RFX4 - RFX4

RFX4
Identifikátory
Aliasy	RFX4, NYD-SP10, regulační faktor X4
Externí ID	OMIM: 603958 MGI: 1918387 HomoloGene: 31119 Genové karty: RFX4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	106,762,803 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	84,906,538 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba chromatinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • vývoj předního mozku; • vývoj telencephalon; • vývoj hřbetní míchy; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace vyhlazené signální dráhy zapojené do ventrální míchy; • morfogeneze mozečkové kůry; • vývoj středního mozku; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace zpracování bílkovin; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • cilium morfogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5992
	71137
	ENSG00000111783
	ENSMUSG00000020037
	Q33E94
	Q7TNK1
	NM_213594; NM_001206691; NM_002920; NM_032491
	NM_001024918; NM_027689
	NP_001193620; NP_115880; NP_998759
	NP_001020089; NP_081965
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor RFX4 je protein že u lidí je kódován RFX4 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen je členem rodiny genů regulačního faktoru X, která kóduje transkripční faktory které obsahují vysoce konzervovanou okřídlenou šroubovice DNA vazebná doména. Protein kódovaný tímto genem strukturálně souvisí s regulačními faktory X1, X2, X3 a X5. Ukázalo se, že interaguje sám se sebou i s regulačními faktory X2 a X3, ale neinteraguje s regulačním faktorem X1. Tento protein může být transkripční represor spíše než transkripční aktivátor. Tři varianty přepisu kódující různé izoformy byly pro tento gen popsány.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111783 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020037 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Emery P, Durand B, Mach B, Reith W (květen 1996). „RFX proteiny, nová rodina proteinů vázajících DNA konzervovaných v eukaryotickém království“. Nucleic Acids Res. 24 (5): 803–7. doi:10.1093 / nar / 24.5.803. PMC 145730. PMID 8600444.
^ Morotomi-Yano K, Yano K, Saito H, Sun Z, Iwama A, Miki Y (leden 2002). „Lidský regulační faktor X 4 (RFX4) je varlat specifický dimerní protein vázající DNA, který spolupracuje s dalšími lidskými členy RFX“. J Biol Chem. 277 (1): 836–42. doi:10,1074 / jbc.M108638200. PMID 11682486.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RFX4 regulační faktor X, 4 (ovlivňuje expresi HLA třídy II)“.

Další čtení

Dotzlaw H, Alkhalaf M, Murphy LC (1992). "Charakterizace variantních mRNA estrogenového receptoru z rakoviny prsu u lidí". Mol. Endokrinol. 6 (5): 773–85. doi:10.1210 / me.6.5.773. PMID 1603086.
Reith W, Ucla C, Barras E a kol. (1994). „RFX1, transaktivátor zesilovače I viru hepatitidy B, patří do nové rodiny homodimerních a heterodimerních proteinů vázajících DNA“. Mol. Buňka. Biol. 14 (2): 1230–44. doi:10.1128 / mcb.14.2.1230. PMC 358479. PMID 8289803.
Gajiwala KS, Chen H, Cornille F a kol. (2000). „Struktura proteinu hRFX1 s křídlovými šroubovicemi odhaluje nový způsob vazby DNA“. Příroda. 403 (6772): 916–21. Bibcode:2000Natur.403..916G. doi:10.1038/35002634. PMID 10706293. S2CID 4425783.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Blackshear PJ, Graves JP, Stumpo DJ a kol. (2003). "Gradovaná fenotypová odpověď na částečný a úplný nedostatek mozkové specifické varianty transkriptu transkripčního faktoru okřídlené šroubovice RFX4". Rozvoj. 130 (19): 4539–52. doi:10,1242 / dev.00661. PMID 12925582.
Araki R, Takahashi H, Fukumura R a kol. (2004). „Omezená exprese a fotická indukce nového transkriptu myšího regulačního faktoru X4 v suprachiasmatickém jádře“. J. Biol. Chem. 279 (11): 10237–42. doi:10,1074 / jbc.M312761200. PMID 14701801.
Glaser B, Kirov G, Bray NJ a kol. (2005). „Identifikace potenciálního bipolárního rizikového haplotypu v genu kódujícím transkripční faktor křídlové šroubovice RFX4“. Mol. Psychiatrie. 10 (10): 920–7. doi:10.1038 / sj.mp.4001689. PMID 15940297.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Matsushita H, Uenaka A, Ono T a kol. (2006). „Identifikace gliomově specifických izoforem RFX4-E a -F a humorální imunitní reakce u pacientů“ (PDF). Cancer Sci. 96 (11): 801–9. doi:10.1111 / j.1349-7006.2005.00112.x. PMID 16271074. S2CID 25967004.

externí odkazy

RFX4 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111783 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020037 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8600444-5] Emery P, Durand B, Mach B, Reith W (květen 1996). „RFX proteiny, nová rodina proteinů vázajících DNA konzervovaných v eukaryotickém království“. Nucleic Acids Res. 24 (5): 803–7. doi:10.1093 / nar / 24.5.803. PMC 145730. PMID 8600444.

[pmid11682486-6] Morotomi-Yano K, Yano K, Saito H, Sun Z, Iwama A, Miki Y (leden 2002). „Lidský regulační faktor X 4 (RFX4) je varlat specifický dimerní protein vázající DNA, který spolupracuje s dalšími lidskými členy RFX“. J Biol Chem. 277 (1): 836–42. doi:10,1074 / jbc.M108638200. PMID 11682486.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RFX4 regulační faktor X, 4 (ovlivňuje expresi HLA třídy II)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]