CEBPA - CEBPA - Wikipedia

CEBPA
Identifikátory
Aliasy	CEBPA, C / EBP-alfa, CEBP, CCAAT / zesilovač vázající protein alfa, CCAAT zesilovač vázající protein alfa
Externí ID	OMIM: 116897 MGI: 99480 HomoloGene: 3211 Genové karty: CEBPA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	33,302,534 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	35,121,928 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • transkripční faktor vazba; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • vazba kinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• komplex regulátoru transkripce; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II; • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • diferenciace myeloidních buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • buněčná odpověď na lithiový iont; • homeostáza glukózy; • negativní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy; • vývoj plic; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • močovinový cyklus; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na organickou cyklickou sloučeninu; • organizace mitochondrií; • vývoj embryonální placenty; • metabolický proces cholesterolu; • negativní regulace buněčného cyklu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • zrání buněk; • generace prekurzorových metabolitů a energie; • transkripce, chráněná DNA; • makrofágová diferenciace; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace diferenciace osteoblastů; • diferenciace granulocytů; • regulace buněčné proliferace; • diferenciace hnědých tukových buněk; • homeostáza lipidů; • diferenciace bílých tukových buněk; • vývoj vnitřního ucha; • vývoj jater; • GO: virový proces 0022415; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace diferenciace tukových buněk; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • diferenciace tukových buněk; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinu závislého na proteinu závislém na ubikvitinu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace buněčné proliferace; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • pozitivní regulace transkripce templátu DNA, iniciace; • pozitivní regulace aktivace makrofágů; • pozitivní regulace zánětlivé reakce; • interleukin-6 zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1050
	12606
	ENSG00000245848
	ENSMUSG00000034957
	P49715
	P53566
	NM_004364; NM_001285829; NM_001287424; NM_001287435
	NM_001287514; NM_001287515; NM_001287521; NM_001287523; NM_007678
	NP_001272758; NP_001274353; NP_001274364; NP_004355
	NP_001274443; NP_001274444; NP_001274450; NP_001274452; NP_031704
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CCAAT / protein vázající zesilovač alfa je protein kódováno CEBPA gen u lidí.^[5]^[6] CCAAT / protein vázající enhancer alfa je a transkripční faktor podílející se na rozlišení určitých krvinky.^[7] Podrobnosti o CCAAT strukturální motiv v zesilovače genů a na CCAAT / Enhancer Binding Proteins viz specifické strana.

Funkce

Tím kódovaný protein intronless gen je a bZIP transkripční faktor které se mohou vázat jako homodimer na určité promotéři a zesilovače genů. Může také tvořit heterodimery se souvisejícími proteiny CEBP-beta a CEBP-gama, stejně jako odlišné transkripční faktory, jako je c-červen. Kódovaný protein je klíčovým regulátorem adipogeneze (proces tvorby nových tukových buněk) a akumulace lipidů v těchto buňkách, stejně jako v metabolismu glukózy a lipidů v játrech.^[8] Ukázalo se, že protein se váže na promotor a moduluje expresi genu kódujícího leptin, protein, který hraje důležitou roli v homeostáze tělesné hmotnosti. S kódovaným proteinem může také interagovat CDK2 a CDK4, čímž je inhibuje kinázy a způsobí, že se kultivované buňky přestanou dělit.^[9] Kromě toho je CEBPA nezbytná pro myeloidní počet řádků, a proto je vyžadováno jak pro normální dospělé granulocyty formování a pro vývoj abnormálních Akutní myeloidní leukémie.^[10]

Společné mutace

Existují dvě hlavní kategorie, do kterých lze kategorizovat mutace CEBPA. Jedna kategorie mutací brání vazbě proteinu alfa DNA na CCAAT / zesilovač změnou jeho COOH-terminální základní domény leucinového zipu. Druhá kategorie mutací narušuje translaci proteinu alfa NH NH vázajícího se na CCAAT₂ konec. Mutace CEBPA, které vedou ke snížení aktivity alfa-proteinu vázajícího CCAAT / enhancer, přispívají k transformaci myeloidních předchůdců.^[11]

Interakce

CEBPA bylo prokázáno komunikovat s Cyklin-dependentní kináza 2^[12] a Cyklin-dependentní kináza 4.^[12]

Klinický význam

Ukázalo se, že mutace CEBPA byla spojena s dobrým výsledkem u dospělých i pediatrických pacientů Akutní myeloidní leukémie pacientů.^[13]

Význam při akutní myeloidní leukémii

Akutní myeloidní leukémie je charakterizována genetickými abnormalitami v hematopoetických progenitorech. To zahrnuje nadměrné šíření výbuchů a blokování krvetvorba z granulocyty. Ukázalo se, že potlačení exprese CEBPA a blokování proteinu alfa vázajícího CCAAT / enhancer zastavuje diferenciaci myeloidních progenitorů. Z tohoto důvodu je role alfa CCAAT / enhancer vázající protein alfa během diferenciace granulocytů a role CEBPA jako supresor nádoru gen je kriticky důležitý v prognóze akutní myeloidní leukémie.^[14]

Prognostický význam mutací CEBPA

CCAAT / protein vázající zesilovač alfa, the transkripční faktor který je kódován CEBPA, je velmi důležitý při diferenciaci nezralých granulocytů. Ukázalo se, že mutace genu CEBPA hraje klíčovou roli v leukemogenezi a prognóze u pacientů s akutní myeloidní leukémií. V nedávných studiích byly mutace CEBPA nalezeny u 7% až 15% pacientů s akutní myeloidní leukémií. Tři různé typy mutací pozorovaných u těchto pacientů s AML zahrnují N-koncovou mutaci zárodečné linie, N-koncovou mutace posunu snímků a C-terminální mutace. Tyto mutace se nejčastěji vyskytují u akutní myeloidní leukémie M1 nebo akutní myeloidní leukémie M2. Mnoho zpráv spojuje mutace CEBPA s příznivým výsledkem u akutní myeloidní leukémie. Je to proto, že tyto mutace pravděpodobně vyvolají diferenciace zatčení u těchto pacientů. Pacienti s mutacemi CEBPA mají delší dobu remise a dobu přežití než pacienti bez mutací.^[11] Proto je přítomnost mutací CEBPA přímo spojena s příznivějším průběhem progrese onemocnění.^[15]

Význam u solidních nádorů

Nedávno bylo prokázáno, že došlo k epigenetické modifikaci oblasti distálního promotoru CEBPA downregulace exprese CEBPA v buňkách rakoviny pankreatu, rakovině plic a hlavě a krku spinocelulární karcinom.^[16]^[17]

Metylace CEBPA jako prognostického biomarkeru u pacientů s AML

Nedávná studie zjistila, že vyšší úrovně CEBPA methylace jsou přímo úměrné reakci na léčbu. Míra úplné odpovědi se úměrně zvyšovala s úrovní methylace CEBPA. Z tohoto důvodu bylo navrženo, že methylace CEBPA může být velmi užitečná biomarker při akutní myeloidní leukémii prognóza.^[18]

Viz také

Ccaat-vazebné proteiny vázající

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000245848 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034957 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Szpirer C, Riviere M, Cortese R, Nakamura T, Islam MQ, Levan G, Szpirer J (červenec 1992). „Chromozomální lokalizace genů kódujících jaterně transkripční faktory C / EBP, DBP a HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP a transkripční faktor 1, TCF1) u člověka a potkana a růstový faktor hepatocytů / gen scatter factor (HGF) ". Genomika. 13 (2): 293–300. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-N. PMID 1535333.
^ Cao Z, Umek RM, McKnight SL (říjen 1991). „Regulovaná exprese tří izoforem C / EBP během tukové konverze buněk 3T3-L1“. Genes Dev. 5 (9): 1538–52. doi:10,1101 / gad. 5.9.1538. PMID 1840554.
^ „CEBPA“. Genetická domácí reference. 20. dubna 2016. Citováno 25. dubna 2016.
^ Olofsson LE, Orho-Melander M, William-Olsson L, Sjöholm K, Sjöström L, Groop L, Carlsson B, Carlsson LM, Olsson B (1. prosince 2009). „CCAAT / zesilovač vázající protein alfa (C / EBPalpha) v tukové tkáni reguluje geny v metabolismu lipidů a glukózy a genetická variace v C / EBPalpha je spojena se sérovými hladinami triglyceridů“. The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism. 93 (12): 4880–4886. doi:10.1210 / jc.2008-0574. PMID 18765514.
^ „Entrez Gene: CEBPA CCAAT / enhancer binding protein (C / EBP), alpha“.
^ Ohlsson E, Schuster MB, Hasemann M, Porse BT (duben 2016). „Mnohostranné funkce C / EBPalfa u normální a maligní hematopoézy“. Leukémie. 30 (4): 767–75. doi:10.1038 / leu.2015.324. PMID 26601784. S2CID 24767947.
^ ^A ^b Lin LI, Chen CY, Lin DT, Tsay W, Tang JL, Yeh YC a kol. (2005). ""Charakterizace mutací CEBPA u akutní myeloidní leukémie „většina pacientů s mutacemi CEBPA má bialelické mutace a vykazuje zřetelný imunofenotyp leukemických buněk“. Clin Cancer Res. 11 (4): 1372–9. doi:10.1158 / 1078-0432.ccr-04-1816. PMID 15746035.
^ ^A ^b Wang H, Iakova P, Wilde M, Welm A, Goode T, Roesler WJ, Timchenko NA (říjen 2001). „C / EBPalfa zastavuje buněčnou proliferaci přímou inhibicí Cdk2 a Cdk4“. Mol. Buňka. 8 (4): 817–28. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00366-5. PMID 11684017.
^ Ho PA, Alonzo TA, Gerbing RB, Pollard J, Stirewalt DL, Hurwitz C, Heerema NA, Hirsch B, Raimondi SC, Lange B, Franklin JL, Radich JP, Meshinchi S (červen 2009). „Prevalence a prognostické důsledky mutací CEBPA u pediatrické akutní myeloidní leukémie (AML): zpráva od dětské onkologické skupiny“. Krev. 113 (26): 6558–66. doi:10.1182 / krev-2008-10-184747. PMC 2943755. PMID 19304957.
^ Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF a kol. (2011). „Methylace CEBPA jako prognostický biomarker u pacientů s de novo Akutní myeloidní leukémie". Leukémie. 25 (1): 32–40. doi:10.1038 / leu.2010.222. PMID 20927134.
^ El-Sharnouby JA, Ahmed LM, Taha AM, Kamal O. Prognostický význam mutací CEBPA a exprese BAALC u egyptských pacientů s akutní myeloidní leukémií s normálním karyotypem. Egypt J Immunol. 2010; 15: 131–143.
^ Tada Y, Brena RM, Hackanson B, Morrison C, Otterson GA, třída C (2006). „Epigenetická modulace aktivity potlačující tumor CCAAT / enhancer vázající protein alfa u rakoviny plic“. J Natl Cancer Inst. 98 (6): 396–406. doi:10.1093 / jnci / djj093. PMID 16537832.
^ Bennett KL, Hackanson B, Smith LT, Morrison CD, Lang JC, Schuller DE a kol. (2007). „Aktivita supresoru nádoru proteinu alfa vázajícího CCAAT / zesilovač je epigeneticky snížena u karcinomu dlaždicových buněk hlavy a krku“. Cancer Res. 67 (10): 4657–4664. doi:10.1158 / 0008-5472.can-06-4793. PMID 17510391.
^ Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF a kol. (2011). „Methylace CEBPA jako prognostický biomarker u pacientů s de novo akutní myeloidní leukémií“. Leukémie. 25: 32–40. doi:10.1038 / leu.2010.222. PMID 20927134.

Další čtení

Sladek FM, Darnell JE (1992). "Mechanismy genové exprese specifické pro játra". Curr. Opin. Genet. Dev. 2 (2): 256–9. doi:10.1016 / S0959-437X (05) 80282-5. PMID 1638120.
Marcucci G, Mrózek K, Bloomfield CD (2005). „Molekulární heterogenita a prognostické biomarkery u dospělých s akutní myeloidní leukémií a normální cytogenetikou“. Curr. Opin. Hematol. 12 (1): 68–75. doi:10.1097 / 01.moh.0000149608.29685.d1. PMID 15604894. S2CID 6183391.
Leroy H, Roumier C, Huyghe P, Biggio V, Fenaux P, Preudhomme C (březen 2005). „Bodové mutace CEBPA u hematologických malignit“. Leukémie. 19 (3): 329–34. doi:10.1038 / sj.leu.2403614. PMID 15674366.

externí odkazy

Člověk CEBPA umístění genomu a CEBPA stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
GeneReviews / NIH / NCBI / UW vstup na familiární akutní myeloidní leukémii (AML) s mutovaným CEBPA
CEBPA + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000245848 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034957 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1535333-5] Szpirer C, Riviere M, Cortese R, Nakamura T, Islam MQ, Levan G, Szpirer J (červenec 1992). „Chromozomální lokalizace genů kódujících jaterně transkripční faktory C / EBP, DBP a HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP a transkripční faktor 1, TCF1) u člověka a potkana a růstový faktor hepatocytů / gen scatter factor (HGF) ". Genomika. 13 (2): 293–300. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-N. PMID 1535333.

[pmid1840554-6] Cao Z, Umek RM, McKnight SL (říjen 1991). „Regulovaná exprese tří izoforem C / EBP během tukové konverze buněk 3T3-L1“. Genes Dev. 5 (9): 1538–52. doi:10,1101 / gad. 5.9.1538. PMID 1840554.

[7] „CEBPA“. Genetická domácí reference. 20. dubna 2016. Citováno 25. dubna 2016.

[Olofsson2008-8] Olofsson LE, Orho-Melander M, William-Olsson L, Sjöholm K, Sjöström L, Groop L, Carlsson B, Carlsson LM, Olsson B (1. prosince 2009). „CCAAT / zesilovač vázající protein alfa (C / EBPalpha) v tukové tkáni reguluje geny v metabolismu lipidů a glukózy a genetická variace v C / EBPalpha je spojena se sérovými hladinami triglyceridů“. The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism. 93 (12): 4880–4886. doi:10.1210 / jc.2008-0574. PMID 18765514.

[9] „Entrez Gene: CEBPA CCAAT / enhancer binding protein (C / EBP), alpha“.

[10] Ohlsson E, Schuster MB, Hasemann M, Porse BT (duben 2016). „Mnohostranné funkce C / EBPalfa u normální a maligní hematopoézy“. Leukémie. 30 (4): 767–75. doi:10.1038 / leu.2015.324. PMID 26601784. S2CID 24767947.

[:0-11] A ^b Lin LI, Chen CY, Lin DT, Tsay W, Tang JL, Yeh YC a kol. (2005). ""Charakterizace mutací CEBPA u akutní myeloidní leukémie „většina pacientů s mutacemi CEBPA má bialelické mutace a vykazuje zřetelný imunofenotyp leukemických buněk“. Clin Cancer Res. 11 (4): 1372–9. doi:10.1158 / 1078-0432.ccr-04-1816. PMID 15746035.

[pmid11684017-12] A ^b Wang H, Iakova P, Wilde M, Welm A, Goode T, Roesler WJ, Timchenko NA (říjen 2001). „C / EBPalfa zastavuje buněčnou proliferaci přímou inhibicí Cdk2 a Cdk4“. Mol. Buňka. 8 (4): 817–28. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00366-5. PMID 11684017.

[pmid19304957-13] Ho PA, Alonzo TA, Gerbing RB, Pollard J, Stirewalt DL, Hurwitz C, Heerema NA, Hirsch B, Raimondi SC, Lange B, Franklin JL, Radich JP, Meshinchi S (červen 2009). „Prevalence a prognostické důsledky mutací CEBPA u pediatrické akutní myeloidní leukémie (AML): zpráva od dětské onkologické skupiny“. Krev. 113 (26): 6558–66. doi:10.1182 / krev-2008-10-184747. PMC 2943755. PMID 19304957.

[14] Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF a kol. (2011). „Methylace CEBPA jako prognostický biomarker u pacientů s de novo Akutní myeloidní leukémie". Leukémie. 25 (1): 32–40. doi:10.1038 / leu.2010.222. PMID 20927134.

[15] El-Sharnouby JA, Ahmed LM, Taha AM, Kamal O. Prognostický význam mutací CEBPA a exprese BAALC u egyptských pacientů s akutní myeloidní leukémií s normálním karyotypem. Egypt J Immunol. 2010; 15: 131–143.

[16] Tada Y, Brena RM, Hackanson B, Morrison C, Otterson GA, třída C (2006). „Epigenetická modulace aktivity potlačující tumor CCAAT / enhancer vázající protein alfa u rakoviny plic“. J Natl Cancer Inst. 98 (6): 396–406. doi:10.1093 / jnci / djj093. PMID 16537832.

[17] Bennett KL, Hackanson B, Smith LT, Morrison CD, Lang JC, Schuller DE a kol. (2007). „Aktivita supresoru nádoru proteinu alfa vázajícího CCAAT / zesilovač je epigeneticky snížena u karcinomu dlaždicových buněk hlavy a krku“. Cancer Res. 67 (10): 4657–4664. doi:10.1158 / 0008-5472.can-06-4793. PMID 17510391.

[18] Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF a kol. (2011). „Methylace CEBPA jako prognostický biomarker u pacientů s de novo akutní myeloidní leukémií“. Leukémie. 25: 32–40. doi:10.1038 / leu.2010.222. PMID 20927134.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]