CREBL1 - CREBL1

ATF6B
Identifikátory
Aliasy	ATF6B, CREB-RP, CREBL1, G13, aktivující transkripční faktor 6 beta
Externí ID	OMIM: 600984 MGI: 105121 HomoloGene: 31238 Genové karty: ATF6B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,128,253 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,655,074 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba prvku odezvy cAMP; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Golgiho aparát; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • intracelulární; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • komplex protein-DNA; • endoplazmatické retikulum; • buněčné jádro; • endomembránový systém; • jádro; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na stres endoplazmatického retikula; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • endoplazmatické retikulum rozložilo proteinovou odpověď; • ATF6 zprostředkovaná rozložená proteinová odpověď; • reakce na rozvinutý protein; • signální transdukce; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace rozložené proteinové reakce zprostředkované ATF6;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1388
	12915
	ENSG00000213676; ENSG00000228628; ENSG00000234539; ENSG00000168468
	ENSMUSG00000015461
	Q99941
	O35451
	NM_004381; NM_001136153
	NM_017406
	NP_001129625; NP_004372
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CAMP reagující na prvek vázající protein podobný 1, také známý jako CREBL1, je protein který je u lidí kódován CREBL1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem má sekvenční podobnost s Creb / ATF podrodina bZip nadčeleď transkripční faktory. Lokalizuje se do obou cytoplazma a jádro. Gen se lokalizuje do hlavní komplex histokompatibility (MHC) region třídy III zapnutý chromozom 6.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000228628, ENSG00000234539, ENSG00000168468 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213676, ENSG00000228628, ENSG00000234539, ENSG00000168468 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015461 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CREBL1 cAMP responzivní prvek vázající protein podobný 1“.
^ Haze K, Okada T, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Negishi M, Mori K (duben 2001). „Identifikace genu G13 (protein související s proteinem vázajícím na odezvu s vazbou na protein) související s aktivací transkripčního faktoru 6 jako transkripčního aktivátoru savčí rozvinuté proteinové odpovědi“. Biochem. J. 355 (Pt 1): 19–28. doi:10.1042/0264-6021:3550019. PMC 1221707. PMID 11256944.

Další čtení

Bristow J, Tee MK, Gitelman SE a kol. (1993). „Tenascin-X: nový protein extracelulární matrix kódovaný lidským genem XB překrývajícím se P450c21B“. J. Cell Biol. 122 (1): 265–78. doi:10.1083 / jcb.122.1.265. PMC 2119596. PMID 7686164.
Min J, Shukla H, Kozono H a kol. (1996). „Nová telomerika genu rodiny Crebů HLA-DRA v komplexu HLA“. Genomika. 30 (2): 149–56. doi:10.1006 / geno.1995,9891. PMID 8586413.
Khanna A, Campbell RD (1996). „Gen G13 v oblasti třídy III lidského MHC kóduje potenciální protein vázající DNA“. Biochem. J. 319. (Pt 1): 81–9. doi:10.1042 / bj3190081. PMC 1217738. PMID 8870652.
Speek M, Barry F, Miller WL (1997). „Alternativní promotory a alternativní sestřih lidského tenascinu-X, genu s 5 'a 3' konci pohřbeného v jiných genech“. Hučení. Mol. Genet. 5 (11): 1749–58. doi:10,1093 / hmg / 5.11.1749. PMID 8923003.
Swanson DJ, Adachi M, Lewis EJ (2000). „Homeodoménový protein Arix podporuje aktivaci promotoru dopaminové beta-hydroxylázy závislou na proteinkináze A prostřednictvím více prvků a interakcí s koaktivátorem cAMP-odezvový prvek vázající protein vázající protein“. J. Biol. Chem. 275 (4): 2911–23. doi:10.1074 / jbc.275.4.2911. PMID 10644760.
Yoshida H, Okada T, Haze K a kol. (2001). „Tvorba komplexu transkripčních faktorů ERSF vyvolaná stresem vyvolaným endoplazmatickým retikulem, včetně NF-Y (CBF) a aktivujících transkripčních faktorů 6alfa a 6beta, které aktivují savčí rozvinutou proteinovou odpověď“. Mol. Buňka. Biol. 21 (4): 1239–48. doi:10.1128 / MCB.21.4.1239-1248.2001. PMC 99577. PMID 11158310.
Ye J, Rawson RB, Komuro R a kol. (2001). „ER stres indukuje štěpení membránově vázaného ATF6 stejnými proteázami, které zpracovávají SREBP“. Mol. Buňka. 6 (6): 1355–64. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00133-7. PMID 11163209.
Haze K, Okada T, Yoshida H a kol. (2001). „Identifikace genu G13 (protein související s proteinem vázajícím na odezvu s vazbou na protein) související s aktivací transkripčního faktoru 6 jako transkripčního aktivátoru savčí rozvinuté proteinové odpovědi“. Biochem. J. 355 (Pt 1): 19–28. doi:10.1042/0264-6021:3550019. PMC 1221707. PMID 11256944.
Tong WY, Nagano-Fujii M, Hidajat R a kol. (2003). „Fyzická interakce mezi proteinem NS4B viru hepatitidy C a CREB-RP / ATF6beta“ (PDF). Biochem. Biophys. Res. Commun. 299 (3): 366–72. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02638-4. PMID 12445808.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Okada T, Haze K, Nadanaka S a kol. (2003). „Inhibitor serinové proteázy zabraňuje štěpení vyvolanému stresem endoplazmatického retikula, ale ne transportu transkripčního faktoru ATF6 vázaného na membránu.“. J. Biol. Chem. 278 (33): 31024–32. doi:10,1074 / jbc.M300923200. PMID 12782636.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Xie T, Rowen L, Aguado B a kol. (2004). „Analýza oblasti genově hustého hlavního histokompatibilního komplexu třídy III a její srovnání s myší“. Genome Res. 13 (12): 2621–36. doi:10,1101 / gr. 1736803. PMC 403804. PMID 14656967.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.

externí odkazy

CREBL1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk ATF6B umístění genomu a ATF6B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000228628, ENSG00000234539, ENSG00000168468 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213676, ENSG00000228628, ENSG00000234539, ENSG00000168468 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015461 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: CREBL1 cAMP responzivní prvek vázající protein podobný 1“.

[pmid11256944-6] Haze K, Okada T, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Negishi M, Mori K (duben 2001). „Identifikace genu G13 (protein související s proteinem vázajícím na odezvu s vazbou na protein) související s aktivací transkripčního faktoru 6 jako transkripčního aktivátoru savčí rozvinuté proteinové odpovědi“. Biochem. J. 355 (Pt 1): 19–28. doi:10.1042/0264-6021:3550019. PMC 1221707. PMID 11256944.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]