Receptor retinoidů X beta - Retinoid X receptor beta

RXRB
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1H9U, 1UHL, 5HJP, 5I4V
Identifikátory
Aliasy	RXRB, DAUDI6, H-2RIIBP, NR2B2, RCoR-1, retinoid X receptor beta
Externí ID	OMIM: 180246 MGI: 98215 HomoloGene: 7923 Genové karty: RXRB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	33,200,688 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,038,399 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • aktivita receptoru steroidních hormonů; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 aktivita jaderného receptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • signální dráha pro receptor kyseliny retinové; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • steroidní hormon zprostředkovaná signální dráha; • intracelulární receptorová signální dráha;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6257
	20182
ENSG00000235712; ENSG00000231321; ENSG00000227322; ENSG00000204231; ENSG00000206289;
	ENSG00000228333
	ENSMUSG00000039656
	P28702; Q5STP9
	P28704
	NM_001270401; NM_001291989; NM_021976
	NM_001205214; NM_001205215; NM_001205216; NM_011306
	NP_001257330; NP_001278918; NP_068811; NP_068811.1
	NP_001192143; NP_001192144; NP_001192145; NP_035436
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Receptor retinoidů X beta (RXR-beta), také známý jako NR2B2 (podrodina jaderného receptoru 2, skupina B, člen 2) je a jaderný receptor že u lidí je kódován RXRB gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena retinoid X receptor (RXR) rodina jaderných receptorů, které se podílejí na zprostředkování účinků kyselina retinová (RA). Tento receptor tvoří heterodimery s kyselina retinová, hormon štítné žlázy, a receptory vitaminu D., zvyšující jak DNA vazebnou, tak transkripční funkci na jejich příslušných prvcích odezvy. Gen leží v oblasti hlavního histokompatibilního komplexu (MHC) třídy II na chromozomu 6. An alternativně sestříhané byla popsána varianta transkriptu, ale její celá délka sekvence nebyla stanovena.^[6]

Interaktivní mapa cest

Kliknutím na geny, bílkoviny a metabolity níže zobrazíte odkazy na příslušné články. ^{[§ 1]}

[[Soubor:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Cesta syntézy vitaminu D (Pohled / Upravit )]]

Cesta syntézy vitaminu D (Pohled / Upravit )

^ Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „VitaminDSynthesis_WP1531“.

Viz také

Receptor retinoidů X

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000231321, ENSG00000227322, ENSG00000204231, ENSG00000206289, ENSG00000228333 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000235712, ENSG00000231321, ENSG00000227322, ENSG0000020423, ENSG00000204231, ENSG00000204231, ENSG0000020423 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039656 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fitzgibbon J, Gillett GT, Woodward KJ, Boyle JM, Wolfe J, Povey S (červenec 1993). "Mapování RXRB na lidský chromozom 6p21.3". Annals of Human Genetics. 57 (Pt 3): 203–9. doi:10.1111 / j.1469-1809.1993.tb01596.x. PMID 8257090. S2CID 26964941.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RXRB retinoid X receptor, beta“.

Další čtení

Szanto A, Narkar V, Shen Q, Uray IP, Davies PJ, Nagy L (prosinec 2004). „Retinoidní X receptory: X-ploring jejich (patologických) fyziologických funkcí“. Buněčná smrt a diferenciace. 11 Suppl 2: S126–43. doi:10.1038 / sj.cdd.4401533. PMID 15608692.
Leid M, Kastner P, Lyons R, Nakshatri H, Saunders M, Zacharewski T, Chen JY, Staub A, Garnier JM, Mader S (leden 1992). "Čištění, klonování a RXR identita buněčného faktoru HeLa, se kterým se RAR nebo TR heterodimerizuje, aby se efektivně navázaly na cílové sekvence". Buňka. 68 (2): 377–95. doi:10.1016 / 0092-8674 (92) 90478-U. PMID 1310259. S2CID 40617478.
Fleischhauer K, Park JH, DiSanto JP, Marks M, Ozato K, Yang SY (duben 1992). „Izolace klonu cDNA plné délky kódující N-terminálně variantní formu lidského retinoidního X receptoru beta“. Výzkum nukleových kyselin. 20 (7): 1801. doi:10.1093 / nar / 20.7.1801. PMC 312273. PMID 1315958.
Berrodin TJ, Marks MS, Ozato K, Linney E, Lazar MA (září 1992). "Heterodimerizace mezi receptorem hormonu štítné žlázy, receptorem kyseliny retinové, receptorem retinoidu X, kuřecím ovalbuminem proti směru transkripčního faktoru promotoru a endogenním jaterním proteinem". Molekulární endokrinologie. 6 (9): 1468–78. doi:10.1210 / me.6.9.1468. PMID 1331778.
Epplen C, Epplen JT (1992). „Lidská sekvence cDNA homologní s genem myšího proteinu vázajícího promotor MHC třídy I obsahuje další čtyři kodony v lymfocytech.“ Savčí genom. 3 (8): 472–5. doi:10.1007 / BF00356161. PMID 1514958. S2CID 1278904.
Yu VC, Delsert C, Andersen B, Holloway JM, Devary OV, Näär AM, Kim SY, Boutin JM, Glass CK, Rosenfeld MG (prosinec 1991). „RXR beta: koregulátor, který zvyšuje vazbu kyseliny retinové, hormonů štítné žlázy a receptorů vitaminu D na jejich příbuzné prvky odpovědi“. Buňka. 67 (6): 1251–66. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90301-E. PMID 1662118. S2CID 10354699.
Oñate SA, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (listopad 1995). "Pořadí a charakterizace koaktivátoru pro nadrodinu receptorů steroidních hormonů". Věda. 270 (5240): 1354–7. Bibcode:1995Sci ... 270.1354O. doi:10.1126 / science.270.5240.1354. PMID 7481822. S2CID 28749162.
Kooistra T, Lansink M, Arts J, Sitter T, Toet K (září 1995). „Zapojení alfa receptoru kyseliny retinové do stimulace exprese genu tkáňového plazminogen-aktivátorového genu v lidských endoteliálních buňkách“. European Journal of Biochemistry / FEBS. 232 (2): 425–32. doi:10.1111 / j.1432-1033.1995.425zz.x. PMID 7556191.
Perlmann T, Jansson L (duben 1995). „Nová cesta pro signalizaci vitaminu A zprostředkovanou heterodimerizací RXR s NGFI-B a NURR1“. Geny a vývoj. 9 (7): 769–82. doi:10,1101 / gad. 9.7.769. PMID 7705655.
Forman BM, Umesono K, Chen J, Evans RM (květen 1995). „Unikátní cesty odezvy jsou stanoveny alosterickými interakcemi mezi nukleárními receptory hormonů“. Buňka. 81 (4): 541–50. doi:10.1016/0092-8674(95)90075-6. PMID 7758108. S2CID 3203590.
Zanaria E, Muscatelli F, Bardoni B, Strom TM, Guioli S, Guo W, Lalli E, Moser C, Walker AP, McCabe ER (prosinec 1994). „Neobvyklý člen nadrodiny hormonálních receptorů zodpovědný za X-vázanou adrenální hypoplasii congenita“. Příroda. 372 (6507): 635–41. Bibcode:1994 Natur.372..635Z. doi:10.1038 / 372635a0. PMID 7990953. S2CID 4363344.
Almasan A, Mangelsdorf DJ, Ong ES, Wahl GM, Evans RM (duben 1994). "Chromozomální lokalizace lidských retinoidních X receptorů". Genomika. 20 (3): 397–403. doi:10.1006 / geno.1994.1193. PMID 8034312.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Fleischhauer K, McBride OW, DiSanto JP, Ozato K, Yang SY (leden 1993). „Klonování a mapování chromozomů lidského retinoidního X receptoru beta: selektivní zachování aminokyselinové sekvence receptoru jaderného hormonu u savců“. Genetika člověka. 90 (5): 505–10. doi:10.1007 / BF00217449. PMID 8381386. S2CID 26472949.
May M, Mengus G, Lavigne AC, Chambon P, Davidson I (červen 1996). „Lidský TAF (II28) podporuje transkripční stimulaci aktivační funkcí 2 retinoidních X receptorů“. Časopis EMBO. 15 (12): 3093–104. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00672.x. PMC 450252. PMID 8670810.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Joyeux A, Cavaillès V, Balaguer P, Nicolas JC (únor 1997). „RIP 140 zvyšuje transkripci závislou na jaderných receptorech in vivo v kvasinkách“. Molekulární endokrinologie. 11 (2): 193–202. doi:10.1210 / me.11.2.193. PMID 9013766.
Xu XC, Sozzi G, Lee JS, Lee JJ, Pastorino U, Pilotti S, Kurie JM, Hong WK, Lotan R (květen 1997). „Potlačení beta receptoru kyseliny retinové u nemalobuněčného karcinomu plic in vivo: důsledky pro vývoj karcinomu plic“. Journal of the National Cancer Institute. 89 (9): 624–9. doi:10.1093 / jnci / 89.9.624. PMID 9150186.
Chen H, Lin RJ, Schiltz RL, Chakravarti D, Nash A, Nagy L, Privalsky ML, Nakatani Y, Evans RM (srpen 1997). „Koaktivátor jaderného receptoru ACTR je nová histon acetyltransferáza a tvoří multimerní aktivační komplex s P / CAF a CBP / p300.“ Buňka. 90 (3): 569–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80516-4. PMID 9267036. S2CID 15284825.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[WikiPathways-7] Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „VitaminDSynthesis_WP1531“.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000231321, ENSG00000227322, ENSG00000204231, ENSG00000206289, ENSG00000228333 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000235712, ENSG00000231321, ENSG00000227322, ENSG0000020423, ENSG00000204231, ENSG00000204231, ENSG0000020423 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039656 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8257090-5] Fitzgibbon J, Gillett GT, Woodward KJ, Boyle JM, Wolfe J, Povey S (červenec 1993). "Mapování RXRB na lidský chromozom 6p21.3". Annals of Human Genetics. 57 (Pt 3): 203–9. doi:10.1111 / j.1469-1809.1993.tb01596.x. PMID 8257090. S2CID 26964941.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RXRB retinoid X receptor, beta“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[§ 1]

Retinoidní receptor modulátory
RAR	Agonisté: 9CDHRA 9-cis-Kyselina retinová (alitretinoin) AC-261066 AC-55649 Acitretin Adapalen Všechno-trans-Kyselina retinová (tretinoin) AM-580 BMS-493 BMS-753 BMS-961 CD-1530 CD-2314 CD-437 Ch-55 EC 23 Etretinát Fenretinid Isotretinoin Palovaroten Kyselina retinová Retinol (vitamin A. ) Tamibaroten Tazaroten Kyselina tazarotenová TTNPB Antagonisté: BMS-195614 BMS-493 CD-2665 ER-50891 LE-135 MM-11253 Inhibitory metabolismu kyseliny retinové: Liarozol
RXR	Agonisté: 9CDHRA 9-cis-Kyselina retinová (alitretinoin) Všechno-trans-Kyselina retinová (tretinoin) Bexaroten CD 3254 Kyselina dokosahexaenová Fluorobexaroten Isotretinoin LG-100268 LG-101506 LG-100754 Kyselina retinová Retinol (vitamin A. ) SR-11237 Antagonisté: HX-531 HX-630 LG-100754 PA-452 UVI-3003 HX-603 LE135 (RAR beta selektivní) LE-540 CD3254 PA-451 PA-452 Rhein HX-711 Kyselina 6- (N-ethyl-N- (5-isobutoxy-4-isopropyl-2- (E) -styrylfenyl) amino) nikotinová
Viz také Receptorové / signalizační modulátory