13 (12): 7813–25. doi:10.1128 / mcb.13.12.7813. PMC 364853. PMID 8246996.
^ „Entrez Gene: E2F2 E2F transkripční faktor 2“.
^ Crowley TE, Kaine EM, Yoshida M, Nandi A, Wolgemuth DJ (srpen 2002). „Regulace reprodukčního cyklu jaderného importu, euchromatická lokalizace a asociace se složkami mediátoru Pol II savčího proteinu dvojité bromodomény“. Mol. Endokrinol. 16 (8): 1727–37. doi:10.1210 / me.2001-0353. PMID 12145330.
^ Denis GV, Vaziri C, Guo N, Faller DV (srpen 2000). „RING3 kináza transaktivuje promotory regulačních genů buněčného cyklu prostřednictvím E2F“. Růst buněk se liší. 11 (8): 417–24. PMC 3968681. PMID 10965846.
^ Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (listopad 2002). „Interakce YY1 s E2F zprostředkovaná RYBP poskytuje mechanismus pro specifičnost funkce E2F“. EMBO J.. 21 (21): 5775–86. doi:10.1093 / emboj / cdf577. PMC 131074. PMID 12411495.
^ Lee C, Chang JH, Lee HS, Cho Y (prosinec 2002). „Strukturální základna pro rozpoznávání transaktivační domény E2F supresorem nádoru retinoblastomu“. Genes Dev. 16 (24): 3199–212. doi:10.1101 / gad.1046102. PMC 187509. PMID 12502741.

Další čtení

Dyson N (1998). „Regulace E2F proteiny z rodiny pRB“. Genes Dev. 12 (15): 2245–62. doi:10.1101 / gad.12.15.2245. PMID 9694791.
Wu CL, Zukerberg LR, Ngwu C, Harlow E, Lees JA (1995). „In vivo asociace proteinů rodiny E2F a DP“. Mol. Buňka. Biol. 15 (5): 2536–46. doi:10,1128 / mcb.15.5.2536. PMC 230484. PMID 7739537.
Karlseder J, Rotheneder H, Wintersberger E (1996). „Interakce Sp1 s transkripčním faktorem E2F regulovaným růstovým a buněčným cyklem“. Mol. Buňka. Biol. 16 (4): 1659–67. doi:10,1128 / mcb.16.4.1659. PMC 231152. PMID 8657141.
Lin SY, Black AR, Kostic D, Pajovic S, Hoover CN, Azizkhan JC (1996). „Sdružení E2F1 a Sp1 regulované buněčným cyklem souvisí s jejich funkční interakcí“. Mol. Buňka. Biol. 16 (4): 1668–75. doi:10.1128 / MCB.16.4.1668. PMC 231153. PMID 8657142.
Rogers KT, Higgins PD, Milla MM, Phillips RS, Horowitz JM (1996). „DP-2, heterodimerní partner E2F: identifikace a charakterizace proteinů DP-2 exprimovaných in vivo“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (15): 7594–9. Bibcode:1996PNAS ... 93.7594R. doi:10.1073 / pnas.93.15.7594. PMC 38791. PMID 8755520.
Magae J, Wu CL, Illenye S, Harlow E, Heintz NH (1997). „Nukleární lokalizace transkripčních faktorů DP a E2F heterodimerními partnery a členy rodiny proteinů retinoblastomu“. J. Cell Sci. 109 (7): 1717–26. PMID 8832394.
Hofmann F, Livingston DM (1996). "Diferenciální účinky cdk2 a cdk3 na řízení funkcí pRb a E2F během výstupu z G1". Genes Dev. 10 (7): 851–61. doi:10,1101 / gad.10.7.851. PMID 8846921.
Lindeman GJ, Gaubatz S, Livingston DM, Ginsberg D (1997). „Subcelulární lokalizace E2F-4 je závislá na buněčném cyklu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (10): 5095–100. Bibcode:1997PNAS ... 94.5095L. doi:10.1073 / pnas.94.10.5095. PMC 24637. PMID 9144196.
Pierce AM, Schneider-Broussard R, Philhower JL, Johnson DG (1998). "Diferenciální aktivity členů rodiny E2F: jedinečné funkce při regulaci transkripce". Mol. Karcinogen. 22 (3): 190–8. doi:10.1002 / (SICI) 1098-2744 (199807) 22: 3 <190 :: AID-MC7> 3.0.CO; 2-P. PMID 9688145.
Halaban R, Cheng E, Smicun Y, Germino J (2000). „Deregulovaná transkripční aktivita E2F v autonomně rostoucích buňkách melanomu“. J. Exp. Med. 191 (6): 1005–16. doi:10.1084 / jem.191.6.1005. PMC 2193116. PMID 10727462.
Takahashi Y, Rayman JB, Dynlacht BD (2000). „Analýza vazby promotoru rodinami E2F a pRB in vivo: odlišné proteiny E2F zprostředkovávají aktivaci a represi“. Genes Dev. 14 (7): 804–16. doi:10,1101 / gad.14.7.804 (neaktivní 10. 9. 2020). PMC 316494. PMID 10766737.CS1 maint: DOI neaktivní od září 2020 (odkaz)
Denis GV, Vaziri C, Guo N, Faller DV (2001). „RING3 kináza transaktivuje promotory regulačních genů buněčného cyklu prostřednictvím E2F“. Růst buněk se liší. 11 (8): 417–24. PMC 3968681. PMID 10965846.
Wu L, Timmers C, Maiti B, Saavedra HI, Sang L, Chong GT, Nuckolls F, Giangrande P, Wright FA, Field SJ, Greenberg ME, Orkin S, Nevins JR, Robinson ML, Leone G (2001). „Transkripční faktory E2F1-3 jsou nezbytné pro buněčnou proliferaci“. Příroda. 414 (6862): 457–62. Bibcode:2001 Natur.414..457W. doi:10.1038/35106593. PMID 11719808. S2CID 3062825.
Yamochi T, Semba K, Tsuji K, Mizumoto K, Sato H, Matsuura Y, Nishimoto I, Matsuoka M (2002). „ik3-1 / Cables je substrát pro cyklin-dependentní kinázu 3 (cdk 3)“. Eur. J. Biochem. 268 (23): 6076–82. doi:10.1046 / j.0014-2956.2001.02555.x. PMID 11733001.
Weinmann AS, Yan PS, Oberley MJ, Huang TH, Farnham PJ (2002). „Izolace cílů lidského transkripčního faktoru spojením imunoprecipitace chromatinu a analýzy mikročipů na ostrově CpG“. Genes Dev. 16 (2): 235–44. doi:10,1101 / gad.943102. PMC 155318. PMID 11799066.
Crowley TE, Kaine EM, Yoshida M, Nandi A, Wolgemuth DJ (2003). „Regulace reprodukčního cyklu jaderného importu, euchromatická lokalizace a asociace se složkami mediátoru Pol II savčího proteinu dvojité bromodomény“. Mol. Endokrinol. 16 (8): 1727–37. doi:10.1210 / me.2001-0353. PMID 12145330.
Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (2002). „Interakce YY1 s E2F zprostředkovaná RYBP poskytuje mechanismus pro specifičnost funkce E2F“. EMBO J.. 21 (21): 5775–86. doi:10.1093 / emboj / cdf577. PMC 131074. PMID 12411495.

externí odkazy

E2F2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000282899 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000007968, ENSG00000282899 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018983 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8246995-5] Ivey-Hoyle M, Conroy R, Huber HE, Goodhart PJ, Oliff A, Heimbrook DC (leden 1994). „Klonování a charakterizace E2F-2, nového proteinu s biochemickými vlastnostmi transkripčního faktoru E2F“. Mol Cell Biol. 13 (12): 7802–12. doi:10.1128 / MCB.13.12.7802. PMC 364852. PMID 8246995.

[pmid8246996-6] Lees JA, Saito M, Vidal M, Valentine M, Look T, Harlow E, Dyson N, Helin K (leden 1994). „Protein retinoblastomu se váže na rodinu transkripčních faktorů E2F“. Mol Cell Biol. 13 (12): 7813–25. doi:10.1128 / mcb.13.12.7813. PMC 364853. PMID 8246996.

[entrez-7] „Entrez Gene: E2F2 E2F transkripční faktor 2“.

[pmid12145330-8] Crowley TE, Kaine EM, Yoshida M, Nandi A, Wolgemuth DJ (srpen 2002). „Regulace reprodukčního cyklu jaderného importu, euchromatická lokalizace a asociace se složkami mediátoru Pol II savčího proteinu dvojité bromodomény“. Mol. Endokrinol. 16 (8): 1727–37. doi:10.1210 / me.2001-0353. PMID 12145330.

[pmid10965846-9] Denis GV, Vaziri C, Guo N, Faller DV (srpen 2000). „RING3 kináza transaktivuje promotory regulačních genů buněčného cyklu prostřednictvím E2F“. Růst buněk se liší. 11 (8): 417–24. PMC 3968681. PMID 10965846.

[pmid12411495-10] Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (listopad 2002). „Interakce YY1 s E2F zprostředkovaná RYBP poskytuje mechanismus pro specifičnost funkce E2F“. EMBO J.. 21 (21): 5775–86. doi:10.1093 / emboj / cdf577. PMC 131074. PMID 12411495.

[pmid12502741-11] Lee C, Chang JH, Lee HS, Cho Y (prosinec 2002). „Strukturální základna pro rozpoznávání transaktivační domény E2F supresorem nádoru retinoblastomu“. Genes Dev. 16 (24): 3199–212. doi:10.1101 / gad.1046102. PMC 187509. PMID 12502741.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]