NFATC3 - NFATC3

NFATC3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2XRW, 2XS0
Identifikátory
Aliasy	NFATC3, NFAT4, NFATX, jaderný faktor aktivovaných T-buněk 3, jaderný faktor aktivovaných T buněk 3, NF-AT4c
Externí ID	OMIM: 602698 MGI: 103296 HomoloGene: 27827 Genové karty: NFATC3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	68,229,259 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	106,130,537 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba chromatinu; • vazba transkripčního faktoru;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • komplex regulátoru transkripce;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • zánětlivá reakce; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace transkripce pri-miRNA z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace diferenciace buněk hladkého svalstva cév; • produkce cytokinů; • kalcineurin-NFAT signalizační kaskáda; • vývoj mnohobuněčných organismů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4775
	18021
	ENSG00000072736
	ENSMUSG00000031902
	Q12968
	P97305
	NM_173165; NM_004555; NM_173163; NM_173164
	NM_010901; NM_001368796; NM_001368797
	NP_004546; NP_775186; NP_775188; NP_004546.1; NP_775188.1
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Jaderný faktor aktivovaných T-buněk, cytoplazmatický 3 je protein že u lidí je kódován NFATC3 gen.^[5]^[6]

Funkce

Produkt tohoto genu je členem jaderných faktorů aktivovaných transkripčních komplexů vázajících DNA na DNA. Tento komplex se skládá z alespoň dvou složek: již existující cytosolické složky, která se translokácí dostává do jádra po stimulaci receptoru T buněk (TCR), a indukovatelné jaderné složky. Ostatní členové této rodiny se také podílejí na tvorbě tohoto komplexu. Produkt tohoto genu hraje roli v regulaci genové exprese v T buňkách a nezralých thymocytech. Pro tento gen byly identifikovány čtyři varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[6]

Viz také

NFAT

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072736 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031902 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hoey T, Sun YL, Williamson K, Xu X (květen 1995). „Izolace dvou nových členů rodiny genů NF-AT a funkční charakterizace proteinů NF-AT“. Imunita. 2 (5): 461–72. doi:10.1016/1074-7613(95)90027-6. PMID 7749981.
^ ^A ^b "Entrez Gene: NFATC3 jaderný faktor aktivovaných T-buněk, cytoplazmatický, na kalcineurinu závislý 3".

Další čtení

Rao A, Luo C, Hogan PG (1997). "Transkripční faktory rodiny NFAT: regulace a funkce". Výroční přehled imunologie. 15: 707–47. doi:10.1146 / annurev.immunol.15.1.707. PMID 9143705.
Crabtree GR (březen 1999). "Obecné signály a specifické výsledky: signalizace přes Ca2 +, kalcineurin a NF-AT". Buňka. 96 (5): 611–4. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80571-1. PMID 10089876. S2CID 8817053.
Horsley V, Pavlath GK (březen 2002). „NFAT: všudypřítomný regulátor buněčné diferenciace a adaptace“. The Journal of Cell Biology. 156 (5): 771–4. doi:10.1083 / jcb.200111073. PMC 2173310. PMID 11877454.
Masuda ES, Naito Y, Tokumitsu H, Campbell D, Saito F, Hannum C, Arai K, Arai N (květen 1995). „NFATx, nový člen nukleárního faktoru rodiny aktivovaných T buněk, který je exprimován převážně v brzlíku“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (5): 2697–706. doi:10,1128 / mcb.15.5.2697. PMC 230500. PMID 7739550.
Jabado N, Le Deist F, Fisher A, Hivroz C (listopad 1994). „Interakce HIV gp120 a anti-CD4 protilátek s molekulou CD4 na lidských CD4 + T buňkách inhibuje vazebnou aktivitu NF-AT, NF-kappa B a AP-1, tří jaderných faktorů regulujících aktivitu zesilovače genu interleukinu-2“. European Journal of Immunology. 24 (11): 2646–52. doi:10.1002 / eji.1830241112. PMID 7957556.
Vacca A, Farina M, Maroder M, Alesse E, Screpanti I, Frati L, Gulino A (listopad 1994). „Virus lidské imunodeficience typu 1 zvyšuje aktivitu promotoru interleukinu-2 prostřednictvím synergismu s forbolesterem a vápníkem zprostředkovanou aktivací NF-AT cis-regulačního motivu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 205 (1): 467–74. doi:10.1006 / bbrc.1994.2689. PMID 7999066.
Di Somma MM, Majolini MB, Burastero SE, Telford JL, Baldari CT (září 1996). „Cyklosporin Citlivost dlouhého terminálního opakování HIV-1 identifikuje odlišné dráhy závislé na p56lck aktivované spouštěním CD4“. European Journal of Immunology. 26 (9): 2181–8. doi:10.1002 / eji.1830260933. PMID 8814265.
Masuda ES, Liu J, Imamura R, Imai SI, Arai KI, Arai N (duben 1997). „Kontrola nukleární translokace NFATx1 inhibiční doménou regulovanou kalcineurinem“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (4): 2066–75. doi:10,1128 / mcb.17.4.2066. PMC 232054. PMID 9121455.
Chow CW, Rincón M, Cavanagh J, Dickens M, Davis RJ (listopad 1997). "Jaderná akumulace NFAT4 v rozporu s cestou přenosu signálu JNK". Věda. 278 (5343): 1638–41. Bibcode:1997Sci ... 278.1638C. doi:10.1126 / science.278.5343.1638. PMID 9374467.
Amasaki Y, Masuda ES, Imamura R, Arai K, Arai N (březen 1998). „Odlišné proteiny rodiny NFAT jsou zapojeny do jaderných komplexů vázajících NFAT-DNA z podskupin lidských thymocytů“. Journal of Immunology. 160 (5): 2324–33. PMID 9498773.
Zhu J, Shibasaki F, Price R, Guillemot JC, Yano T, Dötsch V, Wagner G, Ferrara P, McKeon F (květen 1998). „Intramolekulární maskování signálu importu jaderného materiálu na NF-AT4 kasein kinázou I a MEKK1“. Buňka. 93 (5): 851–61. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81445-2. PMID 9630228. S2CID 9515426.
Aramburu J, Garcia-Cózar F, Raghavan A, Okamura H, Rao A, Hogan PG (duben 1998). "Selektivní inhibice aktivace NFAT peptidem zahrnujícím kalcineurinové cílicí místo NFAT". Molekulární buňka. 1 (5): 627–37. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80063-5. PMID 9660947.
Imamura R, Masuda ES, Naito Y, Imai S, Fujino T, Takano T, Arai K, Arai N (říjen 1998). „Karboxyl-terminální 15-aminokyselinová sekvence NFATx1 je možná vytvořena tkáňově specifickým sestřihem a je nezbytná pro transaktivační aktivitu v T buňkách“. Journal of Immunology. 161 (7): 3455–63. PMID 9759864.
Loftus BJ, Kim UJ, Sneddon VP, Kalush F, Brandon R, Fuhrmann J, Mason T, Crosby ML, Barnstead M, Cronin L, Deslattes Mays A, Cao Y, Xu RX, Kang HL, Mitchell S, Eichler EE, Harris PC, Venter JC, Adams MD (září 1999). "Duplikace genomu a další vlastnosti ve 12 Mb sekvence DNA z lidského chromozomu 16p a 16q". Genomika. 60 (3): 295–308. doi:10.1006 / geno.1999.5927. PMID 10493829.
Amasaki Y, Adachi S, Ishida Y, Iwata M, Arai N, Arai K, Miyatake S (červenec 2002). „Konstitutivně nukleární forma NFATx vykazuje účinnou transaktivační aktivitu a indukuje diferenciaci CD4 (+) CD8 (+) T buněk“ (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 277 (28): 25640–8. doi:10,1074 / jbc.M201860200. PMID 11997392. S2CID 27918489.
Chagnon P, Michaud J, Mitchell G, Mercier J, Marion JF, Drouin E, Rasquin-Weber A, Hudson TJ, Richter A (prosinec 2002). „Missense mutace (R565W) v cirhinu (FLJ14728) v dětské cirhóze u indiánů v Severní Americe“. American Journal of Human Genetics. 71 (6): 1443–9. doi:10.1086/344580. PMC 378590. PMID 12417987.

externí odkazy

NFATC3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072736 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031902 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7749981-5] Hoey T, Sun YL, Williamson K, Xu X (květen 1995). „Izolace dvou nových členů rodiny genů NF-AT a funkční charakterizace proteinů NF-AT“. Imunita. 2 (5): 461–72. doi:10.1016/1074-7613(95)90027-6. PMID 7749981.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: NFATC3 jaderný faktor aktivovaných T-buněk, cytoplazmatický, na kalcineurinu závislý 3".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]