ATF3 - ATF3
Cyklický transkripční faktor závislý na AMP ATF-3 je protein který je u lidí kódován ATF3 gen.[5]
Funkce
Aktivační transkripční faktor 3 je členem vazebného prvku aktivačního transkripčního faktoru savců / cAMP (CREB ) proteinová rodina transkripční faktory. Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících dvě různé izoformy. Delší izoforma spíše potlačuje než aktivuje transkripci z promotorů s vazebnými prvky ATF. Kratší izoforma (deltaZip2) postrádá leucinový zip motiv dimerizace proteinu a neváže se na DNA a předpokládá se, že stimuluje transkripci sekvestrací inhibičních kofaktorů od promotoru. Je možné, že alternativní sestřih genu ATF3 může být fyziologicky důležitý při regulaci cílových genů.[6]
Klinický význam
ATF-3 je indukován při fyziologickém stresu v různých tkáních.[7] Je také markerem regenerace po poranění neuronů ganglií dorzálních kořenů, protože zraněné regenerující neurony aktivují tento transkripční faktor. [8] Studie funkční validace ukázaly, že ATF3 může podporovat regeneraci periferních neuronů, ale není schopen podporovat regeneraci neuronů centrálního nervového systému. [9]
Viz také
Interakce
Bylo prokázáno, že ATF3 komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162772 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026628 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Chen BP, Liang G, Whelan J, Hai T (červen 1994). "ATF3 a ATF3 delta Zip. Transkripční represe versus aktivace alternativně sestřiženými izoformami". The Journal of Biological Chemistry. 269 (22): 15819–26. PMID 7515060.
- ^ „Entrez Gene: ATF3 aktivující transkripční faktor 3“.
- ^ Chen BP, Wolfgang CD, Hai T (březen 1996). „Analýza ATF3, transkripčního faktoru vyvolaného fyziologickými stresy a modulovaného gadd153 / Chop10“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (3): 1157–68. doi:10.1128 / MCB.16.3.1157. PMC 231098. PMID 8622660.
- ^ Lindå H, Sköld MK, Ochsmann T (2011). „Aktivující transkripční faktor 3, užitečný marker pro regenerační reakci po poranění nervového kořene“. Hranice v neurologii. 2: 30. doi:10.3389 / fneur.2011.00030. PMC 3099310. PMID 21629765.
- ^ Mahar M, Cavalli V (červen 2018). "Vnitřní mechanismy regenerace neuronových axonů". Recenze přírody. Neurovědy. 19 (6): 323–337. doi:10.1038 / s41583-018-0001-8. PMC 5987780. PMID 29666508.
- ^ Pearson AG, Gray CW, Pearson JF, Greenwood JM, během MJ, Dragunow M (prosinec 2003). „ATF3 zvyšuje klíčení neuritů zprostředkovaných c-Jun“. Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 120 (1): 38–45. doi:10.1016 / j.molbrainres.2003.09.014. PMID 14667575.
- ^ A b Chen BP, Wolfgang CD, Hai T (březen 1996). „Analýza ATF3, transkripčního faktoru vyvolaného fyziologickými stresy a modulovaného gadd153 / Chop10“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (3): 1157–68. doi:10.1128 / MCB.16.3.1157. PMC 231098. PMID 8622660.
- ^ Hai T, Curran T (květen 1991). "Cross-family dimerizace transkripčních faktorů Fos / Jun a ATF / CREB mění DNA vazebnou specificitu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (9): 3720–4. Bibcode:1991PNAS ... 88.3720H. doi:10.1073 / pnas.88.9.3720. PMC 51524. PMID 1827203.
- ^ Chu HM, Tan Y, Kobierski LA, Balsam LB, Comb MJ (leden 1994). "Aktivující transkripční faktor-3 stimuluje 3 ', 5'-cyklickou expresi genu závislou na adenosin monofosfátu". Molekulární endokrinologie. 8 (1): 59–68. doi:10.1210 / oprava.8.1.8152431. PMID 8152431.
- ^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
- ^ Yan C, Wang H, Boyd DD (březen 2002). „ATF3 potlačuje expresi kolagenázy 72-kDa typu IV (MMP-2) tím, že antagonizuje p53-závislou trans-aktivaci promotoru kolagenázy“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (13): 10804–12. doi:10,1074 / jbc.M112069200. PMID 11792711.
- ^ Kang Y, Chen CR, Massagué J (duben 2003). „Samovolná odpověď TGFbeta spojená se stresovou signalizací: Smad zapojuje faktor stresové reakce ATF3 pro represi Id1 v epitelových buňkách“. Molekulární buňka. 11 (4): 915–26. doi:10.1016 / s1097-2765 (03) 00109-6. PMID 12718878.
Další čtení
- Hai TW, Liu F, Coukos WJ, Green MR (prosinec 1989). „Klony cDNA transkripčního faktoru ATF: rozsáhlá rodina proteinů leucinového zipu schopných selektivně vytvářet heterodimery vázající DNA“. Geny a vývoj. 3 (12B): 2083–90. doi:10.1101 / gad.3.12b.2083. PMID 2516827.
- Kaszubska W, Hooft van Huijsduijnen R, Ghersa P, DeRaemy-Schenk AM, Chen BP, Hai T, DeLamarter JF, Whelan J (listopad 1993). „Členové rodiny ATF nezávislé na cyklickém AMP interagují s NF-kappa B a fungují při aktivaci promotoru E-selektinu v reakci na cytokiny“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (11): 7180–90. doi:10.1128 / MCB.13.11.7180. PMC 364779. PMID 7692236.
- Chu HM, Tan Y, Kobierski LA, Balsam LB, Comb MJ (leden 1994). „Aktivující transkripční faktor-3 stimuluje 3 ', 5'-cyklickou expresi genu závislou na adenosinmonofosfátu“. Molekulární endokrinologie. 8 (1): 59–68. doi:10.1210 / oprava.8.1.8152431. PMID 8152431.
- Liang G, Wolfgang CD, Chen BP, Chen TH, Hai T (leden 1996). "ATF3 gen. Genomická organizace, promotor a regulace". The Journal of Biological Chemistry. 271 (3): 1695–701. doi:10.1074 / jbc.271.3.1695. PMID 8576171.
- Chen BP, Wolfgang CD, Hai T (březen 1996). „Analýza ATF3, transkripčního faktoru vyvolaného fyziologickými stresy a modulovaného gadd153 / Chop10“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (3): 1157–68. doi:10.1128 / MCB.16.3.1157. PMC 231098. PMID 8622660.
- Hagmeyer BM, Duyndam MC, Angel P, de Groot RP, Verlaan M, Elfferich P, van der Eb A, Zantema A (březen 1996). „Změněné komplexy AP-1 / ATF v buňkách transformovaných adenovirem E1 v důsledku indukce ATF3 závislé na EIA“. Onkogen. 12 (5): 1025–32. PMID 8649793.
- Allan AL, Albanese C, Pestell RG, LaMarre J (červenec 2001). „Aktivující transkripční faktor 3 indukuje syntézu DNA a expresi cyklinu D1 v hepatocytech“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (29): 27272–80. doi:10,1074 / jbc.M103196200. PMID 11375399.
- Zhang C, Kawauchi J, Adachi MT, Hashimoto Y, Oshiro S, Aso T, Kitajima S (prosinec 2001). „Aktivace JNK a transkripčního represoru ATF3 / LRF1 cestou IRE1 / TRAF2 se podílí na smrti lidských vaskulárních endoteliálních buněk homocysteinem.“ Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 289 (3): 718–24. doi:10.1006 / bbrc.2001.6044. PMID 11726207.
- Yan C, Wang H, Boyd DD (březen 2002). „ATF3 potlačuje expresi kolagenázy 72-kDa typu IV (MMP-2) tím, že antagonizuje p53-závislou trans-aktivaci promotoru kolagenázy“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (13): 10804–12. doi:10,1074 / jbc.M112069200. PMID 11792711.
- Shaheduzzaman S, Krishnan V, Petrovic A, Bittner M, Meltzer P, Trent J, Venkatesan S, Zeichner S (2002). "Účinky HIV-1 Nef na profily exprese buněčných genů". Journal of Biomedical Science. 9 (1): 82–96. doi:10.1007 / BF02256581. PMID 11810028.
- Hashimoto Y, Zhang C, Kawauchi J, Imoto I, Adachi MT, Inazawa J, Amagasa T, Hai T, Kitajima S (červen 2002). „Alternativně sestřižená izoforma transkripčního represoru ATF3 a její indukce stresovými podněty“. Výzkum nukleových kyselin. 30 (11): 2398–406. doi:10.1093 / nar / 30.11.2398. PMC 117192. PMID 12034827.
- Kawauchi J, Zhang C, Nobori K, Hashimoto Y, Adachi MT, Noda A, Sunamori M, Kitajima S (říjen 2002). "Transkripční represor aktivující transkripční faktor 3 chrání lidské endoteliální buňky pupečníkové žíly před apoptózou indukovanou faktorem alfa vyvolaným faktorem alfa prostřednictvím down-regulace transkripce p53". The Journal of Biological Chemistry. 277 (41): 39025–34. doi:10,1074 / jbc.M202974200. PMID 12161427.
- Zhang C, Gao C, Kawauchi J, Hashimoto Y, Tsuchida N, Kitajima S (říjen 2002). "Transkripční aktivace promotoru genu ATF3 genu indukovatelného lidským stresem pomocí p53". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 297 (5): 1302–10. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02382-3. PMID 12372430.
- Fan F, Jin S, Amundson SA, Tong T, Fan W, Zhao H, Zhu X, Mazzacurati L, Li X, Petrik KL, Fornace AJ, Rajasekaran B, Zhan Q (říjen 2002). „Indukce ATF3 po poškození DNA je regulována odlišnými signálními cestami a nadměrná exprese proteinu ATF3 potlačuje růst buněk“. Onkogen. 21 (49): 7488–96. doi:10.1038 / sj.onc.1205896. PMID 12386811.
- Nobori K, Ito H, Tamamori-Adachi M, Adachi S, Ono Y, Kawauchi J, Kitajima S, Marumo F, Isobe M (říjen 2002). „ATF3 inhibuje doxorubicinem indukovanou apoptózu v srdečních myocytech: nová kardioprotektivní role ATF3“. Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 34 (10): 1387–97. doi:10.1006 / jmcc.2002.2091. PMID 12392999.
- Kang Y, Chen CR, Massagué J (duben 2003). „Samovolná odpověď TGFbeta spojená se stresovou signalizací: Smad zapojuje faktor stresové reakce ATF3 pro represi Id1 v epitelových buňkách“. Molekulární buňka. 11 (4): 915–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00109-6. PMID 12718878.
- Newman JR, Keating AE (červen 2003). "Komplexní identifikace interakcí lidského bZIP s poli vinutých cívek". Věda. 300 (5628): 2097–101. Bibcode:2003Sci ... 300.2097N. doi:10.1126 / science.1084648. PMID 12805554. S2CID 36715183.
- Kool J, Hamdi M, Cornelissen-Steijger P, van der Eb AJ, Terleth C, van Dam H (červenec 2003). „Indukce ATF3 ionizujícím zářením je zprostředkována signální cestou, která zahrnuje ATM, Nibrin1, MAPkinázy vyvolané stresem a ATF-2“. Onkogen. 22 (27): 4235–42. doi:10.1038 / sj.onc.1206611. PMID 12833146.
externí odkazy
- Člověk ATF3 umístění genomu a ATF3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- ATF3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- FactorBook ATF3
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.
- ^ Koh EH, Park JY, Park HS, Jeon MJ, Ryu JW, Kim M, Kim SY, Kim MS, Kim SW, Park IS, Youn JH, Lee KU (prosinec 2007). „Základní role mitochondriální funkce při syntéze adiponektinu v adipocytech“. Cukrovka. 56 (12): 2973–81. doi:10.2337 / db07-0510. PMID 17827403.