KLF13 - KLF13
Kruppelův faktor 13, také známý jako KLF13, je protein že u lidí je kódován KLF13 gen.[5][6][7]
Existují určité důkazy pro KLF13 mít roli v obezitě. Místo methylace, cg07814318, v prvním intron z KLF13 byl spojován s obezitou a orexigenními procesy.[8] Ghrelin hladiny také pozitivně korelovaly s hladinami methylace cg07814318.[8] Úrovně exprese navíc KLF13 byly sníženy a zvýšeny v mozcích hladovějících a obézních myší.[8]
Funkce
KLF13 patří do rodiny transkripční faktory které obsahují 3 klasické zinkový prst Domény vázající DNA sestávající z atomu zinku tetrahedrálně koordinovaného 2 cysteiny a 2 histidiny (motiv C2H2). Tyto transkripční faktory se vážou na sekvence bohaté na GC a související GT a CACCC boxy.[5][9]
KLF13 byl poprvé popsán jako RANTES faktor pozdní aktivace T lymfocyty (RFLAT) -1.[7] Reguluje výraz chemokin RANTES v T lymfocytech. Funguje jako lynchpin a indukuje velký vylepšený. KLF13 knock-out myši vykazují defekt v přežití lymfocytů, protože KLF13 je regulátorem Bcl-xL výraz.[7][10][11][12][13][14][15]
Interakce
KLF13 bylo prokázáno komunikovat s CREB-vazebný protein,[16] Protein tepelného šoku 47[16] a PCAF.[16]
Viz také
Reference
- ^ A b C ENSG00000275746 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169926, ENSG00000275746 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000052040 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b „Entrez Gene: KLF13 Kruppel-like factor 13“.
- ^ Cook T, Gebelein B, Urrutia R (červen 1999). „Sp1 a jeho podoby: biochemické a funkční předpovědi pro rostoucí rodinu transkripčních faktorů se zinkovým prstem“. Annals of the New York Academy of Sciences. 880 (1 BUNKA A KRT): 94–102. Bibcode:1999NYASA.880 ... 94C. doi:10.1111 / j.1749-6632.1999.tb09513.x. PMID 10415854.
- ^ A b C Song A, Chen YF, Thamatrakoln K, Storm TA, Krensky AM (leden 1999). „RFLAT-1: nový transkripční faktor se zinkovým prstem, který aktivuje expresi genu RANTES v T lymfocytech“. Imunita. 10 (1): 93–103. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2. PMID 10023774.
- ^ A b C Wiemerslage L, Islam R, van der Kamp C, Cao H, Olivo G, Ence-Eriksson F, Castillo S, Larsen AL, Bandstein M, Dahlberg LS, Perland E, Gustavsson V, Nilsson J, Vogel H, Schürmann A, Larsson EM, Rask-Andersen M, Benedict C, Schiöth HB (14. února 2017). „Místo methylace DNA v genu KLF13 je spojeno s orexigenními procesy založenými na nervových reakcích a hladinách ghrelinu“. Int J Obes (Lond). 43 (6): 990–994. doi:10.1038 / ijo.2017.43. PMID 28194012. S2CID 52835570.
- ^ Scohy S, Gabant P, Van Reeth T, Hertveldt V, Drèze PL, Van Vooren P, Rivière M, Szpirer J, Szpirer C (listopad 2000). "Identifikace KLF13 a KLF14 (SP6), nových členů rodiny transkripčních faktorů SP / XKLF". Genomika. 70 (1): 93–101. doi:10,1006 / geno.2000.6362. PMID 11087666.
- ^ Song A, Nikolcheva T, Krensky AM (říjen 2000). "Transkripční regulace exprese RANTES v T lymfocytech". Imunologické recenze. 177 (1): 236–45. doi:10.1034 / j.1600-065X.2000.17610.x. PMID 11138780.
- ^ Nikolcheva T, Pyronnet S, Chou SY, Sonenberg N, Song A, Clayberger C, Krensky AM (červenec 2002). "Translační reostat pro RFLAT-1 reguluje expresi RANTES v T lymfocytech". The Journal of Clinical Investigation. 110 (1): 119–26. doi:10,1172 / JCI15336. PMC 151028. PMID 12093895.
- ^ Song A, Patel A, Thamatrakoln K, Liu C, Feng D, Clayberger C, Krensky AM (srpen 2002). "Funkční domény a sekvence vázající DNA RFLAT-1 / KLF13, transkripční faktor aktivovaných T lymfocytů podobný Krüppel". The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 30055–65. doi:10,1074 / jbc.M204278200. PMID 12050170.
- ^ Zhou M, McPherson L, Feng D, Song A, Dong C, Lyu SC, Zhou L, Shi X, Ahn YT, Wang D, Clayberger C, Krensky AM (květen 2007). „Transkripční faktor 13 podobný Kruppelovi reguluje přežití T lymfocytů in vivo“. Journal of Immunology. 178 (9): 5496–504. doi:10,4049 / jimmunol. 179,9,5496. PMC 2664650. PMID 17442931.
- ^ Huang B, Ahn YT, McPherson L, Clayberger C, Krensky AM (červen 2007). „Interakce PRP4 s faktorem 13 podobným Kruppelovi reguluje transkripci CCL5“. Journal of Immunology. 178 (11): 7081–7. doi:10,4049 / jimmunol.178.11.7081. PMC 2674583. PMID 17513757.
- ^ Ahn YT, Huang B, McPherson L, Clayberger C, Krensky AM (leden 2007). „Dynamická souhra transkripčního aparátu a chromatinu reguluje„ pozdní “expresi chemokinu RANTES v T lymfocytech“. Molekulární a buněčná biologie. 27 (1): 253–66. doi:10.1128 / MCB.01071-06. PMC 1800668. PMID 17074812.
- ^ A b C Song CZ, Keller K, Murata K, Asano H, Stamatoyannopoulos G. (Březen 2002). „Funkční interakce mezi koaktivátory CBP / p300, PCAF a transkripčním faktorem FKLF2“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (9): 7029–36. doi:10,1074 / jbc.M108826200. PMC 2808425. PMID 11748222.
Další čtení
- Cook T, Gebelein B, Urrutia R (červen 1999). „Sp1 a jeho podoby: biochemické a funkční předpovědi pro rostoucí rodinu transkripčních faktorů se zinkovým prstem“. Annals of the New York Academy of Sciences. 880 (1 BUNKA A KRT): 94–102. Bibcode:1999NYASA.880 ... 94C. doi:10.1111 / j.1749-6632.1999.tb09513.x. PMID 10415854.
- Song A, Chen YF, Thamatrakoln K, Storm TA, Krensky AM (leden 1999). „RFLAT-1: nový transkripční faktor se zinkovým prstem, který aktivuje expresi genu RANTES v T lymfocytech“. Imunita. 10 (1): 93–103. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2. PMID 10023774.
- Asano H, Li XS, Stamatoyannopoulos G (červen 2000). „FKLF-2: nový transkripční faktor podobný Krüppelovi, který aktivuje globin a další geny erytroidní linie“. Krev. 95 (11): 3578–84. doi:10.1182 / krev. V95.11.3578. PMID 10828046.
- Scohy S, Gabant P, Van Reeth T, Hertveldt V, Drèze PL, Van Vooren P, Rivière M, Szpirer J, Szpirer C (listopad 2000). "Identifikace KLF13 a KLF14 (SP6), nových členů rodiny transkripčních faktorů SP / XKLF". Genomika. 70 (1): 93–101. doi:10,1006 / geno.2000.6362. PMID 11087666.
- Kaczynski J, Zhang JS, Ellenrieder V, Conley A, Duenes T, Kester H, van Der Burg B, Urrutia R (září 2001). „Protein BTEB3 podobný Sp1 inhibuje transkripci skrz box základního transkripčního prvku interakcí s mSin3A a ko-represory HDAC-1 a soutěží s Sp1“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (39): 36749–56. doi:10,1074 / jbc.M105831200. PMID 11477107.
- Song CZ, Keller K, Murata K, Asano H, Stamatoyannopoulos G (březen 2002). „Funkční interakce mezi koaktivátory CBP / p300, PCAF a transkripčním faktorem FKLF2“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (9): 7029–36. doi:10,1074 / jbc.M108826200. PMC 2808425. PMID 11748222.
- Kaczynski JA, Conley AA, Fernandez Zapico M, Delgado SM, Zhang JS, Urrutia R (září 2002). „Funkční analýza proteinu vázajícího základní transkripční prvek (BTE) (BTEB) 3 a BTEB4, nového proteinu podobného Sp1, odhaluje podrodinu transkripčních represorů pro BTE místo promotoru genu cytochromu P4501A1“. The Biochemical Journal. 366 (Pt 3): 873–82. doi:10.1042 / BJ20020388. PMC 1222816. PMID 12036432.
- Song A, Patel A, Thamatrakoln K, Liu C, Feng D, Clayberger C, Krensky AM (srpen 2002). "Funkční domény a sekvence vázající DNA RFLAT-1 / KLF13, transkripční faktor aktivovaných T lymfocytů podobný Krüppel". The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 30055–65. doi:10,1074 / jbc.M204278200. PMID 12050170.
- Nikolcheva T, Pyronnet S, Chou SY, Sonenberg N, Song A, Clayberger C, Krensky AM (červenec 2002). "Translační reostat pro RFLAT-1 reguluje expresi RANTES v T lymfocytech". The Journal of Clinical Investigation. 110 (1): 119–26. doi:10,1172 / JCI15336. PMC 151028. PMID 12093895.
- Mitsuma A, Asano H, Kinoshita T, Murate T, Saito H, Stamatoyannopoulos G, Naoe T (únor 2005). "Transkripční regulace genu FKLF-2 (KLF13) v erytroidních buňkách". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1727 (2): 125–33. doi:10.1016 / j.bbaexp.2004.12.007. PMC 2808416. PMID 15716005.
- Zhang P, Basu P, Redmond LC, Morris PE, Rupon JW, Ginder GD, Lloyd JA (2006). „Funkční screening faktorů podobných Krüppelovi, které regulují lidský gen gama-globinu prostřednictvím promotorového prvku CACCC“. Krevní buňky, molekuly a nemoci. 35 (2): 227–35. doi:10.1016 / j.bcmd.2005.04.009. PMID 16023392.
- Ahn YT, Huang B, McPherson L, Clayberger C, Krensky AM (leden 2007). „Dynamická souhra transkripčního aparátu a chromatinu reguluje„ pozdní “expresi chemokinu RANTES v T lymfocytech“. Molekulární a buněčná biologie. 27 (1): 253–66. doi:10.1128 / MCB.01071-06. PMC 1800668. PMID 17074812.
- Huang B, Ahn YT, McPherson L, Clayberger C, Krensky AM (červen 2007). „Interakce PRP4 s faktorem 13 podobným Kruppelovi reguluje transkripci CCL5“. Journal of Immunology. 178 (11): 7081–7. doi:10,4049 / jimmunol.178.11.7081. PMC 2674583. PMID 17513757.
externí odkazy
- KLF13 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.