NKX6-1 - NKX6-1 - Wikipedia
NKX6-1 Identifikátory Aliasy NKX6-1 , Homeobox NKX6.1, NKX6A, NK6 1Externí ID OMIM: 602563 MGI: 1206039 HomoloGene: 4495 Genové karty: NKX6-1 Genová ontologie Molekulární funkce • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II • sekvenčně specifická vazba DNA • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA • vazba chromatinu • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA • Vazba DNA • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II Buněčná složka • buněčné jádro • extracelulární exosom Biologický proces • vyhlazená signální dráha • detekce glukózy • vývoj slinivky břišní • transkripce, chráněná DNA • regulace prodloužení axonu • vývoj mnohobuněčných organismů • buněčná odpověď na stimul peptidového hormonu • diferenciace neuronů centrálního nervového systému • reakce na nikotin • negativní regulace diferenciace gliových buněk • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II zapojeného do specifikace osudu motorických neuronů míchy • proliferace pankreatických buněk typu B. • buněčná odpověď na stimul cytokinů • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA • neurogeneze • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II zapojeného do specifikace interneuronu ventrální míchy • vývoj pankreatických buněk typu B. • pozitivní regulace neuronové diferenciace • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • pozitivní regulace vývoje pankreatických buněk typu B. • zrání pankreatických buněk typu B. • diferenciace oligodendrocytů • regulace transkripce, DNA-šablony • buněčná proliferace • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • transkripce z promotoru RNA polymerázy II • reakce na drogu • pozitivní regulace diferenciace gliových buněk • diferenciace buněk • pozitivní regulace sekrece inzulínu • morfogeneze zvířecích orgánů • regulace migrace neuronů • migrace neuronů • regulace sekrece inzulínu • vývoj endokrinního pankreatu • diferenciace pankreatických buněk typu B. Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology Druh Člověk Myš Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Místo (UCSC) Chr 4: 84,49 - 84,5 Mb Chr 5: 101,66 - 101,66 Mb PubMed Vyhledávání[3] [4] Wikidata
Homeoboxový protein Nkx-6.1 je protein že u lidí je kódován NKX6-1 gen .[5] [6]
Funkce V slinivka břišní Pro vývoj. Je vyžadován NKX6.1 beta buňky a je účinným bifunkčním regulátorem transkripce, který se váže na sekvence bohaté na AT v promotorové oblasti cílových genů.[6]
Reference ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163623 - Ensembl , Květen 2017^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035187 - Ensembl , Květen 2017^ „Human PubMed Reference:“ . Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna .^ „Myš PubMed Reference:“ . Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna .^ Inoue H, Rudnick A, německý MS, Veile R, Donis-Keller H, Permutt MA (březen 1997). „Izolace, charakterizace a chromozomální mapování lidského genu Nkx6.1 (NKX6A), nového genu homeoboxu pro pankreatické ostrůvky“. Genomika . 40 (2): 367–70. doi :10.1006 / geno.1996.4568 . PMID 9119408 . ^ A b „Entrez Gene: NK6 homeobox 1“ .Další čtení Schisler JC, Fueger PT, Babu DA a kol. (2008). „Stimulace proliferace beta-buněk lidských a potkaních ostrůvků se zachováním funkce transkripčním faktorem homeodomény Nkx6.1“ . Mol. Buňka. Biol . 28 (10): 3465–76. doi :10.1128 / MCB.01791-07 . PMC 2423154 . PMID 18347054 . Hori Y, Gu X, Xie X, Kim SK (2005). „Diferenciace buněk produkujících inzulín od lidských neurálních progenitorových buněk“ . PLOS Med . 2 (4): e103. doi :10.1371 / journal.pmed.0020103 . PMC 1087208 . PMID 15839736 . Jørgensen MC, Vestergírd Petersen H, Ericson J a kol. (1999). "Klonování a DNA vazebné vlastnosti potkaního pankreatického beta-specifického faktoru Nkx6.1". FEBS Lett . 461 (3): 287–94. doi :10.1016 / S0014-5793 (99) 01436-2 . PMID 10567713 . S2CID 1735843 . Iype T, Taylor DG, Ziesmann SM a kol. (2004). „Transkripční represor Nkx6.1 funguje také jako kontextově závislý transkripční aktivátor deoxyribonukleové kyseliny během diferenciace beta-buněk pankreatu: důkaz zpětnovazebné aktivace genu nkx6.1 pomocí Nkx6.1“ . Mol. Endokrinol . 18 (6): 1363–75. doi :10.1210 / me.2004-0006 . PMID 15056733 . Yokoi N, Kanamori M, Horikawa Y a kol. (2006). „Asociační studie variant v genech podílejících se na funkci beta-buněk pankreatu u diabetu typu 2 u japonských subjektů“ . Cukrovka . 55 (8): 2379–86. doi :10.2337 / db05-1203 . PMID 16873704 . Zhu S, Xia HH, Yang Y a kol. (2009). „Změny exprese žaludečního homeoproteinu u infekce Helicobacter pylori, incisurální antralizace a intestinální metaplazie“. Kopat. Dis. Sci . 54 (5): 996–1002. doi :10.1007 / s10620-008-0459-8 . PMID 18754095 . S2CID 25173708 . Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine , který je v veřejná doména .
(1) Základní domény
(1.1) Základní leucinový zip (bZIP )(1.2) Základní šroubovice-smyčka-šroubovice (bHLH )
Skupina A Skupina B Skupina C bHLH-PAS Skupina D Skupina E Skupina F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
(2) Zinkový prst Domény vázající DNA
(2.1) Jaderný receptor (Cys4 )
podčeleď 1 podčeleď 2 podčeleď 3 podčeleď 4 podčeleď 5 podčeleď 6 podčeleď 0
(2.2) Ostatní Cys4 (2.3) Cys2 Jeho2 (2.4) Cys6 (2.5) Střídavé složení (2.6) NEBEZPEČNÉ
(4) Faktory β-lešení s malými kontakty drážky
(0) Další transkripční faktory
viz také nedostatky transkripčního faktoru / koregulátoru