PHF8 - PHF8

PHF8
Protein PHF8 PDB 2WWU.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyPHF8, JHDM1F, MRXSSD, ZNF422, protein prstů PHD 8, KDM7B
Externí IDOMIM: 300560 MGI: 2444341 HomoloGene: 49405 Genové karty: PHF8
Umístění genu (člověk)
X chromozom (lidský)
Chr.X chromozom (lidský)[1]
X chromozom (lidský)
Genomická poloha pro PHF8
Genomická poloha pro PHF8
KapelaXp11.22Start53,936,676 bp[1]
Konec54,048,958 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

23133

320595

Ensembl

ENSG00000172943

ENSMUSG00000041229

UniProt

Q9UPP1

Q80TJ7

RefSeq (mRNA)

NM_001184896
NM_001184897
NM_001184898
NM_015107

NM_001113354
NM_177201

RefSeq (protein)

NP_001171825
NP_001171826
NP_001171827
NP_055922

NP_001106825
NP_796175

Místo (UCSC)Chr X: 53,94 - 54,05 MbChr X: 151,52 - 151,63 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Prstový protein PHD 8 je protein že u lidí je kódován PHF8 gen.[5]

Funkce

PHF8 patří do rodiny železného železa a alfa-ketoglutarát-dependentní hydroxylázy nadčeleď.,[6] a je aktivní jako histon lysin demethyláza se selektivitou pro di- a monomethylové stavy.[7] PHF8 indukuje proces podobný EMT (epiteliální k mezenchymálnímu přechodu) upregulací klíčových transkripčních faktorů EMT SNAI1 a ZEB1.

Regulace během diferenciace

Bylo zjištěno, že PHF8 je expresivně zvýšený během endoteliální diferenciace a významně snížený během kardiální diferenciace myších embryonálních kmenových buněk.[8]

Klinický význam

Mutace v PHF8 způsobují typ Siderius X-vázané mentální postižení (XLMR) (OMIM: 300263 ).[9][10][11] Kromě moderování mentální postižení, rysy syndromu Siderius-Hamel zahrnují obličejový dysmorfismus, rozštěp rtu a / nebo rozštěp patra, a v některých případech mikrocefalie.[12][13][14] Chromozomální mikrodelece na Xp11.22 zahrnující všechny PHF8 a FAM120C geny a část WNK3 gen byl hlášen u dvou bratrů s poruchou autistického spektra kromě XLMR a Siderius typu rozštěp rtu a patra.[15]

Tato katalytická aktivita je narušena klinicky známými mutacemi na PHF8, u kterých bylo zjištěno, že se shlukují ve své katalytické doméně JmjC. Mutace F279S PHF8, nalezená u 2 finských bratrů s mírnou mentální postižení, obličeje dysmorfismus a rozštěp rtu / patra,[14] bylo zjištěno, že navíc brání jaderná lokalizace nadměrně exprimovaného PHF8 v lidských buňkách.[7]

Katalytická aktivita PHF8 závisí na molekulární kyslík,[7] skutečnost považována za důležitou s ohledem na zprávy o zvýšeném výskytu viru rozštěp rtu / patra u myší, které byly vystaveny hypoxie v době těhotenství.[16] U lidí fetální rozštěp rtu a další vrozené abnormality byly také spojeny s hypoxií matky, způsobenou např. mateřské kouření,[17] mateřský zneužití alkoholu nebo mateřská hypertenze léčba.[18]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172943 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041229 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ "Entrez Gene: PHF8 PHD finger protein 8".
  6. ^ Loenarz C, Schofield CJ (březen 2008). "Rozšiřování chemické biologie 2-oxoglutarát oxygenáz". Přírodní chemická biologie. 4 (3): 152–6. doi:10.1038 / nchembio0308-152. PMID  18277970.
  7. ^ A b C Loenarz C, Ge W, Coleman ML, Rose NR, Cooper CD, Klose RJ, Ratcliffe PJ, Schofield CJ (leden 2010). „PHF8, gen spojený s rozštěpem rtu / patra a mentální retardací, kóduje demethylázu Nepsilon-dimethyl lysinu“. Lidská molekulární genetika. 19 (2): 217–22. doi:10,1093 / hmg / ddp480. PMC  4673897. PMID  19843542.
  8. ^ Boeckel, Jes-Niels; Derlet, Anja; Glaser, Simone F .; Luczak, Annika; Lucas, Tina; Heumüller, Andreas W .; Krüger, Marcus; Zehendner, Christoph M .; Kaluza, David (červenec 2016). „JMJD8 reguluje angiogenní klíčení a buněčný metabolismus interakcí s pyruvátkinázou M2 v endoteliálních buňkách“. Arterioskleróza, trombóza a vaskulární biologie. 36 (7): 1425–1433. doi:10.1161 / ATVBAHA.116.307695. ISSN  1524-4636. PMID  27199445.
  9. ^ Siderius LE, Hamel BC, van Bokhoven H, de Jager F, van den Helm B, Kremer H, Heineman-de Boer JA, Ropers HH, Mariman EC (červenec 1999). „Mentální retardace spojená s X spojená s rozštěpem rtu / patra na Xp11.3-q21.3“. American Journal of Medical Genetics. 85 (3): 216–20. doi:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19990730) 85: 3 <216 :: AID-AJMG6> 3.0.CO; 2-X. PMID  10398231.
  10. ^ „OMIM: Siderius X-spojený syndrom mentální retardace“. Citováno 2009-10-21.
  11. ^ „OMIM: Prstový protein PHD 8; PHF8“. Citováno 2009-10-21.
  12. ^ Abidi F, Miano M, Murray J, Schwartz C (červenec 2007). „Nová mutace v genu PHF8 je spojena s mentální retardací spojenou s X s rozštěpem rtu / rozštěpu patra“. Klinická genetika. 72 (1): 19–22. doi:10.1111 / j.1399-0004.2007.00817.x. PMC  2570350. PMID  17594395.
  13. ^ Laumonnier F, Holbert S, Ronce N, Faravelli F, Lenzner S, Schwartz CE, Lespinasse J, Van Esch H, Lacombe D, Goizet C, Phan-Dinh Tuy F, van Bokhoven H, Fryns JP, Chelly J, Ropers HH, Moraine C, Hamel BC, Briault S (říjen 2005). "Mutace v PHF8 jsou spojeny s mentální retardací spojenou s X a rozštěpem rtu / rozštěpu patra". Journal of Medical Genetics. 42 (10): 780–6. doi:10.1136 / jmg.2004.029439. PMC  1735927. PMID  16199551.
  14. ^ A b Koivisto AM, Ala-Mello S, Lemmelä S, Komu HA, Rautio J, Järvelä I (srpen 2007). "Screening mutací v genu PHF8 a identifikace nové mutace ve finské rodině s XLMR a rozštěpem rtu / rozštěpu patra". Klinická genetika. 72 (2): 145–9. doi:10.1111 / j.1399-0004.2007.00836.x. PMID  17661819. S2CID  23326755.
  15. ^ Qiao Y, Liu X, Harvard C, Hildebrand MJ, Rajcan-Separovic E, Holden JJ, Lewis ME (srpen 2008). "Rodinná mikrodelece Xp11.22 spojená s autismem". Klinická genetika. 74 (2): 134–44. doi:10.1111 / j.1399-0004.2008.01028.x. PMID  18498374. S2CID  22008997.
  16. ^ Millicovsky G, Johnston MC (září 1981). „Hyperoxie a hypoxie v těhotenství: jednoduchá experimentální manipulace mění výskyt rozštěpu rtu a patra u myší CL / Fr“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 78 (9): 5722–3. doi:10.1073 / pnas.78.9.5722. PMC  348841. PMID  6946511.
  17. ^ Shi M, Wehby GL, Murray JC (březen 2008). „Přehled genetických variant a kouření matek v etiologii rozštěpů ústní dutiny a dalších vrozených vad“. Výzkum vrozených vad. Část C, embryo dnes. 84 (1): 16–29. doi:10.1002 / bdrc.20117. PMC  2570345. PMID  18383123.
  18. ^ Hurst JA, Houlston RS, Roberts A, Gould SJ, Tingey WG (říjen 1995). „Příčný nedostatek končetin, rozštěp obličeje a hypoxické poškození ledvin: souvislost s léčbou mateřské hypertenze?“. Klinická dysmorfologie. 4 (4): 359–63. doi:10.1097/00019605-199510000-00013. PMID  8574428. S2CID  6330050.

externí odkazy

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.